MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020307	CGG	2	6	78545	78550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119630
1502	NC_020307	GCC	2	6	78562	78567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119630
1503	NC_020307	CAA	2	6	78571	78576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119630
1504	NC_020307	CGC	2	6	78591	78596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119630
1505	NC_020307	CGC	2	6	78624	78629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119630
1506	NC_020307	CTAT	2	8	78671	78678	25 %	50 %	0 %	25 %	452119630
1507	NC_020307	GTA	2	6	78691	78696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119630
1508	NC_020307	TGA	2	6	78762	78767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119630
1509	NC_020307	A	6	6	78820	78825	100 %	0 %	0 %	0 %	452119630
1510	NC_020307	CGC	2	6	78828	78833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119630
1511	NC_020307	GGGT	2	8	78853	78860	0 %	25 %	75 %	0 %	452119630
1512	NC_020307	TGC	2	6	78879	78884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119631
1513	NC_020307	A	7	7	78886	78892	100 %	0 %	0 %	0 %	452119631
1514	NC_020307	TGCTGT	2	12	78908	78919	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452119631
1515	NC_020307	GTT	2	6	78922	78927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119631
1516	NC_020307	CTTG	2	8	78933	78940	0 %	50 %	25 %	25 %	452119631
1517	NC_020307	ATTA	2	8	78958	78965	50 %	50 %	0 %	0 %	452119631
1518	NC_020307	GCG	2	6	78986	78991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119631
1519	NC_020307	GC	3	6	79052	79057	0 %	0 %	50 %	50 %	452119631
1520	NC_020307	TGA	2	6	79106	79111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119631
1521	NC_020307	GCG	2	6	79156	79161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119631
1522	NC_020307	AGG	2	6	79175	79180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119631
1523	NC_020307	TGC	2	6	79238	79243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119631
1524	NC_020307	GCGAT	2	10	79253	79262	20 %	20 %	40 %	20 %	452119631
1525	NC_020307	CCG	2	6	79263	79268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119631
1526	NC_020307	TGC	2	6	79298	79303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119631
1527	NC_020307	GCT	2	6	79332	79337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119631
1528	NC_020307	TGC	2	6	79445	79450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119631
1529	NC_020307	TTCC	2	8	79547	79554	0 %	50 %	0 %	50 %	452119631
1530	NC_020307	CTG	2	6	79570	79575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119631
1531	NC_020307	GGCTG	2	10	79587	79596	0 %	20 %	60 %	20 %	452119631
1532	NC_020307	GCG	2	6	79697	79702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119631
1533	NC_020307	CG	3	6	79727	79732	0 %	0 %	50 %	50 %	452119631
1534	NC_020307	GTA	2	6	79834	79839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119631
1535	NC_020307	CGT	2	6	79863	79868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119631
1536	NC_020307	CGC	2	6	79869	79874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119631
1537	NC_020307	GC	3	6	79898	79903	0 %	0 %	50 %	50 %	452119631
1538	NC_020307	AGC	2	6	79924	79929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119631
1539	NC_020307	GAT	2	6	80032	80037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119631
1540	NC_020307	GAT	2	6	80167	80172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119632
1541	NC_020307	ATT	2	6	80389	80394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119632
1542	NC_020307	GC	3	6	80406	80411	0 %	0 %	50 %	50 %	452119632
1543	NC_020307	CGG	2	6	80440	80445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119632
1544	NC_020307	CAG	2	6	80450	80455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119632
1545	NC_020307	GCTG	2	8	80476	80483	0 %	25 %	50 %	25 %	452119632
1546	NC_020307	GC	3	6	80520	80525	0 %	0 %	50 %	50 %	452119632
1547	NC_020307	CG	3	6	80538	80543	0 %	0 %	50 %	50 %	452119632
1548	NC_020307	GCA	2	6	80551	80556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119632
1549	NC_020307	TCA	2	6	80572	80577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119632
1550	NC_020307	CGA	2	6	80617	80622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119632
1551	NC_020307	CGC	2	6	80685	80690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119632
1552	NC_020307	T	6	6	80732	80737	0 %	100 %	0 %	0 %	452119632
1553	NC_020307	GCT	2	6	80761	80766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119632
1554	NC_020307	CGTAG	2	10	80774	80783	20 %	20 %	40 %	20 %	452119632
1555	NC_020307	GCG	2	6	80814	80819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119632
1556	NC_020307	AGA	2	6	80830	80835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119632
1557	NC_020307	CGCC	2	8	80869	80876	0 %	0 %	25 %	75 %	452119632
1558	NC_020307	CAG	2	6	80903	80908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119632
1559	NC_020307	C	6	6	80958	80963	0 %	0 %	0 %	100 %	452119632
1560	NC_020307	TG	3	6	80974	80979	0 %	50 %	50 %	0 %	452119632
1561	NC_020307	TGTTC	2	10	80999	81008	0 %	60 %	20 %	20 %	452119633
1562	NC_020307	CTG	2	6	81015	81020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119633
1563	NC_020307	AGCC	2	8	81036	81043	25 %	0 %	25 %	50 %	452119633
1564	NC_020307	TTC	2	6	81045	81050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119633
1565	NC_020307	GCC	2	6	81102	81107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119633
1566	NC_020307	TGGT	2	8	81126	81133	0 %	50 %	50 %	0 %	452119633
1567	NC_020307	GTTT	2	8	81145	81152	0 %	75 %	25 %	0 %	452119633
1568	NC_020307	CGT	2	6	81155	81160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119633
1569	NC_020307	TGG	2	6	81220	81225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119633
1570	NC_020307	CGC	2	6	81233	81238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119633
1571	NC_020307	CCG	2	6	81255	81260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119633
1572	NC_020307	TGCC	2	8	81382	81389	0 %	25 %	25 %	50 %	452119633
1573	NC_020307	TGA	2	6	81394	81399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119633
1574	NC_020307	ATT	2	6	81501	81506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119633
1575	NC_020307	GCT	2	6	81614	81619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119633
1576	NC_020307	GGC	2	6	81629	81634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119633
1577	NC_020307	ATCG	2	8	81642	81649	25 %	25 %	25 %	25 %	452119633
1578	NC_020307	CG	4	8	81667	81674	0 %	0 %	50 %	50 %	452119633
1579	NC_020307	CGC	2	6	81717	81722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119634
1580	NC_020307	CAG	2	6	81742	81747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119634
1581	NC_020307	GC	3	6	81877	81882	0 %	0 %	50 %	50 %	452119635
1582	NC_020307	TGC	4	12	81895	81906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119635
1583	NC_020307	TGGC	2	8	82015	82022	0 %	25 %	50 %	25 %	452119635
1584	NC_020307	GGT	2	6	82047	82052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119635
1585	NC_020307	AGC	2	6	82159	82164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119635
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1587	NC_020307	TCG	2	6	82194	82199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119635
1588	NC_020307	GCA	2	6	82307	82312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119635
1589	NC_020307	CTG	2	6	82320	82325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119635
1590	NC_020307	GTT	2	6	82343	82348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119635
1591	NC_020307	AGC	2	6	82366	82371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119635
1592	NC_020307	ACTTTG	2	12	82372	82383	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452119635
1593	NC_020307	TATC	2	8	82400	82407	25 %	50 %	0 %	25 %	452119635
1594	NC_020307	CG	3	6	82509	82514	0 %	0 %	50 %	50 %	452119635
1595	NC_020307	CAAAG	2	10	82537	82546	60 %	0 %	20 %	20 %	452119635
1596	NC_020307	TGC	3	9	82821	82829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119636
1597	NC_020307	CAG	2	6	82832	82837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119636
1598	NC_020307	TCT	2	6	82953	82958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119636
1599	NC_020307	CG	3	6	83012	83017	0 %	0 %	50 %	50 %	452119636
1600	NC_020307	GGC	2	6	83033	83038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119636
1601	NC_020307	CGG	2	6	83044	83049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119636
1602	NC_020307	GTC	2	6	83054	83059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119636
1603	NC_020307	GGTC	2	8	83068	83075	0 %	25 %	50 %	25 %	452119636
1604	NC_020307	GGC	2	6	83105	83110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119636
1605	NC_020307	CCA	2	6	83136	83141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119636
1606	NC_020307	TCG	2	6	83142	83147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119636
1607	NC_020307	GCT	2	6	83152	83157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119636
1608	NC_020307	CGG	2	6	83223	83228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119636
1609	NC_020307	GT	3	6	83239	83244	0 %	50 %	50 %	0 %	452119636
1610	NC_020307	GAT	2	6	83332	83337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119636
1611	NC_020307	GC	3	6	83389	83394	0 %	0 %	50 %	50 %	452119636
1612	NC_020307	CGC	2	6	83443	83448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119636
1613	NC_020307	CGA	2	6	83587	83592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119636
1614	NC_020307	TCA	2	6	83618	83623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119636
1615	NC_020307	GGT	2	6	83656	83661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119636
1616	NC_020307	CGC	2	6	83984	83989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119636
1617	NC_020307	GCCA	2	8	84002	84009	25 %	0 %	25 %	50 %	452119636
1618	NC_020307	T	6	6	84032	84037	0 %	100 %	0 %	0 %	452119636
1619	NC_020307	TTACA	2	10	84195	84204	40 %	40 %	0 %	20 %	452119636
1620	NC_020307	TTG	2	6	84210	84215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119636
1621	NC_020307	GCA	2	6	84289	84294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119636
1622	NC_020307	CCG	2	6	84339	84344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119636
1623	NC_020307	TGG	2	6	84369	84374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119636
1624	NC_020307	GAT	2	6	84401	84406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119636
1625	NC_020307	ATTAC	2	10	84449	84458	40 %	40 %	0 %	20 %	452119636
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1998	NC_020307	TTA	2	6	106109	106114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119657
1999	NC_020307	TGG	2	6	106207	106212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119658
2000	NC_020307	AATC	2	8	106224	106231	50 %	25 %	0 %	25 %	452119658

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