MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020532	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	470192281
2	NC_020532	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	470192282
3	NC_020532	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	470192282
4	NC_020532	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	470192282
5	NC_020532	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	470192284
6	NC_020532	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	470192285
7	NC_020532	ATCGC	2	10	10192	10201	20 %	20 %	20 %	40 %	470192286
8	NC_020532	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	470192287
9	NC_020532	GCAAG	2	10	16624	16633	40 %	0 %	40 %	20 %	470192290
10	NC_020532	TTTGA	2	10	16783	16792	20 %	60 %	20 %	0 %	470192290
11	NC_020532	TCAAT	2	10	18920	18929	40 %	40 %	0 %	20 %	470192292
12	NC_020532	AGTTA	2	10	22098	22107	40 %	40 %	20 %	0 %	470192293
13	NC_020532	ATGTA	2	10	23656	23665	40 %	40 %	20 %	0 %	470192294
14	NC_020532	ACCAA	2	10	26266	26275	60 %	0 %	0 %	40 %	470192296
15	NC_020532	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	470192296
16	NC_020532	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	470192297
17	NC_020532	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	470192297
18	NC_020532	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	470192298
19	NC_020532	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	470192298
20	NC_020532	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	470192300
21	NC_020532	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	470192300
22	NC_020532	TATGA	2	10	32680	32689	40 %	40 %	20 %	0 %	470192300
23	NC_020532	CATTA	2	10	33910	33919	40 %	40 %	0 %	20 %	470192301
24	NC_020532	AAATG	2	10	35554	35563	60 %	20 %	20 %	0 %	470192303
25	NC_020532	ATTTT	2	10	35635	35644	20 %	80 %	0 %	0 %	470192303
26	NC_020532	TGAAT	2	10	37533	37542	40 %	40 %	20 %	0 %	470192304
27	NC_020532	TTGGT	2	10	37575	37584	0 %	60 %	40 %	0 %	470192304
28	NC_020532	AATAT	2	10	37643	37652	60 %	40 %	0 %	0 %	470192304
29	NC_020532	TTCGT	2	10	37854	37863	0 %	60 %	20 %	20 %	470192304
30	NC_020532	AAATT	2	10	40313	40322	60 %	40 %	0 %	0 %	470192305
31	NC_020532	TTGAA	2	10	42342	42351	40 %	40 %	20 %	0 %	470192307
32	NC_020532	TTGAA	2	10	42688	42697	40 %	40 %	20 %	0 %	470192307
33	NC_020532	ATATT	2	10	45359	45368	40 %	60 %	0 %	0 %	470192309
34	NC_020532	GAATT	2	10	46276	46285	40 %	40 %	20 %	0 %	470192310
35	NC_020532	TCAGT	2	10	48177	48186	20 %	40 %	20 %	20 %	470192311
36	NC_020532	GGCCA	2	10	53184	53193	20 %	0 %	40 %	40 %	470192314
37	NC_020532	TAAAT	2	10	58894	58903	60 %	40 %	0 %	0 %	470192318
38	NC_020532	ATATT	2	10	60764	60773	40 %	60 %	0 %	0 %	470192319
39	NC_020532	AATGT	2	10	61489	61498	40 %	40 %	20 %	0 %	470192320
40	NC_020532	TAGTA	2	10	65037	65046	40 %	40 %	20 %	0 %	470192321
41	NC_020532	TACTA	2	10	66396	66405	40 %	40 %	0 %	20 %	470192322
42	NC_020532	ATCAA	2	10	69146	69155	60 %	20 %	0 %	20 %	470192324
43	NC_020532	TAATA	2	10	70978	70987	60 %	40 %	0 %	0 %	470192325
44	NC_020532	TATAT	2	10	73914	73923	40 %	60 %	0 %	0 %	470192327
45	NC_020532	CTAAA	2	10	75554	75563	60 %	20 %	0 %	20 %	470192328
46	NC_020532	CAAAA	2	10	75585	75594	80 %	0 %	0 %	20 %	470192328
47	NC_020532	GATAT	2	10	80277	80286	40 %	40 %	20 %	0 %	470192331
48	NC_020532	ATATA	2	10	81100	81109	60 %	40 %	0 %	0 %	470192332
49	NC_020532	GATAT	2	10	81934	81943	40 %	40 %	20 %	0 %	470192333
50	NC_020532	AATAA	2	10	82564	82573	80 %	20 %	0 %	0 %	470192334
51	NC_020532	ATTGC	2	10	84544	84553	20 %	40 %	20 %	20 %	470192336
52	NC_020532	TCATT	2	10	84732	84741	20 %	60 %	0 %	20 %	470192336
53	NC_020532	CATGG	2	10	85948	85957	20 %	20 %	40 %	20 %	470192336
54	NC_020532	TGAAA	2	10	86616	86625	60 %	20 %	20 %	0 %	470192337
55	NC_020532	TCAAT	2	10	86988	86997	40 %	40 %	0 %	20 %	470192337
56	NC_020532	GTATT	2	10	87477	87486	20 %	60 %	20 %	0 %	470192338
57	NC_020532	ATTAA	2	10	90219	90228	60 %	40 %	0 %	0 %	470192339
58	NC_020532	AGATA	2	10	93338	93347	60 %	20 %	20 %	0 %	470192341
59	NC_020532	TAAAA	2	10	93898	93907	80 %	20 %	0 %	0 %	470192341
60	NC_020532	ATACA	2	10	94328	94337	60 %	20 %	0 %	20 %	470192342
61	NC_020532	AAAGA	2	10	95531	95540	80 %	0 %	20 %	0 %	470192342
62	NC_020532	ATGTT	2	10	97016	97025	20 %	60 %	20 %	0 %	470192344
63	NC_020532	TTGCG	2	10	97587	97596	0 %	40 %	40 %	20 %	470192344
64	NC_020532	AGTTA	2	10	99147	99156	40 %	40 %	20 %	0 %	470192345
65	NC_020532	GGTGA	2	10	102942	102951	20 %	20 %	60 %	0 %	470192348
66	NC_020532	GAAAA	2	10	106379	106388	80 %	0 %	20 %	0 %	470192351
67	NC_020532	TTATT	2	10	106546	106555	20 %	80 %	0 %	0 %	470192351
68	NC_020532	AATCA	2	10	109568	109577	60 %	20 %	0 %	20 %	470192353
69	NC_020532	ATTTT	2	10	110266	110275	20 %	80 %	0 %	0 %	470192354
70	NC_020532	ATCAA	2	10	110293	110302	60 %	20 %	0 %	20 %	470192354
71	NC_020532	ATCAC	2	10	111526	111535	40 %	20 %	0 %	40 %	470192355
72	NC_020532	AACGA	2	10	112203	112212	60 %	0 %	20 %	20 %	470192355
73	NC_020532	ACACA	2	10	114259	114268	60 %	0 %	0 %	40 %	470192357
74	NC_020532	GACAA	2	10	115410	115419	60 %	0 %	20 %	20 %	470192358
75	NC_020532	ATTAC	2	10	117594	117603	40 %	40 %	0 %	20 %	470192360
76	NC_020532	TATCT	2	10	118254	118263	20 %	60 %	0 %	20 %	470192361
77	NC_020532	ATACG	2	10	120687	120696	40 %	20 %	20 %	20 %	470192363
78	NC_020532	TTATA	2	10	121345	121354	40 %	60 %	0 %	0 %	470192364
79	NC_020532	TTTTA	2	10	122143	122152	20 %	80 %	0 %	0 %	470192364
80	NC_020532	GTATT	2	10	122656	122665	20 %	60 %	20 %	0 %	470192365
81	NC_020532	AATAA	2	10	123249	123258	80 %	20 %	0 %	0 %	470192365
82	NC_020532	TACGC	2	10	123516	123525	20 %	20 %	20 %	40 %	470192365
83	NC_020532	TCCCT	2	10	126322	126331	0 %	40 %	0 %	60 %	470192368
84	NC_020532	GCTTT	2	10	128556	128565	0 %	60 %	20 %	20 %	470192370
85	NC_020532	TAATT	2	10	128641	128650	40 %	60 %	0 %	0 %	470192370
86	NC_020532	ATACT	2	10	129822	129831	40 %	40 %	0 %	20 %	470192372
87	NC_020532	TAATA	2	10	130986	130995	60 %	40 %	0 %	0 %	470192373
88	NC_020532	ATTTT	2	10	131977	131986	20 %	80 %	0 %	0 %	470192374
89	NC_020532	TTGTA	2	10	134182	134191	20 %	60 %	20 %	0 %	470192376
90	NC_020532	TGCAA	2	10	135187	135196	40 %	20 %	20 %	20 %	470192377
91	NC_020532	ATATG	2	10	137205	137214	40 %	40 %	20 %	0 %	470192378
92	NC_020532	TATGA	2	10	138885	138894	40 %	40 %	20 %	0 %	470192380
93	NC_020532	AATAT	2	10	139891	139900	60 %	40 %	0 %	0 %	470192380
94	NC_020532	TGGTA	2	10	141788	141797	20 %	40 %	40 %	0 %	470192381
95	NC_020532	CGAAC	2	10	141878	141887	40 %	0 %	20 %	40 %	470192381
96	NC_020532	TTCAA	2	10	143903	143912	40 %	40 %	0 %	20 %	470192382
97	NC_020532	ACATC	2	10	144746	144755	40 %	20 %	0 %	40 %	470192384
98	NC_020532	TAATT	2	10	146969	146978	40 %	60 %	0 %	0 %	470192385
99	NC_020532	AGAGA	2	10	149995	150004	60 %	0 %	40 %	0 %	470192388
100	NC_020532	AATCC	2	10	150351	150360	40 %	20 %	0 %	40 %	470192388
101	NC_020532	TGAAT	2	10	159107	159116	40 %	40 %	20 %	0 %	470192397
102	NC_020532	TTCAT	2	10	163345	163354	20 %	60 %	0 %	20 %	470192399
103	NC_020532	TTTAC	2	10	163728	163737	20 %	60 %	0 %	20 %	470192399
104	NC_020532	TTATT	2	10	164942	164951	20 %	80 %	0 %	0 %	470192400
105	NC_020532	GGATT	2	10	165930	165939	20 %	40 %	40 %	0 %	470192401
106	NC_020532	TAACT	2	10	168967	168976	40 %	40 %	0 %	20 %	470192404
107	NC_020532	TTTAT	2	10	171875	171884	20 %	80 %	0 %	0 %	470192406
108	NC_020532	ATGCA	2	10	173478	173487	40 %	20 %	20 %	20 %	470192407
109	NC_020532	TATGA	2	10	180724	180733	40 %	40 %	20 %	0 %	470192408
110	NC_020532	GTGAA	2	10	180758	180767	40 %	20 %	40 %	0 %	470192408
111	NC_020532	TTAAT	2	10	181201	181210	40 %	60 %	0 %	0 %	470192409
112	NC_020532	ATATA	2	10	184031	184040	60 %	40 %	0 %	0 %	470192412
113	NC_020532	AAGAT	2	10	187760	187769	60 %	20 %	20 %	0 %	470192414
114	NC_020532	CGTTT	2	10	188208	188217	0 %	60 %	20 %	20 %	470192415
115	NC_020532	AAATG	2	10	190688	190697	60 %	20 %	20 %	0 %	470192417
116	NC_020532	GTAAA	2	10	190852	190861	60 %	20 %	20 %	0 %	470192417
117	NC_020532	TTTAA	2	10	190872	190881	40 %	60 %	0 %	0 %	470192417
118	NC_020532	TTTGC	2	10	191388	191397	0 %	60 %	20 %	20 %	470192417
119	NC_020532	TTGTT	2	10	192394	192403	0 %	80 %	20 %	0 %	470192417
120	NC_020532	CAAAA	2	10	195606	195615	80 %	0 %	0 %	20 %	470192420
121	NC_020532	AGTTT	2	10	196142	196151	20 %	60 %	20 %	0 %	470192420
122	NC_020532	CAACA	2	10	196372	196381	60 %	0 %	0 %	40 %	470192420
123	NC_020532	AAAAT	2	10	197000	197009	80 %	20 %	0 %	0 %	470192421
124	NC_020532	AAATG	2	10	197409	197418	60 %	20 %	20 %	0 %	470192421
125	NC_020532	TTGAA	2	10	198683	198692	40 %	40 %	20 %	0 %	470192422
126	NC_020532	ATTAT	2	10	200639	200648	40 %	60 %	0 %	0 %	470192422
127	NC_020532	AATAG	2	10	201405	201414	60 %	20 %	20 %	0 %	470192423
128	NC_020532	ATACA	2	10	202042	202051	60 %	20 %	0 %	20 %	470192424
129	NC_020532	GTGTT	2	10	204727	204736	0 %	60 %	40 %	0 %	470192426
130	NC_020532	TAATT	2	10	207231	207240	40 %	60 %	0 %	0 %	470192428
131	NC_020532	TCTAT	2	10	207364	207373	20 %	60 %	0 %	20 %	470192428
132	NC_020532	ATAAA	2	10	207479	207488	80 %	20 %	0 %	0 %	470192428
133	NC_020532	AAAGA	2	10	208134	208143	80 %	0 %	20 %	0 %	470192429
134	NC_020532	CATGT	2	10	209339	209348	20 %	40 %	20 %	20 %	470192430
135	NC_020532	TTGAA	2	10	209414	209423	40 %	40 %	20 %	0 %	470192430
136	NC_020532	AATTG	2	10	210739	210748	40 %	40 %	20 %	0 %	470192430
137	NC_020532	TTTTC	2	10	210988	210997	0 %	80 %	0 %	20 %	470192431
138	NC_020532	TCAAT	2	10	211427	211436	40 %	40 %	0 %	20 %	470192431
139	NC_020532	TTATT	2	10	211460	211469	20 %	80 %	0 %	0 %	470192431
140	NC_020532	CTATG	2	10	213716	213725	20 %	40 %	20 %	20 %	470192433
141	NC_020532	GATTG	2	10	215779	215788	20 %	40 %	40 %	0 %	470192434
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157	NC_020532	ATCAA	2	10	243333	243342	60 %	20 %	0 %	20 %	470192454
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254	NC_020532	CATGC	2	10	398170	398179	20 %	20 %	20 %	40 %	470192566
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258	NC_020532	CGATT	2	10	402608	402617	20 %	40 %	20 %	20 %	470192569
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262	NC_020532	TTAAA	2	10	408439	408448	60 %	40 %	0 %	0 %	470192575
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391	NC_020532	TATTT	2	10	627413	627422	20 %	80 %	0 %	0 %	470192724
392	NC_020532	TATAT	2	10	628531	628540	40 %	60 %	0 %	0 %	470192725
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