MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020532	TGA	2	6	126220	126225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192368
2502	NC_020532	TTTG	2	8	126299	126306	0 %	75 %	25 %	0 %	470192368
2503	NC_020532	TCCCT	2	10	126322	126331	0 %	40 %	0 %	60 %	470192368
2504	NC_020532	CT	3	6	126338	126343	0 %	50 %	0 %	50 %	470192368
2505	NC_020532	GC	3	6	126406	126411	0 %	0 %	50 %	50 %	470192368
2506	NC_020532	TA	3	6	126474	126479	50 %	50 %	0 %	0 %	470192368
2507	NC_020532	TAT	2	6	126483	126488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192368
2508	NC_020532	GGA	2	6	126760	126765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470192369
2509	NC_020532	CA	3	6	126786	126791	50 %	0 %	0 %	50 %	470192369
2510	NC_020532	AATG	2	8	126799	126806	50 %	25 %	25 %	0 %	470192369
2511	NC_020532	GAT	2	6	126881	126886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192369
2512	NC_020532	A	6	6	126944	126949	100 %	0 %	0 %	0 %	470192369
2513	NC_020532	GGTATG	2	12	126968	126979	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470192369
2514	NC_020532	AATT	2	8	127005	127012	50 %	50 %	0 %	0 %	470192369
2515	NC_020532	A	6	6	127028	127033	100 %	0 %	0 %	0 %	470192369
2516	NC_020532	ATG	2	6	127083	127088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192369
2517	NC_020532	ATT	2	6	127091	127096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192369
2518	NC_020532	CAA	2	6	127130	127135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192369
2519	NC_020532	CTT	2	6	127167	127172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192369
2520	NC_020532	ATT	2	6	127177	127182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192369
2521	NC_020532	TCA	2	6	127222	127227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192369
2522	NC_020532	ACA	2	6	127271	127276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192369
2523	NC_020532	GT	3	6	127374	127379	0 %	50 %	50 %	0 %	470192369
2524	NC_020532	CAA	2	6	127413	127418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192369
2525	NC_020532	GAT	2	6	127480	127485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192369
2526	NC_020532	AAAG	2	8	127510	127517	75 %	0 %	25 %	0 %	470192370
2527	NC_020532	TAT	2	6	127530	127535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192370
2528	NC_020532	TGA	2	6	127597	127602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192370
2529	NC_020532	GTA	2	6	127673	127678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192370
2530	NC_020532	TATT	2	8	127716	127723	25 %	75 %	0 %	0 %	470192370
2531	NC_020532	ATT	2	6	127754	127759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192370
2532	NC_020532	TAT	2	6	127804	127809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192370
2533	NC_020532	GCT	2	6	127826	127831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192370
2534	NC_020532	AT	3	6	127850	127855	50 %	50 %	0 %	0 %	470192370
2535	NC_020532	AGA	2	6	127884	127889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192370
2536	NC_020532	ATTT	2	8	127954	127961	25 %	75 %	0 %	0 %	470192370
2537	NC_020532	GTA	2	6	128006	128011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192370
2538	NC_020532	ATT	2	6	128035	128040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192370
2539	NC_020532	ATA	2	6	128052	128057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192370
2540	NC_020532	TTG	2	6	128079	128084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192370
2541	NC_020532	ACA	2	6	128111	128116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192370
2542	NC_020532	TTA	2	6	128127	128132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192370
2543	NC_020532	TA	3	6	128148	128153	50 %	50 %	0 %	0 %	470192370
2544	NC_020532	TA	3	6	128190	128195	50 %	50 %	0 %	0 %	470192370
2545	NC_020532	TAAA	2	8	128220	128227	75 %	25 %	0 %	0 %	470192370
2546	NC_020532	TTTA	2	8	128260	128267	25 %	75 %	0 %	0 %	470192370
2547	NC_020532	ATC	2	6	128337	128342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192370
2548	NC_020532	ACA	2	6	128354	128359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192370
2549	NC_020532	TTA	2	6	128366	128371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192370
2550	NC_020532	TA	3	6	128381	128386	50 %	50 %	0 %	0 %	470192370
2551	NC_020532	TTG	2	6	128397	128402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192370
2552	NC_020532	ATT	2	6	128462	128467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192370
2553	NC_020532	GCTTT	2	10	128556	128565	0 %	60 %	20 %	20 %	470192370
2554	NC_020532	TAATT	2	10	128641	128650	40 %	60 %	0 %	0 %	470192370
2555	NC_020532	TGC	2	6	128683	128688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192370
2556	NC_020532	ATG	2	6	128727	128732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192370
2557	NC_020532	TAT	2	6	128752	128757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192370
2558	NC_020532	ATT	2	6	128762	128767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192370
2559	NC_020532	AAAT	2	8	128834	128841	75 %	25 %	0 %	0 %	470192370
2560	NC_020532	AGTA	2	8	128913	128920	50 %	25 %	25 %	0 %	470192371
2561	NC_020532	AT	3	6	128934	128939	50 %	50 %	0 %	0 %	470192371
2562	NC_020532	ATC	2	6	128989	128994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192371
2563	NC_020532	TG	3	6	129028	129033	0 %	50 %	50 %	0 %	470192371
2564	NC_020532	GCA	2	6	129055	129060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192371
2565	NC_020532	AGA	2	6	129150	129155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192371
2566	NC_020532	TCA	2	6	129191	129196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192371
2567	NC_020532	TGA	2	6	129225	129230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192371
2568	NC_020532	ACA	2	6	129234	129239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192371
2569	NC_020532	CA	3	6	129274	129279	50 %	0 %	0 %	50 %	470192371
2570	NC_020532	ATT	2	6	129289	129294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192371
2571	NC_020532	TTG	2	6	129304	129309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192371
2572	NC_020532	AGA	2	6	129408	129413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192371
2573	NC_020532	CGTA	2	8	129471	129478	25 %	25 %	25 %	25 %	470192371
2574	NC_020532	AGA	2	6	129483	129488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192371
2575	NC_020532	CAGATT	2	12	129566	129577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192371
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2577	NC_020532	AGT	2	6	129792	129797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192372
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2579	NC_020532	ATACT	2	10	129822	129831	40 %	40 %	0 %	20 %	470192372
2580	NC_020532	CAA	2	6	129949	129954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192372
2581	NC_020532	GAA	2	6	129958	129963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192372
2582	NC_020532	GTT	2	6	129979	129984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192372
2583	NC_020532	TGC	2	6	130092	130097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192372
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2585	NC_020532	TAT	2	6	130188	130193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192372
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2587	NC_020532	ATG	2	6	130307	130312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192372
2588	NC_020532	ATG	2	6	130343	130348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192372
2589	NC_020532	TGA	2	6	130406	130411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192372
2590	NC_020532	AAGA	2	8	130420	130427	75 %	0 %	25 %	0 %	470192372
2591	NC_020532	CTT	2	6	130443	130448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192372
2592	NC_020532	TAG	2	6	130454	130459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192372
2593	NC_020532	TCG	2	6	130482	130487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192372
2594	NC_020532	GAT	2	6	130525	130530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192372
2595	NC_020532	AGA	2	6	130560	130565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192372
2596	NC_020532	ATT	2	6	130576	130581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192372
2597	NC_020532	CAG	2	6	130583	130588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192372
2598	NC_020532	GA	3	6	130629	130634	50 %	0 %	50 %	0 %	470192372
2599	NC_020532	AT	3	6	130635	130640	50 %	50 %	0 %	0 %	470192372
2600	NC_020532	GGT	2	6	130672	130677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192372
2601	NC_020532	TAC	2	6	130695	130700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192372
2602	NC_020532	TAATA	2	10	130986	130995	60 %	40 %	0 %	0 %	470192373
2603	NC_020532	GTG	2	6	131036	131041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192373
2604	NC_020532	ACC	2	6	131049	131054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192373
2605	NC_020532	AGGC	2	8	131126	131133	25 %	0 %	50 %	25 %	470192373
2606	NC_020532	CAC	2	6	131180	131185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192373
2607	NC_020532	AAAT	2	8	131366	131373	75 %	25 %	0 %	0 %	470192373
2608	NC_020532	ATT	2	6	131409	131414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192373
2609	NC_020532	GCG	2	6	131449	131454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470192373
2610	NC_020532	TAA	2	6	131502	131507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192373
2611	NC_020532	TA	3	6	131523	131528	50 %	50 %	0 %	0 %	470192373
2612	NC_020532	AAT	2	6	131551	131556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192373
2613	NC_020532	GAT	2	6	131631	131636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192373
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2617	NC_020532	ATA	2	6	131920	131925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192374
2618	NC_020532	ACA	2	6	131958	131963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192374
2619	NC_020532	ATTTT	2	10	131977	131986	20 %	80 %	0 %	0 %	470192374
2620	NC_020532	ATA	2	6	132049	132054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192374
2621	NC_020532	AAT	2	6	132062	132067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192374
2622	NC_020532	TGC	2	6	132137	132142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192374
2623	NC_020532	TAA	2	6	132143	132148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192374
2624	NC_020532	TGA	2	6	132210	132215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192374
2625	NC_020532	ATA	2	6	132232	132237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192374
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2630	NC_020532	CAT	2	6	132617	132622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192375
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2634	NC_020532	ATC	2	6	132738	132743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192375
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2653	NC_020532	CAG	2	6	133924	133929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192376
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2655	NC_020532	TCT	2	6	134055	134060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192376
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2742	NC_020532	A	6	6	138854	138859	100 %	0 %	0 %	0 %	470192380
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2991	NC_020532	ATT	2	6	150454	150459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192388
2992	NC_020532	GGA	2	6	150494	150499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470192388
2993	NC_020532	TA	3	6	150624	150629	50 %	50 %	0 %	0 %	470192389
2994	NC_020532	TAA	2	6	150698	150703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192389
2995	NC_020532	AC	3	6	150768	150773	50 %	0 %	0 %	50 %	470192389
2996	NC_020532	T	6	6	150774	150779	0 %	100 %	0 %	0 %	470192389
2997	NC_020532	TCA	2	6	150783	150788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192389
2998	NC_020532	T	6	6	150793	150798	0 %	100 %	0 %	0 %	470192389
2999	NC_020532	TAA	3	9	150803	150811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192389
3000	NC_020532	ACCA	2	8	150850	150857	50 %	0 %	0 %	50 %	470192389

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