MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020532	GAA	2	6	177127	177132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192407
3502	NC_020532	CAAT	2	8	177149	177156	50 %	25 %	0 %	25 %	470192407
3503	NC_020532	TATGAT	2	12	177216	177227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470192407
3504	NC_020532	GGA	2	6	177285	177290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470192407
3505	NC_020532	AAAT	2	8	177345	177352	75 %	25 %	0 %	0 %	470192407
3506	NC_020532	ATGA	2	8	177412	177419	50 %	25 %	25 %	0 %	470192407
3507	NC_020532	GCG	2	6	177544	177549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470192407
3508	NC_020532	TA	3	6	177580	177585	50 %	50 %	0 %	0 %	470192407
3509	NC_020532	GGA	2	6	177630	177635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470192407
3510	NC_020532	TTGAAA	2	12	177668	177679	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470192407
3511	NC_020532	TTG	2	6	177719	177724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192407
3512	NC_020532	ATG	2	6	177746	177751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
3513	NC_020532	TTG	2	6	177865	177870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192407
3514	NC_020532	TGCA	2	8	177878	177885	25 %	25 %	25 %	25 %	470192407
3515	NC_020532	TTG	2	6	177972	177977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192407
3516	NC_020532	AG	3	6	178012	178017	50 %	0 %	50 %	0 %	470192407
3517	NC_020532	ACA	2	6	178041	178046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192407
3518	NC_020532	TAA	2	6	178053	178058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192407
3519	NC_020532	GTA	2	6	178097	178102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
3520	NC_020532	AT	3	6	178170	178175	50 %	50 %	0 %	0 %	470192407
3521	NC_020532	TCA	2	6	178229	178234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192407
3522	NC_020532	CAT	2	6	178249	178254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192407
3523	NC_020532	TAT	2	6	178317	178322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192407
3524	NC_020532	AT	3	6	178395	178400	50 %	50 %	0 %	0 %	470192407
3525	NC_020532	AAT	2	6	178435	178440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192407
3526	NC_020532	GTG	2	6	178469	178474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192407
3527	NC_020532	GAA	2	6	178517	178522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192407
3528	NC_020532	TGA	2	6	178563	178568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
3529	NC_020532	TGT	2	6	178611	178616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192407
3530	NC_020532	AT	3	6	178643	178648	50 %	50 %	0 %	0 %	470192407
3531	NC_020532	TTA	2	6	178656	178661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192407
3532	NC_020532	CAA	2	6	178672	178677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192407
3533	NC_020532	TAC	2	6	178788	178793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192407
3534	NC_020532	ACA	2	6	178818	178823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192407
3535	NC_020532	TAA	2	6	178827	178832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192407
3536	NC_020532	TTG	2	6	178871	178876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192407
3537	NC_020532	ATG	2	6	178904	178909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
3538	NC_020532	GAT	2	6	178921	178926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
3539	NC_020532	TGG	2	6	178938	178943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192407
3540	NC_020532	CAT	2	6	178993	178998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192407
3541	NC_020532	CAA	2	6	179065	179070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192407
3542	NC_020532	T	6	6	179202	179207	0 %	100 %	0 %	0 %	470192407
3543	NC_020532	TGA	2	6	179300	179305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
3544	NC_020532	ATT	2	6	179318	179323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192407
3545	NC_020532	AGA	2	6	179328	179333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192407
3546	NC_020532	ATG	2	6	179344	179349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
3547	NC_020532	TTG	2	6	179369	179374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192407
3548	NC_020532	GAT	2	6	179392	179397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
3549	NC_020532	GTT	2	6	179398	179403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192407
3550	NC_020532	ATT	2	6	179425	179430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192407
3551	NC_020532	TGA	4	12	179460	179471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
3552	NC_020532	CAA	2	6	179521	179526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192407
3553	NC_020532	CAT	2	6	179527	179532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192407
3554	NC_020532	AT	3	6	179542	179547	50 %	50 %	0 %	0 %	470192407
3555	NC_020532	AGA	2	6	179589	179594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192407
3556	NC_020532	ACT	2	6	179631	179636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192407
3557	NC_020532	AAT	2	6	179695	179700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192407
3558	NC_020532	AATG	2	8	179799	179806	50 %	25 %	25 %	0 %	470192407
3559	NC_020532	AC	3	6	179912	179917	50 %	0 %	0 %	50 %	470192407
3560	NC_020532	TAA	2	6	179946	179951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192407
3561	NC_020532	AAC	3	9	180083	180091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192407
3562	NC_020532	GATA	2	8	180099	180106	50 %	25 %	25 %	0 %	470192407
3563	NC_020532	AACATT	2	12	180108	180119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470192407
3564	NC_020532	AAT	2	6	180123	180128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192407
3565	NC_020532	TAAC	2	8	180158	180165	50 %	25 %	0 %	25 %	470192407
3566	NC_020532	AT	3	6	180189	180194	50 %	50 %	0 %	0 %	470192407
3567	NC_020532	TAAG	2	8	180210	180217	50 %	25 %	25 %	0 %	470192407
3568	NC_020532	GAA	2	6	180274	180279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192408
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3570	NC_020532	TTA	2	6	180406	180411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192408
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3572	NC_020532	AAAG	2	8	180670	180677	75 %	0 %	25 %	0 %	470192408
3573	NC_020532	ATTG	2	8	180687	180694	25 %	50 %	25 %	0 %	470192408
3574	NC_020532	TATGA	2	10	180724	180733	40 %	40 %	20 %	0 %	470192408
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3576	NC_020532	GTGAA	2	10	180758	180767	40 %	20 %	40 %	0 %	470192408
3577	NC_020532	ATTT	2	8	180777	180784	25 %	75 %	0 %	0 %	470192408
3578	NC_020532	A	6	6	180838	180843	100 %	0 %	0 %	0 %	470192408
3579	NC_020532	AGT	2	6	180865	180870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192408
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3581	NC_020532	TGT	2	6	181229	181234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192409
3582	NC_020532	TCA	2	6	181251	181256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192409
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3584	NC_020532	AAT	2	6	181355	181360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192409
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3586	NC_020532	T	6	6	181414	181419	0 %	100 %	0 %	0 %	470192409
3587	NC_020532	AAT	2	6	181435	181440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192409
3588	NC_020532	ACT	2	6	181531	181536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192409
3589	NC_020532	TTG	2	6	181546	181551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192409
3590	NC_020532	TTG	2	6	181964	181969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192410
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3593	NC_020532	AT	3	6	182116	182121	50 %	50 %	0 %	0 %	470192410
3594	NC_020532	TGA	2	6	182122	182127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192410
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3596	NC_020532	TGA	2	6	182165	182170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192410
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3598	NC_020532	CAT	2	6	182267	182272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192410
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3601	NC_020532	CTA	2	6	182459	182464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192410
3602	NC_020532	GT	3	6	182491	182496	0 %	50 %	50 %	0 %	470192410
3603	NC_020532	TAA	2	6	182582	182587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192410
3604	NC_020532	TGT	2	6	182621	182626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192410
3605	NC_020532	TGT	2	6	182645	182650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192410
3606	NC_020532	TAA	2	6	182651	182656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192410
3607	NC_020532	GATG	2	8	182659	182666	25 %	25 %	50 %	0 %	470192410
3608	NC_020532	CCA	2	6	182686	182691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192410
3609	NC_020532	ATG	2	6	182741	182746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192411
3610	NC_020532	TCA	2	6	182869	182874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192411
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3612	NC_020532	CAA	2	6	183170	183175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192411
3613	NC_020532	TAA	2	6	183312	183317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192411
3614	NC_020532	TGA	2	6	183319	183324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192411
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3617	NC_020532	ACC	2	6	183414	183419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192411
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3620	NC_020532	GTT	2	6	183629	183634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192411
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3622	NC_020532	CAT	2	6	183662	183667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192411
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3744	NC_020532	TAA	3	9	189108	189116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192416
3745	NC_020532	ACG	2	6	189120	189125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192416
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3748	NC_020532	CAT	2	6	189272	189277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192416
3749	NC_020532	CAT	2	6	189297	189302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192416
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3862	NC_020532	TGGT	2	8	194977	194984	0 %	50 %	50 %	0 %	470192419
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3987	NC_020532	A	6	6	201342	201347	100 %	0 %	0 %	0 %	470192423
3988	NC_020532	AATAG	2	10	201405	201414	60 %	20 %	20 %	0 %	470192423
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3990	NC_020532	A	7	7	201595	201601	100 %	0 %	0 %	0 %	470192423
3991	NC_020532	ATG	2	6	201635	201640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192423
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3997	NC_020532	A	6	6	202181	202186	100 %	0 %	0 %	0 %	470192424
3998	NC_020532	TTAA	2	8	202196	202203	50 %	50 %	0 %	0 %	470192424
3999	NC_020532	TAA	2	6	202219	202224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192424
4000	NC_020532	TTG	2	6	202236	202241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192424

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