MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI8T7 complete sequence

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020539	TGA	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816324
2	NC_020539	CAT	2	6	638	643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816324
3	NC_020539	TCA	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
4	NC_020539	TAG	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
5	NC_020539	ATT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816325
6	NC_020539	ATC	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
7	NC_020539	GCA	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816325
8	NC_020539	CAT	2	6	1202	1207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
9	NC_020539	TGA	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
10	NC_020539	AAT	2	6	1473	1478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816325
11	NC_020539	TTC	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
12	NC_020539	ATT	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816325
13	NC_020539	TGT	2	6	1711	1716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816325
14	NC_020539	TTC	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
15	NC_020539	TTC	2	6	1860	1865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
16	NC_020539	CCA	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469816325
17	NC_020539	AAT	2	6	2148	2153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816325
18	NC_020539	AGT	2	6	2200	2205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
19	NC_020539	TCA	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
20	NC_020539	AGC	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816325
21	NC_020539	ATA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816325
22	NC_020539	ATT	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816325
23	NC_020539	CTT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
24	NC_020539	ACA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816325
25	NC_020539	ATG	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
26	NC_020539	TCA	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
27	NC_020539	TCT	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
28	NC_020539	TAG	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
29	NC_020539	TCT	2	6	2785	2790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
30	NC_020539	TTC	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
31	NC_020539	TCT	2	6	3040	3045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
32	NC_020539	CAT	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816326
33	NC_020539	TAT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816326
34	NC_020539	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816326
35	NC_020539	GTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816326
36	NC_020539	TAT	2	6	4474	4479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816326
37	NC_020539	ATC	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816326
38	NC_020539	TTA	2	6	4602	4607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816326
39	NC_020539	AAT	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816326
40	NC_020539	TAT	2	6	4920	4925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
41	NC_020539	AAG	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816327
42	NC_020539	TTA	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
43	NC_020539	TTA	2	6	5004	5009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
44	NC_020539	CTT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816327
45	NC_020539	TAA	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
46	NC_020539	AAT	2	6	5139	5144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
47	NC_020539	ACC	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469816327
48	NC_020539	ATA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
49	NC_020539	TTA	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
50	NC_020539	TTA	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
51	NC_020539	TCT	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816327
52	NC_020539	TAT	3	9	5612	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
53	NC_020539	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
54	NC_020539	TAT	2	6	5741	5746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
55	NC_020539	AGA	2	6	5826	5831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816327
56	NC_020539	AAG	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816327
57	NC_020539	GAA	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816327
58	NC_020539	ATG	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816327
59	NC_020539	TAA	2	6	6341	6346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
60	NC_020539	ATG	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816327
61	NC_020539	TCT	2	6	6477	6482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816327
62	NC_020539	ATT	2	6	6485	6490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
63	NC_020539	TAA	2	6	6557	6562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
64	NC_020539	GGT	2	6	6565	6570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469816327
65	NC_020539	TAT	2	6	6603	6608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
66	NC_020539	TTG	2	6	7513	7518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816328
67	NC_020539	TAA	2	6	7580	7585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816328
68	NC_020539	AGA	2	6	7610	7615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816328
69	NC_020539	GCA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816328
70	NC_020539	TTC	2	6	7712	7717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816328
71	NC_020539	GTC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816328
72	NC_020539	AAT	2	6	7893	7898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816328
73	NC_020539	ATC	2	6	8068	8073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816329
74	NC_020539	AAG	2	6	8184	8189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816329
75	NC_020539	ATG	2	6	8256	8261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816329
76	NC_020539	ATT	2	6	8264	8269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816329
77	NC_020539	ATT	2	6	8280	8285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816329
78	NC_020539	ATG	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816329
79	NC_020539	GTG	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469816329
80	NC_020539	AGA	2	6	8560	8565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816329
81	NC_020539	AAG	2	6	8592	8597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816329
82	NC_020539	ATT	2	6	9559	9564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816330
83	NC_020539	TGC	2	6	9668	9673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816330
84	NC_020539	CAT	2	6	9694	9699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816330
85	NC_020539	CCT	2	6	9727	9732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	469816330
86	NC_020539	ATT	2	6	9828	9833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816330
87	NC_020539	ATA	2	6	9848	9853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816330
88	NC_020539	GTT	2	6	9861	9866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816330
89	NC_020539	TTC	2	6	9953	9958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816330
90	NC_020539	ATA	2	6	10004	10009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816330
91	NC_020539	TAC	2	6	10021	10026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816330
92	NC_020539	AGT	3	9	10052	10060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816330
93	NC_020539	TCA	2	6	10123	10128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816330
94	NC_020539	ATG	2	6	10334	10339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816331
95	NC_020539	TAG	2	6	10365	10370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816331
96	NC_020539	GTT	2	6	10391	10396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816331
97	NC_020539	GAA	2	6	10548	10553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816331
98	NC_020539	ATT	2	6	10561	10566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816331
99	NC_020539	TAA	2	6	10671	10676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816331
100	NC_020539	ACT	2	6	10682	10687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816331
101	NC_020539	GGA	2	6	10793	10798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	469816331
102	NC_020539	ATA	2	6	10856	10861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816331
103	NC_020539	AAG	2	6	10998	11003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816331
104	NC_020539	ATT	2	6	11015	11020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816331
105	NC_020539	TGC	2	6	11146	11151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816331
106	NC_020539	TTA	2	6	11186	11191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816331
107	NC_020539	GAA	2	6	11216	11221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816331
108	NC_020539	GCG	2	6	11303	11308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	469816331
109	NC_020539	TAT	2	6	11368	11373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816331
110	NC_020539	TAA	2	6	11469	11474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816331
111	NC_020539	GCT	2	6	11510	11515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816331
112	NC_020539	TCT	2	6	11576	11581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816331
113	NC_020539	TCA	2	6	11618	11623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816331
114	NC_020539	GAA	2	6	11657	11662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816331
115	NC_020539	CAT	2	6	11730	11735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816331
116	NC_020539	ATG	2	6	11739	11744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816331
117	NC_020539	TAG	2	6	11763	11768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816331
118	NC_020539	TGA	2	6	12051	12056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816332
119	NC_020539	TAG	2	6	12120	12125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816332
120	NC_020539	TTA	2	6	12209	12214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816332
121	NC_020539	TTA	2	6	12357	12362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816332
122	NC_020539	TAT	3	9	12400	12408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816332
123	NC_020539	TAC	2	6	12414	12419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816332
124	NC_020539	ATG	2	6	12597	12602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816332
125	NC_020539	ATT	2	6	12613	12618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816332
126	NC_020539	TTC	2	6	13004	13009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816333
127	NC_020539	ATC	2	6	13019	13024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816333
128	NC_020539	TGT	2	6	13119	13124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816333
129	NC_020539	TTC	2	6	13142	13147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816333
130	NC_020539	CTT	2	6	13159	13164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816333
131	NC_020539	TTA	2	6	13260	13265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816333
132	NC_020539	TTG	2	6	13283	13288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816333
133	NC_020539	TTG	2	6	13328	13333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816333
134	NC_020539	GTT	2	6	13339	13344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816333
135	NC_020539	ATT	2	6	13454	13459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816333
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.