MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 32006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020540	TC	3	6	177650	177655	0 %	50 %	0 %	50 %	523414939
3002	NC_020540	T	6	6	177659	177664	0 %	100 %	0 %	0 %	523414939
3003	NC_020540	TGTT	2	8	177868	177875	0 %	75 %	25 %	0 %	523414939
3004	NC_020540	TTTA	2	8	177901	177908	25 %	75 %	0 %	0 %	523414939
3005	NC_020540	AAT	3	9	177933	177941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414939
3006	NC_020540	ATCA	2	8	177979	177986	50 %	25 %	0 %	25 %	523414939
3007	NC_020540	AT	3	6	177995	178000	50 %	50 %	0 %	0 %	523414939
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3010	NC_020540	ATTT	2	8	178187	178194	25 %	75 %	0 %	0 %	470200320
3011	NC_020540	CAT	2	6	178214	178219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200320
3012	NC_020540	TTA	2	6	178233	178238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200320
3013	NC_020540	TGA	2	6	178242	178247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200320
3014	NC_020540	TCTTTG	2	12	178278	178289	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470200320
3015	NC_020540	A	6	6	178312	178317	100 %	0 %	0 %	0 %	470200320
3016	NC_020540	TGT	2	6	178328	178333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200320
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3018	NC_020540	AACC	2	8	178389	178396	50 %	0 %	0 %	50 %	470200320
3019	NC_020540	A	7	7	178416	178422	100 %	0 %	0 %	0 %	470200320
3020	NC_020540	TCA	2	6	178441	178446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200320
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3022	NC_020540	GGAAA	2	10	178661	178670	60 %	0 %	40 %	0 %	470200320
3023	NC_020540	A	6	6	178682	178687	100 %	0 %	0 %	0 %	470200320
3024	NC_020540	CAG	2	6	178739	178744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200320
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3028	NC_020540	TAG	2	6	178871	178876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200320
3029	NC_020540	TGA	2	6	178935	178940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200320
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3031	NC_020540	T	6	6	179010	179015	0 %	100 %	0 %	0 %	470200320
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3034	NC_020540	GCTC	2	8	179506	179513	0 %	25 %	25 %	50 %	470200321
3035	NC_020540	TGG	2	6	179514	179519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200321
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3038	NC_020540	CAT	2	6	179706	179711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200321
3039	NC_020540	A	6	6	179761	179766	100 %	0 %	0 %	0 %	470200321
3040	NC_020540	TCG	2	6	179814	179819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200321
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3042	NC_020540	TCG	2	6	179874	179879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200321
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3044	NC_020540	TGG	2	6	179928	179933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200321
3045	NC_020540	GAA	2	6	179956	179961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200321
3046	NC_020540	TGGGAG	2	12	180023	180034	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	470200321
3047	NC_020540	TTGA	2	8	180046	180053	25 %	50 %	25 %	0 %	470200321
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3049	NC_020540	TGACTG	2	12	180192	180203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470200321
3050	NC_020540	TGA	2	6	180314	180319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200321
3051	NC_020540	A	6	6	180319	180324	100 %	0 %	0 %	0 %	470200321
3052	NC_020540	TAT	2	6	180336	180341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200321
3053	NC_020540	ACTT	2	8	180350	180357	25 %	50 %	0 %	25 %	470200321
3054	NC_020540	TAA	2	6	180393	180398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200321
3055	NC_020540	TTGACC	2	12	180653	180664	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523414940
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3058	NC_020540	TTA	2	6	180735	180740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414940
3059	NC_020540	T	6	6	180927	180932	0 %	100 %	0 %	0 %	523414940
3060	NC_020540	ATG	2	6	180982	180987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200322
3061	NC_020540	ATT	3	9	180997	181005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200322
3062	NC_020540	GGT	2	6	181096	181101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200322
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3064	NC_020540	CTG	2	6	181202	181207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200322
3065	NC_020540	CTT	2	6	181225	181230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200322
3066	NC_020540	T	6	6	181467	181472	0 %	100 %	0 %	0 %	470200322
3067	NC_020540	TAATC	2	10	181486	181495	40 %	40 %	0 %	20 %	470200322
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3070	NC_020540	GATG	2	8	181726	181733	25 %	25 %	50 %	0 %	470200323
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3081	NC_020540	TCTT	2	8	182398	182405	0 %	75 %	0 %	25 %	470200323
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3085	NC_020540	AG	3	6	182553	182558	50 %	0 %	50 %	0 %	523414941
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3089	NC_020540	GTG	2	6	182678	182683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414941
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3094	NC_020540	A	7	7	182872	182878	100 %	0 %	0 %	0 %	523414941
3095	NC_020540	CTA	2	6	183543	183548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414942
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3102	NC_020540	TGA	2	6	183783	183788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414942
3103	NC_020540	ATC	2	6	183809	183814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414942
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3105	NC_020540	GGCA	2	8	183912	183919	25 %	0 %	50 %	25 %	523414942
3106	NC_020540	GA	3	6	183957	183962	50 %	0 %	50 %	0 %	523414942
3107	NC_020540	ATA	2	6	184004	184009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414942
3108	NC_020540	TTA	2	6	184014	184019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414942
3109	NC_020540	CATG	2	8	184035	184042	25 %	25 %	25 %	25 %	523414942
3110	NC_020540	TGAT	2	8	184217	184224	25 %	50 %	25 %	0 %	523414942
3111	NC_020540	T	6	6	184238	184243	0 %	100 %	0 %	0 %	523414942
3112	NC_020540	ATG	2	6	184263	184268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414942
3113	NC_020540	CGA	2	6	184321	184326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414942
3114	NC_020540	TTGC	2	8	184339	184346	0 %	50 %	25 %	25 %	523414942
3115	NC_020540	TCT	2	6	184371	184376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523414942
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3117	NC_020540	TGA	2	6	184519	184524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414942
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3119	NC_020540	ATA	2	6	184598	184603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414942
3120	NC_020540	TTG	2	6	184628	184633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523414942
3121	NC_020540	T	6	6	184638	184643	0 %	100 %	0 %	0 %	523414942
3122	NC_020540	A	6	6	184654	184659	100 %	0 %	0 %	0 %	523414942
3123	NC_020540	TCA	2	6	184753	184758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414942
3124	NC_020540	AAAC	2	8	185172	185179	75 %	0 %	0 %	25 %	470200327
3125	NC_020540	AAG	2	6	185263	185268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200327
3126	NC_020540	TAC	2	6	185329	185334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200327
3127	NC_020540	CATA	2	8	185341	185348	50 %	25 %	0 %	25 %	470200327
3128	NC_020540	A	6	6	185361	185366	100 %	0 %	0 %	0 %	470200327
3129	NC_020540	ATA	2	6	185487	185492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200327
3130	NC_020540	TGG	2	6	185497	185502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200327
3131	NC_020540	AAAT	2	8	185527	185534	75 %	25 %	0 %	0 %	470200327
3132	NC_020540	GAAA	2	8	185569	185576	75 %	0 %	25 %	0 %	470200327
3133	NC_020540	A	6	6	185605	185610	100 %	0 %	0 %	0 %	470200327
3134	NC_020540	TTTAC	2	10	185618	185627	20 %	60 %	0 %	20 %	470200327
3135	NC_020540	CTA	2	6	185721	185726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200327
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3137	NC_020540	GAT	2	6	185765	185770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200327
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3140	NC_020540	ATT	2	6	186347	186352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414943
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3143	NC_020540	GGCT	2	8	186466	186473	0 %	25 %	50 %	25 %	523414943
3144	NC_020540	CTG	3	9	186521	186529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414943
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3148	NC_020540	T	6	6	186609	186614	0 %	100 %	0 %	0 %	523414943
3149	NC_020540	ATC	2	6	186617	186622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414943
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3151	NC_020540	AAG	3	9	186833	186841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414943
3152	NC_020540	AAC	2	6	186907	186912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414943
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3154	NC_020540	CTG	2	6	186965	186970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414943
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3156	NC_020540	TGC	2	6	187032	187037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414943
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3225	NC_020540	A	6	6	191401	191406	100 %	0 %	0 %	0 %	470200333
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3227	NC_020540	AAG	2	6	191537	191542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200333
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3229	NC_020540	GAT	2	6	191568	191573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200333
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3231	NC_020540	ATG	2	6	191615	191620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200333
3232	NC_020540	TTTG	2	8	191643	191650	0 %	75 %	25 %	0 %	470200333
3233	NC_020540	A	7	7	191703	191709	100 %	0 %	0 %	0 %	470200333
3234	NC_020540	TAGA	2	8	191750	191757	50 %	25 %	25 %	0 %	470200333
3235	NC_020540	AGA	2	6	191769	191774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200333
3236	NC_020540	CA	3	6	191784	191789	50 %	0 %	0 %	50 %	470200333
3237	NC_020540	A	6	6	191935	191940	100 %	0 %	0 %	0 %	470200333
3238	NC_020540	AACT	2	8	191951	191958	50 %	25 %	0 %	25 %	470200333
3239	NC_020540	GAA	2	6	191959	191964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200333
3240	NC_020540	GCA	2	6	192009	192014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200333
3241	NC_020540	AAC	2	6	192053	192058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200333
3242	NC_020540	CTC	2	6	192095	192100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470200333
3243	NC_020540	GAAA	2	8	192108	192115	75 %	0 %	25 %	0 %	470200333
3244	NC_020540	AGA	2	6	192159	192164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200333
3245	NC_020540	TAAAG	2	10	192213	192222	60 %	20 %	20 %	0 %	470200333
3246	NC_020540	GCT	2	6	192241	192246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200333
3247	NC_020540	GAA	2	6	192333	192338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200334
3248	NC_020540	TGC	2	6	192363	192368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200334
3249	NC_020540	CAT	2	6	192412	192417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200334
3250	NC_020540	CAA	2	6	192428	192433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200334
3251	NC_020540	TGA	2	6	192456	192461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200334
3252	NC_020540	ACAA	2	8	192490	192497	75 %	0 %	0 %	25 %	470200334
3253	NC_020540	GAA	2	6	192520	192525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200334
3254	NC_020540	CTG	2	6	192533	192538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200334
3255	NC_020540	ATG	2	6	192623	192628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200334
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3259	NC_020540	TAT	2	6	192736	192741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200334
3260	NC_020540	ACA	2	6	192786	192791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200334
3261	NC_020540	AAG	2	6	192821	192826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200334
3262	NC_020540	AGA	2	6	192867	192872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200334
3263	NC_020540	TAC	2	6	192912	192917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200334
3264	NC_020540	TGA	2	6	192954	192959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200334
3265	NC_020540	AGCT	2	8	193034	193041	25 %	25 %	25 %	25 %	470200334
3266	NC_020540	CCAGCC	2	12	193108	193119	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470200334
3267	NC_020540	TCA	2	6	193173	193178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200334
3268	NC_020540	ATC	2	6	193196	193201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200334
3269	NC_020540	CCT	2	6	193207	193212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470200334
3270	NC_020540	ATG	2	6	193220	193225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200334
3271	NC_020540	AAAC	2	8	193233	193240	75 %	0 %	0 %	25 %	470200334
3272	NC_020540	GAA	2	6	193324	193329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200334
3273	NC_020540	ATCAA	2	10	193360	193369	60 %	20 %	0 %	20 %	470200334
3274	NC_020540	AAG	2	6	193419	193424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200334
3275	NC_020540	AAG	2	6	193523	193528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200334
3276	NC_020540	CATT	2	8	193629	193636	25 %	50 %	0 %	25 %	470200334
3277	NC_020540	TA	3	6	193684	193689	50 %	50 %	0 %	0 %	470200334
3278	NC_020540	TGA	2	6	193758	193763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200334
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3280	NC_020540	A	6	6	193819	193824	100 %	0 %	0 %	0 %	470200334
3281	NC_020540	ATG	2	6	193864	193869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200334
3282	NC_020540	TTG	2	6	193982	193987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200334
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3284	NC_020540	CG	3	6	194126	194131	0 %	0 %	50 %	50 %	470200334
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3286	NC_020540	AT	3	6	194183	194188	50 %	50 %	0 %	0 %	470200334
3287	NC_020540	CTG	2	6	194285	194290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200334
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3293	NC_020540	AGA	2	6	194664	194669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200334
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3301	NC_020540	TGG	2	6	195018	195023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414946
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3305	NC_020540	TGA	2	6	195350	195355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200336
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3320	NC_020540	CTTT	2	8	196259	196266	0 %	75 %	0 %	25 %	470200337
3321	NC_020540	CTT	2	6	196290	196295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200337
3322	NC_020540	AAT	2	6	196362	196367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200337
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3326	NC_020540	TAA	2	6	196543	196548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200337
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3328	NC_020540	TAA	2	6	196654	196659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200337
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3331	NC_020540	AG	3	6	196801	196806	50 %	0 %	50 %	0 %	470200338
3332	NC_020540	GTT	2	6	196847	196852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200338
3333	NC_020540	ATG	2	6	196962	196967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200338
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3336	NC_020540	AG	3	6	197065	197070	50 %	0 %	50 %	0 %	470200338
3337	NC_020540	CAA	3	9	197120	197128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200338
3338	NC_020540	CAAC	2	8	197177	197184	50 %	0 %	0 %	50 %	470200338
3339	NC_020540	TAT	2	6	197190	197195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200338
3340	NC_020540	AAGA	2	8	197247	197254	75 %	0 %	25 %	0 %	470200338
3341	NC_020540	TAA	2	6	197271	197276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200338
3342	NC_020540	CCTA	2	8	197328	197335	25 %	25 %	0 %	50 %	470200338
3343	NC_020540	AAGG	2	8	197362	197369	50 %	0 %	50 %	0 %	470200338
3344	NC_020540	GA	3	6	197448	197453	50 %	0 %	50 %	0 %	470200338
3345	NC_020540	TGA	2	6	197527	197532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200339
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3350	NC_020540	CAT	2	6	197834	197839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200339
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3353	NC_020540	TAA	2	6	198005	198010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200339
3354	NC_020540	A	7	7	198009	198015	100 %	0 %	0 %	0 %	470200339
3355	NC_020540	TCCAA	2	10	198020	198029	40 %	20 %	0 %	40 %	470200339
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3357	NC_020540	AG	3	6	198149	198154	50 %	0 %	50 %	0 %	470200339
3358	NC_020540	AAG	2	6	198169	198174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200339
3359	NC_020540	TAA	2	6	198190	198195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200339
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3361	NC_020540	AAATA	2	10	198262	198271	80 %	20 %	0 %	0 %	470200339
3362	NC_020540	GTG	2	6	198302	198307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200339
3363	NC_020540	TGA	2	6	198439	198444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200339
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3366	NC_020540	GTA	2	6	198465	198470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200339
3367	NC_020540	AAT	2	6	198634	198639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414947
3368	NC_020540	CATGAC	2	12	198647	198658	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523414947
3369	NC_020540	ACCA	2	8	198721	198728	50 %	0 %	0 %	50 %	523414947
3370	NC_020540	AGA	2	6	198816	198821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414947
3371	NC_020540	GAT	2	6	198905	198910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414947
3372	NC_020540	TGC	2	6	198925	198930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414947
3373	NC_020540	TGA	2	6	198934	198939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414947
3374	NC_020540	TCC	2	6	198942	198947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523414947
3375	NC_020540	TCGC	2	8	199064	199071	0 %	25 %	25 %	50 %	523414947
3376	NC_020540	TAG	2	6	199082	199087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414947
3377	NC_020540	GTA	2	6	199089	199094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414947
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3380	NC_020540	TTAGCT	2	12	199177	199188	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	523414947
3381	NC_020540	TAT	2	6	199193	199198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414947
3382	NC_020540	AAT	2	6	199239	199244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414947
3383	NC_020540	CAT	2	6	199346	199351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414947
3384	NC_020540	TGA	2	6	199382	199387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414947
3385	NC_020540	CAT	2	6	199424	199429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414947
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3388	NC_020540	GCT	2	6	199522	199527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414947
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3391	NC_020540	T	6	6	199578	199583	0 %	100 %	0 %	0 %	523414947
3392	NC_020540	T	6	6	199695	199700	0 %	100 %	0 %	0 %	523414947
3393	NC_020540	ACT	2	6	199783	199788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414947
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3395	NC_020540	CAG	2	6	199865	199870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414947
3396	NC_020540	ATC	2	6	199899	199904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414947
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3398	NC_020540	GTT	2	6	200108	200113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523414947
3399	NC_020540	TTTG	2	8	200128	200135	0 %	75 %	25 %	0 %	523414947
3400	NC_020540	TGT	2	6	200143	200148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523414947
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3403	NC_020540	GA	3	6	201062	201067	50 %	0 %	50 %	0 %	523414948
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3422	NC_020540	TAG	2	6	202018	202023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200344
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3424	NC_020540	TCATG	2	10	202260	202269	20 %	40 %	20 %	20 %	470200344
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3438	NC_020540	CAGT	2	8	203393	203400	25 %	25 %	25 %	25 %	470200346
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3457	NC_020540	TGG	2	6	204445	204450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200346
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3469	NC_020540	TCGTC	2	10	205188	205197	0 %	40 %	20 %	40 %	470200347
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3475	NC_020540	AG	3	6	205716	205721	50 %	0 %	50 %	0 %	523414950
3476	NC_020540	ATC	2	6	205750	205755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414950
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3484	NC_020540	T	6	6	205958	205963	0 %	100 %	0 %	0 %	523414950
3485	NC_020540	GCC	2	6	206010	206015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523414950
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