MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP0

Total Repeats: 5506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020542	GCTCG	2	10	26948	26957	0 %	20 %	40 %	40 %	472433689
502	NC_020542	CGA	2	6	26975	26980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433689
503	NC_020542	CAG	2	6	27027	27032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433689
504	NC_020542	GAT	2	6	27062	27067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433689
505	NC_020542	AGC	2	6	27073	27078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433689
506	NC_020542	CCG	2	6	27112	27117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433689
507	NC_020542	GGC	2	6	27122	27127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433689
508	NC_020542	GCC	2	6	27137	27142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433689
509	NC_020542	CGAC	2	8	27148	27155	25 %	0 %	25 %	50 %	472433689
510	NC_020542	AGG	2	6	27208	27213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433689
511	NC_020542	GCG	2	6	27319	27324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433689
512	NC_020542	GAC	2	6	27348	27353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433689
513	NC_020542	CGG	2	6	27388	27393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433689
514	NC_020542	TGC	2	6	27394	27399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433689
515	NC_020542	GAC	2	6	27437	27442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433689
516	NC_020542	CGCGA	2	10	27474	27483	20 %	0 %	40 %	40 %	472433689
517	NC_020542	CGA	2	6	27532	27537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433689
518	NC_020542	CGG	2	6	27539	27544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433689
519	NC_020542	GTG	2	6	27588	27593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433689
520	NC_020542	CAGGTG	2	12	27639	27650	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	472433689
521	NC_020542	GGC	3	9	27660	27668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433689
522	NC_020542	GGT	2	6	27701	27706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433689
523	NC_020542	GCG	2	6	27743	27748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433689
524	NC_020542	GTG	3	9	27750	27758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433689
525	NC_020542	CGTG	2	8	27767	27774	0 %	25 %	50 %	25 %	472433689
526	NC_020542	CGT	2	6	27791	27796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433689
527	NC_020542	GGC	2	6	27809	27814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433689
528	NC_020542	CTGC	2	8	27834	27841	0 %	25 %	25 %	50 %	472433689
529	NC_020542	GGC	2	6	27861	27866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433689
530	NC_020542	GCTT	2	8	27918	27925	0 %	50 %	25 %	25 %	472433689
531	NC_020542	CTG	2	6	27936	27941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433689
532	NC_020542	CTC	2	6	27942	27947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433689
533	NC_020542	CGC	2	6	27974	27979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433689
534	NC_020542	TGG	2	6	28009	28014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433689
535	NC_020542	GCG	2	6	28015	28020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433689
536	NC_020542	CGG	2	6	28060	28065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433689
537	NC_020542	TCA	2	6	28204	28209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433689
538	NC_020542	GTC	2	6	28296	28301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433689
539	NC_020542	CGG	2	6	28304	28309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433689
540	NC_020542	CTT	2	6	28326	28331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433689
541	NC_020542	TGC	2	6	28342	28347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433689
542	NC_020542	GAG	2	6	28404	28409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433689
543	NC_020542	GAC	2	6	28419	28424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433689
544	NC_020542	AAC	2	6	28443	28448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433689
545	NC_020542	GATG	2	8	28456	28463	25 %	25 %	50 %	0 %	472433689
546	NC_020542	CGG	2	6	28543	28548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433690
547	NC_020542	ATC	2	6	28584	28589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433690
548	NC_020542	GAT	2	6	28619	28624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433690
549	NC_020542	TCGAT	2	10	28705	28714	20 %	40 %	20 %	20 %	472433690
550	NC_020542	GGC	2	6	28796	28801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433690
551	NC_020542	GAT	2	6	28858	28863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433690
552	NC_020542	GCC	2	6	28869	28874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433690
553	NC_020542	AGG	2	6	28982	28987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433690
554	NC_020542	GAT	3	9	28995	29003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433690
555	NC_020542	TGC	2	6	29018	29023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433691
556	NC_020542	CCG	2	6	29024	29029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433691
557	NC_020542	GAAA	2	8	29062	29069	75 %	0 %	25 %	0 %	472433691
558	NC_020542	GCC	2	6	29070	29075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433691
559	NC_020542	AGC	2	6	29090	29095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433691
560	NC_020542	GGC	2	6	29138	29143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433691
561	NC_020542	TCG	2	6	29177	29182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433691
562	NC_020542	GCG	2	6	29214	29219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433691
563	NC_020542	CCG	2	6	29233	29238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433691
564	NC_020542	ATG	2	6	29239	29244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433691
565	NC_020542	CG	3	6	29486	29491	0 %	0 %	50 %	50 %	472433692
566	NC_020542	CGT	2	6	29498	29503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433692
567	NC_020542	CAT	2	6	29606	29611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433692
568	NC_020542	CGA	2	6	29618	29623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433692
569	NC_020542	GC	4	8	29708	29715	0 %	0 %	50 %	50 %	472433692
570	NC_020542	GGCG	2	8	29762	29769	0 %	0 %	75 %	25 %	472433692
571	NC_020542	GATC	2	8	29770	29777	25 %	25 %	25 %	25 %	472433692
572	NC_020542	ACGCG	2	10	29784	29793	20 %	0 %	40 %	40 %	472433692
573	NC_020542	GGA	2	6	29822	29827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433692
574	NC_020542	CGT	2	6	29957	29962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433693
575	NC_020542	CGG	2	6	29968	29973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433693
576	NC_020542	CGG	2	6	30032	30037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433693
577	NC_020542	GGC	2	6	30038	30043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433693
578	NC_020542	CGC	2	6	30110	30115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433693
579	NC_020542	GGCG	2	8	30167	30174	0 %	0 %	75 %	25 %	472433693
580	NC_020542	CTG	2	6	30189	30194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433693
581	NC_020542	CGA	2	6	30242	30247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433693
582	NC_020542	TCGC	2	8	30263	30270	0 %	25 %	25 %	50 %	472433693
583	NC_020542	CAT	2	6	30278	30283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433693
584	NC_020542	CTG	3	9	30306	30314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433693
585	NC_020542	GC	3	6	30322	30327	0 %	0 %	50 %	50 %	472433693
586	NC_020542	TGCCG	2	10	30332	30341	0 %	20 %	40 %	40 %	472433693
587	NC_020542	CGC	2	6	30344	30349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433693
588	NC_020542	TGA	2	6	30361	30366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433693
589	NC_020542	GCT	2	6	30398	30403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433693
590	NC_020542	GGA	2	6	30416	30421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433693
591	NC_020542	TCA	2	6	30460	30465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433693
592	NC_020542	TCG	2	6	30478	30483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433693
593	NC_020542	CTG	2	6	30495	30500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433693
594	NC_020542	GAG	2	6	30507	30512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433693
595	NC_020542	ATG	2	6	30513	30518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433693
596	NC_020542	GAT	2	6	30520	30525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433693
597	NC_020542	ACA	2	6	30537	30542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433694
598	NC_020542	CTG	3	9	30578	30586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433694
599	NC_020542	CTT	2	6	30607	30612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433694
600	NC_020542	CTT	2	6	30622	30627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433694
601	NC_020542	GC	3	6	30639	30644	0 %	0 %	50 %	50 %	472433694
602	NC_020542	CGC	2	6	30736	30741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433694
603	NC_020542	TGC	2	6	30759	30764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433694
604	NC_020542	GGC	2	6	30776	30781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433694
605	NC_020542	ATG	2	6	30839	30844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433694
606	NC_020542	CGT	2	6	30865	30870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433694
607	NC_020542	CTGC	2	8	30880	30887	0 %	25 %	25 %	50 %	472433694
608	NC_020542	GCT	2	6	30889	30894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433694
609	NC_020542	ACC	2	6	30935	30940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433694
610	NC_020542	CGG	2	6	30967	30972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433694
611	NC_020542	GTGCTG	2	12	30989	31000	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	472433694
612	NC_020542	CTG	2	6	31025	31030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433694
613	NC_020542	CAT	2	6	31048	31053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433694
614	NC_020542	CG	4	8	31087	31094	0 %	0 %	50 %	50 %	472433694
615	NC_020542	AGG	2	6	31115	31120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433694
616	NC_020542	GTT	2	6	31158	31163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433695
617	NC_020542	TGCC	2	8	31188	31195	0 %	25 %	25 %	50 %	472433695
618	NC_020542	GCG	2	6	31276	31281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433695
619	NC_020542	GCC	2	6	31300	31305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433695
620	NC_020542	GCTGCC	2	12	31308	31319	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	472433695
621	NC_020542	GC	3	6	31338	31343	0 %	0 %	50 %	50 %	472433695
622	NC_020542	GC	3	6	31417	31422	0 %	0 %	50 %	50 %	472433695
623	NC_020542	CGC	2	6	31507	31512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433695
624	NC_020542	ACC	2	6	31516	31521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433695
625	NC_020542	AGG	2	6	31526	31531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433695
626	NC_020542	GC	3	6	31533	31538	0 %	0 %	50 %	50 %	472433695
627	NC_020542	GC	3	6	31724	31729	0 %	0 %	50 %	50 %	472433695
628	NC_020542	GC	3	6	31769	31774	0 %	0 %	50 %	50 %	472433695
629	NC_020542	CGG	2	6	31818	31823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433695
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749	NC_020542	GGC	2	6	37456	37461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433701
750	NC_020542	TGC	2	6	37496	37501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433701
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753	NC_020542	TTGG	2	8	37713	37720	0 %	50 %	50 %	0 %	472433702
754	NC_020542	TTC	2	6	37825	37830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433702
755	NC_020542	TCG	2	6	37852	37857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433702
756	NC_020542	TCCT	2	8	37859	37866	0 %	50 %	0 %	50 %	472433702
757	NC_020542	GC	4	8	37886	37893	0 %	0 %	50 %	50 %	472433702
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761	NC_020542	AC	3	6	38080	38085	50 %	0 %	0 %	50 %	472433702
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775	NC_020542	TTG	2	6	38680	38685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433702
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786	NC_020542	GCC	2	6	39251	39256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433702
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789	NC_020542	CGC	2	6	39422	39427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433702
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793	NC_020542	TTC	2	6	39636	39641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433702
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874	NC_020542	GGC	2	6	43251	43256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433704
875	NC_020542	CGAGC	2	10	43257	43266	20 %	0 %	40 %	40 %	472433704
876	NC_020542	GCG	2	6	43275	43280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433704
877	NC_020542	GCA	2	6	43361	43366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433704
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