MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020533	GCA	2	6	282026	282031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194444
5502	NC_020533	GT	3	6	282070	282075	0 %	50 %	50 %	0 %	470194444
5503	NC_020533	AGG	2	6	282096	282101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470194444
5504	NC_020533	AATA	2	8	282102	282109	75 %	25 %	0 %	0 %	470194444
5505	NC_020533	GAT	2	6	282127	282132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194445
5506	NC_020533	TTA	2	6	282163	282168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194445
5507	NC_020533	TGG	2	6	282177	282182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194445
5508	NC_020533	GAA	2	6	282187	282192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194445
5509	NC_020533	ACT	2	6	282231	282236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194445
5510	NC_020533	ATCA	2	8	282238	282245	50 %	25 %	0 %	25 %	470194445
5511	NC_020533	ATT	2	6	282337	282342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194445
5512	NC_020533	GTGC	2	8	282451	282458	0 %	25 %	50 %	25 %	470194445
5513	NC_020533	GAT	2	6	282472	282477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194445
5514	NC_020533	CAA	2	6	282568	282573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194445
5515	NC_020533	ATT	2	6	282577	282582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194445
5516	NC_020533	CA	3	6	282591	282596	50 %	0 %	0 %	50 %	470194445
5517	NC_020533	CATA	2	8	282612	282619	50 %	25 %	0 %	25 %	470194445
5518	NC_020533	ACA	2	6	282640	282645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194445
5519	NC_020533	AT	3	6	282708	282713	50 %	50 %	0 %	0 %	470194445
5520	NC_020533	CAA	2	6	282742	282747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194445
5521	NC_020533	AC	3	6	283420	283425	50 %	0 %	0 %	50 %	470194446
5522	NC_020533	ATT	2	6	283475	283480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194446
5523	NC_020533	A	6	6	283483	283488	100 %	0 %	0 %	0 %	470194446
5524	NC_020533	TCT	2	6	283498	283503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194446
5525	NC_020533	ATT	2	6	283596	283601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194446
5526	NC_020533	CTT	3	9	283604	283612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194446
5527	NC_020533	CAA	2	6	283621	283626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194446
5528	NC_020533	TA	3	6	283645	283650	50 %	50 %	0 %	0 %	470194446
5529	NC_020533	AGG	2	6	283691	283696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470194446
5530	NC_020533	TTA	2	6	283722	283727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194446
5531	NC_020533	ATT	2	6	283728	283733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194446
5532	NC_020533	ATG	2	6	283765	283770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194446
5533	NC_020533	AGC	2	6	283793	283798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194446
5534	NC_020533	GGT	2	6	283836	283841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194446
5535	NC_020533	CAT	2	6	283855	283860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194446
5536	NC_020533	ATT	2	6	283884	283889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194446
5537	NC_020533	TAA	2	6	283901	283906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194446
5538	NC_020533	CA	3	6	283971	283976	50 %	0 %	0 %	50 %	470194446
5539	NC_020533	AGA	2	6	284012	284017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194446
5540	NC_020533	GTT	2	6	284055	284060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194446
5541	NC_020533	TTC	2	6	284091	284096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194446
5542	NC_020533	TATT	2	8	284201	284208	25 %	75 %	0 %	0 %	470194447
5543	NC_020533	TGG	2	6	284301	284306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194447
5544	NC_020533	GTA	2	6	284338	284343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194447
5545	NC_020533	AAT	2	6	284425	284430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194447
5546	NC_020533	ATC	2	6	284453	284458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194447
5547	NC_020533	ATA	2	6	284486	284491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194447
5548	NC_020533	CAT	2	6	284512	284517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194447
5549	NC_020533	TAG	2	6	284544	284549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194447
5550	NC_020533	ATC	2	6	284555	284560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194447
5551	NC_020533	CTTA	2	8	284792	284799	25 %	50 %	0 %	25 %	470194447
5552	NC_020533	AATA	2	8	285066	285073	75 %	25 %	0 %	0 %	470194448
5553	NC_020533	GGT	2	6	285108	285113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194448
5554	NC_020533	TTG	2	6	285124	285129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194448
5555	NC_020533	ATG	2	6	285235	285240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194448
5556	NC_020533	ATTA	2	8	285299	285306	50 %	50 %	0 %	0 %	470194448
5557	NC_020533	AG	3	6	285323	285328	50 %	0 %	50 %	0 %	470194448
5558	NC_020533	AAGTAA	2	12	285376	285387	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470194448
5559	NC_020533	GTC	2	6	285421	285426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194448
5560	NC_020533	AAG	2	6	285439	285444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194448
5561	NC_020533	AG	3	6	285462	285467	50 %	0 %	50 %	0 %	470194448
5562	NC_020533	GAA	2	6	285504	285509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194448
5563	NC_020533	AGA	2	6	285584	285589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194448
5564	NC_020533	TCAT	2	8	285604	285611	25 %	50 %	0 %	25 %	470194448
5565	NC_020533	GTT	2	6	285695	285700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194448
5566	NC_020533	AT	3	6	285716	285721	50 %	50 %	0 %	0 %	470194448
5567	NC_020533	ACA	3	9	285722	285730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194448
5568	NC_020533	TTA	2	6	285757	285762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194448
5569	NC_020533	AATG	2	8	285797	285804	50 %	25 %	25 %	0 %	470194448
5570	NC_020533	TAA	2	6	285862	285867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194449
5571	NC_020533	GGT	2	6	285942	285947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194449
5572	NC_020533	GTG	2	6	285979	285984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194449
5573	NC_020533	TAT	2	6	286032	286037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194449
5574	NC_020533	ATC	2	6	286063	286068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194449
5575	NC_020533	TACG	2	8	286117	286124	25 %	25 %	25 %	25 %	470194449
5576	NC_020533	GAA	2	6	286176	286181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194449
5577	NC_020533	TGA	2	6	286208	286213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194449
5578	NC_020533	TGT	2	6	286238	286243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194449
5579	NC_020533	TGG	2	6	286289	286294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194449
5580	NC_020533	ATT	2	6	286318	286323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194449
5581	NC_020533	ATAAAG	2	12	286357	286368	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470194449
5582	NC_020533	TAA	2	6	286397	286402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194449
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5584	NC_020533	CAT	2	6	286500	286505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194449
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5586	NC_020533	TTA	2	6	286685	286690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194449
5587	NC_020533	A	7	7	286704	286710	100 %	0 %	0 %	0 %	470194449
5588	NC_020533	ATG	2	6	286729	286734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194449
5589	NC_020533	AAG	2	6	286744	286749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194449
5590	NC_020533	GAC	2	6	286752	286757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194449
5591	NC_020533	CAG	2	6	286767	286772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194449
5592	NC_020533	TTA	2	6	286799	286804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194449
5593	NC_020533	ATG	2	6	286825	286830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194449
5594	NC_020533	TAC	2	6	286835	286840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194449
5595	NC_020533	ACA	2	6	286849	286854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194449
5596	NC_020533	GGT	2	6	286863	286868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194449
5597	NC_020533	TGA	2	6	287015	287020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194449
5598	NC_020533	ATG	2	6	287041	287046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194449
5599	NC_020533	CAG	2	6	287080	287085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194449
5600	NC_020533	GAA	2	6	287177	287182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194449
5601	NC_020533	AT	3	6	287196	287201	50 %	50 %	0 %	0 %	470194449
5602	NC_020533	ATG	2	6	287215	287220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194449
5603	NC_020533	A	6	6	287244	287249	100 %	0 %	0 %	0 %	470194449
5604	NC_020533	CAA	2	6	287268	287273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194449
5605	NC_020533	T	6	6	287799	287804	0 %	100 %	0 %	0 %	470194450
5606	NC_020533	T	7	7	287886	287892	0 %	100 %	0 %	0 %	470194450
5607	NC_020533	CAA	2	6	287921	287926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194450
5608	NC_020533	TGA	2	6	288007	288012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194450
5609	NC_020533	GACATT	2	12	288048	288059	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194450
5610	NC_020533	TGC	2	6	288063	288068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194450
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5612	NC_020533	TG	3	6	288088	288093	0 %	50 %	50 %	0 %	470194450
5613	NC_020533	GTA	2	6	288159	288164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194450
5614	NC_020533	ATTG	2	8	288236	288243	25 %	50 %	25 %	0 %	470194450
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5616	NC_020533	TTG	2	6	288273	288278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194450
5617	NC_020533	AT	3	6	288286	288291	50 %	50 %	0 %	0 %	470194450
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5619	NC_020533	TTAT	2	8	288343	288350	25 %	75 %	0 %	0 %	470194450
5620	NC_020533	TGT	2	6	288399	288404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194450
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5991	NC_020533	TAT	2	6	307992	307997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194464
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