MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP0

Total Repeats: 5506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020542	CGA	2	6	78930	78935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433735
1502	NC_020542	TGAA	2	8	78939	78946	50 %	25 %	25 %	0 %	472433735
1503	NC_020542	CCGAA	2	10	78975	78984	40 %	0 %	20 %	40 %	472433735
1504	NC_020542	GC	3	6	78992	78997	0 %	0 %	50 %	50 %	472433735
1505	NC_020542	CAG	2	6	79045	79050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433735
1506	NC_020542	CCG	2	6	79062	79067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433735
1507	NC_020542	GCG	2	6	79092	79097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433735
1508	NC_020542	TCT	2	6	79119	79124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433735
1509	NC_020542	CTG	2	6	79229	79234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433735
1510	NC_020542	GCG	2	6	79270	79275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433735
1511	NC_020542	GCC	2	6	79335	79340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433736
1512	NC_020542	TCA	2	6	79417	79422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433736
1513	NC_020542	CGC	2	6	79481	79486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433736
1514	NC_020542	CTCG	2	8	79504	79511	0 %	25 %	25 %	50 %	472433736
1515	NC_020542	ATTC	2	8	79534	79541	25 %	50 %	0 %	25 %	472433736
1516	NC_020542	CT	3	6	79563	79568	0 %	50 %	0 %	50 %	472433736
1517	NC_020542	GCA	2	6	79581	79586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433736
1518	NC_020542	CTC	2	6	79604	79609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433736
1519	NC_020542	CAG	2	6	79682	79687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433736
1520	NC_020542	CG	5	10	79732	79741	0 %	0 %	50 %	50 %	472433736
1521	NC_020542	CCT	2	6	79765	79770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433736
1522	NC_020542	GCCCC	2	10	79829	79838	0 %	0 %	20 %	80 %	472433736
1523	NC_020542	CCG	2	6	79841	79846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433736
1524	NC_020542	CGA	2	6	79918	79923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433736
1525	NC_020542	CG	3	6	80204	80209	0 %	0 %	50 %	50 %	472433737
1526	NC_020542	ACC	2	6	80240	80245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433737
1527	NC_020542	GGCG	2	8	80256	80263	0 %	0 %	75 %	25 %	472433737
1528	NC_020542	ACGGG	2	10	80330	80339	20 %	0 %	60 %	20 %	472433737
1529	NC_020542	CAG	2	6	80344	80349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433737
1530	NC_020542	CG	3	6	80460	80465	0 %	0 %	50 %	50 %	472433737
1531	NC_020542	TCG	2	6	80471	80476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433737
1532	NC_020542	GAC	2	6	80482	80487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433737
1533	NC_020542	CG	3	6	80503	80508	0 %	0 %	50 %	50 %	472433737
1534	NC_020542	GAC	3	9	80557	80565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433737
1535	NC_020542	CGC	2	6	80572	80577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433737
1536	NC_020542	GGC	2	6	80611	80616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433737
1537	NC_020542	TCA	2	6	80700	80705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433738
1538	NC_020542	GC	3	6	80725	80730	0 %	0 %	50 %	50 %	472433738
1539	NC_020542	AGC	2	6	80758	80763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433738
1540	NC_020542	ACC	2	6	80775	80780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433738
1541	NC_020542	TGC	2	6	80800	80805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433738
1542	NC_020542	CGA	2	6	80816	80821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433738
1543	NC_020542	GCG	2	6	80834	80839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433738
1544	NC_020542	GGC	2	6	80859	80864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433738
1545	NC_020542	GCA	2	6	80959	80964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433738
1546	NC_020542	GAT	2	6	80967	80972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433738
1547	NC_020542	CAGC	2	8	81023	81030	25 %	0 %	25 %	50 %	472433738
1548	NC_020542	GCC	2	6	81053	81058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433738
1549	NC_020542	TGC	2	6	81102	81107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433738
1550	NC_020542	CGC	2	6	81201	81206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433738
1551	NC_020542	CGC	2	6	81212	81217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433738
1552	NC_020542	CGA	2	6	81221	81226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433738
1553	NC_020542	GCC	2	6	81331	81336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433738
1554	NC_020542	CCA	2	6	81407	81412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433738
1555	NC_020542	AAG	2	6	81439	81444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433738
1556	NC_020542	GCGCC	2	10	81462	81471	0 %	0 %	40 %	60 %	472433738
1557	NC_020542	CG	3	6	81477	81482	0 %	0 %	50 %	50 %	472433738
1558	NC_020542	ATG	2	6	81523	81528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433738
1559	NC_020542	CCA	2	6	81548	81553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433738
1560	NC_020542	CGA	2	6	81581	81586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433738
1561	NC_020542	GC	3	6	81628	81633	0 %	0 %	50 %	50 %	472433738
1562	NC_020542	GCG	2	6	81677	81682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433738
1563	NC_020542	GC	3	6	81755	81760	0 %	0 %	50 %	50 %	472433738
1564	NC_020542	GGAA	2	8	81784	81791	50 %	0 %	50 %	0 %	472433738
1565	NC_020542	CGC	2	6	81819	81824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433738
1566	NC_020542	GCC	2	6	81826	81831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433738
1567	NC_020542	CAA	2	6	81837	81842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433738
1568	NC_020542	AGG	2	6	81851	81856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433738
1569	NC_020542	CAC	2	6	81939	81944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433738
1570	NC_020542	GC	3	6	81948	81953	0 %	0 %	50 %	50 %	472433739
1571	NC_020542	GCCGT	2	10	82011	82020	0 %	20 %	40 %	40 %	472433739
1572	NC_020542	GC	3	6	82026	82031	0 %	0 %	50 %	50 %	472433739
1573	NC_020542	GCG	2	6	82168	82173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433739
1574	NC_020542	GC	4	8	82218	82225	0 %	0 %	50 %	50 %	472433739
1575	NC_020542	CGG	2	6	82300	82305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433739
1576	NC_020542	CCAG	2	8	82306	82313	25 %	0 %	25 %	50 %	472433739
1577	NC_020542	CCTG	2	8	82336	82343	0 %	25 %	25 %	50 %	472433739
1578	NC_020542	AGC	2	6	82350	82355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433739
1579	NC_020542	CCA	2	6	82382	82387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433739
1580	NC_020542	GCT	2	6	82400	82405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433739
1581	NC_020542	GC	3	6	82637	82642	0 %	0 %	50 %	50 %	472433739
1582	NC_020542	CGG	2	6	82646	82651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433739
1583	NC_020542	GCC	2	6	82658	82663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433739
1584	NC_020542	GGC	2	6	82811	82816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433739
1585	NC_020542	CG	3	6	82900	82905	0 %	0 %	50 %	50 %	472433739
1586	NC_020542	ACC	3	9	82928	82936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433740
1587	NC_020542	GCCG	2	8	82948	82955	0 %	0 %	50 %	50 %	472433740
1588	NC_020542	CGG	2	6	83004	83009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433740
1589	NC_020542	GGGC	2	8	83031	83038	0 %	0 %	75 %	25 %	472433740
1590	NC_020542	CAT	2	6	83128	83133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433740
1591	NC_020542	CG	3	6	83277	83282	0 %	0 %	50 %	50 %	472433740
1592	NC_020542	CGC	2	6	83292	83297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433740
1593	NC_020542	CCGCGC	2	12	83336	83347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433740
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1595	NC_020542	CGTGC	2	10	83427	83436	0 %	20 %	40 %	40 %	472433740
1596	NC_020542	TCG	2	6	83496	83501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433740
1597	NC_020542	CAT	2	6	83512	83517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433740
1598	NC_020542	GCG	2	6	83550	83555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433740
1599	NC_020542	GCC	2	6	83564	83569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433740
1600	NC_020542	CGAT	2	8	83612	83619	25 %	25 %	25 %	25 %	472433740
1601	NC_020542	GCC	2	6	83644	83649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433740
1602	NC_020542	CGT	2	6	83670	83675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433740
1603	NC_020542	GTCG	2	8	83734	83741	0 %	25 %	50 %	25 %	472433740
1604	NC_020542	GAA	2	6	83779	83784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433740
1605	NC_020542	CGA	2	6	83802	83807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433740
1606	NC_020542	GCG	2	6	83834	83839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433740
1607	NC_020542	CGG	2	6	83856	83861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433740
1608	NC_020542	GCG	2	6	83862	83867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433740
1609	NC_020542	TCA	2	6	83874	83879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433740
1610	NC_020542	GTCG	2	8	83914	83921	0 %	25 %	50 %	25 %	472433740
1611	NC_020542	CCG	3	9	83947	83955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433740
1612	NC_020542	CGG	2	6	84006	84011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433740
1613	NC_020542	TAG	2	6	84029	84034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433740
1614	NC_020542	CTGCT	2	10	84035	84044	0 %	40 %	20 %	40 %	472433740
1615	NC_020542	GCG	2	6	84069	84074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433740
1616	NC_020542	GAT	2	6	84154	84159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433740
1617	NC_020542	CCG	2	6	84300	84305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433740
1618	NC_020542	GAT	2	6	84310	84315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433740
1619	NC_020542	CGCAGG	2	12	84386	84397	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	472433740
1620	NC_020542	CGG	2	6	84423	84428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433740
1621	NC_020542	GCTCA	2	10	84496	84505	20 %	20 %	20 %	40 %	472433740
1622	NC_020542	CG	3	6	84527	84532	0 %	0 %	50 %	50 %	472433740
1623	NC_020542	CGC	2	6	84561	84566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433740
1624	NC_020542	CG	3	6	84596	84601	0 %	0 %	50 %	50 %	472433740
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1626	NC_020542	CGT	2	6	84712	84717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433741
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1881	NC_020542	GAT	2	6	96971	96976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433757
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1985	NC_020542	CGG	2	6	101411	101416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433760
1986	NC_020542	TGT	2	6	101591	101596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433761
1987	NC_020542	GAAGC	2	10	101606	101615	40 %	0 %	40 %	20 %	472433761
1988	NC_020542	CGC	2	6	101645	101650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433761
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1990	NC_020542	TGC	2	6	101674	101679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433761
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1992	NC_020542	CGACCT	2	12	101702	101713	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	472433761
1993	NC_020542	GTT	2	6	101741	101746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433761
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1995	NC_020542	GCT	2	6	101780	101785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433761
1996	NC_020542	CTG	2	6	101802	101807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433761
1997	NC_020542	GCC	2	6	101822	101827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433761
1998	NC_020542	CAG	2	6	101906	101911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433762
1999	NC_020542	GC	3	6	101924	101929	0 %	0 %	50 %	50 %	472433762
2000	NC_020542	GAC	2	6	101954	101959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433762

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