MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 21477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020540	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200146
2	NC_020540	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200146
3	NC_020540	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200146
4	NC_020540	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200146
5	NC_020540	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200146
6	NC_020540	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200146
7	NC_020540	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200146
8	NC_020540	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200146
9	NC_020540	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200146
10	NC_020540	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200146
11	NC_020540	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200146
12	NC_020540	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200146
13	NC_020540	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470200146
14	NC_020540	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200146
15	NC_020540	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200146
16	NC_020540	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200146
17	NC_020540	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200146
18	NC_020540	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200146
19	NC_020540	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200147
20	NC_020540	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200147
21	NC_020540	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200147
22	NC_020540	ATT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200147
23	NC_020540	AAC	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200147
24	NC_020540	GTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200147
25	NC_020540	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200147
26	NC_020540	ATT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200147
27	NC_020540	TAT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200147
28	NC_020540	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200147
29	NC_020540	CAG	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200147
30	NC_020540	CAG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200147
31	NC_020540	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200147
32	NC_020540	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200147
33	NC_020540	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200147
34	NC_020540	CTT	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200147
35	NC_020540	GAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200147
36	NC_020540	ATG	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200148
37	NC_020540	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200149
38	NC_020540	GCT	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200149
39	NC_020540	TGA	3	9	3800	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200149
40	NC_020540	AGA	2	6	4046	4051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200149
41	NC_020540	GTT	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200149
42	NC_020540	AAC	2	6	4085	4090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200149
43	NC_020540	AGT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200149
44	NC_020540	AGA	3	9	4223	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200149
45	NC_020540	AGA	2	6	4259	4264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200149
46	NC_020540	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200149
47	NC_020540	ATC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200149
48	NC_020540	CAG	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200149
49	NC_020540	GCT	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200149
50	NC_020540	TAT	2	6	4421	4426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200149
51	NC_020540	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200149
52	NC_020540	AAG	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200149
53	NC_020540	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200149
54	NC_020540	TGT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200149
55	NC_020540	CAT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200149
56	NC_020540	GAA	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414887
57	NC_020540	TTG	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523414887
58	NC_020540	GAT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414887
59	NC_020540	TTA	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414887
60	NC_020540	CTA	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414887
61	NC_020540	AAT	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414887
62	NC_020540	CTA	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414887
63	NC_020540	ATG	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414887
64	NC_020540	CAG	2	6	4990	4995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414887
65	NC_020540	GAC	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414887
66	NC_020540	TTA	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414887
67	NC_020540	ATA	2	6	5131	5136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414887
68	NC_020540	ATT	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414888
69	NC_020540	ACC	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523414888
70	NC_020540	GAT	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
71	NC_020540	TGA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
72	NC_020540	TGA	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
73	NC_020540	TTA	2	6	5736	5741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414888
74	NC_020540	GAT	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
75	NC_020540	AAC	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414888
76	NC_020540	TTA	2	6	5898	5903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414888
77	NC_020540	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
78	NC_020540	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414888
79	NC_020540	ATT	2	6	6070	6075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414888
80	NC_020540	ATT	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414888
81	NC_020540	GAT	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
82	NC_020540	AGA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414888
83	NC_020540	ACT	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414888
84	NC_020540	CTT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523414888
85	NC_020540	AAC	2	6	6424	6429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414888
86	NC_020540	TGA	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
87	NC_020540	ACG	2	6	6640	6645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414888
88	NC_020540	TAG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
89	NC_020540	CTG	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414888
90	NC_020540	TAA	2	6	6895	6900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414888
91	NC_020540	ATG	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
92	NC_020540	TGA	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
93	NC_020540	AAG	2	6	6991	6996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414888
94	NC_020540	GAT	2	6	7025	7030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
95	NC_020540	TGA	3	9	7048	7056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
96	NC_020540	AGA	2	6	7075	7080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414888
97	NC_020540	TAG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
98	NC_020540	CAG	2	6	7256	7261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414888
99	NC_020540	GTA	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
100	NC_020540	ATT	2	6	7385	7390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414888
101	NC_020540	AAC	2	6	7461	7466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414888
102	NC_020540	AAT	2	6	7646	7651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414888
103	NC_020540	GGA	2	6	7694	7699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523414888
104	NC_020540	ATG	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
105	NC_020540	ACA	2	6	7871	7876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414888
106	NC_020540	ATC	2	6	7877	7882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414888
107	NC_020540	GAA	2	6	7980	7985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414888
108	NC_020540	GAG	2	6	8127	8132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523414888
109	NC_020540	GAT	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
110	NC_020540	AAT	2	6	8501	8506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414888
111	NC_020540	CTT	2	6	8532	8537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523414888
112	NC_020540	ATT	2	6	8559	8564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414888
113	NC_020540	AGA	2	6	8668	8673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414888
114	NC_020540	ATA	2	6	8737	8742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414888
115	NC_020540	TTA	2	6	8936	8941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200153
116	NC_020540	CGT	2	6	8944	8949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200153
117	NC_020540	AAG	2	6	8960	8965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200153
118	NC_020540	GAA	2	6	9163	9168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200153
119	NC_020540	AAT	2	6	9188	9193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414889
120	NC_020540	GAA	4	12	9230	9241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414889
121	NC_020540	ATG	2	6	9284	9289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414889
122	NC_020540	GGT	2	6	9358	9363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414889
123	NC_020540	GAT	2	6	9437	9442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414889
124	NC_020540	ATG	3	9	9529	9537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414889
125	NC_020540	ATT	2	6	9675	9680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200154
126	NC_020540	CAG	2	6	9878	9883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200154
127	NC_020540	TTA	2	6	9911	9916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200154
128	NC_020540	CTT	3	9	10106	10114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200154
129	NC_020540	TTA	2	6	10170	10175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200154
130	NC_020540	TGA	2	6	10182	10187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200154
131	NC_020540	AAG	2	6	10205	10210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200154
132	NC_020540	ATA	2	6	10268	10273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200154
133	NC_020540	ATT	2	6	10280	10285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200154
134	NC_020540	TGC	2	6	10350	10355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200154
135	NC_020540	CAC	2	6	10373	10378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470200154
136	NC_020540	ATA	2	6	10511	10516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200154
137	NC_020540	CAA	2	6	10555	10560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200154
138	NC_020540	TTA	2	6	10590	10595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200154
139	NC_020540	TCA	2	6	10602	10607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200154
140	NC_020540	AGC	2	6	10667	10672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200154
141	NC_020540	TTA	2	6	10675	10680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200154
142	NC_020540	ATG	2	6	10702	10707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200154
143	NC_020540	ATC	2	6	10718	10723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200154
144	NC_020540	ATT	2	6	10735	10740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200154
145	NC_020540	CAA	2	6	10768	10773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200154
146	NC_020540	ATG	2	6	10950	10955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200154
147	NC_020540	TGG	2	6	11033	11038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414890
148	NC_020540	AGA	2	6	11147	11152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414890
149	NC_020540	AGC	2	6	11231	11236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414890
150	NC_020540	TAT	2	6	11267	11272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414890
151	NC_020540	GAT	2	6	11316	11321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414890
152	NC_020540	TGA	2	6	11338	11343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414890
153	NC_020540	TTC	2	6	11477	11482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523414890
154	NC_020540	ATT	2	6	11524	11529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414890
155	NC_020540	TAC	2	6	11636	11641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414890
156	NC_020540	ATT	2	6	11701	11706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414890
157	NC_020540	ATT	2	6	11753	11758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414890
158	NC_020540	TAT	3	9	11787	11795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414890
159	NC_020540	TAT	2	6	11808	11813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414890
160	NC_020540	AGA	2	6	11876	11881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414890
161	NC_020540	ATT	3	9	11920	11928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414890
162	NC_020540	TAT	2	6	12110	12115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414890
163	NC_020540	TAA	2	6	12155	12160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414890
164	NC_020540	ATT	2	6	12286	12291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200156
165	NC_020540	GTA	2	6	12436	12441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200156
166	NC_020540	GTG	2	6	12470	12475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200156
167	NC_020540	TTG	2	6	12530	12535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200156
168	NC_020540	ATT	2	6	12541	12546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200156
169	NC_020540	GTT	2	6	12646	12651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200156
170	NC_020540	AGA	2	6	12762	12767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200156
171	NC_020540	ATA	2	6	12812	12817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414891
172	NC_020540	AAT	2	6	12820	12825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414891
173	NC_020540	TGA	2	6	12857	12862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414891
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183	NC_020540	GTG	2	6	13295	13300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414891
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241	NC_020540	GCA	2	6	25901	25906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414893
242	NC_020540	AGC	2	6	25915	25920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414893
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246	NC_020540	TTC	2	6	26041	26046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523414893
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250	NC_020540	TGG	2	6	26209	26214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414893
251	NC_020540	ACC	2	6	26307	26312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523414893
252	NC_020540	GGA	2	6	26602	26607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523414894
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254	NC_020540	TCA	2	6	26767	26772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414894
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