MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020307	GCA	2	6	210802	210807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119744
4002	NC_020307	TTG	2	6	210821	210826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119744
4003	NC_020307	AC	3	6	210865	210870	50 %	0 %	0 %	50 %	452119744
4004	NC_020307	CGG	2	6	210900	210905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119744
4005	NC_020307	TGT	2	6	210931	210936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119744
4006	NC_020307	GAA	2	6	210965	210970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119744
4007	NC_020307	A	6	6	211037	211042	100 %	0 %	0 %	0 %	452119744
4008	NC_020307	AGCG	2	8	211049	211056	25 %	0 %	50 %	25 %	452119744
4009	NC_020307	AAAGA	2	10	211073	211082	80 %	0 %	20 %	0 %	452119744
4010	NC_020307	CGC	2	6	211189	211194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119744
4011	NC_020307	TCA	2	6	211195	211200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119744
4012	NC_020307	AGGT	2	8	211203	211210	25 %	25 %	50 %	0 %	452119744
4013	NC_020307	TC	3	6	211293	211298	0 %	50 %	0 %	50 %	452119744
4014	NC_020307	GCA	2	6	211476	211481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119745
4015	NC_020307	CAGG	2	8	211495	211502	25 %	0 %	50 %	25 %	452119745
4016	NC_020307	GGTC	2	8	211534	211541	0 %	25 %	50 %	25 %	452119745
4017	NC_020307	AC	3	6	211549	211554	50 %	0 %	0 %	50 %	452119745
4018	NC_020307	AAC	2	6	211572	211577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119745
4019	NC_020307	TGA	2	6	211578	211583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119745
4020	NC_020307	GTGG	2	8	211585	211592	0 %	25 %	75 %	0 %	452119745
4021	NC_020307	GTG	2	6	211682	211687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119745
4022	NC_020307	GGC	2	6	211751	211756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119745
4023	NC_020307	CTG	2	6	211767	211772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119745
4024	NC_020307	CG	3	6	211774	211779	0 %	0 %	50 %	50 %	452119745
4025	NC_020307	T	6	6	211817	211822	0 %	100 %	0 %	0 %	452119745
4026	NC_020307	CGGA	2	8	211974	211981	25 %	0 %	50 %	25 %	452119745
4027	NC_020307	GCGT	2	8	212060	212067	0 %	25 %	50 %	25 %	452119746
4028	NC_020307	CTG	2	6	212164	212169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119746
4029	NC_020307	GTG	2	6	212218	212223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119746
4030	NC_020307	GCG	2	6	212299	212304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119746
4031	NC_020307	TGG	2	6	212312	212317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119746
4032	NC_020307	TGGTG	2	10	212354	212363	0 %	40 %	60 %	0 %	452119746
4033	NC_020307	GGCT	2	8	212386	212393	0 %	25 %	50 %	25 %	452119746
4034	NC_020307	A	6	6	212404	212409	100 %	0 %	0 %	0 %	452119746
4035	NC_020307	GTT	2	6	212446	212451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119746
4036	NC_020307	TGGCG	2	10	212488	212497	0 %	20 %	60 %	20 %	452119746
4037	NC_020307	TGT	2	6	212528	212533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119746
4038	NC_020307	GC	3	6	212553	212558	0 %	0 %	50 %	50 %	452119746
4039	NC_020307	GTC	2	6	212689	212694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119746
4040	NC_020307	CGCC	2	8	212714	212721	0 %	0 %	25 %	75 %	452119746
4041	NC_020307	CG	3	6	212825	212830	0 %	0 %	50 %	50 %	452119746
4042	NC_020307	CA	3	6	212857	212862	50 %	0 %	0 %	50 %	452119746
4043	NC_020307	CAG	2	6	212875	212880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119746
4044	NC_020307	GCA	2	6	212886	212891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119746
4045	NC_020307	GTT	2	6	212916	212921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119746
4046	NC_020307	TGC	2	6	212973	212978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119746
4047	NC_020307	AGC	2	6	213002	213007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119746
4048	NC_020307	AAC	2	6	213370	213375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119747
4049	NC_020307	CTT	2	6	213381	213386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119747
4050	NC_020307	GAA	2	6	213460	213465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119747
4051	NC_020307	TGC	3	9	213489	213497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119747
4052	NC_020307	ATC	2	6	213554	213559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119747
4053	NC_020307	TGA	2	6	213592	213597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119747
4054	NC_020307	CAT	2	6	213601	213606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119747
4055	NC_020307	AAT	2	6	213696	213701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119747
4056	NC_020307	TGT	2	6	213774	213779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119748
4057	NC_020307	T	6	6	213800	213805	0 %	100 %	0 %	0 %	452119748
4058	NC_020307	CAC	2	6	213866	213871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119748
4059	NC_020307	CAG	2	6	213926	213931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119748
4060	NC_020307	CTGG	2	8	213962	213969	0 %	25 %	50 %	25 %	452119748
4061	NC_020307	GCC	2	6	213987	213992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119748
4062	NC_020307	CTG	2	6	214049	214054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119748
4063	NC_020307	CTG	2	6	214082	214087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119748
4064	NC_020307	GGT	2	6	214099	214104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119748
4065	NC_020307	TGCG	2	8	214110	214117	0 %	25 %	50 %	25 %	452119748
4066	NC_020307	GGC	2	6	214155	214160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119748
4067	NC_020307	ATT	2	6	214190	214195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119748
4068	NC_020307	TGA	2	6	214215	214220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119748
4069	NC_020307	GGT	2	6	214268	214273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119748
4070	NC_020307	GAT	2	6	214294	214299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119748
4071	NC_020307	CCG	2	6	214312	214317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119748
4072	NC_020307	GCG	2	6	214320	214325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119748
4073	NC_020307	CTG	2	6	214338	214343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119748
4074	NC_020307	CCA	2	6	214438	214443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119748
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4076	NC_020307	ATCC	2	8	214548	214555	25 %	25 %	0 %	50 %	452119748
4077	NC_020307	GC	3	6	214629	214634	0 %	0 %	50 %	50 %	452119748
4078	NC_020307	TGA	2	6	214777	214782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119749
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4081	NC_020307	GC	4	8	214896	214903	0 %	0 %	50 %	50 %	452119749
4082	NC_020307	TCC	2	6	214946	214951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452119749
4083	NC_020307	ATA	2	6	214959	214964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119749
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4085	NC_020307	GAC	2	6	215067	215072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119749
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4087	NC_020307	TAA	2	6	215108	215113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119749
4088	NC_020307	GCG	2	6	215128	215133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119749
4089	NC_020307	CAT	2	6	215198	215203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119749
4090	NC_020307	GCG	2	6	215215	215220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119749
4091	NC_020307	TGC	2	6	215269	215274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119749
4092	NC_020307	ACA	2	6	215291	215296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119749
4093	NC_020307	CGC	2	6	215344	215349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119749
4094	NC_020307	TAA	2	6	215406	215411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119749
4095	NC_020307	A	6	6	215615	215620	100 %	0 %	0 %	0 %	452119749
4096	NC_020307	CCG	2	6	215625	215630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119749
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4101	NC_020307	ATT	2	6	215955	215960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119750
4102	NC_020307	TAA	2	6	215972	215977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119750
4103	NC_020307	TCG	2	6	216068	216073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119750
4104	NC_020307	CGC	2	6	216275	216280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119750
4105	NC_020307	CTGG	2	8	216312	216319	0 %	25 %	50 %	25 %	452119750
4106	NC_020307	GGT	2	6	216370	216375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119751
4107	NC_020307	CAT	2	6	216382	216387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119751
4108	NC_020307	CAG	2	6	216429	216434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119751
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4110	NC_020307	AAT	2	6	216523	216528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119751
4111	NC_020307	CTT	2	6	216592	216597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119751
4112	NC_020307	AAAT	2	8	216598	216605	75 %	25 %	0 %	0 %	452119751
4113	NC_020307	CCA	2	6	216707	216712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119752
4114	NC_020307	CGCC	2	8	216827	216834	0 %	0 %	25 %	75 %	452119752
4115	NC_020307	ACC	2	6	216835	216840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119752
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4117	NC_020307	GCG	2	6	216919	216924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119752
4118	NC_020307	GCC	2	6	216934	216939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119752
4119	NC_020307	CGA	2	6	216953	216958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119752
4120	NC_020307	TACC	2	8	216959	216966	25 %	25 %	0 %	50 %	452119752
4121	NC_020307	CGA	2	6	217046	217051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119752
4122	NC_020307	CTG	2	6	217089	217094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119752
4123	NC_020307	CGC	2	6	217109	217114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119752
4124	NC_020307	CAG	2	6	217158	217163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119752
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4126	NC_020307	T	7	7	217445	217451	0 %	100 %	0 %	0 %	452119753
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4131	NC_020307	CAG	3	9	217700	217708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119753
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4137	NC_020307	CAG	2	6	217901	217906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119753
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4236	NC_020307	GA	3	6	221529	221534	50 %	0 %	50 %	0 %	452119756
4237	NC_020307	TGC	2	6	221554	221559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119756
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4239	NC_020307	GAT	2	6	221603	221608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119756
4240	NC_020307	CG	3	6	221636	221641	0 %	0 %	50 %	50 %	452119756
4241	NC_020307	ACGT	2	8	221696	221703	25 %	25 %	25 %	25 %	452119756
4242	NC_020307	CCG	2	6	221710	221715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119756
4243	NC_020307	GGC	2	6	221728	221733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119756
4244	NC_020307	CGGCG	2	10	221737	221746	0 %	0 %	60 %	40 %	452119756
4245	NC_020307	CGAT	2	8	221838	221845	25 %	25 %	25 %	25 %	452119756
4246	NC_020307	GCT	2	6	221873	221878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119756
4247	NC_020307	GCT	2	6	221902	221907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119756
4248	NC_020307	A	6	6	221938	221943	100 %	0 %	0 %	0 %	452119756
4249	NC_020307	TGC	2	6	221946	221951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119756
4250	NC_020307	GCG	2	6	221991	221996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119756
4251	NC_020307	GCG	2	6	222015	222020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119756
4252	NC_020307	GGGT	2	8	222057	222064	0 %	25 %	75 %	0 %	452119756
4253	NC_020307	A	6	6	222205	222210	100 %	0 %	0 %	0 %	452119757
4254	NC_020307	GCC	2	6	222227	222232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119757
4255	NC_020307	CAG	3	9	222341	222349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119757
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4257	NC_020307	TTAA	2	8	222432	222439	50 %	50 %	0 %	0 %	452119758
4258	NC_020307	AGC	2	6	222522	222527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119758
4259	NC_020307	T	7	7	222617	222623	0 %	100 %	0 %	0 %	452119758
4260	NC_020307	GCA	2	6	222637	222642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119758
4261	NC_020307	GCTG	2	8	222643	222650	0 %	25 %	50 %	25 %	452119758
4262	NC_020307	CGT	2	6	222688	222693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119758
4263	NC_020307	TCG	2	6	222714	222719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119758
4264	NC_020307	CAG	2	6	222743	222748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119758
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4268	NC_020307	TCG	2	6	223049	223054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119759
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4270	NC_020307	CGA	2	6	223140	223145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119759
4271	NC_020307	GCG	2	6	223230	223235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119759
4272	NC_020307	GCA	2	6	223361	223366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119759
4273	NC_020307	GCA	2	6	223380	223385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119759
4274	NC_020307	T	8	8	223390	223397	0 %	100 %	0 %	0 %	452119759
4275	NC_020307	GATGG	2	10	223402	223411	20 %	20 %	60 %	0 %	452119759
4276	NC_020307	GCT	2	6	223422	223427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119759
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4279	NC_020307	GGAGGG	2	12	223725	223736	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	452119760
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4284	NC_020307	TTCAC	2	10	224092	224101	20 %	40 %	0 %	40 %	452119761
4285	NC_020307	GCC	2	6	224113	224118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119761
4286	NC_020307	CTGC	2	8	224122	224129	0 %	25 %	25 %	50 %	452119761
4287	NC_020307	GCT	2	6	224137	224142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119761
4288	NC_020307	CGC	2	6	224159	224164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119761
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4298	NC_020307	GA	3	6	224694	224699	50 %	0 %	50 %	0 %	452119763
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4303	NC_020307	GCG	2	6	224930	224935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119763
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4333	NC_020307	ACC	2	6	226092	226097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119763
4334	NC_020307	CTC	2	6	226133	226138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452119763
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4336	NC_020307	TGA	2	6	226216	226221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119763
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4341	NC_020307	TA	3	6	226484	226489	50 %	50 %	0 %	0 %	452119763
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4343	NC_020307	T	6	6	226529	226534	0 %	100 %	0 %	0 %	452119764
4344	NC_020307	ACGA	2	8	226562	226569	50 %	0 %	25 %	25 %	452119764
4345	NC_020307	TCG	2	6	226608	226613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119764
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4353	NC_020307	ACG	2	6	227087	227092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119765
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4357	NC_020307	CTG	2	6	227293	227298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119765
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4361	NC_020307	CTT	3	9	227427	227435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119765
4362	NC_020307	CTG	2	6	227542	227547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119765
4363	NC_020307	GC	3	6	227557	227562	0 %	0 %	50 %	50 %	452119765
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4365	NC_020307	AATC	2	8	227734	227741	50 %	25 %	0 %	25 %	452119766
4366	NC_020307	AG	3	6	227849	227854	50 %	0 %	50 %	0 %	452119766
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4478	NC_020307	CGG	2	6	234910	234915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119771
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4482	NC_020307	GGTTGT	2	12	235102	235113	0 %	50 %	50 %	0 %	452119772
4483	NC_020307	CTGGCG	2	12	235145	235156	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	452119772
4484	NC_020307	GAT	2	6	235198	235203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119772
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4486	NC_020307	CGCGC	2	10	235235	235244	0 %	0 %	40 %	60 %	452119772
4487	NC_020307	AGG	2	6	235245	235250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119772
4488	NC_020307	TCG	2	6	235308	235313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119772
4489	NC_020307	CAGC	2	8	235334	235341	25 %	0 %	25 %	50 %	452119772
4490	NC_020307	GTG	2	6	235358	235363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119772
4491	NC_020307	CGC	2	6	235401	235406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119772
4492	NC_020307	CGG	2	6	235423	235428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119772
4493	NC_020307	CGC	2	6	235431	235436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119772
4494	NC_020307	TGG	2	6	235476	235481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119772
4495	NC_020307	GAC	2	6	235532	235537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119772
4496	NC_020307	CCCG	2	8	235553	235560	0 %	0 %	25 %	75 %	452119772
4497	NC_020307	GCTG	2	8	235566	235573	0 %	25 %	50 %	25 %	452119772
4498	NC_020307	GGCG	2	8	235614	235621	0 %	0 %	75 %	25 %	452119772
4499	NC_020307	TGGC	2	8	235630	235637	0 %	25 %	50 %	25 %	452119772
4500	NC_020307	GT	3	6	235684	235689	0 %	50 %	50 %	0 %	452119772

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