MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020307	GCG	2	6	320142	320147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119862
6002	NC_020307	CTG	2	6	320389	320394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119862
6003	NC_020307	GGT	2	6	320399	320404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119862
6004	NC_020307	TAC	2	6	320468	320473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119862
6005	NC_020307	GCTG	2	8	320663	320670	0 %	25 %	50 %	25 %	452119862
6006	NC_020307	TA	3	6	320694	320699	50 %	50 %	0 %	0 %	452119862
6007	NC_020307	GGT	2	6	320917	320922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119863
6008	NC_020307	TAA	2	6	320947	320952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119863
6009	NC_020307	GCG	2	6	321008	321013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119863
6010	NC_020307	A	6	6	321014	321019	100 %	0 %	0 %	0 %	452119863
6011	NC_020307	AACCGC	2	12	321021	321032	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	452119863
6012	NC_020307	A	8	8	321092	321099	100 %	0 %	0 %	0 %	452119863
6013	NC_020307	CTG	2	6	321144	321149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119863
6014	NC_020307	T	6	6	321182	321187	0 %	100 %	0 %	0 %	452119863
6015	NC_020307	CGG	2	6	321231	321236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119863
6016	NC_020307	AACGAG	2	12	321501	321512	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452119864
6017	NC_020307	GAT	2	6	321525	321530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119864
6018	NC_020307	AATAC	2	10	321541	321550	60 %	20 %	0 %	20 %	452119864
6019	NC_020307	G	7	7	321652	321658	0 %	0 %	100 %	0 %	452119864
6020	NC_020307	CGTA	2	8	321664	321671	25 %	25 %	25 %	25 %	452119864
6021	NC_020307	GCC	2	6	321741	321746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119864
6022	NC_020307	TTG	2	6	321820	321825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119864
6023	NC_020307	GAA	2	6	321930	321935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119864
6024	NC_020307	TGG	2	6	322023	322028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119864
6025	NC_020307	ACG	2	6	322044	322049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119864
6026	NC_020307	A	6	6	322119	322124	100 %	0 %	0 %	0 %	452119864
6027	NC_020307	TGC	2	6	322134	322139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119864
6028	NC_020307	CCAGCG	2	12	322297	322308	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	452119865
6029	NC_020307	GCC	2	6	322316	322321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119865
6030	NC_020307	GAG	2	6	322382	322387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119865
6031	NC_020307	GCG	2	6	322468	322473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119865
6032	NC_020307	GCG	2	6	322520	322525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119865
6033	NC_020307	AAT	2	6	322551	322556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119865
6034	NC_020307	CGCCAG	2	12	322583	322594	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	452119865
6035	NC_020307	GCA	2	6	322657	322662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119865
6036	NC_020307	TGGC	2	8	322680	322687	0 %	25 %	50 %	25 %	452119865
6037	NC_020307	A	6	6	322741	322746	100 %	0 %	0 %	0 %	452119865
6038	NC_020307	CTG	2	6	322895	322900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119865
6039	NC_020307	AAG	2	6	322913	322918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119865
6040	NC_020307	ATG	2	6	322956	322961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119865
6041	NC_020307	CA	3	6	323024	323029	50 %	0 %	0 %	50 %	452119865
6042	NC_020307	ACC	2	6	323031	323036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119865
6043	NC_020307	CAA	2	6	323044	323049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119865
6044	NC_020307	CAG	2	6	323057	323062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119865
6045	NC_020307	TTA	2	6	323100	323105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119865
6046	NC_020307	GGC	2	6	323144	323149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119865
6047	NC_020307	CAT	2	6	323171	323176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119865
6048	NC_020307	AGCCC	2	10	323230	323239	20 %	0 %	20 %	60 %	452119865
6049	NC_020307	TAG	2	6	323276	323281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119865
6050	NC_020307	CAA	2	6	323315	323320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119865
6051	NC_020307	GTG	2	6	323388	323393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119865
6052	NC_020307	ATG	2	6	323694	323699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119866
6053	NC_020307	GGC	2	6	323738	323743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119866
6054	NC_020307	GC	3	6	323751	323756	0 %	0 %	50 %	50 %	452119866
6055	NC_020307	CGG	3	9	323803	323811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119866
6056	NC_020307	GGC	2	6	323828	323833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119866
6057	NC_020307	GAAAG	2	10	323834	323843	60 %	0 %	40 %	0 %	452119866
6058	NC_020307	GCC	2	6	323890	323895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119866
6059	NC_020307	CGC	2	6	323999	324004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119867
6060	NC_020307	AAT	2	6	324030	324035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119867
6061	NC_020307	TCT	2	6	324052	324057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119867
6062	NC_020307	CTGG	2	8	324108	324115	0 %	25 %	50 %	25 %	452119867
6063	NC_020307	T	6	6	324143	324148	0 %	100 %	0 %	0 %	452119867
6064	NC_020307	TAA	2	6	324152	324157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119867
6065	NC_020307	GCT	2	6	324158	324163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119867
6066	NC_020307	CG	3	6	324177	324182	0 %	0 %	50 %	50 %	452119867
6067	NC_020307	GAA	2	6	324220	324225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119867
6068	NC_020307	TCT	2	6	324295	324300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119867
6069	NC_020307	CGA	2	6	324310	324315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119867
6070	NC_020307	CAC	2	6	324352	324357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119867
6071	NC_020307	TTG	2	6	324366	324371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119867
6072	NC_020307	GAG	2	6	324382	324387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119867
6073	NC_020307	TAA	3	9	324684	324692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119868
6074	NC_020307	AAACG	2	10	324803	324812	60 %	0 %	20 %	20 %	452119868
6075	NC_020307	CTG	2	6	324830	324835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119868
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6077	NC_020307	GGCT	2	8	324934	324941	0 %	25 %	50 %	25 %	452119868
6078	NC_020307	TGA	2	6	325287	325292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119869
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6080	NC_020307	CAT	2	6	325321	325326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119869
6081	NC_020307	CGA	2	6	325390	325395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119869
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6083	NC_020307	CAT	2	6	325429	325434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119869
6084	NC_020307	GC	3	6	325500	325505	0 %	0 %	50 %	50 %	452119869
6085	NC_020307	CAA	2	6	325585	325590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119869
6086	NC_020307	GCTGA	2	10	325637	325646	20 %	20 %	40 %	20 %	452119869
6087	NC_020307	GTC	2	6	325763	325768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119869
6088	NC_020307	CGG	2	6	325821	325826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119869
6089	NC_020307	TGTT	2	8	325850	325857	0 %	75 %	25 %	0 %	452119869
6090	NC_020307	ACG	2	6	326110	326115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119870
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6092	NC_020307	CTG	3	9	326208	326216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119870
6093	NC_020307	CAT	2	6	326255	326260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119870
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6095	NC_020307	TTC	2	6	326340	326345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119870
6096	NC_020307	AG	3	6	326347	326352	50 %	0 %	50 %	0 %	452119870
6097	NC_020307	CAT	2	6	326430	326435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119870
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6100	NC_020307	T	6	6	326842	326847	0 %	100 %	0 %	0 %	452119871
6101	NC_020307	GAA	2	6	327188	327193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119872
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6104	NC_020307	TGC	2	6	327354	327359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119872
6105	NC_020307	GGC	2	6	327388	327393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119872
6106	NC_020307	CGG	2	6	327399	327404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119872
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6108	NC_020307	GGCA	2	8	327433	327440	25 %	0 %	50 %	25 %	452119872
6109	NC_020307	AATT	2	8	327441	327448	50 %	50 %	0 %	0 %	452119872
6110	NC_020307	CGG	2	6	327465	327470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119872
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6113	NC_020307	TAATT	2	10	327586	327595	40 %	60 %	0 %	0 %	452119872
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6117	NC_020307	GTT	2	6	328470	328475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119873
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6119	NC_020307	CGCT	2	8	328571	328578	0 %	25 %	25 %	50 %	452119873
6120	NC_020307	CGT	2	6	328597	328602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119873
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6122	NC_020307	GCG	2	6	328762	328767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119873
6123	NC_020307	GCA	2	6	328794	328799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119873
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6241	NC_020307	AAAC	2	8	334061	334068	75 %	0 %	0 %	25 %	452119879
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6366	NC_020307	TGC	2	6	340629	340634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119884
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6392	NC_020307	TGC	2	6	341655	341660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119886
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6485	NC_020307	GC	3	6	345485	345490	0 %	0 %	50 %	50 %	452119888
6486	NC_020307	ATT	2	6	345525	345530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119888
6487	NC_020307	GCG	2	6	345543	345548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119888
6488	NC_020307	TGG	2	6	345563	345568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119888
6489	NC_020307	TGT	2	6	345569	345574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119888
6490	NC_020307	GGA	2	6	345625	345630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119888
6491	NC_020307	AAT	2	6	345632	345637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119888
6492	NC_020307	TGGC	2	8	345645	345652	0 %	25 %	50 %	25 %	452119889
6493	NC_020307	TTG	2	6	345654	345659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119889
6494	NC_020307	TGA	2	6	345790	345795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119889
6495	NC_020307	CCGCT	2	10	345936	345945	0 %	20 %	20 %	60 %	452119889
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6497	NC_020307	ATG	2	6	346265	346270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119890
6498	NC_020307	TGA	2	6	346534	346539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119890
6499	NC_020307	CGA	3	9	346569	346577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119890
6500	NC_020307	ATGA	2	8	346682	346689	50 %	25 %	25 %	0 %	452119890

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