MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI2T2 complete sequence

Total Repeats: 254

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020531	TCA	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455777
2	NC_020531	TAG	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455777
3	NC_020531	ATT	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455777
4	NC_020531	ATC	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455777
5	NC_020531	GCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455777
6	NC_020531	CAT	2	6	1203	1208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455777
7	NC_020531	TGA	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455777
8	NC_020531	AAT	2	6	1474	1479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455777
9	NC_020531	TTC	2	6	1639	1644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
10	NC_020531	ATT	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455777
11	NC_020531	TGT	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455777
12	NC_020531	TTC	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
13	NC_020531	TTC	2	6	1861	1866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
14	NC_020531	CCA	2	6	2015	2020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455777
15	NC_020531	AAT	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455777
16	NC_020531	AGT	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455777
17	NC_020531	TCA	2	6	2237	2242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455777
18	NC_020531	AGC	2	6	2281	2286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455777
19	NC_020531	ATA	2	6	2357	2362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455777
20	NC_020531	ATT	2	6	2393	2398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455777
21	NC_020531	CTT	2	6	2424	2429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
22	NC_020531	ACA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455777
23	NC_020531	ATG	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455777
24	NC_020531	TCA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455777
25	NC_020531	TCT	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
26	NC_020531	TAG	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455777
27	NC_020531	TCT	2	6	2786	2791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
28	NC_020531	TTC	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
29	NC_020531	TCT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455777
30	NC_020531	CAT	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455778
31	NC_020531	TAT	2	6	4229	4234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455778
32	NC_020531	AGC	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455778
33	NC_020531	GTT	2	6	4421	4426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455778
34	NC_020531	TAT	2	6	4475	4480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455778
35	NC_020531	ATC	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455778
36	NC_020531	TTA	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455778
37	NC_020531	AAT	2	6	4885	4890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455778
38	NC_020531	TAT	2	6	4921	4926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
39	NC_020531	AAG	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455779
40	NC_020531	TTA	2	6	4960	4965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
41	NC_020531	TTA	2	6	5005	5010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
42	NC_020531	CTT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455779
43	NC_020531	TAA	2	6	5130	5135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455779
44	NC_020531	AAT	2	6	5140	5145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455779
45	NC_020531	ACC	2	6	5197	5202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455779
46	NC_020531	ATA	2	6	5258	5263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455779
47	NC_020531	TTA	2	6	5291	5296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
48	NC_020531	TTA	2	6	5323	5328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
49	NC_020531	TCT	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455779
50	NC_020531	TAT	3	9	5613	5621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
51	NC_020531	TAA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455779
52	NC_020531	TAT	2	6	5742	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
53	NC_020531	AGA	2	6	5827	5832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455779
54	NC_020531	AAG	2	6	5846	5851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455779
55	NC_020531	GAA	2	6	6054	6059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455779
56	NC_020531	ATG	2	6	6167	6172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455779
57	NC_020531	TAA	2	6	6342	6347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455779
58	NC_020531	ATG	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455779
59	NC_020531	TCT	2	6	6478	6483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455779
60	NC_020531	ATT	2	6	6486	6491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
61	NC_020531	TAA	2	6	6558	6563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455779
62	NC_020531	GGT	2	6	6566	6571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472455779
63	NC_020531	TAT	2	6	6604	6609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455779
64	NC_020531	TTG	2	6	7514	7519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455780
65	NC_020531	TAA	2	6	7581	7586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455780
66	NC_020531	AGA	2	6	7611	7616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455780
67	NC_020531	GCA	2	6	7672	7677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455780
68	NC_020531	TTC	2	6	7713	7718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455780
69	NC_020531	GTC	2	6	7760	7765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472455780
70	NC_020531	AAT	2	6	7894	7899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455780
71	NC_020531	ATC	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455781
72	NC_020531	AAG	2	6	8185	8190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455781
73	NC_020531	ATG	2	6	8257	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455781
74	NC_020531	ATT	2	6	8265	8270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455781
75	NC_020531	ATT	2	6	8281	8286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455781
76	NC_020531	ATG	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455781
77	NC_020531	GTG	2	6	8547	8552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472455781
78	NC_020531	AGA	2	6	8561	8566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455781
79	NC_020531	AAG	2	6	8593	8598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455781
80	NC_020531	ATT	2	6	9560	9565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455782
81	NC_020531	TGC	2	6	9669	9674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472455782
82	NC_020531	CAT	2	6	9695	9700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455782
83	NC_020531	CCT	2	6	9728	9733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472455782
84	NC_020531	ATT	2	6	9829	9834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455782
85	NC_020531	ATA	2	6	9849	9854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455782
86	NC_020531	GTT	2	6	9862	9867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455782
87	NC_020531	TTC	2	6	9954	9959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455782
88	NC_020531	ATA	2	6	10005	10010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455782
89	NC_020531	TAC	2	6	10022	10027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455782
90	NC_020531	AGT	3	9	10053	10061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455782
91	NC_020531	TCA	2	6	10124	10129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455782
92	NC_020531	ATG	2	6	10335	10340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455783
93	NC_020531	TAG	2	6	10366	10371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455783
94	NC_020531	GTT	2	6	10392	10397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455783
95	NC_020531	GAA	2	6	10549	10554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455783
96	NC_020531	ATT	2	6	10562	10567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455783
97	NC_020531	TAA	2	6	10672	10677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455783
98	NC_020531	ACT	2	6	10683	10688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455783
99	NC_020531	GGA	2	6	10794	10799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472455783
100	NC_020531	ATA	2	6	10857	10862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455783
101	NC_020531	AAG	2	6	10999	11004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455783
102	NC_020531	ATT	2	6	11016	11021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455783
103	NC_020531	TGC	2	6	11147	11152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472455783
104	NC_020531	TTA	2	6	11187	11192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455783
105	NC_020531	GAA	2	6	11217	11222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455783
106	NC_020531	GCG	2	6	11304	11309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472455783
107	NC_020531	TAT	2	6	11369	11374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455783
108	NC_020531	TAA	2	6	11470	11475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455783
109	NC_020531	GCT	2	6	11511	11516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472455783
110	NC_020531	TCT	2	6	11577	11582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455783
111	NC_020531	TCA	2	6	11619	11624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455783
112	NC_020531	GAA	2	6	11658	11663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455783
113	NC_020531	CAT	2	6	11731	11736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455783
114	NC_020531	ATG	2	6	11740	11745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455783
115	NC_020531	TAG	2	6	11764	11769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455783
116	NC_020531	TGA	2	6	12052	12057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455784
117	NC_020531	TAG	2	6	12121	12126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455784
118	NC_020531	TTA	2	6	12210	12215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455784
119	NC_020531	TTA	2	6	12358	12363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455784
120	NC_020531	TAT	3	9	12401	12409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455784
121	NC_020531	TAC	2	6	12415	12420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455784
122	NC_020531	ATG	2	6	12598	12603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455784
123	NC_020531	ATT	2	6	12614	12619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455784
124	NC_020531	TTC	2	6	13005	13010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455785
125	NC_020531	ATC	2	6	13020	13025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455785
126	NC_020531	TGT	2	6	13120	13125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455785
127	NC_020531	TTC	2	6	13143	13148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455785
128	NC_020531	CTT	2	6	13160	13165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455785
129	NC_020531	TTA	2	6	13261	13266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455785
130	NC_020531	TTG	2	6	13284	13289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455785
131	NC_020531	TTG	2	6	13329	13334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455785
132	NC_020531	GTT	2	6	13340	13345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455785
133	NC_020531	ATT	2	6	13455	13460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455785
134	NC_020531	ATT	2	6	13638	13643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455785
135	NC_020531	ACC	2	6	13741	13746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455785
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250	NC_020531	CAA	2	6	30181	30186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455797
251	NC_020531	GCA	2	6	30222	30227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455797
252	NC_020531	TCC	2	6	30312	30317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472455797
253	NC_020531	CAG	2	6	30358	30363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455797
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.