MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP2

Total Repeats: 977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020543	CGG	2	6	28849	28854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
502	NC_020543	GCA	2	6	28883	28888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
503	NC_020543	GC	3	6	28946	28951	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
504	NC_020543	GCC	2	6	28964	28969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
505	NC_020543	GTG	2	6	29013	29018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434200
506	NC_020543	CCA	2	6	29037	29042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434200
507	NC_020543	CG	3	6	29064	29069	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
508	NC_020543	GCG	2	6	29110	29115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
509	NC_020543	TCG	2	6	29118	29123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
510	NC_020543	AGC	2	6	29139	29144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
511	NC_020543	ATA	2	6	29153	29158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472434200
512	NC_020543	GGC	2	6	29170	29175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
513	NC_020543	GGT	2	6	29285	29290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434200
514	NC_020543	TGCC	2	8	29325	29332	0 %	25 %	25 %	50 %	472434200
515	NC_020543	TCG	2	6	29373	29378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
516	NC_020543	CGT	2	6	29506	29511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
517	NC_020543	GTG	2	6	29541	29546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434200
518	NC_020543	GCC	2	6	29594	29599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
519	NC_020543	ATGA	2	8	29679	29686	50 %	25 %	25 %	0 %	472434200
520	NC_020543	GCT	2	6	29704	29709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
521	NC_020543	TCG	2	6	29748	29753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
522	NC_020543	CG	3	6	29786	29791	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
523	NC_020543	ACCGAT	2	12	29807	29818	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472434200
524	NC_020543	CGC	2	6	29827	29832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
525	NC_020543	AAG	2	6	29879	29884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434200
526	NC_020543	CGTG	2	8	29923	29930	0 %	25 %	50 %	25 %	472434200
527	NC_020543	ATC	2	6	29946	29951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434200
528	NC_020543	GCC	2	6	29959	29964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
529	NC_020543	AGC	2	6	29994	29999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
530	NC_020543	TCTGC	2	10	30004	30013	0 %	40 %	20 %	40 %	472434200
531	NC_020543	GC	3	6	30021	30026	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
532	NC_020543	CGC	2	6	30073	30078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
533	NC_020543	TG	3	6	30088	30093	0 %	50 %	50 %	0 %	472434200
534	NC_020543	AG	3	6	30122	30127	50 %	0 %	50 %	0 %	472434200
535	NC_020543	AGGA	2	8	30129	30136	50 %	0 %	50 %	0 %	472434200
536	NC_020543	GC	4	8	30192	30199	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
537	NC_020543	TGG	2	6	30279	30284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434200
538	NC_020543	GCG	3	9	30288	30296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
539	NC_020543	TCCA	2	8	30404	30411	25 %	25 %	0 %	50 %	472434200
540	NC_020543	CCGG	2	8	30414	30421	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
541	NC_020543	GGC	2	6	30439	30444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
542	NC_020543	TG	3	6	30480	30485	0 %	50 %	50 %	0 %	472434200
543	NC_020543	CGG	2	6	30535	30540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
544	NC_020543	CAG	2	6	30563	30568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
545	NC_020543	CGA	2	6	30598	30603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
546	NC_020543	GC	3	6	30626	30631	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
547	NC_020543	GAT	2	6	30680	30685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434200
548	NC_020543	TCC	2	6	30696	30701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434200
549	NC_020543	TCA	2	6	30735	30740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434200
550	NC_020543	TCG	2	6	30757	30762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
551	NC_020543	GGC	2	6	30828	30833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
552	NC_020543	GCC	2	6	30854	30859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
553	NC_020543	CAT	2	6	30874	30879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434200
554	NC_020543	CCGT	2	8	30978	30985	0 %	25 %	25 %	50 %	472434200
555	NC_020543	GGC	2	6	31003	31008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
556	NC_020543	CAGG	2	8	31026	31033	25 %	0 %	50 %	25 %	472434200
557	NC_020543	CGG	2	6	31044	31049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
558	NC_020543	ATG	2	6	31259	31264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434200
559	NC_020543	GTC	2	6	31413	31418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
560	NC_020543	CGA	3	9	31444	31452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
561	NC_020543	CCTG	2	8	31717	31724	0 %	25 %	25 %	50 %	472434200
562	NC_020543	GGC	2	6	31732	31737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
563	NC_020543	AGG	2	6	31815	31820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434200
564	NC_020543	GGC	2	6	31876	31881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
565	NC_020543	AGC	2	6	31896	31901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
566	NC_020543	CG	3	6	31931	31936	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
567	NC_020543	GGC	2	6	31981	31986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
568	NC_020543	GCA	2	6	32028	32033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
569	NC_020543	CGC	2	6	32211	32216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
570	NC_020543	CAG	2	6	32222	32227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
571	NC_020543	ATG	2	6	32228	32233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434200
572	NC_020543	GCG	2	6	32271	32276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
573	NC_020543	GCAA	2	8	32301	32308	50 %	0 %	25 %	25 %	472434200
574	NC_020543	TCGA	2	8	32337	32344	25 %	25 %	25 %	25 %	472434200
575	NC_020543	CGG	2	6	32398	32403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
576	NC_020543	GGC	2	6	32414	32419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
577	NC_020543	CG	3	6	32426	32431	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
578	NC_020543	CGG	2	6	32525	32530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
579	NC_020543	TCTCG	2	10	32636	32645	0 %	40 %	20 %	40 %	472434200
580	NC_020543	CGAT	2	8	32682	32689	25 %	25 %	25 %	25 %	472434200
581	NC_020543	GCC	2	6	32746	32751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
582	NC_020543	CAT	2	6	32774	32779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434200
583	NC_020543	GTTG	2	8	32786	32793	0 %	50 %	50 %	0 %	472434200
584	NC_020543	GGTGC	2	10	32798	32807	0 %	20 %	60 %	20 %	472434200
585	NC_020543	TTCG	2	8	32816	32823	0 %	50 %	25 %	25 %	472434200
586	NC_020543	GGGA	2	8	32843	32850	25 %	0 %	75 %	0 %	472434200
587	NC_020543	GCG	2	6	32897	32902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
588	NC_020543	CCA	2	6	32905	32910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434200
589	NC_020543	AGGA	2	8	32957	32964	50 %	0 %	50 %	0 %	472434200
590	NC_020543	CAA	2	6	32995	33000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434200
591	NC_020543	AGC	2	6	33006	33011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
592	NC_020543	GGC	2	6	33035	33040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
593	NC_020543	CAA	2	6	33067	33072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434200
594	NC_020543	GGC	2	6	33110	33115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
595	NC_020543	GC	3	6	33128	33133	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
596	NC_020543	GCA	2	6	33156	33161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
597	NC_020543	GCC	2	6	33196	33201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
598	NC_020543	GCCT	2	8	33288	33295	0 %	25 %	25 %	50 %	472434200
599	NC_020543	GAA	2	6	33298	33303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434200
600	NC_020543	CGC	2	6	33316	33321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
601	NC_020543	GGC	2	6	33368	33373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
602	NC_020543	GCA	2	6	33378	33383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
603	NC_020543	GAG	2	6	33389	33394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434200
604	NC_020543	GCC	2	6	33431	33436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
605	NC_020543	CAG	3	9	33437	33445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
606	NC_020543	CGA	2	6	33448	33453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
607	NC_020543	GCG	2	6	33473	33478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
608	NC_020543	CAGC	2	8	33527	33534	25 %	0 %	25 %	50 %	472434200
609	NC_020543	CGC	2	6	33586	33591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
610	NC_020543	GAT	2	6	33653	33658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434200
611	NC_020543	TCGC	2	8	33660	33667	0 %	25 %	25 %	50 %	472434200
612	NC_020543	GAG	2	6	33710	33715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434200
613	NC_020543	CGA	2	6	33781	33786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
614	NC_020543	AGG	2	6	33801	33806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434200
615	NC_020543	GC	3	6	33828	33833	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
616	NC_020543	GAT	2	6	33923	33928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434200
617	NC_020543	CGG	2	6	34008	34013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
618	NC_020543	CGGG	2	8	34021	34028	0 %	0 %	75 %	25 %	472434200
619	NC_020543	CAC	2	6	34052	34057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434200
620	NC_020543	GCGCA	2	10	34070	34079	20 %	0 %	40 %	40 %	472434200
621	NC_020543	CCGG	2	8	34085	34092	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
622	NC_020543	GGA	2	6	34123	34128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434200
623	NC_020543	TCCCA	2	10	34167	34176	20 %	20 %	0 %	60 %	472434200
624	NC_020543	GTC	2	6	34301	34306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
625	NC_020543	CGGC	2	8	34309	34316	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
626	NC_020543	AGG	2	6	34410	34415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434200
627	NC_020543	GAC	2	6	34454	34459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
628	NC_020543	GAA	2	6	34507	34512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434200
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756	NC_020543	CGG	2	6	42819	42824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434206
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772	NC_020543	GCG	2	6	43696	43701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434207
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881	NC_020543	CG	3	6	48731	48736	0 %	0 %	50 %	50 %	472434211
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