MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020532	A	6	6	252744	252749	100 %	0 %	0 %	0 %	470192459
5002	NC_020532	AAT	3	9	252757	252765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192459
5003	NC_020532	GTT	2	6	253088	253093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192460
5004	NC_020532	AGC	2	6	253153	253158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192460
5005	NC_020532	TAA	2	6	253215	253220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192460
5006	NC_020532	ATTA	2	8	253273	253280	50 %	50 %	0 %	0 %	470192460
5007	NC_020532	ATC	2	6	253282	253287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192460
5008	NC_020532	TAT	2	6	253296	253301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192460
5009	NC_020532	TTA	2	6	253313	253318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192460
5010	NC_020532	T	6	6	253330	253335	0 %	100 %	0 %	0 %	470192460
5011	NC_020532	TCA	2	6	253439	253444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192460
5012	NC_020532	T	6	6	253474	253479	0 %	100 %	0 %	0 %	470192460
5013	NC_020532	GAC	2	6	253521	253526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192460
5014	NC_020532	TAA	2	6	253585	253590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192460
5015	NC_020532	TTTG	2	8	253611	253618	0 %	75 %	25 %	0 %	470192460
5016	NC_020532	AT	3	6	253637	253642	50 %	50 %	0 %	0 %	470192460
5017	NC_020532	ATGAT	2	10	253721	253730	40 %	40 %	20 %	0 %	470192460
5018	NC_020532	T	7	7	253758	253764	0 %	100 %	0 %	0 %	470192460
5019	NC_020532	AAG	2	6	253788	253793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192460
5020	NC_020532	ATT	2	6	253831	253836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192460
5021	NC_020532	TTA	2	6	253853	253858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192460
5022	NC_020532	TTA	2	6	253872	253877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192460
5023	NC_020532	ATC	2	6	253879	253884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192460
5024	NC_020532	ATT	2	6	253912	253917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192460
5025	NC_020532	TCT	2	6	253922	253927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192460
5026	NC_020532	TAA	2	6	254081	254086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192460
5027	NC_020532	TGA	2	6	254176	254181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192460
5028	NC_020532	T	7	7	254211	254217	0 %	100 %	0 %	0 %	470192460
5029	NC_020532	TGA	2	6	254324	254329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192460
5030	NC_020532	AAT	2	6	254378	254383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192460
5031	NC_020532	GCA	2	6	254390	254395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192460
5032	NC_020532	CTG	2	6	254514	254519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192460
5033	NC_020532	TTCAT	2	10	254546	254555	20 %	60 %	0 %	20 %	470192460
5034	NC_020532	ACC	2	6	255565	255570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192461
5035	NC_020532	TTC	2	6	255613	255618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192461
5036	NC_020532	GT	3	6	255649	255654	0 %	50 %	50 %	0 %	470192461
5037	NC_020532	TGT	2	6	255716	255721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192461
5038	NC_020532	CTA	2	6	255786	255791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192461
5039	NC_020532	CTT	2	6	255891	255896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192461
5040	NC_020532	TTG	2	6	255915	255920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192461
5041	NC_020532	TGT	2	6	255940	255945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192461
5042	NC_020532	T	7	7	255977	255983	0 %	100 %	0 %	0 %	470192461
5043	NC_020532	TTC	2	6	256087	256092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192461
5044	NC_020532	CAT	2	6	256171	256176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192461
5045	NC_020532	TTC	2	6	256264	256269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192461
5046	NC_020532	TAA	2	6	256297	256302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192461
5047	NC_020532	TAA	2	6	256383	256388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192461
5048	NC_020532	GTTT	2	8	256568	256575	0 %	75 %	25 %	0 %	470192461
5049	NC_020532	TTG	2	6	257266	257271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192462
5050	NC_020532	TCA	2	6	257281	257286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192462
5051	NC_020532	GAG	2	6	257311	257316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470192462
5052	NC_020532	CAA	2	6	257353	257358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192462
5053	NC_020532	ATG	2	6	257395	257400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192462
5054	NC_020532	TGC	2	6	257426	257431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192462
5055	NC_020532	TTG	2	6	257494	257499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192462
5056	NC_020532	ATT	2	6	257648	257653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192462
5057	NC_020532	AAGCG	2	10	257657	257666	40 %	0 %	40 %	20 %	470192462
5058	NC_020532	ATT	2	6	257700	257705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192462
5059	NC_020532	AAC	2	6	257782	257787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192462
5060	NC_020532	GCA	2	6	257838	257843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192462
5061	NC_020532	ATT	2	6	257850	257855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192462
5062	NC_020532	TTA	2	6	257873	257878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192462
5063	NC_020532	ATT	2	6	257954	257959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192462
5064	NC_020532	ATG	2	6	257971	257976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192462
5065	NC_020532	AAG	2	6	257977	257982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192462
5066	NC_020532	CAG	2	6	258001	258006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192462
5067	NC_020532	TCA	2	6	258007	258012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192462
5068	NC_020532	CGT	2	6	258032	258037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192462
5069	NC_020532	ACG	2	6	258052	258057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192462
5070	NC_020532	AGA	2	6	258116	258121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192462
5071	NC_020532	TTC	2	6	258466	258471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192463
5072	NC_020532	CAA	2	6	258663	258668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192463
5073	NC_020532	TTG	2	6	258697	258702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192463
5074	NC_020532	TGC	2	6	258703	258708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192463
5075	NC_020532	TCT	2	6	258716	258721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192463
5076	NC_020532	AAATT	2	10	258737	258746	60 %	40 %	0 %	0 %	470192463
5077	NC_020532	CA	3	6	258788	258793	50 %	0 %	0 %	50 %	470192463
5078	NC_020532	GTTT	2	8	258820	258827	0 %	75 %	25 %	0 %	470192463
5079	NC_020532	CAT	2	6	258916	258921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192463
5080	NC_020532	AAG	2	6	258938	258943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192463
5081	NC_020532	ACAA	2	8	258971	258978	75 %	0 %	0 %	25 %	470192463
5082	NC_020532	AAACT	2	10	258980	258989	60 %	20 %	0 %	20 %	470192463
5083	NC_020532	AGTG	2	8	259021	259028	25 %	25 %	50 %	0 %	470192463
5084	NC_020532	CCG	2	6	259046	259051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470192463
5085	NC_020532	T	6	6	259057	259062	0 %	100 %	0 %	0 %	470192463
5086	NC_020532	TG	3	6	259078	259083	0 %	50 %	50 %	0 %	470192463
5087	NC_020532	CAC	2	6	259101	259106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192463
5088	NC_020532	CAT	2	6	259117	259122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192463
5089	NC_020532	TAA	2	6	259125	259130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192463
5090	NC_020532	AC	3	6	259152	259157	50 %	0 %	0 %	50 %	470192463
5091	NC_020532	AAT	2	6	259161	259166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192463
5092	NC_020532	AGA	2	6	259200	259205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192463
5093	NC_020532	ACC	2	6	259249	259254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192463
5094	NC_020532	GTAA	2	8	259275	259282	50 %	25 %	25 %	0 %	470192463
5095	NC_020532	A	6	6	259281	259286	100 %	0 %	0 %	0 %	470192463
5096	NC_020532	CCA	2	6	259370	259375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192463
5097	NC_020532	CCA	2	6	259475	259480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192463
5098	NC_020532	GGT	2	6	259496	259501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192463
5099	NC_020532	TGT	2	6	259521	259526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192463
5100	NC_020532	ATA	2	6	259541	259546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192463
5101	NC_020532	TAA	2	6	259654	259659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192463
5102	NC_020532	AGC	2	6	259694	259699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192463
5103	NC_020532	TAC	2	6	259788	259793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192463
5104	NC_020532	TAA	2	6	259825	259830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192463
5105	NC_020532	CAC	2	6	259881	259886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192463
5106	NC_020532	CAA	2	6	259894	259899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192463
5107	NC_020532	CTG	2	6	259951	259956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192463
5108	NC_020532	TCA	2	6	259977	259982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192463
5109	NC_020532	ATT	2	6	260354	260359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192464
5110	NC_020532	GAT	2	6	260381	260386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192464
5111	NC_020532	AAC	2	6	260443	260448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192464
5112	NC_020532	AATC	2	8	260459	260466	50 %	25 %	0 %	25 %	470192464
5113	NC_020532	TTAA	2	8	260555	260562	50 %	50 %	0 %	0 %	470192464
5114	NC_020532	TGA	2	6	260682	260687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192464
5115	NC_020532	GTG	2	6	260799	260804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192464
5116	NC_020532	CAG	2	6	260829	260834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192464
5117	NC_020532	AGC	2	6	260860	260865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192464
5118	NC_020532	AAT	2	6	260969	260974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192464
5119	NC_020532	TCG	2	6	260988	260993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192464
5120	NC_020532	ATT	2	6	260998	261003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192464
5121	NC_020532	AAG	2	6	261014	261019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192464
5122	NC_020532	ATGG	2	8	261041	261048	25 %	25 %	50 %	0 %	470192464
5123	NC_020532	ATG	2	6	261060	261065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192464
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5152	NC_020532	TTAT	2	8	262995	263002	25 %	75 %	0 %	0 %	470192465
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5230	NC_020532	AGA	2	6	267833	267838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192469
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5238	NC_020532	AAGA	2	8	268197	268204	75 %	0 %	25 %	0 %	470192469
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5334	NC_020532	A	6	6	274228	274233	100 %	0 %	0 %	0 %	470192474
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5347	NC_020532	TGA	2	6	274643	274648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192474
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5365	NC_020532	TTACA	2	10	275325	275334	40 %	40 %	0 %	20 %	470192475
5366	NC_020532	TTA	2	6	275341	275346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192475
5367	NC_020532	AT	3	6	275371	275376	50 %	50 %	0 %	0 %	470192475
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5374	NC_020532	GTA	2	6	275630	275635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192475
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5481	NC_020532	TATCT	2	10	280719	280728	20 %	60 %	0 %	20 %	470192479
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5487	NC_020532	GAT	2	6	281090	281095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192479
5488	NC_020532	ATC	2	6	281176	281181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192479
5489	NC_020532	CAA	2	6	281188	281193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192479
5490	NC_020532	GTCT	2	8	281209	281216	0 %	50 %	25 %	25 %	470192479
5491	NC_020532	AAG	2	6	281245	281250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192479
5492	NC_020532	AGA	2	6	281261	281266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192479
5493	NC_020532	AGC	2	6	281300	281305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192479
5494	NC_020532	TCG	2	6	281338	281343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192479
5495	NC_020532	TAG	2	6	281426	281431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192479
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5497	NC_020532	T	6	6	281519	281524	0 %	100 %	0 %	0 %	470192479
5498	NC_020532	TTCAA	2	10	281526	281535	40 %	40 %	0 %	20 %	470192479
5499	NC_020532	AATA	2	8	281561	281568	75 %	25 %	0 %	0 %	470192479
5500	NC_020532	T	6	6	281606	281611	0 %	100 %	0 %	0 %	470192479

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