MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 1060

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020540	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	470200147
2	NC_020540	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	470200148
3	NC_020540	TGGTA	2	10	3602	3611	20 %	40 %	40 %	0 %	470200149
4	NC_020540	GATTT	2	10	6168	6177	20 %	60 %	20 %	0 %	523414888
5	NC_020540	TCAAT	2	10	11676	11685	40 %	40 %	0 %	20 %	523414890
6	NC_020540	ATTAA	2	10	11997	12006	60 %	40 %	0 %	0 %	523414890
7	NC_020540	TACAC	2	10	15944	15953	40 %	20 %	0 %	40 %	523414892
8	NC_020540	TAAAT	2	10	15954	15963	60 %	40 %	0 %	0 %	523414892
9	NC_020540	AGTGA	2	10	27227	27236	40 %	20 %	40 %	0 %	523414894
10	NC_020540	ATTTT	2	10	27926	27935	20 %	80 %	0 %	0 %	523414895
11	NC_020540	TTGAT	2	10	28115	28124	20 %	60 %	20 %	0 %	523414895
12	NC_020540	TGGTG	2	10	30199	30208	0 %	40 %	60 %	0 %	470200167
13	NC_020540	AGCAG	2	10	37447	37456	40 %	0 %	40 %	20 %	470200172
14	NC_020540	GGTCA	2	10	37811	37820	20 %	20 %	40 %	20 %	470200172
15	NC_020540	TTGGG	2	10	38207	38216	0 %	40 %	60 %	0 %	470200173
16	NC_020540	GCAGG	2	10	42287	42296	20 %	0 %	60 %	20 %	523414899
17	NC_020540	CTCAG	2	10	43644	43653	20 %	20 %	20 %	40 %	523414901
18	NC_020540	TTTAT	2	10	44230	44239	20 %	80 %	0 %	0 %	523414902
19	NC_020540	ATAGA	2	10	45274	45283	60 %	20 %	20 %	0 %	523414902
20	NC_020540	TCGGA	2	10	48505	48514	20 %	20 %	40 %	20 %	523414903
21	NC_020540	GCTTT	2	10	51250	51259	0 %	60 %	20 %	20 %	470200185
22	NC_020540	TTTTC	2	10	51448	51457	0 %	80 %	0 %	20 %	470200185
23	NC_020540	AAACC	2	10	51513	51522	60 %	0 %	0 %	40 %	470200185
24	NC_020540	ATGGT	2	10	53286	53295	20 %	40 %	40 %	0 %	523414904
25	NC_020540	ATTCA	2	10	53970	53979	40 %	40 %	0 %	20 %	523414904
26	NC_020540	TTTTA	2	10	57744	57753	20 %	80 %	0 %	0 %	470200190
27	NC_020540	AAAGC	2	10	57937	57946	60 %	0 %	20 %	20 %	470200190
28	NC_020540	TTTGG	2	10	61901	61910	0 %	60 %	40 %	0 %	470200197
29	NC_020540	TTCAC	2	10	62257	62266	20 %	40 %	0 %	40 %	470200198
30	NC_020540	TCCAA	2	10	69037	69046	40 %	20 %	0 %	40 %	523414908
31	NC_020540	CTTGG	2	10	83245	83254	0 %	40 %	40 %	20 %	523414911
32	NC_020540	TCTTA	2	10	83663	83672	20 %	60 %	0 %	20 %	523414911
33	NC_020540	CACTC	2	10	85208	85217	20 %	20 %	0 %	60 %	523414912
34	NC_020540	GATTG	2	10	87469	87478	20 %	40 %	40 %	0 %	523414913
35	NC_020540	TTGAT	2	10	97628	97637	20 %	60 %	20 %	0 %	523414914
36	NC_020540	AAATC	2	10	97796	97805	60 %	20 %	0 %	20 %	523414914
37	NC_020540	TGAAG	2	10	103112	103121	40 %	20 %	40 %	0 %	470200241
38	NC_020540	TTTAG	2	10	104971	104980	20 %	60 %	20 %	0 %	470200243
39	NC_020540	GTGTT	2	10	109375	109384	0 %	60 %	40 %	0 %	470200249
40	NC_020540	TAGGT	2	10	110198	110207	20 %	40 %	40 %	0 %	523414920
41	NC_020540	TAAAT	2	10	110331	110340	60 %	40 %	0 %	0 %	523414920
42	NC_020540	GAGAG	2	10	111365	111374	40 %	0 %	60 %	0 %	523414921
43	NC_020540	TTTAA	2	10	111702	111711	40 %	60 %	0 %	0 %	523414921
44	NC_020540	TGAAT	2	10	112415	112424	40 %	40 %	20 %	0 %	523414921
45	NC_020540	TATTT	2	10	113856	113865	20 %	80 %	0 %	0 %	470200252
46	NC_020540	ATGGC	2	10	115467	115476	20 %	20 %	40 %	20 %	523414922
47	NC_020540	ATGTT	2	10	115657	115666	20 %	60 %	20 %	0 %	523414922
48	NC_020540	TTTTA	2	10	121101	121110	20 %	80 %	0 %	0 %	523414926
49	NC_020540	GCTTT	3	15	121677	121691	0 %	60 %	20 %	20 %	523414926
50	NC_020540	GTCAT	2	10	121996	122005	20 %	40 %	20 %	20 %	523414926
51	NC_020540	TTGTT	2	10	122551	122560	0 %	80 %	20 %	0 %	470200263
52	NC_020540	GTTAA	2	10	123341	123350	40 %	40 %	20 %	0 %	470200264
53	NC_020540	AATAA	2	10	123370	123379	80 %	20 %	0 %	0 %	470200264
54	NC_020540	TACCT	2	10	125860	125869	20 %	40 %	0 %	40 %	470200267
55	NC_020540	AATCA	2	10	126639	126648	60 %	20 %	0 %	20 %	470200268
56	NC_020540	TCATG	2	10	127246	127255	20 %	40 %	20 %	20 %	470200269
57	NC_020540	AACAA	2	10	128392	128401	80 %	0 %	0 %	20 %	470200270
58	NC_020540	GCAAA	2	10	129609	129618	60 %	0 %	20 %	20 %	470200272
59	NC_020540	TTTTA	2	10	130704	130713	20 %	80 %	0 %	0 %	470200272
60	NC_020540	AAAGC	2	10	131892	131901	60 %	0 %	20 %	20 %	523414928
61	NC_020540	AGTTC	2	10	132142	132151	20 %	40 %	20 %	20 %	523414928
62	NC_020540	GCTGA	2	10	132162	132171	20 %	20 %	40 %	20 %	523414928
63	NC_020540	ATCGC	2	10	135536	135545	20 %	20 %	20 %	40 %	470200278
64	NC_020540	TTGGG	2	10	136939	136948	0 %	40 %	60 %	0 %	470200279
65	NC_020540	GAAAA	2	10	142249	142258	80 %	0 %	20 %	0 %	470200284
66	NC_020540	GGATT	2	10	142366	142375	20 %	40 %	40 %	0 %	470200284
67	NC_020540	TTTTG	2	10	142886	142895	0 %	80 %	20 %	0 %	470200284
68	NC_020540	TCATG	2	10	144391	144400	20 %	40 %	20 %	20 %	523414930
69	NC_020540	GTATC	2	10	145652	145661	20 %	40 %	20 %	20 %	470200287
70	NC_020540	GTCGC	2	10	146091	146100	0 %	20 %	40 %	40 %	523414931
71	NC_020540	CTTGT	2	10	151489	151498	0 %	60 %	20 %	20 %	523414934
72	NC_020540	GCAAC	2	10	152422	152431	40 %	0 %	20 %	40 %	470200295
73	NC_020540	AAGGT	2	10	154104	154113	40 %	20 %	40 %	0 %	470200295
74	NC_020540	ATTTG	2	10	160388	160397	20 %	60 %	20 %	0 %	470200302
75	NC_020540	CAAGA	2	10	162310	162319	60 %	0 %	20 %	20 %	470200303
76	NC_020540	TTTGG	2	10	163478	163487	0 %	60 %	40 %	0 %	470200304
77	NC_020540	TGGAT	2	10	164427	164436	20 %	40 %	40 %	0 %	470200305
78	NC_020540	TTGCC	2	10	164802	164811	0 %	40 %	20 %	40 %	470200305
79	NC_020540	ACCTA	2	10	165499	165508	40 %	20 %	0 %	40 %	470200305
80	NC_020540	ATTTT	2	10	170364	170373	20 %	80 %	0 %	0 %	470200309
81	NC_020540	TCTAT	2	10	171352	171361	20 %	60 %	0 %	20 %	470200310
82	NC_020540	GTTTG	2	10	171892	171901	0 %	60 %	40 %	0 %	470200310
83	NC_020540	TGAAA	2	10	172067	172076	60 %	20 %	20 %	0 %	470200311
84	NC_020540	TTGAT	2	10	172315	172324	20 %	60 %	20 %	0 %	470200311
85	NC_020540	TAGGT	2	10	173285	173294	20 %	40 %	40 %	0 %	470200314
86	NC_020540	CCAAA	2	10	174662	174671	60 %	0 %	0 %	40 %	523414937
87	NC_020540	TCCCA	2	10	174864	174873	20 %	20 %	0 %	60 %	523414937
88	NC_020540	GCCAA	2	10	175711	175720	40 %	0 %	20 %	40 %	523414938
89	NC_020540	GGAAA	2	10	178661	178670	60 %	0 %	40 %	0 %	470200320
90	NC_020540	TAATC	2	10	181486	181495	40 %	40 %	0 %	20 %	470200322
91	NC_020540	TTTAC	2	10	185618	185627	20 %	60 %	0 %	20 %	470200327
92	NC_020540	CAAAC	2	10	188137	188146	60 %	0 %	0 %	40 %	470200330
93	NC_020540	AGATA	2	10	188251	188260	60 %	20 %	20 %	0 %	470200330
94	NC_020540	ATATA	2	10	189040	189049	60 %	40 %	0 %	0 %	470200330
95	NC_020540	TAAAG	2	10	192213	192222	60 %	20 %	20 %	0 %	470200333
96	NC_020540	ATCAA	2	10	193360	193369	60 %	20 %	0 %	20 %	470200334
97	NC_020540	AAACA	2	10	196201	196210	80 %	0 %	0 %	20 %	470200337
98	NC_020540	TCCAA	2	10	198020	198029	40 %	20 %	0 %	40 %	470200339
99	NC_020540	AAATA	2	10	198262	198271	80 %	20 %	0 %	0 %	470200339
100	NC_020540	GTTTT	2	10	201634	201643	0 %	80 %	20 %	0 %	523414948
101	NC_020540	TCATG	2	10	202260	202269	20 %	40 %	20 %	20 %	470200344
102	NC_020540	TTGTC	2	10	204346	204355	0 %	60 %	20 %	20 %	470200346
103	NC_020540	TCGTC	2	10	205188	205197	0 %	40 %	20 %	40 %	470200347
104	NC_020540	CTATG	2	10	207315	207324	20 %	40 %	20 %	20 %	470200349
105	NC_020540	CTTAT	2	10	208592	208601	20 %	60 %	0 %	20 %	470200350
106	NC_020540	GAGCA	2	10	209149	209158	40 %	0 %	40 %	20 %	470200351
107	NC_020540	GTTTC	2	10	209877	209886	0 %	60 %	20 %	20 %	470200352
108	NC_020540	CAACA	2	10	211956	211965	60 %	0 %	0 %	40 %	470200352
109	NC_020540	CTATG	2	10	216330	216339	20 %	40 %	20 %	20 %	523414953
110	NC_020540	TATCT	2	10	217946	217955	20 %	60 %	0 %	20 %	470200358
111	NC_020540	AGTTG	2	10	220244	220253	20 %	40 %	40 %	0 %	470200360
112	NC_020540	TTTGG	2	10	220389	220398	0 %	60 %	40 %	0 %	470200360
113	NC_020540	CAGCG	2	10	220672	220681	20 %	0 %	40 %	40 %	470200360
114	NC_020540	GACTT	2	10	224882	224891	20 %	40 %	20 %	20 %	523414955
115	NC_020540	AAACA	2	10	225193	225202	80 %	0 %	0 %	20 %	523414955
116	NC_020540	TTGCG	2	10	227090	227099	0 %	40 %	40 %	20 %	523414955
117	NC_020540	ACAAA	2	10	229241	229250	80 %	0 %	0 %	20 %	523414957
118	NC_020540	TCTTT	2	10	229766	229775	0 %	80 %	0 %	20 %	470200367
119	NC_020540	TTAAA	2	10	232966	232975	60 %	40 %	0 %	0 %	523414958
120	NC_020540	GATGC	2	10	239827	239836	20 %	20 %	40 %	20 %	470200374
121	NC_020540	GATTT	2	10	242378	242387	20 %	60 %	20 %	0 %	523414960
122	NC_020540	TTTGA	2	10	243056	243065	20 %	60 %	20 %	0 %	523414960
123	NC_020540	TTTGA	2	10	243584	243593	20 %	60 %	20 %	0 %	523414960
124	NC_020540	TGATT	2	10	246099	246108	20 %	60 %	20 %	0 %	523414963
125	NC_020540	TCATT	2	10	251071	251080	20 %	60 %	0 %	20 %	470200388
126	NC_020540	GTCAG	2	10	252791	252800	20 %	20 %	40 %	20 %	470200390
127	NC_020540	TAGCG	2	10	254194	254203	20 %	20 %	40 %	20 %	523414965
128	NC_020540	TAAGG	2	10	256093	256102	40 %	20 %	40 %	0 %	523414966
129	NC_020540	AACAA	2	10	256790	256799	80 %	0 %	0 %	20 %	523414967
130	NC_020540	ATCAA	2	10	260490	260499	60 %	20 %	0 %	20 %	470200401
131	NC_020540	TTCAT	2	10	260829	260838	20 %	60 %	0 %	20 %	470200401
132	NC_020540	AGTTT	2	10	263485	263494	20 %	60 %	20 %	0 %	470200405
133	NC_020540	ATTGA	2	10	265223	265232	40 %	40 %	20 %	0 %	470200407
134	NC_020540	ATTTT	2	10	266454	266463	20 %	80 %	0 %	0 %	523414968
135	NC_020540	TTACA	2	10	267544	267553	40 %	40 %	0 %	20 %	523414968
136	NC_020540	GTTTT	2	10	270992	271001	0 %	80 %	20 %	0 %	470200412
137	NC_020540	ATTTA	2	10	271119	271128	40 %	60 %	0 %	0 %	470200412
138	NC_020540	ACTTG	2	10	271248	271257	20 %	40 %	20 %	20 %	470200412
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141	NC_020540	ATATT	2	10	275104	275113	40 %	60 %	0 %	0 %	470200416
142	NC_020540	GTTCT	2	10	276487	276496	0 %	60 %	20 %	20 %	470200418
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147	NC_020540	GCTTG	2	10	291661	291670	0 %	40 %	40 %	20 %	523414973
148	NC_020540	TATCA	2	10	292010	292019	40 %	40 %	0 %	20 %	523414973
149	NC_020540	GCAGA	2	10	294235	294244	40 %	0 %	40 %	20 %	470200429
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151	NC_020540	GATGA	2	10	297192	297201	40 %	20 %	40 %	0 %	523414977
152	NC_020540	AAGGC	2	10	299268	299277	40 %	0 %	40 %	20 %	470200434
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155	NC_020540	ATTTT	2	10	306011	306020	20 %	80 %	0 %	0 %	470200440
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159	NC_020540	TTCCA	2	10	308405	308414	20 %	40 %	0 %	40 %	470200443
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162	NC_020540	CATTA	2	10	309855	309864	40 %	40 %	0 %	20 %	470200445
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164	NC_020540	TATGA	2	10	314664	314673	40 %	40 %	20 %	0 %	470200450
165	NC_020540	AAGCA	2	10	314818	314827	60 %	0 %	20 %	20 %	470200450
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172	NC_020540	AGCAA	2	10	321134	321143	60 %	0 %	20 %	20 %	523414981
173	NC_020540	AGCAA	2	10	321329	321338	60 %	0 %	20 %	20 %	523414981
174	NC_020540	AACAT	2	10	322510	322519	60 %	20 %	0 %	20 %	470200457
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176	NC_020540	AGAAA	2	10	323787	323796	80 %	0 %	20 %	0 %	523414982
177	NC_020540	ACTTT	2	10	323982	323991	20 %	60 %	0 %	20 %	523414982
178	NC_020540	ATTTT	2	10	326478	326487	20 %	80 %	0 %	0 %	470200461
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201	NC_020540	CGCTA	2	10	361410	361419	20 %	20 %	20 %	40 %	470200505
202	NC_020540	CCTCT	2	10	363656	363665	0 %	40 %	0 %	60 %	523415001
203	NC_020540	GTTTT	2	10	363962	363971	0 %	80 %	20 %	0 %	523415001
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209	NC_020540	TGGAA	2	10	372258	372267	40 %	20 %	40 %	0 %	470200512
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241	NC_020540	TTAGC	2	10	431325	431334	20 %	40 %	20 %	20 %	523415021
242	NC_020540	GTAAT	2	10	431387	431396	40 %	40 %	20 %	0 %	523415021
243	NC_020540	CCCTA	2	10	435631	435640	20 %	20 %	0 %	60 %	470200582
244	NC_020540	AGGAA	2	10	435815	435824	60 %	0 %	40 %	0 %	470200582
245	NC_020540	CAGCA	2	10	437389	437398	40 %	0 %	20 %	40 %	470200583
246	NC_020540	AAAGC	2	10	440870	440879	60 %	0 %	20 %	20 %	523415022
247	NC_020540	AGTTT	2	10	440980	440989	20 %	60 %	20 %	0 %	523415022
248	NC_020540	GCAAA	2	10	444910	444919	60 %	0 %	20 %	20 %	470200591
249	NC_020540	GCCTA	2	10	445562	445571	20 %	20 %	20 %	40 %	470200591
250	NC_020540	TATAA	2	10	446530	446539	60 %	40 %	0 %	0 %	523415024
251	NC_020540	TTGAT	2	10	447238	447247	20 %	60 %	20 %	0 %	470200593
252	NC_020540	GATTT	2	10	448673	448682	20 %	60 %	20 %	0 %	470200594
253	NC_020540	ATTAA	2	10	451626	451635	60 %	40 %	0 %	0 %	523415025
254	NC_020540	AATTG	2	10	452000	452009	40 %	40 %	20 %	0 %	523415025
255	NC_020540	AAGAG	2	10	452234	452243	60 %	0 %	40 %	0 %	523415025
256	NC_020540	GTAAT	2	10	454920	454929	40 %	40 %	20 %	0 %	523415026
257	NC_020540	TTTAG	2	10	457619	457628	20 %	60 %	20 %	0 %	470200602
258	NC_020540	ATCTT	2	10	459088	459097	20 %	60 %	0 %	20 %	470200604
259	NC_020540	TTCAG	2	10	459642	459651	20 %	40 %	20 %	20 %	470200605
260	NC_020540	TATCA	2	10	460308	460317	40 %	40 %	0 %	20 %	470200605
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262	NC_020540	CAGCT	2	10	464196	464205	20 %	20 %	20 %	40 %	470200609
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