MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020529	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190317
2	NC_020529	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470190320
3	NC_020529	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190320
4	NC_020529	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190320
5	NC_020529	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190320
6	NC_020529	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470190320
7	NC_020529	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470190322
8	NC_020529	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190322
9	NC_020529	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470190326
10	NC_020529	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190326
11	NC_020529	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	470190327
12	NC_020529	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470190328
13	NC_020529	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190328
14	NC_020529	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190329
15	NC_020529	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190330
16	NC_020529	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470190332
17	NC_020529	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190335
18	NC_020529	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470190336
19	NC_020529	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190338
20	NC_020529	ACAACT	2	12	40613	40624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470190340
21	NC_020529	TAGTTT	2	12	47301	47312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470190346
22	NC_020529	ATAACC	2	12	47797	47808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470190346
23	NC_020529	TTTGTA	2	12	52952	52963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470190349
24	NC_020529	TTTTTC	2	12	53969	53980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470190350
25	NC_020529	TATTTT	2	12	54273	54284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470190350
26	NC_020529	ATAAAA	2	12	55465	55476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470190351
27	NC_020529	TTGTGA	2	12	59572	59583	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470190353
28	NC_020529	TTTATA	2	12	59912	59923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190353
29	NC_020529	TTTATC	2	12	60216	60227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470190354
30	NC_020529	ACAAAT	2	12	63549	63560	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470190356
31	NC_020529	AATTAA	2	12	63640	63651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190356
32	NC_020529	TTAATG	2	12	66583	66594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190357
33	NC_020529	AAGTCA	2	12	67788	67799	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190358
34	NC_020529	AAAAAG	2	12	67902	67913	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470190358
35	NC_020529	GAAAAA	2	12	68215	68226	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470190358
36	NC_020529	AATTAT	2	12	70454	70465	50 %	50 %	0 %	0 %	470190360
37	NC_020529	ACCCTT	2	12	72293	72304	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470190361
38	NC_020529	TTTAGC	2	12	74202	74213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470190362
39	NC_020529	AAATAA	2	12	74253	74264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470190362
40	NC_020529	GTTAGA	2	12	76376	76387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190363
41	NC_020529	AAAAGA	2	12	76430	76441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470190363
42	NC_020529	GCTAAA	2	12	79218	79229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190365
43	NC_020529	TAAAGA	2	12	83366	83377	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470190370
44	NC_020529	AACCAC	2	12	87238	87249	50 %	0 %	0 %	50 %	470190372
45	NC_020529	AACCGA	2	12	90549	90560	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470190374
46	NC_020529	ATAGAT	2	12	95449	95460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190377
47	NC_020529	TATCAT	2	12	96216	96227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470190378
48	NC_020529	TTTATT	2	12	96624	96635	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470190379
49	NC_020529	TATTTG	2	12	96710	96721	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470190379
50	NC_020529	TAAATA	2	12	98143	98154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190379
51	NC_020529	TTTTTC	2	12	99837	99848	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470190380
52	NC_020529	TAAGCC	2	12	101698	101709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190382
53	NC_020529	ATCGCA	2	12	102913	102924	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190383
54	NC_020529	TTTGAA	2	12	103944	103955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190384
55	NC_020529	CAATGG	2	12	112902	112913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470190390
56	NC_020529	TGAAGA	2	12	113736	113747	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470190391
57	NC_020529	TTTCAT	2	12	114417	114428	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470190392
58	NC_020529	TGTATA	2	12	118637	118648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190396
59	NC_020529	TCGAAA	2	12	120138	120149	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190398
60	NC_020529	CTATTG	2	12	122724	122735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470190400
61	NC_020529	CATATG	2	12	123927	123938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190401
62	NC_020529	GGTATG	2	12	126970	126981	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470190404
63	NC_020529	CAGATT	2	12	129568	129579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190406
64	NC_020529	AGATAT	2	12	136946	136957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190413
65	NC_020529	ATGCCT	2	12	138085	138096	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470190414
66	NC_020529	TGAAAG	2	12	138725	138736	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470190414
67	NC_020529	GATATG	2	12	146225	146236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190420
68	NC_020529	ATTTGA	2	12	150131	150142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190423
69	NC_020529	GATTTT	2	12	154642	154653	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470190428
70	NC_020529	ACAAAG	2	12	159162	159173	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470190432
71	NC_020529	AAAGAT	2	12	161175	161186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470190433
72	NC_020529	ATTAAT	2	12	163081	163092	50 %	50 %	0 %	0 %	470190434
73	NC_020529	CAATAT	2	12	163647	163658	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470190434
74	NC_020529	TTGGTA	2	12	167732	167743	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470190438
75	NC_020529	GCGATT	2	12	167752	167763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470190438
76	NC_020529	AAATTT	2	12	167850	167861	50 %	50 %	0 %	0 %	470190438
77	NC_020529	ACCTGC	2	12	170753	170764	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470190440
78	NC_020529	AAGATA	2	12	170899	170910	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470190440
79	NC_020529	CGTTAA	2	12	173833	173844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190442
80	NC_020529	CTATTA	2	12	175684	175695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470190442
81	NC_020529	TATGAT	2	12	177218	177229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190442
82	NC_020529	TTGAAA	2	12	177670	177681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190442
83	NC_020529	AACATT	2	12	180110	180121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470190442
84	NC_020529	AGCAAC	2	12	183599	183610	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470190446
85	NC_020529	TGTTTG	2	12	183647	183658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190446
86	NC_020529	CACCTT	2	12	185651	185662	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470190448
87	NC_020529	ACCTTT	2	12	186156	186167	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470190448
88	NC_020529	GTAAAT	2	12	189895	189906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190451
89	NC_020529	ATTTTA	2	12	191490	191501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190452
90	NC_020529	TATCTT	2	12	196104	196115	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470190455
91	NC_020529	ATTTGG	2	12	197117	197128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470190456
92	NC_020529	GAGTTT	2	12	200460	200471	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470190457
93	NC_020529	TATACA	2	12	204461	204472	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470190461
94	NC_020529	TTATTT	2	12	206493	206504	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470190462
95	NC_020529	ATTTAT	2	12	207072	207083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190462
96	NC_020529	CCCTGA	2	12	209830	209841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470190465
97	NC_020529	TCCTGA	2	12	210649	210660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470190465
98	NC_020529	TCAATT	2	12	212800	212811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470190467
99	NC_020529	AATATG	2	12	214100	214111	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190468
100	NC_020529	AAAAAT	2	12	217607	217618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470190470
101	NC_020529	AGGACA	2	12	219467	219478	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470190472
102	NC_020529	ACATTT	2	12	219803	219814	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470190472
103	NC_020529	TTCTTG	2	12	224732	224743	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470190476
104	NC_020529	GGACGT	2	12	235234	235245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470190485
105	NC_020529	TATAGA	2	12	267766	267777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190504
106	NC_020529	ACGATG	2	12	274395	274406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470190509
107	NC_020529	AGAATC	2	12	281953	281964	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190514
108	NC_020529	AAGTAA	2	12	285376	285387	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470190518
109	NC_020529	ATAAAG	2	12	286357	286368	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470190519
110	NC_020529	GACATT	2	12	288048	288059	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190520
111	NC_020529	GATTTC	2	12	289867	289878	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470190522
112	NC_020529	TTCATA	2	12	290437	290448	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470190523
113	NC_020529	GATTAT	2	12	294844	294855	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190526
114	NC_020529	ATGGTG	2	12	294977	294988	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470190526
115	NC_020529	CAGCAA	2	12	295364	295375	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470190526
116	NC_020529	TCTTCA	2	12	300943	300954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470190531
117	NC_020529	TTATCT	2	12	301039	301050	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470190531
118	NC_020529	GAAAAA	2	12	303301	303312	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470190533
119	NC_020529	GATACA	2	12	304466	304477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190533
120	NC_020529	ACAAGA	2	12	307633	307644	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470190534
121	NC_020529	AGGACA	2	12	308011	308022	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470190534
122	NC_020529	TAAATT	2	12	310861	310872	50 %	50 %	0 %	0 %	470190535
123	NC_020529	TGAAGA	2	12	311122	311133	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470190535
124	NC_020529	TAAAAC	2	12	317571	317582	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470190539
125	NC_020529	CTGAAT	2	12	324056	324067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190545
126	NC_020529	GAAAAA	2	12	328251	328262	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470190548
127	NC_020529	TTTATT	2	12	328836	328847	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470190549
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129	NC_020529	GAAACA	2	12	330919	330930	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470190550
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131	NC_020529	AATGCA	2	12	343858	343869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190560
132	NC_020529	AATGAC	2	12	346912	346923	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190563
133	NC_020529	AAAATG	2	12	348393	348404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470190564
134	NC_020529	AATAAG	2	12	351349	351360	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470190567
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137	NC_020529	GATGCT	2	12	367078	367089	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470190579
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140	NC_020529	ATTAAA	2	12	370861	370872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190581
141	NC_020529	AGGACA	2	12	374601	374612	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470190585
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143	NC_020529	GCAAAA	2	12	381462	381473	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470190589
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147	NC_020529	CCAAAC	2	12	401957	401968	50 %	0 %	0 %	50 %	470190604
148	NC_020529	CATTTT	2	12	403864	403875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470190605
149	NC_020529	TCTTTT	2	12	404367	404378	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470190605
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219	NC_020529	CTGGTA	2	12	562916	562927	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470190713
220	NC_020529	ACGACT	2	12	564640	564651	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190715
221	NC_020529	AACGTG	2	12	565613	565624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470190715
222	NC_020529	TTCGAA	2	12	566134	566145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190715
223	NC_020529	TACAGC	2	12	568380	568391	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190717
224	NC_020529	TTGCTA	2	12	568661	568672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470190717
225	NC_020529	AAATCA	2	12	569784	569795	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470190718
226	NC_020529	TTATGA	2	12	575428	575439	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470190722
227	NC_020529	TTTCTT	2	12	578622	578633	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470190725
228	NC_020529	AAGCAC	2	12	579550	579561	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470190726
229	NC_020529	ACTGCA	2	12	581556	581567	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190728
230	NC_020529	TTAAAA	2	12	581952	581963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190728
231	NC_020529	TCAGAT	2	12	583494	583505	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190728
232	NC_020529	GACTCA	2	12	583509	583520	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190728
233	NC_020529	GACTCA	2	12	583527	583538	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190728
234	NC_020529	GACTCA	2	12	583557	583568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190728
235	NC_020529	GACTCA	2	12	583629	583640	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190728
236	NC_020529	GACTCA	2	12	583677	583688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190728
237	NC_020529	TCAGAT	2	12	583734	583745	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190728
238	NC_020529	GATTCA	2	12	583839	583850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190728
239	NC_020529	GATTCA	2	12	583857	583868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190728
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241	NC_020529	GACTCA	2	12	583893	583904	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190728
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250	NC_020529	GATTCA	2	12	587991	588002	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190729
251	NC_020529	GACTCA	2	12	588009	588020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190729
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342	NC_020529	GAAAAA	2	12	762005	762016	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470190864
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344	NC_020529	ATTCTT	2	12	763712	763723	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470190865
345	NC_020529	AATGAT	2	12	764530	764541	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470190866
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