MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020307	CGACC	2	10	25813	25822	20 %	0 %	20 %	60 %	452119582
502	NC_020307	CG	3	6	25857	25862	0 %	0 %	50 %	50 %	452119582
503	NC_020307	ATA	2	6	25883	25888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119582
504	NC_020307	CCG	2	6	25902	25907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119582
505	NC_020307	GCA	2	6	25923	25928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119582
506	NC_020307	CAG	2	6	25945	25950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119582
507	NC_020307	CAT	2	6	25951	25956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119582
508	NC_020307	GCA	2	6	26007	26012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119582
509	NC_020307	AG	3	6	26041	26046	50 %	0 %	50 %	0 %	452119582
510	NC_020307	GC	3	6	26057	26062	0 %	0 %	50 %	50 %	452119582
511	NC_020307	CAC	2	6	26098	26103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119582
512	NC_020307	AGC	2	6	26111	26116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119582
513	NC_020307	GCC	2	6	26142	26147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119582
514	NC_020307	TCT	2	6	26159	26164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119582
515	NC_020307	CAG	2	6	26200	26205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119582
516	NC_020307	ATT	2	6	26227	26232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119582
517	NC_020307	CCA	2	6	26245	26250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119582
518	NC_020307	CCA	2	6	26268	26273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119582
519	NC_020307	AAG	2	6	26285	26290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119582
520	NC_020307	CGG	2	6	26367	26372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119582
521	NC_020307	CAA	2	6	26472	26477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119583
522	NC_020307	CGG	2	6	26538	26543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119583
523	NC_020307	GAG	2	6	26661	26666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119583
524	NC_020307	TGA	2	6	26716	26721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119583
525	NC_020307	GCT	2	6	26753	26758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119583
526	NC_020307	GCG	2	6	26776	26781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119583
527	NC_020307	T	6	6	26787	26792	0 %	100 %	0 %	0 %	452119583
528	NC_020307	GCG	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119583
529	NC_020307	CTGG	2	8	26821	26828	0 %	25 %	50 %	25 %	452119583
530	NC_020307	CGC	2	6	26909	26914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119583
531	NC_020307	CCA	2	6	26925	26930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119583
532	NC_020307	GGC	2	6	26940	26945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119583
533	NC_020307	GAT	2	6	26982	26987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119583
534	NC_020307	AATC	2	8	27086	27093	50 %	25 %	0 %	25 %	452119583
535	NC_020307	TAA	2	6	27117	27122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119583
536	NC_020307	GGTT	2	8	27153	27160	0 %	50 %	50 %	0 %	452119583
537	NC_020307	AGC	2	6	27193	27198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119583
538	NC_020307	GCA	2	6	27234	27239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119583
539	NC_020307	GCC	2	6	27246	27251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119583
540	NC_020307	AGC	2	6	27286	27291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119583
541	NC_020307	GC	3	6	27290	27295	0 %	0 %	50 %	50 %	452119583
542	NC_020307	TAA	2	6	27363	27368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119583
543	NC_020307	GGT	2	6	27381	27386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119583
544	NC_020307	TAA	2	6	27410	27415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119583
545	NC_020307	CG	3	6	27649	27654	0 %	0 %	50 %	50 %	452119584
546	NC_020307	CGA	2	6	27801	27806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119584
547	NC_020307	CAG	2	6	27841	27846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119584
548	NC_020307	CTT	2	6	27909	27914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119584
549	NC_020307	TCT	2	6	27950	27955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119584
550	NC_020307	CGC	2	6	28002	28007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119584
551	NC_020307	TCG	2	6	28037	28042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119584
552	NC_020307	TTC	2	6	28054	28059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119584
553	NC_020307	GGC	2	6	28108	28113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119584
554	NC_020307	T	6	6	28189	28194	0 %	100 %	0 %	0 %	452119584
555	NC_020307	TTCG	2	8	28198	28205	0 %	50 %	25 %	25 %	452119584
556	NC_020307	TCG	2	6	28588	28593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119585
557	NC_020307	GC	3	6	28637	28642	0 %	0 %	50 %	50 %	452119585
558	NC_020307	ATT	2	6	28753	28758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119585
559	NC_020307	TTG	2	6	29397	29402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119586
560	NC_020307	GCA	2	6	29428	29433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119586
561	NC_020307	AAC	2	6	29527	29532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119586
562	NC_020307	AAAAT	2	10	29577	29586	80 %	20 %	0 %	0 %	452119586
563	NC_020307	GAA	2	6	29636	29641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119586
564	NC_020307	AAT	2	6	29648	29653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119586
565	NC_020307	ATT	2	6	29654	29659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119586
566	NC_020307	GAT	2	6	29705	29710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119586
567	NC_020307	TTG	2	6	29777	29782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119586
568	NC_020307	AAT	2	6	29798	29803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119586
569	NC_020307	GCTGGT	2	12	29854	29865	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	452119586
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572	NC_020307	TAAC	2	8	30083	30090	50 %	25 %	0 %	25 %	452119587
573	NC_020307	AGA	2	6	30098	30103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119587
574	NC_020307	TGGTAT	2	12	30173	30184	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	452119587
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576	NC_020307	GCCTG	2	10	30205	30214	0 %	20 %	40 %	40 %	452119587
577	NC_020307	GTGC	2	8	30305	30312	0 %	25 %	50 %	25 %	452119587
578	NC_020307	CGG	3	9	30431	30439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119587
579	NC_020307	CAT	2	6	30444	30449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119587
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581	NC_020307	ACAA	2	8	30550	30557	75 %	0 %	0 %	25 %	452119587
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584	NC_020307	CGC	2	6	30656	30661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119587
585	NC_020307	CCG	2	6	30677	30682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119587
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587	NC_020307	GGA	2	6	30773	30778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119587
588	NC_020307	AGT	2	6	30902	30907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119587
589	NC_020307	ACA	2	6	30923	30928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119587
590	NC_020307	T	6	6	30969	30974	0 %	100 %	0 %	0 %	452119587
591	NC_020307	T	6	6	30984	30989	0 %	100 %	0 %	0 %	452119587
592	NC_020307	A	6	6	31047	31052	100 %	0 %	0 %	0 %	452119587
593	NC_020307	CCA	2	6	31058	31063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119587
594	NC_020307	CGA	2	6	31148	31153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119587
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596	NC_020307	TGT	2	6	31208	31213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119587
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598	NC_020307	A	6	6	31425	31430	100 %	0 %	0 %	0 %	452119588
599	NC_020307	T	9	9	31510	31518	0 %	100 %	0 %	0 %	452119588
600	NC_020307	T	7	7	31537	31543	0 %	100 %	0 %	0 %	452119588
601	NC_020307	AGA	2	6	31641	31646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119589
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603	NC_020307	GGCG	2	8	31692	31699	0 %	0 %	75 %	25 %	452119589
604	NC_020307	GC	3	6	31720	31725	0 %	0 %	50 %	50 %	452119589
605	NC_020307	CG	3	6	31787	31792	0 %	0 %	50 %	50 %	452119589
606	NC_020307	GCC	2	6	31885	31890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119589
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609	NC_020307	GC	3	6	31992	31997	0 %	0 %	50 %	50 %	452119589
610	NC_020307	GCG	2	6	32101	32106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119589
611	NC_020307	GCG	2	6	32134	32139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119589
612	NC_020307	TCG	2	6	32141	32146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119589
613	NC_020307	AGC	2	6	32277	32282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119589
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615	NC_020307	ACG	2	6	32306	32311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119589
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622	NC_020307	GTG	2	6	32596	32601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119589
623	NC_020307	GAA	2	6	32613	32618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119589
624	NC_020307	GCGAT	2	10	32681	32690	20 %	20 %	40 %	20 %	452119589
625	NC_020307	CGC	2	6	32691	32696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119589
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752	NC_020307	GCTGG	2	10	38875	38884	0 %	20 %	60 %	20 %	452119595
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