MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 2635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020307	CGCGC	2	10	398	407	0 %	0 %	40 %	60 %	452119556
2	NC_020307	GCTCG	2	10	3382	3391	0 %	20 %	40 %	40 %	452119562
3	NC_020307	GCTGG	2	10	3409	3418	0 %	20 %	60 %	20 %	452119562
4	NC_020307	AGGAG	2	10	7871	7880	40 %	0 %	60 %	0 %	452119566
5	NC_020307	GATGC	2	10	10101	10110	20 %	20 %	40 %	20 %	452119568
6	NC_020307	ATTGT	2	10	11398	11407	20 %	60 %	20 %	0 %	452119570
7	NC_020307	TACGC	2	10	11925	11934	20 %	20 %	20 %	40 %	452119570
8	NC_020307	GATGC	2	10	11983	11992	20 %	20 %	40 %	20 %	452119570
9	NC_020307	CTTTG	2	10	15809	15818	0 %	60 %	20 %	20 %	452119574
10	NC_020307	CGGGC	2	10	16113	16122	0 %	0 %	60 %	40 %	452119574
11	NC_020307	TGCGG	2	10	17233	17242	0 %	20 %	60 %	20 %	452119576
12	NC_020307	GCGCG	2	10	19098	19107	0 %	0 %	60 %	40 %	452119577
13	NC_020307	GGGGA	2	10	19466	19475	20 %	0 %	80 %	0 %	452119577
14	NC_020307	CTGCG	2	10	21132	21141	0 %	20 %	40 %	40 %	452119579
15	NC_020307	GTATT	2	10	24251	24260	20 %	60 %	20 %	0 %	452119580
16	NC_020307	CGACC	2	10	25813	25822	20 %	0 %	20 %	60 %	452119582
17	NC_020307	AAAAT	2	10	29577	29586	80 %	20 %	0 %	0 %	452119586
18	NC_020307	GCCTG	2	10	30205	30214	0 %	20 %	40 %	40 %	452119587
19	NC_020307	GCGAT	2	10	32681	32690	20 %	20 %	40 %	20 %	452119589
20	NC_020307	GCTGG	2	10	38875	38884	0 %	20 %	60 %	20 %	452119595
21	NC_020307	TGGCC	2	10	40454	40463	0 %	20 %	40 %	40 %	452119596
22	NC_020307	CTGGA	2	10	42127	42136	20 %	20 %	40 %	20 %	452119596
23	NC_020307	GGTCT	2	10	43682	43691	0 %	40 %	40 %	20 %	452119597
24	NC_020307	GGTAA	2	10	44024	44033	40 %	20 %	40 %	0 %	452119598
25	NC_020307	ATAAA	2	10	44657	44666	80 %	20 %	0 %	0 %	452119598
26	NC_020307	GGCGT	2	10	45919	45928	0 %	20 %	60 %	20 %	452119599
27	NC_020307	AATAC	2	10	46269	46278	60 %	20 %	0 %	20 %	452119600
28	NC_020307	AATAA	2	10	46718	46727	80 %	20 %	0 %	0 %	452119601
29	NC_020307	CAGTA	2	10	47358	47367	40 %	20 %	20 %	20 %	452119601
30	NC_020307	AAAAT	2	10	48101	48110	80 %	20 %	0 %	0 %	452119602
31	NC_020307	ACGCG	2	10	48878	48887	20 %	0 %	40 %	40 %	452119603
32	NC_020307	GTGGC	2	10	50789	50798	0 %	20 %	60 %	20 %	452119604
33	NC_020307	CGATG	2	10	52027	52036	20 %	20 %	40 %	20 %	452119605
34	NC_020307	CGGTA	2	10	52147	52156	20 %	20 %	40 %	20 %	452119605
35	NC_020307	CGTTA	2	10	64288	64297	20 %	40 %	20 %	20 %	452119617
36	NC_020307	GCAGG	2	10	64420	64429	20 %	0 %	60 %	20 %	452119617
37	NC_020307	GATTT	2	10	65203	65212	20 %	60 %	20 %	0 %	452119618
38	NC_020307	AATCT	2	10	68212	68221	40 %	40 %	0 %	20 %	452119621
39	NC_020307	GCATC	2	10	74155	74164	20 %	20 %	20 %	40 %	452119628
40	NC_020307	GGCCG	2	10	74699	74708	0 %	0 %	60 %	40 %	452119628
41	NC_020307	GCCAG	2	10	74848	74857	20 %	0 %	40 %	40 %	452119628
42	NC_020307	CGGAA	2	10	75082	75091	40 %	0 %	40 %	20 %	452119628
43	NC_020307	CTGGT	2	10	78301	78310	0 %	40 %	40 %	20 %	452119630
44	NC_020307	GCGAT	2	10	79253	79262	20 %	20 %	40 %	20 %	452119631
45	NC_020307	GGCTG	2	10	79587	79596	0 %	20 %	60 %	20 %	452119631
46	NC_020307	CGTAG	2	10	80774	80783	20 %	20 %	40 %	20 %	452119632
47	NC_020307	TGTTC	2	10	80999	81008	0 %	60 %	20 %	20 %	452119633
48	NC_020307	CAAAG	2	10	82537	82546	60 %	0 %	20 %	20 %	452119635
49	NC_020307	TTACA	2	10	84195	84204	40 %	40 %	0 %	20 %	452119636
50	NC_020307	ATTAC	2	10	84449	84458	40 %	40 %	0 %	20 %	452119636
51	NC_020307	TGACT	2	10	85986	85995	20 %	40 %	20 %	20 %	452119639
52	NC_020307	TATTT	2	10	86047	86056	20 %	80 %	0 %	0 %	452119639
53	NC_020307	GCGCG	2	10	87286	87295	0 %	0 %	60 %	40 %	452119641
54	NC_020307	CAGTT	2	10	87668	87677	20 %	40 %	20 %	20 %	452119641
55	NC_020307	AGTAA	2	10	92450	92459	60 %	20 %	20 %	0 %	452119645
56	NC_020307	GCGTG	2	10	93422	93431	0 %	20 %	60 %	20 %	452119646
57	NC_020307	CCAAT	2	10	94541	94550	40 %	20 %	0 %	40 %	452119646
58	NC_020307	GGCGC	2	10	94889	94898	0 %	0 %	60 %	40 %	452119646
59	NC_020307	GTTAA	2	10	95364	95373	40 %	40 %	20 %	0 %	452119647
60	NC_020307	GCAGT	2	10	96025	96034	20 %	20 %	40 %	20 %	452119647
61	NC_020307	TTCGG	2	10	103250	103259	0 %	40 %	40 %	20 %	452119655
62	NC_020307	GGGAT	2	10	108691	108700	20 %	20 %	60 %	0 %	452119660
63	NC_020307	TTTTG	2	10	111924	111933	0 %	80 %	20 %	0 %	452119663
64	NC_020307	GTTAT	2	10	115515	115524	20 %	60 %	20 %	0 %	452119668
65	NC_020307	CGAAA	2	10	116629	116638	60 %	0 %	20 %	20 %	452119669
66	NC_020307	CTTCA	2	10	116870	116879	20 %	40 %	0 %	40 %	452119669
67	NC_020307	CGGCC	2	10	118415	118424	0 %	0 %	40 %	60 %	452119669
68	NC_020307	AGCGC	2	10	119576	119585	20 %	0 %	40 %	40 %	452119670
69	NC_020307	AGTTT	2	10	120244	120253	20 %	60 %	20 %	0 %	452119670
70	NC_020307	GCCGC	2	10	123705	123714	0 %	0 %	40 %	60 %	452119673
71	NC_020307	AAATT	2	10	127198	127207	60 %	40 %	0 %	0 %	452119675
72	NC_020307	TCATT	2	10	127247	127256	20 %	60 %	0 %	20 %	452119675
73	NC_020307	GAGCG	2	10	128196	128205	20 %	0 %	60 %	20 %	452119676
74	NC_020307	TCCGC	2	10	128825	128834	0 %	20 %	20 %	60 %	452119676
75	NC_020307	AGCGT	2	10	131430	131439	20 %	20 %	40 %	20 %	452119677
76	NC_020307	CGGCG	2	10	131741	131750	0 %	0 %	60 %	40 %	452119677
77	NC_020307	CCGTA	2	10	133614	133623	20 %	20 %	20 %	40 %	452119678
78	NC_020307	CCGGC	2	10	134737	134746	0 %	0 %	40 %	60 %	452119680
79	NC_020307	CCGAT	2	10	135531	135540	20 %	20 %	20 %	40 %	452119680
80	NC_020307	AGCTG	2	10	135901	135910	20 %	20 %	40 %	20 %	452119680
81	NC_020307	GAACC	2	10	135952	135961	40 %	0 %	20 %	40 %	452119680
82	NC_020307	CCGGC	2	10	139155	139164	0 %	0 %	40 %	60 %	452119682
83	NC_020307	CGCTG	2	10	139439	139448	0 %	20 %	40 %	40 %	452119683
84	NC_020307	TCCAG	2	10	140141	140150	20 %	20 %	20 %	40 %	452119683
85	NC_020307	TCGCG	2	10	140255	140264	0 %	20 %	40 %	40 %	452119683
86	NC_020307	GGAAA	2	10	140627	140636	60 %	0 %	40 %	0 %	452119683
87	NC_020307	AAACC	2	10	142188	142197	60 %	0 %	0 %	40 %	452119684
88	NC_020307	TCCAT	2	10	142798	142807	20 %	40 %	0 %	40 %	452119684
89	NC_020307	TCGAT	2	10	145998	146007	20 %	40 %	20 %	20 %	452119687
90	NC_020307	CGCGG	2	10	148464	148473	0 %	0 %	60 %	40 %	452119689
91	NC_020307	TCACG	2	10	148556	148565	20 %	20 %	20 %	40 %	452119689
92	NC_020307	CGGCA	2	10	148831	148840	20 %	0 %	40 %	40 %	452119690
93	NC_020307	GGCTG	2	10	149214	149223	0 %	20 %	60 %	20 %	452119690
94	NC_020307	CGCGT	2	10	149804	149813	0 %	20 %	40 %	40 %	452119690
95	NC_020307	GGCGA	2	10	151398	151407	20 %	0 %	60 %	20 %	452119692
96	NC_020307	GAAAA	2	10	152774	152783	80 %	0 %	20 %	0 %	452119694
97	NC_020307	CGGAT	2	10	155286	155295	20 %	20 %	40 %	20 %	452119697
98	NC_020307	TGACG	2	10	155617	155626	20 %	20 %	40 %	20 %	452119697
99	NC_020307	GCGCG	2	10	155908	155917	0 %	0 %	60 %	40 %	452119697
100	NC_020307	GCGAT	2	10	160987	160996	20 %	20 %	40 %	20 %	452119702
101	NC_020307	TTTTA	2	10	162068	162077	20 %	80 %	0 %	0 %	452119702
102	NC_020307	GGCGT	2	10	164219	164228	0 %	20 %	60 %	20 %	452119704
103	NC_020307	TGAAG	2	10	164338	164347	40 %	20 %	40 %	0 %	452119704
104	NC_020307	TTAAA	2	10	165709	165718	60 %	40 %	0 %	0 %	452119705
105	NC_020307	GAACC	2	10	166960	166969	40 %	0 %	20 %	40 %	452119706
106	NC_020307	GGCAG	2	10	168298	168307	20 %	0 %	60 %	20 %	452119707
107	NC_020307	AGAAC	2	10	168609	168618	60 %	0 %	20 %	20 %	452119707
108	NC_020307	ATCTT	2	10	169072	169081	20 %	60 %	0 %	20 %	452119708
109	NC_020307	CAGCC	2	10	173049	173058	20 %	0 %	20 %	60 %	452119713
110	NC_020307	TTATC	2	10	177667	177676	20 %	60 %	0 %	20 %	452119717
111	NC_020307	TGGTA	2	10	180253	180262	20 %	40 %	40 %	0 %	452119719
112	NC_020307	TAATT	2	10	180680	180689	40 %	60 %	0 %	0 %	452119719
113	NC_020307	CCGTT	2	10	181598	181607	0 %	40 %	20 %	40 %	452119720
114	NC_020307	ATAAA	2	10	182040	182049	80 %	20 %	0 %	0 %	452119720
115	NC_020307	GATTT	2	10	185040	185049	20 %	60 %	20 %	0 %	452119723
116	NC_020307	TATTT	2	10	185088	185097	20 %	80 %	0 %	0 %	452119723
117	NC_020307	ATTTT	2	10	185155	185164	20 %	80 %	0 %	0 %	452119723
118	NC_020307	ATTTG	2	10	185276	185285	20 %	60 %	20 %	0 %	452119723
119	NC_020307	GTTAT	2	10	185763	185772	20 %	60 %	20 %	0 %	452119723
120	NC_020307	CGCGC	2	10	191473	191482	0 %	0 %	40 %	60 %	452119728
121	NC_020307	CGCAG	2	10	194759	194768	20 %	0 %	40 %	40 %	452119732
122	NC_020307	CCGCG	2	10	195176	195185	0 %	0 %	40 %	60 %	452119732
123	NC_020307	CTGAC	2	10	196074	196083	20 %	20 %	20 %	40 %	452119733
124	NC_020307	GAGCC	2	10	196330	196339	20 %	0 %	40 %	40 %	452119733
125	NC_020307	GCGCA	2	10	202647	202656	20 %	0 %	40 %	40 %	452119738
126	NC_020307	GCTTC	2	10	208194	208203	0 %	40 %	20 %	40 %	452119741
127	NC_020307	GAGAT	2	10	208448	208457	40 %	20 %	40 %	0 %	452119741
128	NC_020307	CGGTA	2	10	208635	208644	20 %	20 %	40 %	20 %	452119741
129	NC_020307	CCGCG	2	10	210003	210012	0 %	0 %	40 %	60 %	452119743
130	NC_020307	AAAGA	2	10	211073	211082	80 %	0 %	20 %	0 %	452119744
131	NC_020307	TGGTG	2	10	212354	212363	0 %	40 %	60 %	0 %	452119746
132	NC_020307	TGGCG	2	10	212488	212497	0 %	20 %	60 %	20 %	452119746
133	NC_020307	TGGCG	2	10	219813	219822	0 %	20 %	60 %	20 %	452119755
134	NC_020307	GCAGG	2	10	220314	220323	20 %	0 %	60 %	20 %	452119755
135	NC_020307	GCTCA	2	10	221324	221333	20 %	20 %	20 %	40 %	452119756
136	NC_020307	CCGTG	2	10	221431	221440	0 %	20 %	40 %	40 %	452119756
137	NC_020307	CGGCG	2	10	221737	221746	0 %	0 %	60 %	40 %	452119756
138	NC_020307	GATGG	2	10	223402	223411	20 %	20 %	60 %	0 %	452119759
139	NC_020307	TTCAC	2	10	224092	224101	20 %	40 %	0 %	40 %	452119761
140	NC_020307	GCACG	2	10	228448	228457	20 %	0 %	40 %	40 %	452119766
141	NC_020307	ACGGC	2	10	228466	228475	20 %	0 %	40 %	40 %	452119766
142	NC_020307	TTCAC	2	10	230294	230303	20 %	40 %	0 %	40 %	452119768
143	NC_020307	TGGCG	2	10	233720	233729	0 %	20 %	60 %	20 %	452119771
144	NC_020307	CGACC	2	10	233978	233987	20 %	0 %	20 %	60 %	452119771
145	NC_020307	CGCGC	2	10	235235	235244	0 %	0 %	40 %	60 %	452119772
146	NC_020307	CGATT	2	10	235806	235815	20 %	40 %	20 %	20 %	452119772
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149	NC_020307	GCCGG	2	10	238863	238872	0 %	0 %	60 %	40 %	452119777
150	NC_020307	TACCG	2	10	239213	239222	20 %	20 %	20 %	40 %	452119777
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152	NC_020307	GCATC	2	10	241571	241580	20 %	20 %	20 %	40 %	452119780
153	NC_020307	AGGCC	2	10	242086	242095	20 %	0 %	40 %	40 %	452119780
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156	NC_020307	TGCCG	2	10	244127	244136	0 %	20 %	40 %	40 %	452119783
157	NC_020307	GCGTT	2	10	244218	244227	0 %	40 %	40 %	20 %	452119783
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247	NC_020307	CGCGT	2	10	428871	428880	0 %	20 %	40 %	40 %	452119982
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249	NC_020307	CGGCG	2	10	435848	435857	0 %	0 %	60 %	40 %	452119988
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253	NC_020307	TGGCG	2	10	443608	443617	0 %	20 %	60 %	20 %	452119997
254	NC_020307	CATCA	2	10	449171	449180	40 %	20 %	0 %	40 %	452120005
255	NC_020307	GTAAT	2	10	450159	450168	40 %	40 %	20 %	0 %	452120005
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259	NC_020307	TCCAG	2	10	454577	454586	20 %	20 %	20 %	40 %	452120008
260	NC_020307	TAATG	2	10	454617	454626	40 %	40 %	20 %	0 %	452120008
261	NC_020307	TGAGT	2	10	455261	455270	20 %	40 %	40 %	0 %	452120009
262	NC_020307	GCGCC	2	10	455432	455441	0 %	0 %	40 %	60 %	452120009
263	NC_020307	TGGCG	2	10	456605	456614	0 %	20 %	60 %	20 %	452120010
264	NC_020307	GTTCA	2	10	457149	457158	20 %	40 %	20 %	20 %	452120011
265	NC_020307	ACGTA	2	10	457254	457263	40 %	20 %	20 %	20 %	452120011
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293	NC_020307	GTCGG	2	10	508092	508101	0 %	20 %	60 %	20 %	452120057
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298	NC_020307	CCGCG	2	10	521149	521158	0 %	0 %	40 %	60 %	452120069
299	NC_020307	ATGCG	2	10	521419	521428	20 %	20 %	40 %	20 %	452120069
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302	NC_020307	CATGG	2	10	526318	526327	20 %	20 %	40 %	20 %	452120076
303	NC_020307	TAGCG	2	10	529199	529208	20 %	20 %	40 %	20 %	452120080
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342	NC_020307	ATGAA	2	10	595716	595725	60 %	20 %	20 %	0 %	452120149
343	NC_020307	CGTAA	2	10	599566	599575	40 %	20 %	20 %	20 %	452120155
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353	NC_020307	CGTTG	2	10	623732	623741	0 %	40 %	40 %	20 %	452120180
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360	NC_020307	GGCGA	2	10	631166	631175	20 %	0 %	60 %	20 %	452120187
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362	NC_020307	GCAGG	2	10	639197	639206	20 %	0 %	60 %	20 %	452120194
363	NC_020307	ATGAA	2	10	639892	639901	60 %	20 %	20 %	0 %	452120195
364	NC_020307	CGTTT	2	10	641188	641197	0 %	60 %	20 %	20 %	452120195
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369	NC_020307	CGCTG	2	10	644412	644421	0 %	20 %	40 %	40 %	452120198
370	NC_020307	GGCGC	2	10	646140	646149	0 %	0 %	60 %	40 %	452120199
371	NC_020307	GGCGA	2	10	647074	647083	20 %	0 %	60 %	20 %	452120199
372	NC_020307	CTGTC	2	10	647516	647525	0 %	40 %	20 %	40 %	452120200
373	NC_020307	TGATT	2	10	651420	651429	20 %	60 %	20 %	0 %	452120205
374	NC_020307	GATAA	2	10	651481	651490	60 %	20 %	20 %	0 %	452120205
375	NC_020307	CGATG	2	10	652145	652154	20 %	20 %	40 %	20 %	452120206
376	NC_020307	CGGCG	2	10	655900	655909	0 %	0 %	60 %	40 %	452120210
377	NC_020307	TTACT	2	10	658177	658186	20 %	60 %	0 %	20 %	452120213
378	NC_020307	AGTAA	2	10	659203	659212	60 %	20 %	20 %	0 %	452120214
379	NC_020307	CCGAT	2	10	659708	659717	20 %	20 %	20 %	40 %	452120215
380	NC_020307	GACCA	2	10	660762	660771	40 %	0 %	20 %	40 %	452120215
381	NC_020307	CGCGG	2	10	663018	663027	0 %	0 %	60 %	40 %	452120217
382	NC_020307	ACTTC	2	10	666518	666527	20 %	40 %	0 %	40 %	452120221
383	NC_020307	ATCCC	2	10	666966	666975	20 %	20 %	0 %	60 %	452120221
384	NC_020307	GTGAT	2	10	672545	672554	20 %	40 %	40 %	0 %	452120226
385	NC_020307	CGTCC	2	10	673115	673124	0 %	20 %	20 %	60 %	452120227
386	NC_020307	AGGGA	2	10	674130	674139	40 %	0 %	60 %	0 %	452120227
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388	NC_020307	GGCGC	2	10	676516	676525	0 %	0 %	60 %	40 %	452120228
389	NC_020307	CGGCG	2	10	678238	678247	0 %	0 %	60 %	40 %	452120231
390	NC_020307	TGCCA	2	10	681055	681064	20 %	20 %	20 %	40 %	452120234
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