MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020536	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196213
2	NC_020536	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196216
3	NC_020536	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470196216
4	NC_020536	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196216
5	NC_020536	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196216
6	NC_020536	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470196216
7	NC_020536	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470196218
8	NC_020536	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196218
9	NC_020536	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196222
10	NC_020536	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196222
11	NC_020536	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	470196223
12	NC_020536	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470196224
13	NC_020536	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196224
14	NC_020536	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196225
15	NC_020536	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196226
16	NC_020536	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470196228
17	NC_020536	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196231
18	NC_020536	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196232
19	NC_020536	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196234
20	NC_020536	ACAACT	2	12	40613	40624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470196236
21	NC_020536	TAGTTT	2	12	47301	47312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470196242
22	NC_020536	ATAACC	2	12	47797	47808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470196242
23	NC_020536	TTTGTA	2	12	52952	52963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470196245
24	NC_020536	TTTTTC	2	12	53969	53980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470196246
25	NC_020536	TATTTT	2	12	54273	54284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470196246
26	NC_020536	ATAAAA	2	12	55465	55476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470196247
27	NC_020536	TTGTGA	2	12	59572	59583	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470196249
28	NC_020536	TTTATA	2	12	59912	59923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196249
29	NC_020536	TTTATC	2	12	60216	60227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470196250
30	NC_020536	ACAAAT	2	12	63549	63560	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470196252
31	NC_020536	AATTAA	2	12	63640	63651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196252
32	NC_020536	TTAATG	2	12	66583	66594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196253
33	NC_020536	AAGTCA	2	12	67788	67799	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470196254
34	NC_020536	AAAAAG	2	12	67902	67913	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196254
35	NC_020536	GAAAAA	2	12	68215	68226	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196254
36	NC_020536	AATTAT	2	12	70454	70465	50 %	50 %	0 %	0 %	470196256
37	NC_020536	ACCCTT	2	12	72293	72304	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470196257
38	NC_020536	TTTAGC	2	12	74202	74213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196258
39	NC_020536	AAATAA	2	12	74253	74264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470196258
40	NC_020536	GTTAGA	2	12	76376	76387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196259
41	NC_020536	AAAAGA	2	12	76430	76441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196259
42	NC_020536	GCTAAA	2	12	79218	79229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470196261
43	NC_020536	TAAAGA	2	12	83365	83376	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470196266
44	NC_020536	AACCAC	2	12	87237	87248	50 %	0 %	0 %	50 %	470196268
45	NC_020536	AACCGA	2	12	90548	90559	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470196270
46	NC_020536	ATAGAT	2	12	95448	95459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196273
47	NC_020536	TATCAT	2	12	96215	96226	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470196274
48	NC_020536	TTTATT	2	12	96623	96634	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470196275
49	NC_020536	TATTTG	2	12	96709	96720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470196275
50	NC_020536	TAAATA	2	12	98142	98153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196275
51	NC_020536	TTTTTC	2	12	99836	99847	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470196276
52	NC_020536	TAAGCC	2	12	101697	101708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196278
53	NC_020536	ATCGCA	2	12	102912	102923	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196279
54	NC_020536	TTTGAA	2	12	103943	103954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196280
55	NC_020536	CAATGG	2	12	112901	112912	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470196286
56	NC_020536	TGAAGA	2	12	113735	113746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470196287
57	NC_020536	TTTCAT	2	12	114416	114427	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470196288
58	NC_020536	TGTATA	2	12	118636	118647	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196292
59	NC_020536	TCGAAA	2	12	120137	120148	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470196294
60	NC_020536	CTATTG	2	12	122723	122734	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196296
61	NC_020536	CATATG	2	12	123926	123937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196297
62	NC_020536	GGTATG	2	12	126969	126980	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470196300
63	NC_020536	CAGATT	2	12	129567	129578	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196302
64	NC_020536	AGATAT	2	12	136943	136954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196309
65	NC_020536	ATGCCT	2	12	138082	138093	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470196310
66	NC_020536	TGAAAG	2	12	138722	138733	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470196310
67	NC_020536	GATATG	2	12	146222	146233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196316
68	NC_020536	ATTTGA	2	12	150128	150139	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196319
69	NC_020536	GATTTT	2	12	154639	154650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470196324
70	NC_020536	ACAAAG	2	12	159159	159170	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470196328
71	NC_020536	AAAGAT	2	12	161172	161183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470196329
72	NC_020536	ATTAAT	2	12	163078	163089	50 %	50 %	0 %	0 %	470196330
73	NC_020536	CAATAT	2	12	163644	163655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470196330
74	NC_020536	TTGGTA	2	12	167729	167740	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470196334
75	NC_020536	GCGATT	2	12	167749	167760	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470196334
76	NC_020536	AAATTT	2	12	167847	167858	50 %	50 %	0 %	0 %	470196334
77	NC_020536	ACCTGC	2	12	170750	170761	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470196336
78	NC_020536	AAGATA	2	12	170896	170907	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470196336
79	NC_020536	CGTTAA	2	12	173830	173841	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196338
80	NC_020536	CTATTA	2	12	175681	175692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470196338
81	NC_020536	TATGAT	2	12	177215	177226	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196338
82	NC_020536	TTGAAA	2	12	177667	177678	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196338
83	NC_020536	AACATT	2	12	180107	180118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470196338
84	NC_020536	AGCAAC	2	12	183596	183607	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470196342
85	NC_020536	TGTTTG	2	12	183644	183655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196342
86	NC_020536	CACCTT	2	12	185648	185659	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470196344
87	NC_020536	ACCTTT	2	12	186153	186164	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470196344
88	NC_020536	GTAAAT	2	12	189892	189903	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196347
89	NC_020536	ATTTTA	2	12	191487	191498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196348
90	NC_020536	TATCTT	2	12	196101	196112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470196351
91	NC_020536	ATTTGG	2	12	197114	197125	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470196352
92	NC_020536	GAGTTT	2	12	200457	200468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470196353
93	NC_020536	TATACA	2	12	204458	204469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470196357
94	NC_020536	TTATTT	2	12	206490	206501	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470196358
95	NC_020536	ATTTAT	2	12	207069	207080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196358
96	NC_020536	CCCTGA	2	12	209827	209838	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470196361
97	NC_020536	TCCTGA	2	12	210646	210657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470196361
98	NC_020536	TCAATT	2	12	212797	212808	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470196363
99	NC_020536	AATATG	2	12	214097	214108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196364
100	NC_020536	AAAAAT	2	12	217604	217615	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470196366
101	NC_020536	AGGACA	2	12	219464	219475	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470196368
102	NC_020536	ACATTT	2	12	219800	219811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470196368
103	NC_020536	TTCTTG	2	12	224729	224740	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470196372
104	NC_020536	GGACGT	2	12	235231	235242	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470196381
105	NC_020536	TATAGA	2	12	267763	267774	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196400
106	NC_020536	ACGATG	2	12	274392	274403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470196405
107	NC_020536	AGAATC	2	12	281950	281961	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470196410
108	NC_020536	AAGTAA	2	12	285373	285384	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470196414
109	NC_020536	ATAAAG	2	12	286354	286365	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470196415
110	NC_020536	GACATT	2	12	288045	288056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196416
111	NC_020536	GATTTC	2	12	289864	289875	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196418
112	NC_020536	TTCATA	2	12	290434	290445	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470196419
113	NC_020536	GATTAT	2	12	294841	294852	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196422
114	NC_020536	ATGGTG	2	12	294974	294985	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470196422
115	NC_020536	CAGCAA	2	12	295361	295372	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470196422
116	NC_020536	TCTTCA	2	12	300940	300951	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470196427
117	NC_020536	TTATCT	2	12	301036	301047	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470196427
118	NC_020536	GAAAAA	2	12	303298	303309	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196429
119	NC_020536	GATACA	2	12	304463	304474	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470196429
120	NC_020536	ACAAGA	2	12	307630	307641	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470196430
121	NC_020536	AGGACA	2	12	308008	308019	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470196430
122	NC_020536	TAAATT	2	12	310858	310869	50 %	50 %	0 %	0 %	470196431
123	NC_020536	TGAAGA	2	12	311119	311130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470196431
124	NC_020536	TAAAAC	2	12	317568	317579	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470196435
125	NC_020536	CTGAAT	2	12	324053	324064	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196441
126	NC_020536	GAAAAA	2	12	328248	328259	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196444
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137	NC_020536	GATGCT	2	12	367073	367084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470196475
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219	NC_020536	CTGGTA	2	12	562898	562909	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470196609
220	NC_020536	ACGACT	2	12	564622	564633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196611
221	NC_020536	AACGTG	2	12	565595	565606	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470196611
222	NC_020536	TTCGAA	2	12	566116	566127	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196611
223	NC_020536	TACAGC	2	12	568362	568373	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196613
224	NC_020536	TTGCTA	2	12	568643	568654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196613
225	NC_020536	AAATCA	2	12	569766	569777	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470196614
226	NC_020536	TTATGA	2	12	575410	575421	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470196618
227	NC_020536	TTTCTT	2	12	578604	578615	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470196621
228	NC_020536	AAGCAC	2	12	579532	579543	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470196622
229	NC_020536	ACTGCA	2	12	581538	581549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196624
230	NC_020536	TTAAAA	2	12	581934	581945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196624
231	NC_020536	TCAGAT	2	12	583476	583487	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196624
232	NC_020536	GACTCA	2	12	583491	583502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196624
233	NC_020536	GACTCA	2	12	583509	583520	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196624
234	NC_020536	GACTCA	2	12	583539	583550	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196624
235	NC_020536	GACTCA	2	12	583611	583622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196624
236	NC_020536	GACTCA	2	12	583659	583670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196624
237	NC_020536	TCAGAT	2	12	583716	583727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196624
238	NC_020536	GATTCA	2	12	583821	583832	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196624
239	NC_020536	GATTCA	2	12	583839	583850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196624
240	NC_020536	TCAGAT	2	12	583860	583871	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196624
241	NC_020536	GACTCA	2	12	583875	583886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196624
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249	NC_020536	GATTCA	2	12	587955	587966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196625
250	NC_020536	GATTCA	2	12	587973	587984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196625
251	NC_020536	GACTCA	2	12	587991	588002	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196625
252	NC_020536	GACTCA	2	12	588009	588020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196625
253	NC_020536	GATTCA	2	12	588027	588038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196625
254	NC_020536	TCAGAC	2	12	588048	588059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196625
255	NC_020536	GATTCA	2	12	588063	588074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196625
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258	NC_020536	GACTCA	2	12	588171	588182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196625
259	NC_020536	GATTCA	2	12	588189	588200	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196625
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261	NC_020536	GATTCA	2	12	588225	588236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196625
262	NC_020536	TCAGAT	2	12	588246	588257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196625
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342	NC_020536	GAAAAA	2	12	761987	761998	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196760
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345	NC_020536	AATGAT	2	12	764512	764523	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196762
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455	NC_020536	TAGAGG	2	12	992403	992414	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	470196923
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