MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 32006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020540	GGT	2	6	31862	31867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200168
502	NC_020540	CAGGCG	2	12	31923	31934	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470200168
503	NC_020540	CAA	2	6	31979	31984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200168
504	NC_020540	GCG	2	6	32000	32005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470200168
505	NC_020540	TTC	2	6	32014	32019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200168
506	NC_020540	TGGT	2	8	32109	32116	0 %	50 %	50 %	0 %	470200168
507	NC_020540	GGT	2	6	32180	32185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200168
508	NC_020540	GGT	2	6	32207	32212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200168
509	NC_020540	GAA	2	6	32291	32296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200168
510	NC_020540	TTA	2	6	32340	32345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200168
511	NC_020540	GGT	2	6	32369	32374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200168
512	NC_020540	GTT	2	6	32501	32506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200168
513	NC_020540	ATG	2	6	32514	32519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200168
514	NC_020540	CAA	2	6	32542	32547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200168
515	NC_020540	GTT	2	6	32567	32572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200168
516	NC_020540	ATC	2	6	32621	32626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200168
517	NC_020540	GTT	2	6	32672	32677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200168
518	NC_020540	GCAC	2	8	32717	32724	25 %	0 %	25 %	50 %	470200168
519	NC_020540	CAG	2	6	32730	32735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200168
520	NC_020540	ACC	2	6	32841	32846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470200168
521	NC_020540	GGT	2	6	32852	32857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200168
522	NC_020540	ACA	2	6	32918	32923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200168
523	NC_020540	TGC	2	6	32986	32991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200168
524	NC_020540	CTT	2	6	33125	33130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200168
525	NC_020540	CGG	2	6	33172	33177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470200168
526	NC_020540	ACC	2	6	33217	33222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470200168
527	NC_020540	ACA	2	6	33245	33250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200168
528	NC_020540	TC	4	8	33268	33275	0 %	50 %	0 %	50 %	470200168
529	NC_020540	AGA	2	6	33331	33336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200168
530	NC_020540	GGT	2	6	33428	33433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200168
531	NC_020540	CAG	2	6	33505	33510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200168
532	NC_020540	AGC	2	6	33643	33648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200168
533	NC_020540	CAGA	2	8	33692	33699	50 %	0 %	25 %	25 %	470200168
534	NC_020540	GAA	2	6	33707	33712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200168
535	NC_020540	CTG	2	6	33717	33722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200168
536	NC_020540	ATC	2	6	33935	33940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200168
537	NC_020540	CAG	2	6	33960	33965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200168
538	NC_020540	ATC	2	6	34064	34069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200168
539	NC_020540	TCT	2	6	34108	34113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200168
540	NC_020540	CT	3	6	34155	34160	0 %	50 %	0 %	50 %	470200168
541	NC_020540	ATG	2	6	34167	34172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200168
542	NC_020540	TTGG	2	8	34228	34235	0 %	50 %	50 %	0 %	470200168
543	NC_020540	TTG	2	6	34293	34298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200168
544	NC_020540	ATC	2	6	34448	34453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200168
545	NC_020540	GAA	2	6	34752	34757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414897
546	NC_020540	ACTT	2	8	34803	34810	25 %	50 %	0 %	25 %	523414897
547	NC_020540	AAG	2	6	34840	34845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414897
548	NC_020540	AATC	2	8	34923	34930	50 %	25 %	0 %	25 %	523414897
549	NC_020540	CCT	2	6	35128	35133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523414897
550	NC_020540	TCG	2	6	35162	35167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414897
551	NC_020540	AAG	2	6	35200	35205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414897
552	NC_020540	TGA	2	6	35242	35247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414897
553	NC_020540	TGC	2	6	35264	35269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414897
554	NC_020540	GGT	2	6	35357	35362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414897
555	NC_020540	TGA	2	6	35444	35449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414897
556	NC_020540	A	6	6	35537	35542	100 %	0 %	0 %	0 %	523414897
557	NC_020540	GCT	2	6	35619	35624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414897
558	NC_020540	GAA	2	6	35637	35642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414897
559	NC_020540	A	6	6	35672	35677	100 %	0 %	0 %	0 %	523414897
560	NC_020540	GTT	2	6	35781	35786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523414897
561	NC_020540	TGAT	2	8	35788	35795	25 %	50 %	25 %	0 %	523414897
562	NC_020540	ATT	2	6	35837	35842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414897
563	NC_020540	TCG	2	6	35930	35935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414897
564	NC_020540	TGA	2	6	35963	35968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414897
565	NC_020540	GT	3	6	35970	35975	0 %	50 %	50 %	0 %	523414897
566	NC_020540	ATT	2	6	35979	35984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414897
567	NC_020540	TC	3	6	36005	36010	0 %	50 %	0 %	50 %	523414897
568	NC_020540	TTGA	2	8	36021	36028	25 %	50 %	25 %	0 %	523414897
569	NC_020540	TGG	2	6	36059	36064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414897
570	NC_020540	GAA	3	9	36117	36125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414897
571	NC_020540	AGA	2	6	36140	36145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414897
572	NC_020540	A	7	7	36214	36220	100 %	0 %	0 %	0 %	523414898
573	NC_020540	A	7	7	36278	36284	100 %	0 %	0 %	0 %	523414898
574	NC_020540	TGG	2	6	36335	36340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414898
575	NC_020540	TGCT	2	8	36418	36425	0 %	50 %	25 %	25 %	523414898
576	NC_020540	TG	3	6	36472	36477	0 %	50 %	50 %	0 %	523414898
577	NC_020540	ATT	2	6	36486	36491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414898
578	NC_020540	GCA	2	6	36492	36497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414898
579	NC_020540	T	6	6	36515	36520	0 %	100 %	0 %	0 %	523414898
580	NC_020540	A	6	6	36539	36544	100 %	0 %	0 %	0 %	523414898
581	NC_020540	GAA	2	6	36561	36566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414898
582	NC_020540	GTT	2	6	36567	36572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523414898
583	NC_020540	AGC	2	6	36605	36610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414898
584	NC_020540	GAT	2	6	36657	36662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414898
585	NC_020540	ATC	2	6	36708	36713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414898
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587	NC_020540	CGT	2	6	36795	36800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414898
588	NC_020540	GCT	2	6	36827	36832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414898
589	NC_020540	AAC	2	6	36850	36855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414898
590	NC_020540	TCC	2	6	36865	36870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523414898
591	NC_020540	AGC	2	6	36896	36901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414898
592	NC_020540	GAA	2	6	36918	36923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414898
593	NC_020540	GTG	2	6	36952	36957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414898
594	NC_020540	GAT	2	6	36990	36995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414898
595	NC_020540	GAA	2	6	37077	37082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414898
596	NC_020540	ATC	2	6	37191	37196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414898
597	NC_020540	GTG	2	6	37215	37220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414898
598	NC_020540	AGCAG	2	10	37447	37456	40 %	0 %	40 %	20 %	470200172
599	NC_020540	AGTT	2	8	37462	37469	25 %	50 %	25 %	0 %	470200172
600	NC_020540	ATC	2	6	37482	37487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200172
601	NC_020540	TTG	2	6	37595	37600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200172
602	NC_020540	GTCT	2	8	37622	37629	0 %	50 %	25 %	25 %	470200172
603	NC_020540	TTG	2	6	37647	37652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200172
604	NC_020540	TAT	2	6	37684	37689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200172
605	NC_020540	CCTG	2	8	37708	37715	0 %	25 %	25 %	50 %	470200172
606	NC_020540	GGTCA	2	10	37811	37820	20 %	20 %	40 %	20 %	470200172
607	NC_020540	CAA	2	6	37823	37828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200172
608	NC_020540	TTG	2	6	38178	38183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200173
609	NC_020540	TTGGG	2	10	38207	38216	0 %	40 %	60 %	0 %	470200173
610	NC_020540	TGG	2	6	38230	38235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200173
611	NC_020540	CGA	2	6	38281	38286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200173
612	NC_020540	GAT	2	6	38305	38310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200173
613	NC_020540	TCG	2	6	38362	38367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200173
614	NC_020540	GCT	2	6	38390	38395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200173
615	NC_020540	ACA	2	6	38400	38405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200173
616	NC_020540	ACATCG	2	12	38499	38510	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470200173
617	NC_020540	GAC	2	6	38620	38625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200173
618	NC_020540	CA	3	6	38666	38671	50 %	0 %	0 %	50 %	470200173
619	NC_020540	ACG	2	6	38679	38684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200173
620	NC_020540	CAA	2	6	38789	38794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200173
621	NC_020540	ACT	2	6	38829	38834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200173
622	NC_020540	AAT	2	6	38879	38884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200173
623	NC_020540	TAT	2	6	38911	38916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200173
624	NC_020540	TGT	2	6	38941	38946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200173
625	NC_020540	TGA	2	6	38986	38991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200173
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627	NC_020540	AAG	2	6	39089	39094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200173
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