MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI1T1 complete sequence

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020530	CTTA	2	8	1096	1103	25 %	50 %	0 %	25 %	472455755
2	NC_020530	AGTA	2	8	1584	1591	50 %	25 %	25 %	0 %	472455755
3	NC_020530	TAGA	2	8	1867	1874	50 %	25 %	25 %	0 %	472455755
4	NC_020530	CCAT	2	8	2321	2328	25 %	25 %	0 %	50 %	472455755
5	NC_020530	TTAA	2	8	4207	4214	50 %	50 %	0 %	0 %	472455756
6	NC_020530	TTTA	2	8	4296	4303	25 %	75 %	0 %	0 %	472455756
7	NC_020530	AAGT	2	8	5163	5170	50 %	25 %	25 %	0 %	472455757
8	NC_020530	AAAG	2	8	5651	5658	75 %	0 %	25 %	0 %	472455757
9	NC_020530	CATT	2	8	5794	5801	25 %	50 %	0 %	25 %	472455757
10	NC_020530	TTAA	2	8	5833	5840	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
11	NC_020530	AATT	2	8	5873	5880	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
12	NC_020530	AAAG	2	8	6085	6092	75 %	0 %	25 %	0 %	472455757
13	NC_020530	ATTT	2	8	6127	6134	25 %	75 %	0 %	0 %	472455757
14	NC_020530	TGGA	2	8	6373	6380	25 %	25 %	50 %	0 %	472455757
15	NC_020530	TAGA	2	8	7529	7536	50 %	25 %	25 %	0 %	472455758
16	NC_020530	TAAA	2	8	7775	7782	75 %	25 %	0 %	0 %	472455758
17	NC_020530	ATAA	2	8	7913	7920	75 %	25 %	0 %	0 %	472455758
18	NC_020530	ATGA	2	8	8042	8049	50 %	25 %	25 %	0 %	472455759
19	NC_020530	TTAT	2	8	8533	8540	25 %	75 %	0 %	0 %	472455759
20	NC_020530	ATAA	2	8	10081	10088	75 %	25 %	0 %	0 %	472455760
21	NC_020530	GTTT	2	8	10384	10391	0 %	75 %	25 %	0 %	472455761
22	NC_020530	ATTA	2	8	10415	10422	50 %	50 %	0 %	0 %	472455761
23	NC_020530	AAAG	2	8	10722	10729	75 %	0 %	25 %	0 %	472455761
24	NC_020530	TAAT	2	8	10837	10844	50 %	50 %	0 %	0 %	472455761
25	NC_020530	TATG	2	8	11528	11535	25 %	50 %	25 %	0 %	472455761
26	NC_020530	AATT	2	8	12169	12176	50 %	50 %	0 %	0 %	472455762
27	NC_020530	CAAA	2	8	12938	12945	75 %	0 %	0 %	25 %	472455763
28	NC_020530	TCTT	2	8	13221	13228	0 %	75 %	0 %	25 %	472455763
29	NC_020530	TTTA	2	8	13302	13309	25 %	75 %	0 %	0 %	472455763
30	NC_020530	TCTT	2	8	13500	13507	0 %	75 %	0 %	25 %	472455763
31	NC_020530	CTTT	2	8	13537	13544	0 %	75 %	0 %	25 %	472455763
32	NC_020530	TAAT	2	8	13591	13598	50 %	50 %	0 %	0 %	472455763
33	NC_020530	GTTT	2	8	13651	13658	0 %	75 %	25 %	0 %	472455763
34	NC_020530	TATG	2	8	14260	14267	25 %	50 %	25 %	0 %	472455764
35	NC_020530	ATCC	2	8	14293	14300	25 %	25 %	0 %	50 %	472455764
36	NC_020530	TAGA	2	8	14313	14320	50 %	25 %	25 %	0 %	472455764
37	NC_020530	TATT	2	8	14471	14478	25 %	75 %	0 %	0 %	472455764
38	NC_020530	ATTA	2	8	19138	19145	50 %	50 %	0 %	0 %	472455765
39	NC_020530	TTAG	2	8	19613	19620	25 %	50 %	25 %	0 %	472455765
40	NC_020530	CAAC	2	8	19684	19691	50 %	0 %	0 %	50 %	472455765
41	NC_020530	AAGC	2	8	20185	20192	50 %	0 %	25 %	25 %	472455766
42	NC_020530	GCTA	2	8	20649	20656	25 %	25 %	25 %	25 %	472455766
43	NC_020530	TAAA	2	8	21807	21814	75 %	25 %	0 %	0 %	472455767
44	NC_020530	AAAT	2	8	21999	22006	75 %	25 %	0 %	0 %	472455767
45	NC_020530	AAGA	2	8	22800	22807	75 %	0 %	25 %	0 %	472455768
46	NC_020530	ACAT	2	8	24032	24039	50 %	25 %	0 %	25 %	472455769
47	NC_020530	AAGA	2	8	24266	24273	75 %	0 %	25 %	0 %	472455769
48	NC_020530	AGTA	2	8	24607	24614	50 %	25 %	25 %	0 %	472455770
49	NC_020530	CCGA	2	8	25418	25425	25 %	0 %	25 %	50 %	472455771
50	NC_020530	CGGA	2	8	25513	25520	25 %	0 %	50 %	25 %	472455771
51	NC_020530	ACGG	2	8	25808	25815	25 %	0 %	50 %	25 %	472455771
52	NC_020530	TCAC	2	8	26146	26153	25 %	25 %	0 %	50 %	472455772
53	NC_020530	CGAT	2	8	26321	26328	25 %	25 %	25 %	25 %	472455772
54	NC_020530	CGCT	2	8	26770	26777	0 %	25 %	25 %	50 %	472455772
55	NC_020530	TCAT	2	8	26920	26927	25 %	50 %	0 %	25 %	472455772
56	NC_020530	TGAC	2	8	27100	27107	25 %	25 %	25 %	25 %	472455772
57	NC_020530	GGCT	2	8	27403	27410	0 %	25 %	50 %	25 %	472455772
58	NC_020530	ATAG	2	8	28464	28471	50 %	25 %	25 %	0 %	472455773
59	NC_020530	CTTT	2	8	29031	29038	0 %	75 %	0 %	25 %	472455774
60	NC_020530	AACT	2	8	29059	29066	50 %	25 %	0 %	25 %	472455774
61	NC_020530	TAGG	2	8	29182	29189	25 %	25 %	50 %	0 %	472455774
62	NC_020530	ATTC	2	8	29224	29231	25 %	50 %	0 %	25 %	472455774
63	NC_020530	TACC	2	8	30325	30332	25 %	25 %	0 %	50 %	472455775
64	NC_020530	TTAC	2	8	30504	30511	25 %	50 %	0 %	25 %	472455775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.