MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020532	TCG	3	9	225330	225338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192442
4502	NC_020532	GAA	2	6	225370	225375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192442
4503	NC_020532	GGA	2	6	225385	225390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470192442
4504	NC_020532	ACGC	2	8	225409	225416	25 %	0 %	25 %	50 %	470192442
4505	NC_020532	GAT	2	6	225435	225440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192442
4506	NC_020532	TAAAT	2	10	225483	225492	60 %	40 %	0 %	0 %	470192442
4507	NC_020532	AGC	2	6	225494	225499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192442
4508	NC_020532	ATG	2	6	225500	225505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192442
4509	NC_020532	TTA	2	6	225569	225574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192442
4510	NC_020532	GAA	2	6	225579	225584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192442
4511	NC_020532	CGA	2	6	225590	225595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192442
4512	NC_020532	GAA	3	9	225796	225804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192442
4513	NC_020532	CAT	2	6	225960	225965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192443
4514	NC_020532	TGG	2	6	225996	226001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192443
4515	NC_020532	GAT	2	6	226089	226094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192443
4516	NC_020532	TTG	2	6	226157	226162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192443
4517	NC_020532	GGT	2	6	226167	226172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192443
4518	NC_020532	GAC	2	6	226263	226268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192443
4519	NC_020532	TAA	2	6	226299	226304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192443
4520	NC_020532	ATT	2	6	226314	226319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192443
4521	NC_020532	CA	3	6	226342	226347	50 %	0 %	0 %	50 %	470192443
4522	NC_020532	A	6	6	226366	226371	100 %	0 %	0 %	0 %	470192443
4523	NC_020532	TGGT	2	8	226388	226395	0 %	50 %	50 %	0 %	470192443
4524	NC_020532	TAG	2	6	226403	226408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192443
4525	NC_020532	TGGG	2	8	226443	226450	0 %	25 %	75 %	0 %	470192443
4526	NC_020532	AAC	2	6	226592	226597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192443
4527	NC_020532	GAT	2	6	226648	226653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192443
4528	NC_020532	AGCA	2	8	226686	226693	50 %	0 %	25 %	25 %	470192443
4529	NC_020532	ATTT	2	8	226775	226782	25 %	75 %	0 %	0 %	470192443
4530	NC_020532	AT	3	6	226792	226797	50 %	50 %	0 %	0 %	470192443
4531	NC_020532	AAAGC	2	10	226823	226832	60 %	0 %	20 %	20 %	470192443
4532	NC_020532	GA	3	6	226864	226869	50 %	0 %	50 %	0 %	470192443
4533	NC_020532	AGA	2	6	226905	226910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192443
4534	NC_020532	GAA	2	6	226927	226932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192443
4535	NC_020532	TAT	2	6	227081	227086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192444
4536	NC_020532	TGGAT	2	10	227133	227142	20 %	40 %	40 %	0 %	470192444
4537	NC_020532	GGT	2	6	227161	227166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192444
4538	NC_020532	GTT	2	6	227199	227204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192444
4539	NC_020532	CAGA	2	8	227246	227253	50 %	0 %	25 %	25 %	470192444
4540	NC_020532	AAG	2	6	227318	227323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192444
4541	NC_020532	GTT	2	6	227377	227382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192444
4542	NC_020532	GAT	2	6	227410	227415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192444
4543	NC_020532	AT	3	6	227628	227633	50 %	50 %	0 %	0 %	470192444
4544	NC_020532	TGG	2	6	227662	227667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192444
4545	NC_020532	TGC	2	6	227685	227690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192444
4546	NC_020532	TCA	2	6	227721	227726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192444
4547	NC_020532	TTA	3	9	227885	227893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192444
4548	NC_020532	TAT	2	6	227934	227939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192444
4549	NC_020532	AGA	2	6	227946	227951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192444
4550	NC_020532	CAG	2	6	228005	228010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192444
4551	NC_020532	TGG	2	6	228016	228021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192444
4552	NC_020532	ATA	2	6	228024	228029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192444
4553	NC_020532	TCT	2	6	228407	228412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192445
4554	NC_020532	TAA	2	6	228451	228456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192445
4555	NC_020532	GT	3	6	228475	228480	0 %	50 %	50 %	0 %	470192445
4556	NC_020532	TAA	3	9	228481	228489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192445
4557	NC_020532	ATG	2	6	228509	228514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192445
4558	NC_020532	AAG	2	6	228518	228523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192445
4559	NC_020532	TA	3	6	228546	228551	50 %	50 %	0 %	0 %	470192445
4560	NC_020532	TAA	2	6	228561	228566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192445
4561	NC_020532	AAT	2	6	228587	228592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192445
4562	NC_020532	ACC	2	6	228607	228612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192445
4563	NC_020532	TAA	2	6	228621	228626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192445
4564	NC_020532	ATAA	2	8	228629	228636	75 %	25 %	0 %	0 %	470192445
4565	NC_020532	TAA	2	6	228702	228707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192445
4566	NC_020532	GT	3	6	228742	228747	0 %	50 %	50 %	0 %	470192445
4567	NC_020532	ATAG	2	8	228869	228876	50 %	25 %	25 %	0 %	470192445
4568	NC_020532	ATG	2	6	228881	228886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192445
4569	NC_020532	TCC	2	6	228887	228892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470192445
4570	NC_020532	ACA	2	6	228926	228931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192445
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4572	NC_020532	CTTT	2	8	229203	229210	0 %	75 %	0 %	25 %	470192446
4573	NC_020532	AAC	2	6	229250	229255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192446
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4577	NC_020532	ATT	2	6	229483	229488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192446
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4580	NC_020532	GGT	2	6	229622	229627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192446
4581	NC_020532	GGT	2	6	229637	229642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192446
4582	NC_020532	TTC	2	6	229667	229672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192446
4583	NC_020532	ATT	2	6	229738	229743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192446
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4586	NC_020532	GAA	2	6	229787	229792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192446
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4588	NC_020532	TAT	2	6	230043	230048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192446
4589	NC_020532	TTA	2	6	230066	230071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192446
4590	NC_020532	GTC	2	6	230076	230081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192446
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4593	NC_020532	ATT	2	6	230209	230214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192446
4594	NC_020532	GGC	2	6	230326	230331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470192446
4595	NC_020532	TGGA	2	8	230383	230390	25 %	25 %	50 %	0 %	470192446
4596	NC_020532	TCT	2	6	230406	230411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192446
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4601	NC_020532	T	6	6	230898	230903	0 %	100 %	0 %	0 %	470192447
4602	NC_020532	AAT	2	6	231017	231022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192447
4603	NC_020532	TCGCA	2	10	231057	231066	20 %	20 %	20 %	40 %	470192447
4604	NC_020532	CAA	2	6	231143	231148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192447
4605	NC_020532	ATA	2	6	231159	231164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192447
4606	NC_020532	ATC	2	6	231165	231170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192447
4607	NC_020532	CAT	2	6	231200	231205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192447
4608	NC_020532	TTG	2	6	231237	231242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192447
4609	NC_020532	TAA	2	6	231246	231251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192447
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4611	NC_020532	ATG	2	6	231324	231329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192447
4612	NC_020532	AT	3	6	231346	231351	50 %	50 %	0 %	0 %	470192447
4613	NC_020532	ATA	2	6	231371	231376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192447
4614	NC_020532	TGA	2	6	231377	231382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192447
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4616	NC_020532	CAT	2	6	231759	231764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192448
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4618	NC_020532	CAT	2	6	231931	231936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192448
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4620	NC_020532	TCA	2	6	231995	232000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192448
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4622	NC_020532	TTG	2	6	232108	232113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192448
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4740	NC_020532	A	6	6	238511	238516	100 %	0 %	0 %	0 %	470192452
4741	NC_020532	GAA	2	6	238542	238547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192452
4742	NC_020532	ACG	2	6	238557	238562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192452
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4744	NC_020532	TCA	2	6	238744	238749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192452
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