MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020532	GTGC	2	8	281673	281680	0 %	25 %	50 %	25 %	470192479
5502	NC_020532	ACC	2	6	281765	281770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192479
5503	NC_020532	TAT	2	6	281882	281887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192479
5504	NC_020532	TTG	2	6	281931	281936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192479
5505	NC_020532	AGAATC	2	12	281951	281962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470192479
5506	NC_020532	ATT	2	6	282008	282013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192479
5507	NC_020532	GCA	2	6	282024	282029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192479
5508	NC_020532	GT	3	6	282068	282073	0 %	50 %	50 %	0 %	470192479
5509	NC_020532	AGG	2	6	282094	282099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470192479
5510	NC_020532	AATA	2	8	282100	282107	75 %	25 %	0 %	0 %	470192479
5511	NC_020532	GAT	2	6	282125	282130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192480
5512	NC_020532	TTA	2	6	282161	282166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192480
5513	NC_020532	TGG	2	6	282175	282180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192480
5514	NC_020532	GAA	2	6	282185	282190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192480
5515	NC_020532	ACT	2	6	282229	282234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192480
5516	NC_020532	ATCA	2	8	282236	282243	50 %	25 %	0 %	25 %	470192480
5517	NC_020532	ATT	2	6	282335	282340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192480
5518	NC_020532	GTGC	2	8	282449	282456	0 %	25 %	50 %	25 %	470192480
5519	NC_020532	GAT	2	6	282470	282475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192480
5520	NC_020532	CAA	2	6	282566	282571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192480
5521	NC_020532	ATT	2	6	282575	282580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192480
5522	NC_020532	CA	3	6	282589	282594	50 %	0 %	0 %	50 %	470192480
5523	NC_020532	CATA	2	8	282610	282617	50 %	25 %	0 %	25 %	470192480
5524	NC_020532	ACA	2	6	282638	282643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192480
5525	NC_020532	AT	3	6	282706	282711	50 %	50 %	0 %	0 %	470192480
5526	NC_020532	CAA	2	6	282740	282745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192480
5527	NC_020532	AC	3	6	283418	283423	50 %	0 %	0 %	50 %	470192481
5528	NC_020532	ATT	2	6	283473	283478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192481
5529	NC_020532	A	6	6	283481	283486	100 %	0 %	0 %	0 %	470192481
5530	NC_020532	TCT	2	6	283496	283501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192481
5531	NC_020532	ATT	2	6	283594	283599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192481
5532	NC_020532	CTT	3	9	283602	283610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192481
5533	NC_020532	CAA	2	6	283619	283624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192481
5534	NC_020532	TA	3	6	283643	283648	50 %	50 %	0 %	0 %	470192481
5535	NC_020532	AGG	2	6	283689	283694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470192481
5536	NC_020532	TTA	2	6	283720	283725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192481
5537	NC_020532	ATT	2	6	283726	283731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192481
5538	NC_020532	ATG	2	6	283763	283768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192481
5539	NC_020532	AGC	2	6	283791	283796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192481
5540	NC_020532	GGT	2	6	283834	283839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192481
5541	NC_020532	CAT	2	6	283853	283858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192481
5542	NC_020532	ATT	2	6	283882	283887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192481
5543	NC_020532	TAA	2	6	283899	283904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192481
5544	NC_020532	CA	3	6	283969	283974	50 %	0 %	0 %	50 %	470192481
5545	NC_020532	AGA	2	6	284010	284015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192481
5546	NC_020532	GTT	2	6	284053	284058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192481
5547	NC_020532	TTC	2	6	284089	284094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192481
5548	NC_020532	TATT	2	8	284199	284206	25 %	75 %	0 %	0 %	470192482
5549	NC_020532	TGG	2	6	284299	284304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192482
5550	NC_020532	GTA	2	6	284336	284341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192482
5551	NC_020532	AAT	2	6	284423	284428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192482
5552	NC_020532	ATC	2	6	284451	284456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192482
5553	NC_020532	ATA	2	6	284484	284489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192482
5554	NC_020532	CAT	2	6	284510	284515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192482
5555	NC_020532	TAG	2	6	284542	284547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192482
5556	NC_020532	ATC	2	6	284553	284558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192482
5557	NC_020532	CTTA	2	8	284790	284797	25 %	50 %	0 %	25 %	470192482
5558	NC_020532	AATA	2	8	285064	285071	75 %	25 %	0 %	0 %	470192483
5559	NC_020532	GGT	2	6	285106	285111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192483
5560	NC_020532	TTG	2	6	285122	285127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192483
5561	NC_020532	ATG	2	6	285233	285238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192483
5562	NC_020532	ATTA	2	8	285297	285304	50 %	50 %	0 %	0 %	470192483
5563	NC_020532	AG	3	6	285321	285326	50 %	0 %	50 %	0 %	470192483
5564	NC_020532	AAGTAA	2	12	285374	285385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470192483
5565	NC_020532	GTC	2	6	285419	285424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192483
5566	NC_020532	AAG	2	6	285437	285442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192483
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5568	NC_020532	GAA	2	6	285502	285507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192483
5569	NC_020532	AGA	2	6	285582	285587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192483
5570	NC_020532	TCAT	2	8	285602	285609	25 %	50 %	0 %	25 %	470192483
5571	NC_020532	GTT	2	6	285693	285698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192483
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5573	NC_020532	ACA	3	9	285720	285728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192483
5574	NC_020532	TTA	2	6	285755	285760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192483
5575	NC_020532	AATG	2	8	285795	285802	50 %	25 %	25 %	0 %	470192483
5576	NC_020532	TAA	2	6	285860	285865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192484
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5578	NC_020532	GTG	2	6	285977	285982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192484
5579	NC_020532	TAT	2	6	286030	286035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192484
5580	NC_020532	ATC	2	6	286061	286066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192484
5581	NC_020532	TACG	2	8	286115	286122	25 %	25 %	25 %	25 %	470192484
5582	NC_020532	GAA	2	6	286174	286179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192484
5583	NC_020532	TGA	2	6	286206	286211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192484
5584	NC_020532	TGT	2	6	286236	286241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192484
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5586	NC_020532	ATT	2	6	286316	286321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192484
5587	NC_020532	ATAAAG	2	12	286355	286366	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470192484
5588	NC_020532	TAA	2	6	286395	286400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192484
5589	NC_020532	GAA	2	6	286474	286479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192484
5590	NC_020532	CAT	2	6	286498	286503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192484
5591	NC_020532	ATG	2	6	286621	286626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192484
5592	NC_020532	TTA	2	6	286683	286688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192484
5593	NC_020532	A	7	7	286702	286708	100 %	0 %	0 %	0 %	470192484
5594	NC_020532	ATG	2	6	286727	286732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192484
5595	NC_020532	AAG	2	6	286742	286747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192484
5596	NC_020532	GAC	2	6	286750	286755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192484
5597	NC_020532	CAG	2	6	286765	286770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192484
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5600	NC_020532	TAC	2	6	286833	286838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192484
5601	NC_020532	ACA	2	6	286847	286852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192484
5602	NC_020532	GGT	2	6	286861	286866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192484
5603	NC_020532	TGA	2	6	287013	287018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192484
5604	NC_020532	ATG	2	6	287039	287044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192484
5605	NC_020532	CAG	2	6	287078	287083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192484
5606	NC_020532	GAA	2	6	287175	287180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192484
5607	NC_020532	AT	3	6	287194	287199	50 %	50 %	0 %	0 %	470192484
5608	NC_020532	ATG	2	6	287213	287218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192484
5609	NC_020532	A	6	6	287242	287247	100 %	0 %	0 %	0 %	470192484
5610	NC_020532	CAA	2	6	287266	287271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192484
5611	NC_020532	T	6	6	287797	287802	0 %	100 %	0 %	0 %	470192485
5612	NC_020532	T	7	7	287884	287890	0 %	100 %	0 %	0 %	470192485
5613	NC_020532	CAA	2	6	287919	287924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192485
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5615	NC_020532	GACATT	2	12	288046	288057	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470192485
5616	NC_020532	TGC	2	6	288061	288066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192485
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5618	NC_020532	TG	3	6	288086	288091	0 %	50 %	50 %	0 %	470192485
5619	NC_020532	GTA	2	6	288157	288162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192485
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5989	NC_020532	GAT	2	6	307815	307820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192499
5990	NC_020532	ATG	2	6	307843	307848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192499
5991	NC_020532	A	7	7	307859	307865	100 %	0 %	0 %	0 %	470192499
5992	NC_020532	CAAA	2	8	307908	307915	75 %	0 %	0 %	25 %	470192499
5993	NC_020532	AAGA	2	8	307938	307945	75 %	0 %	25 %	0 %	470192499
5994	NC_020532	TAA	2	6	307955	307960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192499
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5996	NC_020532	ACT	2	6	307984	307989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192499
5997	NC_020532	TAT	2	6	307990	307995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192499
5998	NC_020532	TGGA	2	8	307998	308005	25 %	25 %	50 %	0 %	470192499
5999	NC_020532	AGGACA	2	12	308009	308020	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470192499
6000	NC_020532	TGA	2	6	308024	308029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192499

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