MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020529	TAA	2	6	26379	26384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190331
503	NC_020529	AAG	2	6	26402	26407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190331
504	NC_020529	TAT	2	6	26472	26477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190331
505	NC_020529	CCG	2	6	26487	26492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470190331
506	NC_020529	AGA	2	6	26547	26552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190331
507	NC_020529	CAT	2	6	26553	26558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190331
508	NC_020529	GAA	2	6	26608	26613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190331
509	NC_020529	AAT	2	6	26623	26628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190331
510	NC_020529	T	6	6	26634	26639	0 %	100 %	0 %	0 %	470190331
511	NC_020529	GAA	3	9	26653	26661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190331
512	NC_020529	AAC	3	9	26750	26758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190331
513	NC_020529	CGT	2	6	26773	26778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190331
514	NC_020529	TTG	2	6	26783	26788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190331
515	NC_020529	GAA	2	6	26851	26856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190331
516	NC_020529	GAA	2	6	26908	26913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190331
517	NC_020529	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	470190331
518	NC_020529	TAA	2	6	27018	27023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190331
519	NC_020529	ATT	2	6	27025	27030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190331
520	NC_020529	ACA	2	6	27058	27063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190331
521	NC_020529	GGT	2	6	27325	27330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190331
522	NC_020529	ATCT	2	8	27417	27424	25 %	50 %	0 %	25 %	470190331
523	NC_020529	AAT	2	6	27470	27475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190331
524	NC_020529	TGA	2	6	27516	27521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190332
525	NC_020529	AT	3	6	27535	27540	50 %	50 %	0 %	0 %	470190332
526	NC_020529	AAG	2	6	27590	27595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190332
527	NC_020529	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	470190332
528	NC_020529	ATT	2	6	27662	27667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190332
529	NC_020529	ATC	2	6	27681	27686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190332
530	NC_020529	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	470190332
531	NC_020529	TCG	2	6	27772	27777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190332
532	NC_020529	TGA	2	6	27789	27794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190332
533	NC_020529	ATT	2	6	27820	27825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190332
534	NC_020529	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470190332
535	NC_020529	ATG	2	6	27930	27935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190332
536	NC_020529	TGA	2	6	27937	27942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190332
537	NC_020529	AAC	2	6	27994	27999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190332
538	NC_020529	T	6	6	28018	28023	0 %	100 %	0 %	0 %	470190332
539	NC_020529	AGC	2	6	28033	28038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190332
540	NC_020529	A	6	6	28043	28048	100 %	0 %	0 %	0 %	470190332
541	NC_020529	ATC	2	6	28070	28075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190332
542	NC_020529	ACAA	2	8	28076	28083	75 %	0 %	0 %	25 %	470190332
543	NC_020529	ACG	2	6	28100	28105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190332
544	NC_020529	AATG	2	8	28180	28187	50 %	25 %	25 %	0 %	470190332
545	NC_020529	TCGT	2	8	28212	28219	0 %	50 %	25 %	25 %	470190332
546	NC_020529	GTG	2	6	28230	28235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190332
547	NC_020529	ACA	2	6	28245	28250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190332
548	NC_020529	ATA	2	6	28251	28256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190332
549	NC_020529	GAA	2	6	28340	28345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190332
550	NC_020529	TTA	2	6	28368	28373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190332
551	NC_020529	TGG	2	6	28381	28386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190332
552	NC_020529	AAT	2	6	28421	28426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190332
553	NC_020529	TAA	2	6	28477	28482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190332
554	NC_020529	TCG	2	6	28537	28542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190332
555	NC_020529	ATA	2	6	28581	28586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190332
556	NC_020529	AACA	2	8	28657	28664	75 %	0 %	0 %	25 %	470190332
557	NC_020529	ATG	2	6	28758	28763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190332
558	NC_020529	TAA	2	6	28879	28884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190333
559	NC_020529	CA	3	6	28896	28901	50 %	0 %	0 %	50 %	470190333
560	NC_020529	AAG	2	6	28941	28946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190333
561	NC_020529	TGG	2	6	29071	29076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190333
562	NC_020529	ATT	2	6	29080	29085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190333
563	NC_020529	GT	3	6	29160	29165	0 %	50 %	50 %	0 %	470190333
564	NC_020529	AATT	2	8	29194	29201	50 %	50 %	0 %	0 %	470190333
565	NC_020529	AGA	2	6	29281	29286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190333
566	NC_020529	CAAT	2	8	29309	29316	50 %	25 %	0 %	25 %	470190333
567	NC_020529	GATG	2	8	29317	29324	25 %	25 %	50 %	0 %	470190333
568	NC_020529	AAG	2	6	29351	29356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190333
569	NC_020529	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	470190333
570	NC_020529	A	6	6	29414	29419	100 %	0 %	0 %	0 %	470190333
571	NC_020529	TGA	2	6	29422	29427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190333
572	NC_020529	TAC	2	6	29450	29455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190333
573	NC_020529	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	470190333
574	NC_020529	TACT	2	8	29539	29546	25 %	50 %	0 %	25 %	470190333
575	NC_020529	ATA	2	6	29562	29567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190333
576	NC_020529	ATT	2	6	29576	29581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190333
577	NC_020529	GTA	2	6	30016	30021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190334
578	NC_020529	GAA	2	6	30096	30101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190334
579	NC_020529	GGCA	2	8	30238	30245	25 %	0 %	50 %	25 %	470190334
580	NC_020529	AAAG	2	8	30251	30258	75 %	0 %	25 %	0 %	470190334
581	NC_020529	ATG	2	6	30352	30357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190334
582	NC_020529	ATA	2	6	30385	30390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190334
583	NC_020529	AAG	2	6	30396	30401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190334
584	NC_020529	AAC	2	6	30535	30540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190334
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586	NC_020529	AAG	2	6	30721	30726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190334
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589	NC_020529	TTA	2	6	31015	31020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190335
590	NC_020529	GTA	2	6	31117	31122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190335
591	NC_020529	CAA	2	6	31139	31144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190335
592	NC_020529	CAA	2	6	31153	31158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190335
593	NC_020529	CAA	2	6	31166	31171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190335
594	NC_020529	TCA	2	6	31182	31187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190335
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596	NC_020529	CAAC	2	8	31205	31212	50 %	0 %	0 %	50 %	470190335
597	NC_020529	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470190335
598	NC_020529	TGA	2	6	31239	31244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190335
599	NC_020529	CAG	2	6	31292	31297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190335
600	NC_020529	CAA	2	6	31301	31306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190335
601	NC_020529	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	470190335
602	NC_020529	ACA	2	6	31335	31340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190335
603	NC_020529	CAC	2	6	31409	31414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470190335
604	NC_020529	TGC	2	6	31422	31427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190335
605	NC_020529	ACA	3	9	31441	31449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190335
606	NC_020529	TACA	2	8	31460	31467	50 %	25 %	0 %	25 %	470190335
607	NC_020529	GAA	2	6	31492	31497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190335
608	NC_020529	GAA	2	6	31618	31623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190335
609	NC_020529	AATG	2	8	31635	31642	50 %	25 %	25 %	0 %	470190335
610	NC_020529	ATG	2	6	31652	31657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190335
611	NC_020529	CG	3	6	31768	31773	0 %	0 %	50 %	50 %	470190335
612	NC_020529	CAA	2	6	31784	31789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190335
613	NC_020529	ATT	2	6	31819	31824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190335
614	NC_020529	CAG	2	6	31910	31915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190335
615	NC_020529	ATG	2	6	31918	31923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190335
616	NC_020529	TGT	2	6	31950	31955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190335
617	NC_020529	GTG	2	6	32000	32005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190335
618	NC_020529	GAA	2	6	32043	32048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190335
619	NC_020529	ATG	2	6	32111	32116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190335
620	NC_020529	CAG	2	6	32297	32302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190335
621	NC_020529	TTA	2	6	32306	32311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190335
622	NC_020529	ATA	2	6	32318	32323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190335
623	NC_020529	GACT	2	8	32433	32440	25 %	25 %	25 %	25 %	470190335
624	NC_020529	TGG	2	6	32454	32459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190335
625	NC_020529	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	470190335
626	NC_020529	CAA	2	6	32600	32605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190335
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