MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP0

Total Repeats: 5506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020542	GCC	2	6	49107	49112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433710
1002	NC_020542	ATA	2	6	49154	49159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472433710
1003	NC_020542	ACT	2	6	50491	50496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433711
1004	NC_020542	CTG	2	6	50517	50522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433711
1005	NC_020542	CAA	2	6	50658	50663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433711
1006	NC_020542	GCT	2	6	50669	50674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433711
1007	NC_020542	GCC	2	6	50758	50763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433711
1008	NC_020542	GAA	2	6	50808	50813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433711
1009	NC_020542	CGA	2	6	50921	50926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433711
1010	NC_020542	TCA	2	6	50969	50974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433711
1011	NC_020542	CGT	2	6	50976	50981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433711
1012	NC_020542	CGC	2	6	50987	50992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433711
1013	NC_020542	GGAT	2	8	51025	51032	25 %	25 %	50 %	0 %	472433711
1014	NC_020542	GAT	2	6	51191	51196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433712
1015	NC_020542	GGCAG	2	10	51197	51206	20 %	0 %	60 %	20 %	472433712
1016	NC_020542	TTC	2	6	51213	51218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433712
1017	NC_020542	GCG	2	6	51249	51254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433712
1018	NC_020542	GGC	2	6	51275	51280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433712
1019	NC_020542	GCG	2	6	51318	51323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433712
1020	NC_020542	GCC	2	6	51352	51357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433712
1021	NC_020542	CT	3	6	51453	51458	0 %	50 %	0 %	50 %	472433712
1022	NC_020542	CGA	2	6	51505	51510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433712
1023	NC_020542	GGGC	2	8	51611	51618	0 %	0 %	75 %	25 %	472433712
1024	NC_020542	ATC	2	6	51621	51626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433712
1025	NC_020542	AGC	2	6	51652	51657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433712
1026	NC_020542	GAG	3	9	51666	51674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433712
1027	NC_020542	GGC	2	6	51677	51682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433712
1028	NC_020542	AGG	2	6	51688	51693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433712
1029	NC_020542	AAGG	2	8	51789	51796	50 %	0 %	50 %	0 %	472433712
1030	NC_020542	GCC	2	6	51909	51914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433712
1031	NC_020542	ACA	2	6	51958	51963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433712
1032	NC_020542	GAA	3	9	52001	52009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433712
1033	NC_020542	CCA	2	6	52049	52054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433712
1034	NC_020542	CCG	2	6	52067	52072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433712
1035	NC_020542	CGG	2	6	52114	52119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433712
1036	NC_020542	TCCGC	2	10	52120	52129	0 %	20 %	20 %	60 %	472433712
1037	NC_020542	TGG	2	6	52171	52176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433712
1038	NC_020542	GCCTG	2	10	52246	52255	0 %	20 %	40 %	40 %	472433712
1039	NC_020542	CAT	2	6	52381	52386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433713
1040	NC_020542	TTC	2	6	52402	52407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433713
1041	NC_020542	CCGA	2	8	52436	52443	25 %	0 %	25 %	50 %	472433713
1042	NC_020542	AAT	2	6	52517	52522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472433713
1043	NC_020542	GACAAG	2	12	52654	52665	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	472433713
1044	NC_020542	CTG	2	6	52686	52691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433713
1045	NC_020542	T	6	6	52737	52742	0 %	100 %	0 %	0 %	472433713
1046	NC_020542	GCTCT	2	10	52819	52828	0 %	40 %	20 %	40 %	472433713
1047	NC_020542	ACC	2	6	52949	52954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433713
1048	NC_020542	ATG	2	6	52979	52984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433713
1049	NC_020542	CCG	2	6	53393	53398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433714
1050	NC_020542	GCC	2	6	53446	53451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433714
1051	NC_020542	TTC	2	6	53775	53780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433715
1052	NC_020542	GC	3	6	53828	53833	0 %	0 %	50 %	50 %	472433715
1053	NC_020542	GGC	2	6	53834	53839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433715
1054	NC_020542	CG	3	6	53872	53877	0 %	0 %	50 %	50 %	472433715
1055	NC_020542	GCC	3	9	53908	53916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433715
1056	NC_020542	CTCG	2	8	53929	53936	0 %	25 %	25 %	50 %	472433715
1057	NC_020542	CCCG	2	8	54026	54033	0 %	0 %	25 %	75 %	472433715
1058	NC_020542	GTG	3	9	54036	54044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433715
1059	NC_020542	GAGC	2	8	54059	54066	25 %	0 %	50 %	25 %	472433715
1060	NC_020542	ACC	2	6	54150	54155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433715
1061	NC_020542	CGC	2	6	54163	54168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433715
1062	NC_020542	GGCCG	2	10	54196	54205	0 %	0 %	60 %	40 %	472433715
1063	NC_020542	TCG	2	6	54231	54236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433715
1064	NC_020542	CG	3	6	54307	54312	0 %	0 %	50 %	50 %	472433715
1065	NC_020542	CAT	2	6	54358	54363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433715
1066	NC_020542	CCGTC	2	10	57508	57517	0 %	20 %	20 %	60 %	472433716
1067	NC_020542	CCG	2	6	57561	57566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433716
1068	NC_020542	ACG	2	6	57639	57644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433716
1069	NC_020542	CTG	2	6	57665	57670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433716
1070	NC_020542	ATC	2	6	57681	57686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433716
1071	NC_020542	GCT	2	6	57706	57711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433716
1072	NC_020542	CG	4	8	57727	57734	0 %	0 %	50 %	50 %	472433716
1073	NC_020542	TCG	2	6	57759	57764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433716
1074	NC_020542	TGC	2	6	57835	57840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433716
1075	NC_020542	CTGG	2	8	57862	57869	0 %	25 %	50 %	25 %	472433716
1076	NC_020542	GTT	2	6	57935	57940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433716
1077	NC_020542	TCGC	2	8	57981	57988	0 %	25 %	25 %	50 %	472433716
1078	NC_020542	ATC	2	6	57995	58000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433716
1079	NC_020542	GGC	2	6	58039	58044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433716
1080	NC_020542	CGATGC	2	12	58045	58056	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	472433716
1081	NC_020542	ATCCG	2	10	58079	58088	20 %	20 %	20 %	40 %	472433716
1082	NC_020542	CGTCA	2	10	58094	58103	20 %	20 %	20 %	40 %	472433716
1083	NC_020542	CGA	2	6	58156	58161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433716
1084	NC_020542	GGC	2	6	58192	58197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433716
1085	NC_020542	GC	3	6	58196	58201	0 %	0 %	50 %	50 %	472433716
1086	NC_020542	CG	3	6	58222	58227	0 %	0 %	50 %	50 %	472433716
1087	NC_020542	TGGG	2	8	58281	58288	0 %	25 %	75 %	0 %	472433716
1088	NC_020542	TGC	2	6	58393	58398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433716
1089	NC_020542	CGT	2	6	58988	58993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433717
1090	NC_020542	TCG	2	6	58999	59004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433717
1091	NC_020542	ACATGC	2	12	59137	59148	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472433717
1092	NC_020542	GACGC	2	10	59183	59192	20 %	0 %	40 %	40 %	472433717
1093	NC_020542	CGT	2	6	59207	59212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433717
1094	NC_020542	GGCG	2	8	59261	59268	0 %	0 %	75 %	25 %	472433717
1095	NC_020542	CGT	2	6	59355	59360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433717
1096	NC_020542	TGA	2	6	59515	59520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433717
1097	NC_020542	GAT	2	6	59666	59671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433718
1098	NC_020542	TCG	2	6	59688	59693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433718
1099	NC_020542	GGGCAA	2	12	59776	59787	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	472433718
1100	NC_020542	CGCCGG	2	12	59945	59956	0 %	0 %	50 %	50 %	472433718
1101	NC_020542	ATC	2	6	59985	59990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433718
1102	NC_020542	CGC	2	6	60001	60006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433718
1103	NC_020542	AG	3	6	60082	60087	50 %	0 %	50 %	0 %	472433719
1104	NC_020542	CGC	2	6	60094	60099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433719
1105	NC_020542	CGC	2	6	60151	60156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433719
1106	NC_020542	GCC	2	6	60234	60239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433719
1107	NC_020542	AGC	2	6	60272	60277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433719
1108	NC_020542	CGG	3	9	60336	60344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433719
1109	NC_020542	CGT	2	6	60357	60362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433719
1110	NC_020542	CGA	2	6	60384	60389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433719
1111	NC_020542	TCT	2	6	60426	60431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433719
1112	NC_020542	GCA	2	6	60438	60443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433719
1113	NC_020542	TCG	2	6	60458	60463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433719
1114	NC_020542	GCG	2	6	60548	60553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433719
1115	NC_020542	GCC	2	6	60601	60606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433719
1116	NC_020542	CTGG	2	8	60667	60674	0 %	25 %	50 %	25 %	472433719
1117	NC_020542	TCG	2	6	60698	60703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433719
1118	NC_020542	GCC	2	6	60735	60740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433719
1119	NC_020542	GC	3	6	60756	60761	0 %	0 %	50 %	50 %	472433719
1120	NC_020542	AGTCGA	2	12	60777	60788	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472433719
1121	NC_020542	CGA	2	6	60828	60833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433719
1122	NC_020542	GGC	2	6	60874	60879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433719
1123	NC_020542	GCA	2	6	60885	60890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433719
1124	NC_020542	TCG	2	6	60899	60904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433719
1125	NC_020542	GGCC	2	8	60938	60945	0 %	0 %	50 %	50 %	472433719
1126	NC_020542	CGA	3	9	60969	60977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433719
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1216	NC_020542	GCCCTA	2	12	65249	65260	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	472433724
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1219	NC_020542	GCAA	2	8	65338	65345	50 %	0 %	25 %	25 %	472433724
1220	NC_020542	TGC	2	6	65356	65361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433724
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1230	NC_020542	ACCG	2	8	65711	65718	25 %	0 %	25 %	50 %	472433725
1231	NC_020542	CCCCG	2	10	65810	65819	0 %	0 %	20 %	80 %	472433725
1232	NC_020542	CGT	2	6	65858	65863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433725
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1234	NC_020542	CGT	2	6	65990	65995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433725
1235	NC_020542	GCAGGA	2	12	66035	66046	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	472433725
1236	NC_020542	ATC	3	9	66063	66071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433725
1237	NC_020542	CCG	2	6	66076	66081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433725
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1239	NC_020542	GCT	2	6	66218	66223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433725
1240	NC_020542	CCG	2	6	66283	66288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433725
1241	NC_020542	TCA	2	6	66397	66402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433725
1242	NC_020542	ACC	2	6	66417	66422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433725
1243	NC_020542	CGA	2	6	66497	66502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433725
1244	NC_020542	ACG	2	6	66529	66534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433725
1245	NC_020542	CGCGC	2	10	66617	66626	0 %	0 %	40 %	60 %	472433725
1246	NC_020542	TGGC	2	8	66634	66641	0 %	25 %	50 %	25 %	472433725
1247	NC_020542	GCG	2	6	66739	66744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433725
1248	NC_020542	GAA	2	6	66773	66778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433725
1249	NC_020542	CG	3	6	66785	66790	0 %	0 %	50 %	50 %	472433725
1250	NC_020542	CGGCG	2	10	66800	66809	0 %	0 %	60 %	40 %	472433725
1251	NC_020542	ACA	2	6	66829	66834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433725
1252	NC_020542	GGAT	2	8	66862	66869	25 %	25 %	50 %	0 %	472433725
1253	NC_020542	GGAT	2	8	66886	66893	25 %	25 %	50 %	0 %	472433725
1254	NC_020542	CGC	2	6	67009	67014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433725
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1256	NC_020542	GCA	2	6	67171	67176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433725
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1270	NC_020542	CGGC	2	8	67652	67659	0 %	0 %	50 %	50 %	472433726
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1283	NC_020542	CG	3	6	68061	68066	0 %	0 %	50 %	50 %	472433726
1284	NC_020542	CAT	2	6	68068	68073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433726
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1355	NC_020542	GCGG	2	8	70853	70860	0 %	0 %	75 %	25 %	472433728
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1358	NC_020542	CGA	3	9	70899	70907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433729
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1368	NC_020542	CG	3	6	71229	71234	0 %	0 %	50 %	50 %	472433729
1369	NC_020542	CGA	2	6	71238	71243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433729
1370	NC_020542	CG	3	6	71401	71406	0 %	0 %	50 %	50 %	472433729
1371	NC_020542	CGAT	2	8	71533	71540	25 %	25 %	25 %	25 %	472433730
1372	NC_020542	ATG	2	6	71600	71605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433730
1373	NC_020542	CGA	3	9	71628	71636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433730
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1375	NC_020542	GCT	3	9	71661	71669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433730
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