MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP0

Total Repeats: 5506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020542	GCG	2	6	175536	175541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433827
3502	NC_020542	CTA	2	6	175591	175596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433827
3503	NC_020542	CTGAC	2	10	175722	175731	20 %	20 %	20 %	40 %	472433827
3504	NC_020542	A	7	7	175751	175757	100 %	0 %	0 %	0 %	472433827
3505	NC_020542	CGA	3	9	175777	175785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433827
3506	NC_020542	CGC	2	6	175797	175802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433828
3507	NC_020542	TCG	2	6	175826	175831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433828
3508	NC_020542	GGA	2	6	175938	175943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433828
3509	NC_020542	CG	3	6	175993	175998	0 %	0 %	50 %	50 %	472433828
3510	NC_020542	TCG	2	6	176003	176008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433828
3511	NC_020542	CGA	2	6	176064	176069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433828
3512	NC_020542	ACC	2	6	176182	176187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433828
3513	NC_020542	ATC	2	6	176230	176235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433828
3514	NC_020542	CGA	2	6	176268	176273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433828
3515	NC_020542	CAT	2	6	176286	176291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433828
3516	NC_020542	GC	3	6	176316	176321	0 %	0 %	50 %	50 %	472433828
3517	NC_020542	CTA	2	6	176401	176406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433828
3518	NC_020542	CAG	2	6	176461	176466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433828
3519	NC_020542	AGG	2	6	176514	176519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433828
3520	NC_020542	CCT	2	6	176567	176572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433829
3521	NC_020542	GTG	2	6	176608	176613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433829
3522	NC_020542	CGG	2	6	176635	176640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433829
3523	NC_020542	GCG	2	6	176687	176692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433829
3524	NC_020542	CTA	2	6	176742	176747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433829
3525	NC_020542	CTGAC	2	10	176873	176882	20 %	20 %	20 %	40 %	472433829
3526	NC_020542	A	7	7	176902	176908	100 %	0 %	0 %	0 %	472433829
3527	NC_020542	CGA	3	9	176928	176936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433829
3528	NC_020542	CGC	2	6	176948	176953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433830
3529	NC_020542	TCG	2	6	176977	176982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433830
3530	NC_020542	GGA	2	6	177089	177094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433830
3531	NC_020542	CG	3	6	177144	177149	0 %	0 %	50 %	50 %	472433830
3532	NC_020542	TCG	2	6	177154	177159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433830
3533	NC_020542	CGA	2	6	177215	177220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433830
3534	NC_020542	ACC	2	6	177333	177338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433830
3535	NC_020542	ATC	2	6	177381	177386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433830
3536	NC_020542	CGA	2	6	177419	177424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433830
3537	NC_020542	CAT	2	6	177437	177442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433830
3538	NC_020542	GC	3	6	177467	177472	0 %	0 %	50 %	50 %	472433830
3539	NC_020542	CTA	2	6	177552	177557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433830
3540	NC_020542	CAG	2	6	177612	177617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433830
3541	NC_020542	GAA	2	6	177689	177694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433830
3542	NC_020542	AAC	2	6	177795	177800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433830
3543	NC_020542	ATC	2	6	177840	177845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433830
3544	NC_020542	A	6	6	177868	177873	100 %	0 %	0 %	0 %	472433830
3545	NC_020542	CGC	2	6	177885	177890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433830
3546	NC_020542	CGC	2	6	177908	177913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433830
3547	NC_020542	TGCG	2	8	178208	178215	0 %	25 %	50 %	25 %	472433831
3548	NC_020542	GAT	2	6	178336	178341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433831
3549	NC_020542	CGA	2	6	178365	178370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433831
3550	NC_020542	CGA	2	6	178380	178385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433831
3551	NC_020542	TGC	2	6	178420	178425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433831
3552	NC_020542	GCG	2	6	178446	178451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433831
3553	NC_020542	TCG	3	9	178457	178465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433831
3554	NC_020542	GA	3	6	178497	178502	50 %	0 %	50 %	0 %	472433831
3555	NC_020542	GGTC	2	8	178527	178534	0 %	25 %	50 %	25 %	472433831
3556	NC_020542	GAA	2	6	178567	178572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433831
3557	NC_020542	CCG	2	6	178578	178583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433831
3558	NC_020542	CG	3	6	178620	178625	0 %	0 %	50 %	50 %	472433831
3559	NC_020542	CCGCG	2	10	178691	178700	0 %	0 %	40 %	60 %	472433831
3560	NC_020542	GATC	2	8	178717	178724	25 %	25 %	25 %	25 %	472433831
3561	NC_020542	CAG	2	6	178732	178737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433831
3562	NC_020542	GCC	2	6	178756	178761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433831
3563	NC_020542	CGC	2	6	178848	178853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433831
3564	NC_020542	GCC	2	6	178933	178938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433831
3565	NC_020542	GAG	2	6	178945	178950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433831
3566	NC_020542	CGC	2	6	178962	178967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433831
3567	NC_020542	ACCA	2	8	178991	178998	50 %	0 %	0 %	50 %	472433831
3568	NC_020542	ACG	2	6	179012	179017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433831
3569	NC_020542	GCA	2	6	179024	179029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433831
3570	NC_020542	GAG	2	6	179056	179061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433831
3571	NC_020542	ACC	2	6	179110	179115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433831
3572	NC_020542	ACC	2	6	179126	179131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433831
3573	NC_020542	CCA	2	6	179146	179151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433831
3574	NC_020542	TAG	2	6	179209	179214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433831
3575	NC_020542	CGA	3	9	179229	179237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433831
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3577	NC_020542	CGC	2	6	179287	179292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433831
3578	NC_020542	TGC	2	6	179350	179355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433831
3579	NC_020542	CGC	2	6	179422	179427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433831
3580	NC_020542	GCG	2	6	179430	179435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433831
3581	NC_020542	GAG	2	6	179476	179481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433831
3582	NC_020542	ATG	2	6	179549	179554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433831
3583	NC_020542	AGC	2	6	179618	179623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433831
3584	NC_020542	TCCGA	2	10	179702	179711	20 %	20 %	20 %	40 %	472433831
3585	NC_020542	GAT	2	6	179743	179748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433831
3586	NC_020542	ACC	2	6	179759	179764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433831
3587	NC_020542	AGCC	2	8	179765	179772	25 %	0 %	25 %	50 %	472433831
3588	NC_020542	CGG	2	6	179802	179807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433831
3589	NC_020542	AGA	2	6	179823	179828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433831
3590	NC_020542	TGG	2	6	179832	179837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433831
3591	NC_020542	ACG	2	6	179894	179899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433831
3592	NC_020542	GCG	2	6	179923	179928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433831
3593	NC_020542	TGG	2	6	179951	179956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433831
3594	NC_020542	CGCCA	2	10	180122	180131	20 %	0 %	20 %	60 %	472433832
3595	NC_020542	CGC	2	6	180134	180139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433832
3596	NC_020542	CGC	2	6	180183	180188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433832
3597	NC_020542	CTC	2	6	180203	180208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433832
3598	NC_020542	CCG	2	6	180224	180229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433832
3599	NC_020542	TTA	2	6	180321	180326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472433832
3600	NC_020542	CG	3	6	180327	180332	0 %	0 %	50 %	50 %	472433832
3601	NC_020542	GGC	2	6	180334	180339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433832
3602	NC_020542	GGCG	2	8	180354	180361	0 %	0 %	75 %	25 %	472433832
3603	NC_020542	AGCA	2	8	180478	180485	50 %	0 %	25 %	25 %	472433832
3604	NC_020542	CGG	2	6	180715	180720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433833
3605	NC_020542	C	7	7	180774	180780	0 %	0 %	0 %	100 %	472433833
3606	NC_020542	CGC	3	9	180944	180952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433834
3607	NC_020542	CCG	2	6	180993	180998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433834
3608	NC_020542	CGGG	2	8	181062	181069	0 %	0 %	75 %	25 %	472433834
3609	NC_020542	TCT	2	6	181085	181090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433834
3610	NC_020542	GGCA	2	8	181093	181100	25 %	0 %	50 %	25 %	472433834
3611	NC_020542	TCA	2	6	181132	181137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433834
3612	NC_020542	TCT	2	6	181163	181168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433834
3613	NC_020542	CGGGC	2	10	181181	181190	0 %	0 %	60 %	40 %	472433834
3614	NC_020542	CGG	2	6	181220	181225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433834
3615	NC_020542	GC	4	8	181245	181252	0 %	0 %	50 %	50 %	472433834
3616	NC_020542	CGT	2	6	181268	181273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433834
3617	NC_020542	GCC	2	6	181308	181313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433834
3618	NC_020542	GGA	2	6	181319	181324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433834
3619	NC_020542	GTC	2	6	181374	181379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433834
3620	NC_020542	CGG	2	6	181411	181416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433834
3621	NC_020542	TTTC	2	8	181443	181450	0 %	75 %	0 %	25 %	472433834
3622	NC_020542	CGG	2	6	181538	181543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433834
3623	NC_020542	GAT	2	6	181575	181580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433834
3624	NC_020542	GC	3	6	181615	181620	0 %	0 %	50 %	50 %	472433834
3625	NC_020542	AGC	4	12	181675	181686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433834
3626	NC_020542	GAT	2	6	181694	181699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433834
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3628	NC_020542	CGG	2	6	181726	181731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433834
3629	NC_020542	TCG	2	6	181756	181761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433834
3630	NC_020542	CAG	2	6	181791	181796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433834
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3632	NC_020542	CGG	2	6	181851	181856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433834
3633	NC_020542	TGGG	2	8	181897	181904	0 %	25 %	75 %	0 %	472433834
3634	NC_020542	GAG	2	6	181956	181961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433834
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3636	NC_020542	GGC	2	6	182057	182062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433834
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3638	NC_020542	T	6	6	182139	182144	0 %	100 %	0 %	0 %	472433835
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3642	NC_020542	ATG	3	9	182299	182307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433835
3643	NC_020542	AGT	2	6	182361	182366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433835
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3645	NC_020542	CGC	4	12	182480	182491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433836
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3647	NC_020542	CTGG	2	8	182616	182623	0 %	25 %	50 %	25 %	472433836
3648	NC_020542	CG	3	6	182757	182762	0 %	0 %	50 %	50 %	472433836
3649	NC_020542	GCA	2	6	182815	182820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433836
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3652	NC_020542	TCC	2	6	182981	182986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433836
3653	NC_020542	CTT	2	6	183004	183009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433836
3654	NC_020542	TCATGC	2	12	183015	183026	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	472433836
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3658	NC_020542	CAG	2	6	183255	183260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433837
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3662	NC_020542	ATC	2	6	183463	183468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433837
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3721	NC_020542	GCA	2	6	187640	187645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433840
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3724	NC_020542	TGCGG	2	10	187784	187793	0 %	20 %	60 %	20 %	472433840
3725	NC_020542	GCTTT	2	10	188044	188053	0 %	60 %	20 %	20 %	472433840
3726	NC_020542	CGG	2	6	188057	188062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433840
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3729	NC_020542	GAC	2	6	188105	188110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433840
3730	NC_020542	CGG	2	6	188197	188202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433840
3731	NC_020542	CCCT	2	8	188397	188404	0 %	25 %	0 %	75 %	472433840
3732	NC_020542	CAC	2	6	188414	188419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433840
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3734	NC_020542	TGC	2	6	188510	188515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433840
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3736	NC_020542	GTC	2	6	188553	188558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433840
3737	NC_020542	GGT	2	6	188576	188581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433840
3738	NC_020542	CCG	2	6	188706	188711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433840
3739	NC_020542	GGC	2	6	188837	188842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433840
3740	NC_020542	TGT	2	6	188918	188923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433840
3741	NC_020542	GC	4	8	188962	188969	0 %	0 %	50 %	50 %	472433840
3742	NC_020542	CGC	2	6	189048	189053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433841
3743	NC_020542	CGA	2	6	189057	189062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433841
3744	NC_020542	CCG	2	6	189081	189086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433841
3745	NC_020542	GACCG	2	10	189088	189097	20 %	0 %	40 %	40 %	472433841
3746	NC_020542	GCC	2	6	189148	189153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433841
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3748	NC_020542	TGGT	2	8	189299	189306	0 %	50 %	50 %	0 %	472433841
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3852	NC_020542	CAT	2	6	194392	194397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433850
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3860	NC_020542	CTGG	2	8	194737	194744	0 %	25 %	50 %	25 %	472433850
3861	NC_020542	CGC	2	6	194792	194797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433850
3862	NC_020542	CA	3	6	194805	194810	50 %	0 %	0 %	50 %	472433850
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3977	NC_020542	CTCA	2	8	199989	199996	25 %	25 %	0 %	50 %	472433856
3978	NC_020542	CG	3	6	200088	200093	0 %	0 %	50 %	50 %	472433856
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3987	NC_020542	GCC	2	6	200574	200579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433856
3988	NC_020542	TCGG	2	8	200584	200591	0 %	25 %	50 %	25 %	472433856
3989	NC_020542	CG	3	6	200638	200643	0 %	0 %	50 %	50 %	472433856
3990	NC_020542	CG	5	10	200654	200663	0 %	0 %	50 %	50 %	472433856
3991	NC_020542	TGCT	2	8	200755	200762	0 %	50 %	25 %	25 %	472433856
3992	NC_020542	TCG	2	6	200781	200786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433856
3993	NC_020542	CT	3	6	200804	200809	0 %	50 %	0 %	50 %	472433856
3994	NC_020542	GCA	2	6	200820	200825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433856
3995	NC_020542	GGCG	2	8	200845	200852	0 %	0 %	75 %	25 %	472433856
3996	NC_020542	GCT	2	6	200920	200925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433857
3997	NC_020542	GCTGG	2	10	200936	200945	0 %	20 %	60 %	20 %	472433857
3998	NC_020542	CTTT	2	8	200950	200957	0 %	75 %	0 %	25 %	472433857
3999	NC_020542	ATG	2	6	200979	200984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433857
4000	NC_020542	TGGA	2	8	200988	200995	25 %	25 %	50 %	0 %	472433857

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