MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020533	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	470194246
2	NC_020533	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	470194247
3	NC_020533	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	470194247
4	NC_020533	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	470194247
5	NC_020533	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	470194249
6	NC_020533	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	470194250
7	NC_020533	ATCGC	2	10	10192	10201	20 %	20 %	20 %	40 %	470194251
8	NC_020533	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	470194252
9	NC_020533	GCAAG	2	10	16624	16633	40 %	0 %	40 %	20 %	470194255
10	NC_020533	TTTGA	2	10	16783	16792	20 %	60 %	20 %	0 %	470194255
11	NC_020533	TCAAT	2	10	18920	18929	40 %	40 %	0 %	20 %	470194257
12	NC_020533	AGTTA	2	10	22098	22107	40 %	40 %	20 %	0 %	470194258
13	NC_020533	ATGTA	2	10	23656	23665	40 %	40 %	20 %	0 %	470194259
14	NC_020533	ACCAA	2	10	26266	26275	60 %	0 %	0 %	40 %	470194261
15	NC_020533	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	470194261
16	NC_020533	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	470194262
17	NC_020533	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	470194262
18	NC_020533	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	470194263
19	NC_020533	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	470194263
20	NC_020533	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	470194265
21	NC_020533	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	470194265
22	NC_020533	TATGA	2	10	32680	32689	40 %	40 %	20 %	0 %	470194265
23	NC_020533	CATTA	2	10	33910	33919	40 %	40 %	0 %	20 %	470194266
24	NC_020533	AAATG	2	10	35554	35563	60 %	20 %	20 %	0 %	470194268
25	NC_020533	ATTTT	2	10	35635	35644	20 %	80 %	0 %	0 %	470194268
26	NC_020533	TGAAT	2	10	37533	37542	40 %	40 %	20 %	0 %	470194269
27	NC_020533	TTGGT	2	10	37575	37584	0 %	60 %	40 %	0 %	470194269
28	NC_020533	AATAT	2	10	37643	37652	60 %	40 %	0 %	0 %	470194269
29	NC_020533	TTCGT	2	10	37854	37863	0 %	60 %	20 %	20 %	470194269
30	NC_020533	AAATT	2	10	40313	40322	60 %	40 %	0 %	0 %	470194270
31	NC_020533	TTGAA	2	10	42342	42351	40 %	40 %	20 %	0 %	470194272
32	NC_020533	TTGAA	2	10	42688	42697	40 %	40 %	20 %	0 %	470194272
33	NC_020533	ATATT	2	10	45359	45368	40 %	60 %	0 %	0 %	470194274
34	NC_020533	GAATT	2	10	46276	46285	40 %	40 %	20 %	0 %	470194275
35	NC_020533	TCAGT	2	10	48177	48186	20 %	40 %	20 %	20 %	470194276
36	NC_020533	GGCCA	2	10	53184	53193	20 %	0 %	40 %	40 %	470194279
37	NC_020533	TAAAT	2	10	58894	58903	60 %	40 %	0 %	0 %	470194283
38	NC_020533	ATATT	2	10	60766	60775	40 %	60 %	0 %	0 %	470194284
39	NC_020533	AATGT	2	10	61491	61500	40 %	40 %	20 %	0 %	470194285
40	NC_020533	TAGTA	2	10	65039	65048	40 %	40 %	20 %	0 %	470194286
41	NC_020533	TACTA	2	10	66399	66408	40 %	40 %	0 %	20 %	470194287
42	NC_020533	ATCAA	2	10	69149	69158	60 %	20 %	0 %	20 %	470194289
43	NC_020533	TAATA	2	10	70981	70990	60 %	40 %	0 %	0 %	470194290
44	NC_020533	TATAT	2	10	73917	73926	40 %	60 %	0 %	0 %	470194292
45	NC_020533	CTAAA	2	10	75557	75566	60 %	20 %	0 %	20 %	470194293
46	NC_020533	CAAAA	2	10	75588	75597	80 %	0 %	0 %	20 %	470194293
47	NC_020533	GATAT	2	10	80280	80289	40 %	40 %	20 %	0 %	470194296
48	NC_020533	ATATA	2	10	81103	81112	60 %	40 %	0 %	0 %	470194297
49	NC_020533	GATAT	2	10	81937	81946	40 %	40 %	20 %	0 %	470194298
50	NC_020533	AATAA	2	10	82567	82576	80 %	20 %	0 %	0 %	470194299
51	NC_020533	ATTGC	2	10	84546	84555	20 %	40 %	20 %	20 %	470194301
52	NC_020533	TCATT	2	10	84734	84743	20 %	60 %	0 %	20 %	470194301
53	NC_020533	CATGG	2	10	85950	85959	20 %	20 %	40 %	20 %	470194301
54	NC_020533	TGAAA	2	10	86618	86627	60 %	20 %	20 %	0 %	470194302
55	NC_020533	TCAAT	2	10	86990	86999	40 %	40 %	0 %	20 %	470194302
56	NC_020533	GTATT	2	10	87479	87488	20 %	60 %	20 %	0 %	470194303
57	NC_020533	ATTAA	2	10	90221	90230	60 %	40 %	0 %	0 %	470194304
58	NC_020533	AGATA	2	10	93340	93349	60 %	20 %	20 %	0 %	470194306
59	NC_020533	TAAAA	2	10	93900	93909	80 %	20 %	0 %	0 %	470194306
60	NC_020533	ATACA	2	10	94330	94339	60 %	20 %	0 %	20 %	470194307
61	NC_020533	AAAGA	2	10	95533	95542	80 %	0 %	20 %	0 %	470194307
62	NC_020533	ATGTT	2	10	97018	97027	20 %	60 %	20 %	0 %	470194309
63	NC_020533	TTGCG	2	10	97589	97598	0 %	40 %	40 %	20 %	470194309
64	NC_020533	AGTTA	2	10	99149	99158	40 %	40 %	20 %	0 %	470194310
65	NC_020533	GGTGA	2	10	102944	102953	20 %	20 %	60 %	0 %	470194313
66	NC_020533	GAAAA	2	10	106381	106390	80 %	0 %	20 %	0 %	470194316
67	NC_020533	TTATT	2	10	106548	106557	20 %	80 %	0 %	0 %	470194316
68	NC_020533	AATCA	2	10	109570	109579	60 %	20 %	0 %	20 %	470194318
69	NC_020533	ATTTT	2	10	110268	110277	20 %	80 %	0 %	0 %	470194319
70	NC_020533	ATCAA	2	10	110295	110304	60 %	20 %	0 %	20 %	470194319
71	NC_020533	ATCAC	2	10	111528	111537	40 %	20 %	0 %	40 %	470194320
72	NC_020533	AACGA	2	10	112205	112214	60 %	0 %	20 %	20 %	470194320
73	NC_020533	ACACA	2	10	114261	114270	60 %	0 %	0 %	40 %	470194322
74	NC_020533	GACAA	2	10	115412	115421	60 %	0 %	20 %	20 %	470194323
75	NC_020533	ATTAC	2	10	117596	117605	40 %	40 %	0 %	20 %	470194325
76	NC_020533	TATCT	2	10	118256	118265	20 %	60 %	0 %	20 %	470194326
77	NC_020533	ATACG	2	10	120689	120698	40 %	20 %	20 %	20 %	470194328
78	NC_020533	TTATA	2	10	121347	121356	40 %	60 %	0 %	0 %	470194329
79	NC_020533	TTTTA	2	10	122145	122154	20 %	80 %	0 %	0 %	470194329
80	NC_020533	GTATT	2	10	122658	122667	20 %	60 %	20 %	0 %	470194330
81	NC_020533	AATAA	2	10	123251	123260	80 %	20 %	0 %	0 %	470194330
82	NC_020533	TACGC	2	10	123518	123527	20 %	20 %	20 %	40 %	470194330
83	NC_020533	TCCCT	2	10	126324	126333	0 %	40 %	0 %	60 %	470194333
84	NC_020533	GCTTT	2	10	128558	128567	0 %	60 %	20 %	20 %	470194335
85	NC_020533	TAATT	2	10	128643	128652	40 %	60 %	0 %	0 %	470194335
86	NC_020533	ATACT	2	10	129824	129833	40 %	40 %	0 %	20 %	470194337
87	NC_020533	TAATA	2	10	130988	130997	60 %	40 %	0 %	0 %	470194338
88	NC_020533	ATTTT	2	10	131979	131988	20 %	80 %	0 %	0 %	470194339
89	NC_020533	TTGTA	2	10	134184	134193	20 %	60 %	20 %	0 %	470194341
90	NC_020533	TGCAA	2	10	135189	135198	40 %	20 %	20 %	20 %	470194342
91	NC_020533	ATATG	2	10	137207	137216	40 %	40 %	20 %	0 %	470194343
92	NC_020533	TATGA	2	10	138887	138896	40 %	40 %	20 %	0 %	470194345
93	NC_020533	AATAT	2	10	139893	139902	60 %	40 %	0 %	0 %	470194345
94	NC_020533	TGGTA	2	10	141790	141799	20 %	40 %	40 %	0 %	470194346
95	NC_020533	CGAAC	2	10	141880	141889	40 %	0 %	20 %	40 %	470194346
96	NC_020533	TTCAA	2	10	143905	143914	40 %	40 %	0 %	20 %	470194347
97	NC_020533	ACATC	2	10	144748	144757	40 %	20 %	0 %	40 %	470194349
98	NC_020533	TAATT	2	10	146971	146980	40 %	60 %	0 %	0 %	470194350
99	NC_020533	AGAGA	2	10	149997	150006	60 %	0 %	40 %	0 %	470194353
100	NC_020533	AATCC	2	10	150353	150362	40 %	20 %	0 %	40 %	470194353
101	NC_020533	TGAAT	2	10	159109	159118	40 %	40 %	20 %	0 %	470194362
102	NC_020533	TTCAT	2	10	163347	163356	20 %	60 %	0 %	20 %	470194364
103	NC_020533	TTTAC	2	10	163730	163739	20 %	60 %	0 %	20 %	470194364
104	NC_020533	TTATT	2	10	164944	164953	20 %	80 %	0 %	0 %	470194365
105	NC_020533	GGATT	2	10	165932	165941	20 %	40 %	40 %	0 %	470194366
106	NC_020533	TAACT	2	10	168969	168978	40 %	40 %	0 %	20 %	470194369
107	NC_020533	TTTAT	2	10	171877	171886	20 %	80 %	0 %	0 %	470194371
108	NC_020533	ATGCA	2	10	173480	173489	40 %	20 %	20 %	20 %	470194372
109	NC_020533	TATGA	2	10	180726	180735	40 %	40 %	20 %	0 %	470194373
110	NC_020533	GTGAA	2	10	180760	180769	40 %	20 %	40 %	0 %	470194373
111	NC_020533	TTAAT	2	10	181203	181212	40 %	60 %	0 %	0 %	470194374
112	NC_020533	ATATA	2	10	184033	184042	60 %	40 %	0 %	0 %	470194377
113	NC_020533	AAGAT	2	10	187762	187771	60 %	20 %	20 %	0 %	470194379
114	NC_020533	CGTTT	2	10	188210	188219	0 %	60 %	20 %	20 %	470194380
115	NC_020533	AAATG	2	10	190690	190699	60 %	20 %	20 %	0 %	470194382
116	NC_020533	GTAAA	2	10	190854	190863	60 %	20 %	20 %	0 %	470194382
117	NC_020533	TTTAA	2	10	190874	190883	40 %	60 %	0 %	0 %	470194382
118	NC_020533	TTTGC	2	10	191390	191399	0 %	60 %	20 %	20 %	470194382
119	NC_020533	TTGTT	2	10	192396	192405	0 %	80 %	20 %	0 %	470194382
120	NC_020533	CAAAA	2	10	195608	195617	80 %	0 %	0 %	20 %	470194385
121	NC_020533	AGTTT	2	10	196144	196153	20 %	60 %	20 %	0 %	470194385
122	NC_020533	CAACA	2	10	196374	196383	60 %	0 %	0 %	40 %	470194385
123	NC_020533	AAAAT	2	10	197002	197011	80 %	20 %	0 %	0 %	470194386
124	NC_020533	AAATG	2	10	197411	197420	60 %	20 %	20 %	0 %	470194386
125	NC_020533	TTGAA	2	10	198685	198694	40 %	40 %	20 %	0 %	470194387
126	NC_020533	ATTAT	2	10	200641	200650	40 %	60 %	0 %	0 %	470194387
127	NC_020533	AATAG	2	10	201407	201416	60 %	20 %	20 %	0 %	470194388
128	NC_020533	ATACA	2	10	202044	202053	60 %	20 %	0 %	20 %	470194389
129	NC_020533	GTGTT	2	10	204729	204738	0 %	60 %	40 %	0 %	470194391
130	NC_020533	TAATT	2	10	207233	207242	40 %	60 %	0 %	0 %	470194393
131	NC_020533	TCTAT	2	10	207366	207375	20 %	60 %	0 %	20 %	470194393
132	NC_020533	ATAAA	2	10	207481	207490	80 %	20 %	0 %	0 %	470194393
133	NC_020533	AAAGA	2	10	208136	208145	80 %	0 %	20 %	0 %	470194394
134	NC_020533	CATGT	2	10	209341	209350	20 %	40 %	20 %	20 %	470194395
135	NC_020533	TTGAA	2	10	209416	209425	40 %	40 %	20 %	0 %	470194395
136	NC_020533	AATTG	2	10	210741	210750	40 %	40 %	20 %	0 %	470194395
137	NC_020533	TTTTC	2	10	210990	210999	0 %	80 %	0 %	20 %	470194396
138	NC_020533	TCAAT	2	10	211429	211438	40 %	40 %	0 %	20 %	470194396
139	NC_020533	TTATT	2	10	211462	211471	20 %	80 %	0 %	0 %	470194396
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249	NC_020533	TCTAT	2	10	390513	390522	20 %	60 %	0 %	20 %	470194526
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254	NC_020533	CATGC	2	10	398172	398181	20 %	20 %	20 %	40 %	470194531
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256	NC_020533	CAATA	2	10	401104	401113	60 %	20 %	0 %	20 %	470194533
257	NC_020533	TTACT	2	10	402188	402197	20 %	60 %	0 %	20 %	470194534
258	NC_020533	CGATT	2	10	402610	402619	20 %	40 %	20 %	20 %	470194534
259	NC_020533	GCTGT	2	10	403716	403725	0 %	40 %	40 %	20 %	470194535
260	NC_020533	CTGCA	2	10	406641	406650	20 %	20 %	20 %	40 %	470194538
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262	NC_020533	TTAAA	2	10	408441	408450	60 %	40 %	0 %	0 %	470194540
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