MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020307	TAT	2	6	183262	183267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119721
3502	NC_020307	TCC	2	6	183335	183340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452119721
3503	NC_020307	GAT	2	6	183423	183428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119721
3504	NC_020307	ATT	2	6	183429	183434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119721
3505	NC_020307	AAC	2	6	183442	183447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119721
3506	NC_020307	TAA	2	6	183486	183491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119721
3507	NC_020307	ATTC	2	8	183505	183512	25 %	50 %	0 %	25 %	452119722
3508	NC_020307	TGC	2	6	183579	183584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119722
3509	NC_020307	TTG	2	6	183599	183604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119722
3510	NC_020307	AGT	2	6	183664	183669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119722
3511	NC_020307	TGC	3	9	183690	183698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119722
3512	NC_020307	T	6	6	183725	183730	0 %	100 %	0 %	0 %	452119722
3513	NC_020307	ATG	2	6	183869	183874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119722
3514	NC_020307	GCT	2	6	183946	183951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119722
3515	NC_020307	TA	3	6	183958	183963	50 %	50 %	0 %	0 %	452119722
3516	NC_020307	TTTA	2	8	184059	184066	25 %	75 %	0 %	0 %	452119722
3517	NC_020307	TTA	2	6	184085	184090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119722
3518	NC_020307	TGA	2	6	184236	184241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119722
3519	NC_020307	TAT	2	6	184277	184282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119722
3520	NC_020307	GCC	2	6	184306	184311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119722
3521	NC_020307	TCT	2	6	184342	184347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119722
3522	NC_020307	T	6	6	184354	184359	0 %	100 %	0 %	0 %	452119722
3523	NC_020307	T	6	6	184464	184469	0 %	100 %	0 %	0 %	452119722
3524	NC_020307	AAT	2	6	184542	184547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119722
3525	NC_020307	GATG	2	8	184771	184778	25 %	25 %	50 %	0 %	452119722
3526	NC_020307	GC	3	6	184791	184796	0 %	0 %	50 %	50 %	452119722
3527	NC_020307	GCT	2	6	184820	184825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119722
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3532	NC_020307	T	7	7	185023	185029	0 %	100 %	0 %	0 %	452119723
3533	NC_020307	GATTT	2	10	185040	185049	20 %	60 %	20 %	0 %	452119723
3534	NC_020307	T	8	8	185047	185054	0 %	100 %	0 %	0 %	452119723
3535	NC_020307	TATTT	2	10	185088	185097	20 %	80 %	0 %	0 %	452119723
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3538	NC_020307	AGT	2	6	185168	185173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119723
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3540	NC_020307	ATTTG	2	10	185276	185285	20 %	60 %	20 %	0 %	452119723
3541	NC_020307	TTG	2	6	185336	185341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119723
3542	NC_020307	T	7	7	185366	185372	0 %	100 %	0 %	0 %	452119723
3543	NC_020307	GAA	2	6	185414	185419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119723
3544	NC_020307	A	7	7	185418	185424	100 %	0 %	0 %	0 %	452119723
3545	NC_020307	ATC	2	6	185427	185432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119723
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3550	NC_020307	AAAT	2	8	185539	185546	75 %	25 %	0 %	0 %	452119723
3551	NC_020307	ATT	2	6	185574	185579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119723
3552	NC_020307	CAT	2	6	185676	185681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119723
3553	NC_020307	TA	3	6	185725	185730	50 %	50 %	0 %	0 %	452119723
3554	NC_020307	GTTAT	2	10	185763	185772	20 %	60 %	20 %	0 %	452119723
3555	NC_020307	GTC	2	6	185801	185806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119723
3556	NC_020307	TTGT	2	8	185833	185840	0 %	75 %	25 %	0 %	452119723
3557	NC_020307	AAT	2	6	185843	185848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119723
3558	NC_020307	CAC	2	6	185866	185871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119723
3559	NC_020307	TGG	2	6	185906	185911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119723
3560	NC_020307	TCA	2	6	185927	185932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119723
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3562	NC_020307	TGA	2	6	186215	186220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119723
3563	NC_020307	ATT	3	9	186226	186234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119723
3564	NC_020307	AGTG	2	8	186269	186276	25 %	25 %	50 %	0 %	452119723
3565	NC_020307	ATG	2	6	186283	186288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119723
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3588	NC_020307	GC	3	6	187379	187384	0 %	0 %	50 %	50 %	452119724
3589	NC_020307	CG	3	6	187540	187545	0 %	0 %	50 %	50 %	452119724
3590	NC_020307	CGC	2	6	187596	187601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119724
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3592	NC_020307	TGA	2	6	187764	187769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119724
3593	NC_020307	CAG	2	6	187774	187779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119724
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3601	NC_020307	TTCC	2	8	188308	188315	0 %	50 %	0 %	50 %	452119725
3602	NC_020307	TTG	2	6	188350	188355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119725
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3604	NC_020307	TGA	2	6	188551	188556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119725
3605	NC_020307	TTA	2	6	188557	188562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119725
3606	NC_020307	GCA	2	6	188589	188594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119725
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3608	NC_020307	TCCC	2	8	188678	188685	0 %	25 %	0 %	75 %	452119725
3609	NC_020307	GC	3	6	188711	188716	0 %	0 %	50 %	50 %	452119725
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3613	NC_020307	TAT	2	6	189029	189034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119725
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3622	NC_020307	ATT	2	6	189625	189630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119726
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3988	NC_020307	GTTT	2	8	210174	210181	0 %	75 %	25 %	0 %	452119744
3989	NC_020307	CTT	2	6	210189	210194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119744
3990	NC_020307	GCCA	2	8	210256	210263	25 %	0 %	25 %	50 %	452119744
3991	NC_020307	CCG	2	6	210315	210320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119744
3992	NC_020307	CGT	2	6	210376	210381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119744
3993	NC_020307	CTC	2	6	210475	210480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452119744
3994	NC_020307	AAG	2	6	210495	210500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119744
3995	NC_020307	TG	3	6	210563	210568	0 %	50 %	50 %	0 %	452119744
3996	NC_020307	CGGG	2	8	210588	210595	0 %	0 %	75 %	25 %	452119744
3997	NC_020307	GAT	2	6	210613	210618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119744
3998	NC_020307	A	6	6	210632	210637	100 %	0 %	0 %	0 %	452119744
3999	NC_020307	ACA	2	6	210691	210696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119744
4000	NC_020307	ATT	2	6	210734	210739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119744

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