MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020533	GCG	2	6	177546	177551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470194372
3502	NC_020533	TA	3	6	177582	177587	50 %	50 %	0 %	0 %	470194372
3503	NC_020533	GGA	2	6	177632	177637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470194372
3504	NC_020533	TTGAAA	2	12	177670	177681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194372
3505	NC_020533	TTG	2	6	177721	177726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194372
3506	NC_020533	ATG	2	6	177748	177753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194372
3507	NC_020533	TTG	2	6	177867	177872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194372
3508	NC_020533	TGCA	2	8	177880	177887	25 %	25 %	25 %	25 %	470194372
3509	NC_020533	TTG	2	6	177974	177979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194372
3510	NC_020533	AG	3	6	178014	178019	50 %	0 %	50 %	0 %	470194372
3511	NC_020533	ACA	2	6	178043	178048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194372
3512	NC_020533	TAA	2	6	178055	178060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194372
3513	NC_020533	GTA	2	6	178099	178104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194372
3514	NC_020533	AT	3	6	178172	178177	50 %	50 %	0 %	0 %	470194372
3515	NC_020533	TCA	2	6	178231	178236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194372
3516	NC_020533	CAT	2	6	178251	178256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194372
3517	NC_020533	TAT	2	6	178319	178324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194372
3518	NC_020533	AT	3	6	178397	178402	50 %	50 %	0 %	0 %	470194372
3519	NC_020533	AAT	2	6	178437	178442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194372
3520	NC_020533	GTG	2	6	178471	178476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194372
3521	NC_020533	GAA	2	6	178519	178524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194372
3522	NC_020533	TGA	2	6	178565	178570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194372
3523	NC_020533	TGT	2	6	178613	178618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194372
3524	NC_020533	AT	3	6	178645	178650	50 %	50 %	0 %	0 %	470194372
3525	NC_020533	TTA	2	6	178658	178663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194372
3526	NC_020533	CAA	2	6	178674	178679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194372
3527	NC_020533	TAC	2	6	178790	178795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194372
3528	NC_020533	ACA	2	6	178820	178825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194372
3529	NC_020533	TAA	2	6	178829	178834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194372
3530	NC_020533	TTG	2	6	178873	178878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194372
3531	NC_020533	ATG	2	6	178906	178911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194372
3532	NC_020533	GAT	2	6	178923	178928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194372
3533	NC_020533	TGG	2	6	178940	178945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194372
3534	NC_020533	CAT	2	6	178995	179000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194372
3535	NC_020533	CAA	2	6	179067	179072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194372
3536	NC_020533	T	6	6	179204	179209	0 %	100 %	0 %	0 %	470194372
3537	NC_020533	TGA	2	6	179302	179307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194372
3538	NC_020533	ATT	2	6	179320	179325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194372
3539	NC_020533	AGA	2	6	179330	179335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194372
3540	NC_020533	ATG	2	6	179346	179351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194372
3541	NC_020533	TTG	2	6	179371	179376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194372
3542	NC_020533	GAT	2	6	179394	179399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194372
3543	NC_020533	GTT	2	6	179400	179405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194372
3544	NC_020533	ATT	2	6	179427	179432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194372
3545	NC_020533	TGA	4	12	179462	179473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194372
3546	NC_020533	CAA	2	6	179523	179528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194372
3547	NC_020533	CAT	2	6	179529	179534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194372
3548	NC_020533	AT	3	6	179544	179549	50 %	50 %	0 %	0 %	470194372
3549	NC_020533	AGA	2	6	179591	179596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194372
3550	NC_020533	ACT	2	6	179633	179638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194372
3551	NC_020533	AAT	2	6	179697	179702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194372
3552	NC_020533	AATG	2	8	179801	179808	50 %	25 %	25 %	0 %	470194372
3553	NC_020533	AC	3	6	179914	179919	50 %	0 %	0 %	50 %	470194372
3554	NC_020533	TAA	2	6	179948	179953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194372
3555	NC_020533	AAC	3	9	180085	180093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194372
3556	NC_020533	GATA	2	8	180101	180108	50 %	25 %	25 %	0 %	470194372
3557	NC_020533	AACATT	2	12	180110	180121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470194372
3558	NC_020533	AAT	2	6	180125	180130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194372
3559	NC_020533	TAAC	2	8	180160	180167	50 %	25 %	0 %	25 %	470194372
3560	NC_020533	AT	3	6	180191	180196	50 %	50 %	0 %	0 %	470194372
3561	NC_020533	TAAG	2	8	180212	180219	50 %	25 %	25 %	0 %	470194372
3562	NC_020533	GAA	2	6	180276	180281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194373
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3564	NC_020533	TTA	2	6	180408	180413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194373
3565	NC_020533	GT	4	8	180525	180532	0 %	50 %	50 %	0 %	470194373
3566	NC_020533	AAAG	2	8	180672	180679	75 %	0 %	25 %	0 %	470194373
3567	NC_020533	ATTG	2	8	180689	180696	25 %	50 %	25 %	0 %	470194373
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3569	NC_020533	ATCA	2	8	180751	180758	50 %	25 %	0 %	25 %	470194373
3570	NC_020533	GTGAA	2	10	180760	180769	40 %	20 %	40 %	0 %	470194373
3571	NC_020533	ATTT	2	8	180779	180786	25 %	75 %	0 %	0 %	470194373
3572	NC_020533	A	6	6	180840	180845	100 %	0 %	0 %	0 %	470194373
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3574	NC_020533	TTAAT	2	10	181203	181212	40 %	60 %	0 %	0 %	470194374
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3578	NC_020533	AAT	2	6	181357	181362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194374
3579	NC_020533	TAAG	2	8	181404	181411	50 %	25 %	25 %	0 %	470194374
3580	NC_020533	T	6	6	181416	181421	0 %	100 %	0 %	0 %	470194374
3581	NC_020533	AAT	2	6	181437	181442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194374
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3587	NC_020533	AT	3	6	182118	182123	50 %	50 %	0 %	0 %	470194375
3588	NC_020533	TGA	2	6	182124	182129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194375
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3590	NC_020533	TGA	2	6	182167	182172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194375
3591	NC_020533	ATG	3	9	182215	182223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194375
3592	NC_020533	CAT	2	6	182269	182274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194375
3593	NC_020533	TGA	2	6	182296	182301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194375
3594	NC_020533	TTG	2	6	182375	182380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194375
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3596	NC_020533	GT	3	6	182493	182498	0 %	50 %	50 %	0 %	470194375
3597	NC_020533	TAA	2	6	182584	182589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194375
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3599	NC_020533	TGT	2	6	182647	182652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194375
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3601	NC_020533	GATG	2	8	182661	182668	25 %	25 %	50 %	0 %	470194375
3602	NC_020533	CCA	2	6	182688	182693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194375
3603	NC_020533	ATG	2	6	182743	182748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194376
3604	NC_020533	TCA	2	6	182871	182876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194376
3605	NC_020533	TTG	2	6	183106	183111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194376
3606	NC_020533	CAA	2	6	183172	183177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194376
3607	NC_020533	TAA	2	6	183314	183319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194376
3608	NC_020533	TGA	2	6	183321	183326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194376
3609	NC_020533	GTT	2	6	183354	183359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194376
3610	NC_020533	AGCA	2	8	183365	183372	50 %	0 %	25 %	25 %	470194376
3611	NC_020533	ACC	2	6	183416	183421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194376
3612	NC_020533	GTT	2	6	183483	183488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194376
3613	NC_020533	AGCAAC	2	12	183599	183610	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470194376
3614	NC_020533	GTT	2	6	183631	183636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194376
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3620	NC_020533	TA	3	6	183799	183804	50 %	50 %	0 %	0 %	470194376
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3988	NC_020533	ATACA	2	10	202044	202053	60 %	20 %	0 %	20 %	470194389
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3990	NC_020533	AAT	2	6	202129	202134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194389
3991	NC_020533	A	6	6	202183	202188	100 %	0 %	0 %	0 %	470194389
3992	NC_020533	TTAA	2	8	202198	202205	50 %	50 %	0 %	0 %	470194389
3993	NC_020533	TAA	2	6	202221	202226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194389
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3999	NC_020533	GTAT	2	8	202403	202410	25 %	50 %	25 %	0 %	470194389
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