MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020307	CCGT	2	8	157305	157312	0 %	25 %	25 %	50 %	452119698
3002	NC_020307	GTG	3	9	157426	157434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119698
3003	NC_020307	GAC	2	6	157591	157596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119698
3004	NC_020307	GTG	2	6	157597	157602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119698
3005	NC_020307	CGGG	2	8	157620	157627	0 %	0 %	75 %	25 %	452119698
3006	NC_020307	GCG	2	6	157873	157878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119699
3007	NC_020307	GCTGGC	2	12	157907	157918	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	452119699
3008	NC_020307	CGG	2	6	158012	158017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119699
3009	NC_020307	GCCA	2	8	158031	158038	25 %	0 %	25 %	50 %	452119699
3010	NC_020307	GCCC	2	8	158082	158089	0 %	0 %	25 %	75 %	452119699
3011	NC_020307	GCG	2	6	158095	158100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119699
3012	NC_020307	CCG	2	6	158148	158153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119699
3013	NC_020307	CG	4	8	158165	158172	0 %	0 %	50 %	50 %	452119699
3014	NC_020307	ACC	2	6	158212	158217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119699
3015	NC_020307	GCG	2	6	158283	158288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119699
3016	NC_020307	GC	3	6	158313	158318	0 %	0 %	50 %	50 %	452119699
3017	NC_020307	GC	3	6	158332	158337	0 %	0 %	50 %	50 %	452119699
3018	NC_020307	TCA	2	6	158347	158352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119699
3019	NC_020307	TGC	2	6	158404	158409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119699
3020	NC_020307	CGA	2	6	158420	158425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119699
3021	NC_020307	GCT	2	6	158491	158496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119699
3022	NC_020307	TAC	2	6	158532	158537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119699
3023	NC_020307	TCG	2	6	158539	158544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119699
3024	NC_020307	GCT	2	6	158546	158551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119699
3025	NC_020307	GTG	2	6	158628	158633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119699
3026	NC_020307	CGG	3	9	158635	158643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119699
3027	NC_020307	GGA	2	6	158702	158707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119699
3028	NC_020307	GC	3	6	158731	158736	0 %	0 %	50 %	50 %	452119699
3029	NC_020307	GAT	2	6	158774	158779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119699
3030	NC_020307	GCT	2	6	158786	158791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119699
3031	NC_020307	GGC	2	6	158852	158857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119699
3032	NC_020307	CAG	2	6	158882	158887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119699
3033	NC_020307	CG	3	6	158912	158917	0 %	0 %	50 %	50 %	452119699
3034	NC_020307	ACGG	2	8	158961	158968	25 %	0 %	50 %	25 %	452119699
3035	NC_020307	TCG	2	6	159009	159014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119699
3036	NC_020307	GGT	2	6	159026	159031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119699
3037	NC_020307	CTG	2	6	159090	159095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119699
3038	NC_020307	GCT	2	6	159098	159103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119699
3039	NC_020307	A	6	6	160705	160710	100 %	0 %	0 %	0 %	452119702
3040	NC_020307	GCG	2	6	160717	160722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119702
3041	NC_020307	ATC	2	6	160794	160799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119702
3042	NC_020307	ACC	2	6	160804	160809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119702
3043	NC_020307	GGT	2	6	160970	160975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119702
3044	NC_020307	GCGAT	2	10	160987	160996	20 %	20 %	40 %	20 %	452119702
3045	NC_020307	GCA	2	6	161075	161080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119702
3046	NC_020307	CG	3	6	161085	161090	0 %	0 %	50 %	50 %	452119702
3047	NC_020307	GCT	2	6	161243	161248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119702
3048	NC_020307	CGG	2	6	161341	161346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119702
3049	NC_020307	GCC	2	6	161456	161461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119702
3050	NC_020307	CAT	2	6	161477	161482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119702
3051	NC_020307	GTG	2	6	161565	161570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119702
3052	NC_020307	GTG	2	6	161685	161690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119702
3053	NC_020307	GCT	2	6	161693	161698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119702
3054	NC_020307	TCGG	2	8	161703	161710	0 %	25 %	50 %	25 %	452119702
3055	NC_020307	GC	3	6	161742	161747	0 %	0 %	50 %	50 %	452119702
3056	NC_020307	TGG	2	6	161810	161815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119702
3057	NC_020307	TGG	2	6	161854	161859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119702
3058	NC_020307	ATC	2	6	161865	161870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119702
3059	NC_020307	TGA	2	6	161893	161898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119702
3060	NC_020307	TC	3	6	161960	161965	0 %	50 %	0 %	50 %	452119702
3061	NC_020307	TTA	2	6	161977	161982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119702
3062	NC_020307	TTTTA	2	10	162068	162077	20 %	80 %	0 %	0 %	452119702
3063	NC_020307	ATT	2	6	162081	162086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119702
3064	NC_020307	T	6	6	162085	162090	0 %	100 %	0 %	0 %	452119702
3065	NC_020307	TTG	2	6	162127	162132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119702
3066	NC_020307	TTA	2	6	162153	162158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119702
3067	NC_020307	ATT	2	6	162197	162202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119703
3068	NC_020307	CA	3	6	162216	162221	50 %	0 %	0 %	50 %	452119703
3069	NC_020307	GTG	2	6	162232	162237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119703
3070	NC_020307	GATG	2	8	162296	162303	25 %	25 %	50 %	0 %	452119703
3071	NC_020307	TGA	2	6	162304	162309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119703
3072	NC_020307	ATT	2	6	162351	162356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119703
3073	NC_020307	CAG	2	6	162387	162392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119703
3074	NC_020307	GCG	2	6	162393	162398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119703
3075	NC_020307	A	6	6	162420	162425	100 %	0 %	0 %	0 %	452119703
3076	NC_020307	CGT	2	6	162435	162440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119703
3077	NC_020307	AGGA	2	8	162475	162482	50 %	0 %	50 %	0 %	452119703
3078	NC_020307	TGG	2	6	162649	162654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119703
3079	NC_020307	CCG	2	6	162766	162771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119703
3080	NC_020307	ACG	2	6	162835	162840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119703
3081	NC_020307	GCA	2	6	162863	162868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119703
3082	NC_020307	CTGG	2	8	162869	162876	0 %	25 %	50 %	25 %	452119703
3083	NC_020307	CG	3	6	162884	162889	0 %	0 %	50 %	50 %	452119703
3084	NC_020307	CAC	2	6	162947	162952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119703
3085	NC_020307	CAG	2	6	162954	162959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119703
3086	NC_020307	ATCG	2	8	163044	163051	25 %	25 %	25 %	25 %	452119703
3087	NC_020307	CGCC	2	8	163231	163238	0 %	0 %	25 %	75 %	452119703
3088	NC_020307	ATTA	2	8	163245	163252	50 %	50 %	0 %	0 %	452119703
3089	NC_020307	CCG	2	6	163264	163269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119703
3090	NC_020307	GCA	2	6	163277	163282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119703
3091	NC_020307	GTG	2	6	163344	163349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119703
3092	NC_020307	TCAA	2	8	163360	163367	50 %	25 %	0 %	25 %	452119703
3093	NC_020307	GAG	2	6	163407	163412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119703
3094	NC_020307	GAT	2	6	163430	163435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119703
3095	NC_020307	T	6	6	163481	163486	0 %	100 %	0 %	0 %	452119704
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3097	NC_020307	CGC	2	6	163606	163611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119704
3098	NC_020307	GGC	2	6	163630	163635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119704
3099	NC_020307	GCG	2	6	163724	163729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119704
3100	NC_020307	GC	3	6	163797	163802	0 %	0 %	50 %	50 %	452119704
3101	NC_020307	AGCC	2	8	163808	163815	25 %	0 %	25 %	50 %	452119704
3102	NC_020307	CGG	2	6	163851	163856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119704
3103	NC_020307	CGG	2	6	163863	163868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119704
3104	NC_020307	CAG	2	6	163973	163978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119704
3105	NC_020307	TCG	2	6	163984	163989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119704
3106	NC_020307	TGC	2	6	164001	164006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119704
3107	NC_020307	CCG	2	6	164051	164056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119704
3108	NC_020307	GAT	2	6	164140	164145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119704
3109	NC_020307	CG	3	6	164152	164157	0 %	0 %	50 %	50 %	452119704
3110	NC_020307	A	6	6	164168	164173	100 %	0 %	0 %	0 %	452119704
3111	NC_020307	GGCGT	2	10	164219	164228	0 %	20 %	60 %	20 %	452119704
3112	NC_020307	TGAAG	2	10	164338	164347	40 %	20 %	40 %	0 %	452119704
3113	NC_020307	T	7	7	164370	164376	0 %	100 %	0 %	0 %	452119704
3114	NC_020307	GTG	2	6	164459	164464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119704
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3116	NC_020307	GGCT	2	8	164513	164520	0 %	25 %	50 %	25 %	452119704
3117	NC_020307	GGC	2	6	164548	164553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119704
3118	NC_020307	CG	3	6	164607	164612	0 %	0 %	50 %	50 %	452119704
3119	NC_020307	CAG	2	6	164642	164647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119704
3120	NC_020307	AGCC	2	8	164665	164672	25 %	0 %	25 %	50 %	452119704
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3122	NC_020307	CGG	2	6	164830	164835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119705
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3124	NC_020307	GCG	2	6	164922	164927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119705
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3232	NC_020307	TTG	2	6	171163	171168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119711
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3240	NC_020307	TGA	2	6	171462	171467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119711
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3242	NC_020307	GTC	2	6	171683	171688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119711
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3490	NC_020307	AT	3	6	182890	182895	50 %	50 %	0 %	0 %	452119721
3491	NC_020307	ATC	2	6	182905	182910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119721
3492	NC_020307	ACA	2	6	183024	183029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119721
3493	NC_020307	TGG	2	6	183040	183045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119721
3494	NC_020307	TAA	2	6	183047	183052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119721
3495	NC_020307	A	7	7	183072	183078	100 %	0 %	0 %	0 %	452119721
3496	NC_020307	ATT	2	6	183085	183090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119721
3497	NC_020307	ACA	2	6	183119	183124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119721
3498	NC_020307	AAG	2	6	183127	183132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119721
3499	NC_020307	TGAT	2	8	183160	183167	25 %	50 %	25 %	0 %	452119721
3500	NC_020307	CAC	2	6	183237	183242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119721

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