MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	T	6	6	113	118	0 %	100 %	0 %	0 %	469816295
2	NC_020535	T	6	6	167	172	0 %	100 %	0 %	0 %	469816295
3	NC_020535	A	7	7	338	344	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
4	NC_020535	A	6	6	356	361	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
5	NC_020535	A	6	6	390	395	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
6	NC_020535	A	6	6	830	835	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
7	NC_020535	A	6	6	929	934	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
8	NC_020535	A	6	6	1021	1026	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
9	NC_020535	A	6	6	2223	2228	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
10	NC_020535	T	6	6	2263	2268	0 %	100 %	0 %	0 %	469816296
11	NC_020535	C	6	6	2276	2281	0 %	0 %	0 %	100 %	469816296
12	NC_020535	A	9	9	2428	2436	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
13	NC_020535	A	7	7	2499	2505	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
14	NC_020535	A	6	6	2640	2645	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
15	NC_020535	A	6	6	3249	3254	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
16	NC_020535	A	6	6	3267	3272	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
17	NC_020535	A	7	7	3906	3912	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
18	NC_020535	A	6	6	4338	4343	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
19	NC_020535	A	6	6	4420	4425	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
20	NC_020535	T	6	6	4634	4639	0 %	100 %	0 %	0 %	469816296
21	NC_020535	A	6	6	4679	4684	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
22	NC_020535	A	7	7	4818	4824	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
23	NC_020535	A	6	6	5030	5035	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
24	NC_020535	A	6	6	5927	5932	100 %	0 %	0 %	0 %	469816297
25	NC_020535	A	7	7	6838	6844	100 %	0 %	0 %	0 %	469816298
26	NC_020535	A	7	7	8391	8397	100 %	0 %	0 %	0 %	469816299
27	NC_020535	A	6	6	8481	8486	100 %	0 %	0 %	0 %	469816299
28	NC_020535	A	6	6	9087	9092	100 %	0 %	0 %	0 %	469816300
29	NC_020535	A	6	6	10185	10190	100 %	0 %	0 %	0 %	469816301
30	NC_020535	A	6	6	10373	10378	100 %	0 %	0 %	0 %	469816301
31	NC_020535	T	6	6	10776	10781	0 %	100 %	0 %	0 %	469816301
32	NC_020535	A	6	6	10878	10883	100 %	0 %	0 %	0 %	469816301
33	NC_020535	A	7	7	10995	11001	100 %	0 %	0 %	0 %	469816301
34	NC_020535	A	6	6	11206	11211	100 %	0 %	0 %	0 %	469816302
35	NC_020535	A	6	6	11238	11243	100 %	0 %	0 %	0 %	469816302
36	NC_020535	A	8	8	11806	11813	100 %	0 %	0 %	0 %	469816303
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38	NC_020535	A	6	6	12627	12632	100 %	0 %	0 %	0 %	469816304
39	NC_020535	A	6	6	12888	12893	100 %	0 %	0 %	0 %	469816304
40	NC_020535	A	6	6	12916	12921	100 %	0 %	0 %	0 %	469816304
41	NC_020535	A	6	6	13255	13260	100 %	0 %	0 %	0 %	469816304
42	NC_020535	A	6	6	13344	13349	100 %	0 %	0 %	0 %	469816304
43	NC_020535	T	6	6	13468	13473	0 %	100 %	0 %	0 %	469816304
44	NC_020535	A	6	6	14289	14294	100 %	0 %	0 %	0 %	469816304
45	NC_020535	T	6	6	14657	14662	0 %	100 %	0 %	0 %	469816305
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47	NC_020535	T	6	6	14846	14851	0 %	100 %	0 %	0 %	469816305
48	NC_020535	T	6	6	15022	15027	0 %	100 %	0 %	0 %	469816305
49	NC_020535	A	6	6	15145	15150	100 %	0 %	0 %	0 %	469816305
50	NC_020535	A	6	6	15362	15367	100 %	0 %	0 %	0 %	469816305
51	NC_020535	A	6	6	15375	15380	100 %	0 %	0 %	0 %	469816305
52	NC_020535	A	7	7	15385	15391	100 %	0 %	0 %	0 %	469816305
53	NC_020535	A	6	6	15662	15667	100 %	0 %	0 %	0 %	469816305
54	NC_020535	A	6	6	15758	15763	100 %	0 %	0 %	0 %	469816305
55	NC_020535	A	6	6	15862	15867	100 %	0 %	0 %	0 %	469816306
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57	NC_020535	A	7	7	16070	16076	100 %	0 %	0 %	0 %	469816306
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60	NC_020535	A	6	6	16293	16298	100 %	0 %	0 %	0 %	469816306
61	NC_020535	A	6	6	16780	16785	100 %	0 %	0 %	0 %	469816306
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63	NC_020535	A	6	6	16909	16914	100 %	0 %	0 %	0 %	469816307
64	NC_020535	A	6	6	17003	17008	100 %	0 %	0 %	0 %	469816307
65	NC_020535	A	7	7	17172	17178	100 %	0 %	0 %	0 %	469816307
66	NC_020535	A	6	6	17260	17265	100 %	0 %	0 %	0 %	469816307
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70	NC_020535	A	6	6	18138	18143	100 %	0 %	0 %	0 %	469816308
71	NC_020535	A	6	6	18740	18745	100 %	0 %	0 %	0 %	469816308
72	NC_020535	A	7	7	18773	18779	100 %	0 %	0 %	0 %	469816308
73	NC_020535	A	6	6	18845	18850	100 %	0 %	0 %	0 %	469816308
74	NC_020535	A	7	7	18998	19004	100 %	0 %	0 %	0 %	469816308
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103	NC_020535	A	6	6	27333	27338	100 %	0 %	0 %	0 %	469816316
104	NC_020535	A	8	8	27397	27404	100 %	0 %	0 %	0 %	469816316
105	NC_020535	A	7	7	27459	27465	100 %	0 %	0 %	0 %	469816316
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107	NC_020535	A	6	6	29362	29367	100 %	0 %	0 %	0 %	469816318
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109	NC_020535	A	7	7	30562	30568	100 %	0 %	0 %	0 %	469816319
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111	NC_020535	A	6	6	31474	31479	100 %	0 %	0 %	0 %	469816319
112	NC_020535	A	6	6	31542	31547	100 %	0 %	0 %	0 %	469816319
113	NC_020535	A	6	6	31828	31833	100 %	0 %	0 %	0 %	469816319
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116	NC_020535	T	7	7	33628	33634	0 %	100 %	0 %	0 %	469816321
117	NC_020535	T	7	7	33673	33679	0 %	100 %	0 %	0 %	469816321
118	NC_020535	T	6	6	34055	34060	0 %	100 %	0 %	0 %	469816321
119	NC_020535	A	6	6	36059	36064	100 %	0 %	0 %	0 %	469816322
120	NC_020535	A	6	6	36135	36140	100 %	0 %	0 %	0 %	469816322
121	NC_020535	A	6	6	36379	36384	100 %	0 %	0 %	0 %	469816322

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.