MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020307	GAA	2	6	53085	53090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119606
1003	NC_020307	TGGATA	2	12	53164	53175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119606
1004	NC_020307	GAT	2	6	53186	53191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119606
1005	NC_020307	TCG	2	6	53371	53376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119606
1006	NC_020307	GTC	2	6	53402	53407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119606
1007	NC_020307	TAA	2	6	53438	53443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119606
1008	NC_020307	CGAA	2	8	53452	53459	50 %	0 %	25 %	25 %	452119606
1009	NC_020307	CGT	2	6	53496	53501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119606
1010	NC_020307	CGCA	2	8	53658	53665	25 %	0 %	25 %	50 %	452119606
1011	NC_020307	CGG	2	6	53681	53686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119606
1012	NC_020307	A	6	6	53817	53822	100 %	0 %	0 %	0 %	452119606
1013	NC_020307	ATC	2	6	53832	53837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119606
1014	NC_020307	TCT	2	6	53844	53849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119606
1015	NC_020307	TGA	2	6	53890	53895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119606
1016	NC_020307	ACA	2	6	53931	53936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119606
1017	NC_020307	CTT	2	6	53962	53967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119606
1018	NC_020307	AAG	2	6	54034	54039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119607
1019	NC_020307	CGT	2	6	54050	54055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119607
1020	NC_020307	ATT	3	9	54075	54083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119607
1021	NC_020307	T	6	6	54098	54103	0 %	100 %	0 %	0 %	452119607
1022	NC_020307	TAT	3	9	54149	54157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119607
1023	NC_020307	CGG	2	6	54205	54210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119607
1024	NC_020307	GGC	2	6	54227	54232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119607
1025	NC_020307	GGC	2	6	54239	54244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119607
1026	NC_020307	CAAT	2	8	54255	54262	50 %	25 %	0 %	25 %	452119607
1027	NC_020307	CAT	3	9	54365	54373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119607
1028	NC_020307	TTA	2	6	54397	54402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119607
1029	NC_020307	GAT	2	6	54416	54421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119607
1030	NC_020307	GGC	2	6	54633	54638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119607
1031	NC_020307	CTG	2	6	54684	54689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119607
1032	NC_020307	CGG	2	6	54725	54730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119607
1033	NC_020307	CCA	2	6	54760	54765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119607
1034	NC_020307	TATG	2	8	54779	54786	25 %	50 %	25 %	0 %	452119607
1035	NC_020307	GCG	2	6	54832	54837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119607
1036	NC_020307	GTG	2	6	54858	54863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119607
1037	NC_020307	TCA	2	6	54886	54891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119607
1038	NC_020307	GGC	2	6	54945	54950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119607
1039	NC_020307	CG	3	6	54989	54994	0 %	0 %	50 %	50 %	452119607
1040	NC_020307	AAG	2	6	54996	55001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119607
1041	NC_020307	T	6	6	55109	55114	0 %	100 %	0 %	0 %	452119608
1042	NC_020307	CAG	2	6	55166	55171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119608
1043	NC_020307	GCG	2	6	55201	55206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119608
1044	NC_020307	TGA	2	6	55236	55241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119608
1045	NC_020307	CCG	2	6	55242	55247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119608
1046	NC_020307	CCG	2	6	55336	55341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119608
1047	NC_020307	ATA	2	6	55344	55349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119608
1048	NC_020307	ATC	2	6	55368	55373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119608
1049	NC_020307	TCT	2	6	55431	55436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119608
1050	NC_020307	GTC	2	6	55467	55472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119608
1051	NC_020307	CGC	2	6	55484	55489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119608
1052	NC_020307	CAG	3	9	55493	55501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119608
1053	NC_020307	GCC	2	6	55532	55537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119608
1054	NC_020307	CTG	2	6	55583	55588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119608
1055	NC_020307	ACC	2	6	55656	55661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119608
1056	NC_020307	TGG	2	6	55717	55722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119608
1057	NC_020307	CCG	2	6	55737	55742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119608
1058	NC_020307	GGC	2	6	55748	55753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119608
1059	NC_020307	CTT	2	6	55939	55944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119608
1060	NC_020307	CTG	2	6	55970	55975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119608
1061	NC_020307	ATG	2	6	55989	55994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119608
1062	NC_020307	GGC	2	6	56042	56047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119608
1063	NC_020307	TCT	2	6	56112	56117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119608
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1065	NC_020307	A	7	7	56159	56165	100 %	0 %	0 %	0 %	452119608
1066	NC_020307	GAA	3	9	56244	56252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119608
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1069	NC_020307	ATG	2	6	56335	56340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119609
1070	NC_020307	CTT	2	6	56355	56360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119609
1071	NC_020307	ACG	2	6	56381	56386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119609
1072	NC_020307	GTC	2	6	56431	56436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119609
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1074	NC_020307	TGC	2	6	56468	56473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119609
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1083	NC_020307	AAT	2	6	56770	56775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119609
1084	NC_020307	GC	3	6	56819	56824	0 %	0 %	50 %	50 %	452119609
1085	NC_020307	A	6	6	56828	56833	100 %	0 %	0 %	0 %	452119609
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1088	NC_020307	AAT	2	6	57160	57165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119609
1089	NC_020307	CTG	2	6	57217	57222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119609
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1092	NC_020307	ATA	2	6	57465	57470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119609
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1097	NC_020307	TAAA	2	8	57789	57796	75 %	25 %	0 %	0 %	452119610
1098	NC_020307	A	6	6	57794	57799	100 %	0 %	0 %	0 %	452119610
1099	NC_020307	ATAAAC	2	12	57856	57867	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452119610
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1103	NC_020307	A	6	6	58108	58113	100 %	0 %	0 %	0 %	452119611
1104	NC_020307	GC	3	6	58148	58153	0 %	0 %	50 %	50 %	452119611
1105	NC_020307	GC	3	6	58258	58263	0 %	0 %	50 %	50 %	452119611
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1108	NC_020307	CGCC	2	8	58385	58392	0 %	0 %	25 %	75 %	452119611
1109	NC_020307	CGC	2	6	58448	58453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119611
1110	NC_020307	AGC	2	6	58456	58461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119611
1111	NC_020307	ACG	2	6	58567	58572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119611
1112	NC_020307	CAG	2	6	58665	58670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119611
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1114	NC_020307	CG	3	6	58997	59002	0 %	0 %	50 %	50 %	452119612
1115	NC_020307	CAG	2	6	59036	59041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119612
1116	NC_020307	GC	3	6	59047	59052	0 %	0 %	50 %	50 %	452119612
1117	NC_020307	GGC	2	6	59081	59086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119612
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1121	NC_020307	GCG	2	6	59314	59319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119612
1122	NC_020307	CG	3	6	59318	59323	0 %	0 %	50 %	50 %	452119612
1123	NC_020307	CGG	2	6	59413	59418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119612
1124	NC_020307	CGC	2	6	59431	59436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119612
1125	NC_020307	TGG	2	6	59488	59493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119612
1126	NC_020307	CGC	2	6	59539	59544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119612
1127	NC_020307	GC	3	6	59543	59548	0 %	0 %	50 %	50 %	452119612
1128	NC_020307	GCC	3	9	59592	59600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119612
1129	NC_020307	CCG	2	6	59641	59646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119612
1130	NC_020307	TGG	2	6	59694	59699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119612
1131	NC_020307	CGT	2	6	59925	59930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119613
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1133	NC_020307	GC	3	6	60050	60055	0 %	0 %	50 %	50 %	452119613
1134	NC_020307	GCC	2	6	60200	60205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119613
1135	NC_020307	TGC	2	6	60208	60213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119613
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1141	NC_020307	GCA	2	6	60427	60432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119613
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1154	NC_020307	TA	3	6	60985	60990	50 %	50 %	0 %	0 %	452119614
1155	NC_020307	ATA	2	6	60998	61003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119614
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1158	NC_020307	AAAG	2	8	61306	61313	75 %	0 %	25 %	0 %	452119615
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1163	NC_020307	GCC	2	6	61590	61595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119615
1164	NC_020307	ACC	2	6	61606	61611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119615
1165	NC_020307	GCAA	2	8	61627	61634	50 %	0 %	25 %	25 %	452119615
1166	NC_020307	GCA	2	6	61640	61645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119615
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1233	NC_020307	TGAA	2	8	65153	65160	50 %	25 %	25 %	0 %	452119618
1234	NC_020307	T	6	6	65182	65187	0 %	100 %	0 %	0 %	452119618
1235	NC_020307	GATTT	2	10	65203	65212	20 %	60 %	20 %	0 %	452119618
1236	NC_020307	GTG	2	6	65242	65247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119618
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1238	NC_020307	GATT	2	8	65387	65394	25 %	50 %	25 %	0 %	452119619
1239	NC_020307	CAG	2	6	65427	65432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119619
1240	NC_020307	TGA	2	6	65489	65494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119619
1241	NC_020307	TCG	2	6	65524	65529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119619
1242	NC_020307	CTGG	2	8	65531	65538	0 %	25 %	50 %	25 %	452119619
1243	NC_020307	CGC	2	6	65557	65562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119619
1244	NC_020307	TGC	2	6	65563	65568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119619
1245	NC_020307	CGA	2	6	65569	65574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119619
1246	NC_020307	GC	3	6	65583	65588	0 %	0 %	50 %	50 %	452119619
1247	NC_020307	CAAT	2	8	65635	65642	50 %	25 %	0 %	25 %	452119619
1248	NC_020307	A	6	6	65697	65702	100 %	0 %	0 %	0 %	452119619
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