MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 32006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020540	A	7	7	206868	206874	100 %	0 %	0 %	0 %	523414950
3502	NC_020540	GCT	2	6	206878	206883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414950
3503	NC_020540	CAC	2	6	206901	206906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523414950
3504	NC_020540	GACC	2	8	206951	206958	25 %	0 %	25 %	50 %	523414950
3505	NC_020540	CTA	2	6	206984	206989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414950
3506	NC_020540	TCA	2	6	206995	207000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414950
3507	NC_020540	AAT	2	6	207033	207038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414950
3508	NC_020540	AGA	3	9	207282	207290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200349
3509	NC_020540	CTATG	2	10	207315	207324	20 %	40 %	20 %	20 %	470200349
3510	NC_020540	GAT	2	6	207427	207432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200349
3511	NC_020540	GCA	2	6	207487	207492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200349
3512	NC_020540	ATT	2	6	207494	207499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200349
3513	NC_020540	TCT	2	6	207638	207643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200349
3514	NC_020540	GAA	2	6	207667	207672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200349
3515	NC_020540	CAA	2	6	207676	207681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200349
3516	NC_020540	AGA	2	6	207687	207692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200349
3517	NC_020540	AGC	2	6	207693	207698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200349
3518	NC_020540	TTACCC	2	12	207702	207713	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470200349
3519	NC_020540	AAG	2	6	207807	207812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200350
3520	NC_020540	TTGA	2	8	207860	207867	25 %	50 %	25 %	0 %	470200350
3521	NC_020540	AGT	2	6	207992	207997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200350
3522	NC_020540	ATT	2	6	208013	208018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200350
3523	NC_020540	A	6	6	208127	208132	100 %	0 %	0 %	0 %	470200350
3524	NC_020540	CTG	2	6	208200	208205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200350
3525	NC_020540	GGGACA	2	12	208244	208255	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	470200350
3526	NC_020540	GTG	3	9	208302	208310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200350
3527	NC_020540	ACA	2	6	208428	208433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200350
3528	NC_020540	ACA	2	6	208455	208460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200350
3529	NC_020540	GCT	2	6	208469	208474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200350
3530	NC_020540	AAG	2	6	208500	208505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200350
3531	NC_020540	TGA	2	6	208555	208560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200350
3532	NC_020540	AAGG	2	8	208580	208587	50 %	0 %	50 %	0 %	470200350
3533	NC_020540	CTTAT	2	10	208592	208601	20 %	60 %	0 %	20 %	470200350
3534	NC_020540	CAT	2	6	208606	208611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200350
3535	NC_020540	A	7	7	208709	208715	100 %	0 %	0 %	0 %	470200350
3536	NC_020540	GAT	2	6	208718	208723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200350
3537	NC_020540	GGC	2	6	208739	208744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470200350
3538	NC_020540	TTA	2	6	208760	208765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200351
3539	NC_020540	A	7	7	208778	208784	100 %	0 %	0 %	0 %	470200351
3540	NC_020540	TGA	2	6	208869	208874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200351
3541	NC_020540	CAG	2	6	209063	209068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200351
3542	NC_020540	A	6	6	209095	209100	100 %	0 %	0 %	0 %	470200351
3543	NC_020540	A	6	6	209107	209112	100 %	0 %	0 %	0 %	470200351
3544	NC_020540	GAGCA	2	10	209149	209158	40 %	0 %	40 %	20 %	470200351
3545	NC_020540	AAG	2	6	209300	209305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200351
3546	NC_020540	GCA	2	6	209383	209388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200351
3547	NC_020540	TAAG	2	8	209494	209501	50 %	25 %	25 %	0 %	470200351
3548	NC_020540	CAT	2	6	209861	209866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200352
3549	NC_020540	GTTTC	2	10	209877	209886	0 %	60 %	20 %	20 %	470200352
3550	NC_020540	TTGG	2	8	210035	210042	0 %	50 %	50 %	0 %	470200352
3551	NC_020540	TGG	2	6	210084	210089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200352
3552	NC_020540	AAAG	2	8	210100	210107	75 %	0 %	25 %	0 %	470200352
3553	NC_020540	GCTT	2	8	210132	210139	0 %	50 %	25 %	25 %	470200352
3554	NC_020540	CCT	2	6	210222	210227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470200352
3555	NC_020540	ATT	2	6	210251	210256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200352
3556	NC_020540	ATT	2	6	210307	210312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200352
3557	NC_020540	CTT	2	6	210381	210386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200352
3558	NC_020540	GTT	3	9	210451	210459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200352
3559	NC_020540	TTG	2	6	210568	210573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200352
3560	NC_020540	CAC	2	6	210586	210591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470200352
3561	NC_020540	TGG	2	6	210624	210629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200352
3562	NC_020540	GCA	2	6	210652	210657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200352
3563	NC_020540	GCTT	2	8	210693	210700	0 %	50 %	25 %	25 %	470200352
3564	NC_020540	A	6	6	210862	210867	100 %	0 %	0 %	0 %	470200352
3565	NC_020540	CA	3	6	210868	210873	50 %	0 %	0 %	50 %	470200352
3566	NC_020540	ATG	2	6	210880	210885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200352
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3568	NC_020540	GCA	2	6	210955	210960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200352
3569	NC_020540	CTA	2	6	211057	211062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200352
3570	NC_020540	TTTG	2	8	211114	211121	0 %	75 %	25 %	0 %	470200352
3571	NC_020540	ATG	2	6	211165	211170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200352
3572	NC_020540	TGG	2	6	211308	211313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200352
3573	NC_020540	GGCA	2	8	211314	211321	25 %	0 %	50 %	25 %	470200352
3574	NC_020540	TGA	2	6	211326	211331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200352
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3576	NC_020540	AGA	2	6	211590	211595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200352
3577	NC_020540	GAT	2	6	211665	211670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200352
3578	NC_020540	AACC	2	8	211691	211698	50 %	0 %	0 %	50 %	470200352
3579	NC_020540	TGC	2	6	211905	211910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200352
3580	NC_020540	CAG	2	6	211919	211924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200352
3581	NC_020540	TTG	3	9	211940	211948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200352
3582	NC_020540	CAACA	2	10	211956	211965	60 %	0 %	0 %	40 %	470200352
3583	NC_020540	CTT	2	6	212098	212103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523414951
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3585	NC_020540	A	6	6	212177	212182	100 %	0 %	0 %	0 %	523414951
3586	NC_020540	TTGC	2	8	212230	212237	0 %	50 %	25 %	25 %	523414951
3587	NC_020540	ATCA	2	8	212243	212250	50 %	25 %	0 %	25 %	523414951
3588	NC_020540	GAGC	2	8	212260	212267	25 %	0 %	50 %	25 %	523414951
3589	NC_020540	ATT	2	6	212349	212354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414951
3590	NC_020540	GCA	2	6	212368	212373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414951
3591	NC_020540	TAT	2	6	212375	212380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414951
3592	NC_020540	AAC	2	6	212445	212450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414951
3593	NC_020540	GATG	2	8	212482	212489	25 %	25 %	50 %	0 %	523414951
3594	NC_020540	CTCA	2	8	212515	212522	25 %	25 %	0 %	50 %	523414951
3595	NC_020540	AAG	2	6	212547	212552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414951
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3597	NC_020540	TGA	2	6	212700	212705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414951
3598	NC_020540	TGGC	2	8	212788	212795	0 %	25 %	50 %	25 %	523414951
3599	NC_020540	AAG	2	6	212805	212810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414951
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3601	NC_020540	TCT	2	6	212858	212863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523414951
3602	NC_020540	GTC	2	6	212894	212899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414951
3603	NC_020540	TG	3	6	213354	213359	0 %	50 %	50 %	0 %	470200354
3604	NC_020540	ATG	2	6	213390	213395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200354
3605	NC_020540	TCA	2	6	213417	213422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200354
3606	NC_020540	TTG	2	6	213516	213521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200354
3607	NC_020540	AAT	2	6	213530	213535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200354
3608	NC_020540	GCA	2	6	213564	213569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200354
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3610	NC_020540	TAA	2	6	213790	213795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200354
3611	NC_020540	CAA	2	6	214225	214230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414952
3612	NC_020540	AGC	2	6	214295	214300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414952
3613	NC_020540	TCT	2	6	214316	214321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523414952
3614	NC_020540	AG	3	6	214343	214348	50 %	0 %	50 %	0 %	523414952
3615	NC_020540	GAA	2	6	214367	214372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414952
3616	NC_020540	A	6	6	214379	214384	100 %	0 %	0 %	0 %	523414952
3617	NC_020540	GAAA	2	8	214415	214422	75 %	0 %	25 %	0 %	523414952
3618	NC_020540	AGA	3	9	214444	214452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414952
3619	NC_020540	GTG	2	6	214539	214544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414952
3620	NC_020540	CTG	2	6	214554	214559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414952
3621	NC_020540	CAG	2	6	214878	214883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414952
3622	NC_020540	AGGC	2	8	214896	214903	25 %	0 %	50 %	25 %	523414952
3623	NC_020540	CAG	2	6	214923	214928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414952
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3743	NC_020540	ATG	2	6	222896	222901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414954
3744	NC_020540	GGT	2	6	222926	222931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414954
3745	NC_020540	TGA	2	6	223053	223058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414954
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3748	NC_020540	AC	3	6	223590	223595	50 %	0 %	0 %	50 %	523414954
3749	NC_020540	T	6	6	223692	223697	0 %	100 %	0 %	0 %	523414954
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3768	NC_020540	A	6	6	224773	224778	100 %	0 %	0 %	0 %	523414955
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3862	NC_020540	AGTAGC	2	12	229647	229658	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470200367
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3987	NC_020540	G	6	6	237236	237241	0 %	0 %	100 %	0 %	470200371
3988	NC_020540	TTG	2	6	237243	237248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200371
3989	NC_020540	GAT	2	6	237302	237307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200371
3990	NC_020540	CTT	2	6	237315	237320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200371
3991	NC_020540	TGA	2	6	237352	237357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200371
3992	NC_020540	ATG	2	6	237387	237392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200371
3993	NC_020540	CTG	2	6	237450	237455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200371
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3995	NC_020540	AAG	2	6	237681	237686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200371
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