MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020307	CG	4	8	293933	293940	0 %	0 %	50 %	50 %	452119834
5503	NC_020307	CCGC	2	8	294021	294028	0 %	0 %	25 %	75 %	452119834
5504	NC_020307	GC	3	6	294034	294039	0 %	0 %	50 %	50 %	452119834
5505	NC_020307	CAT	2	6	294040	294045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119834
5506	NC_020307	AAC	2	6	294116	294121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119834
5507	NC_020307	CGG	2	6	294187	294192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119834
5508	NC_020307	GCAG	2	8	294227	294234	25 %	0 %	50 %	25 %	452119834
5509	NC_020307	CCG	2	6	294251	294256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119834
5510	NC_020307	GGGCC	2	10	294279	294288	0 %	0 %	60 %	40 %	452119834
5511	NC_020307	CGA	2	6	294414	294419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119834
5512	NC_020307	AAT	2	6	294463	294468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119834
5513	NC_020307	ACG	2	6	294544	294549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119834
5514	NC_020307	CCG	2	6	294552	294557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119834
5515	NC_020307	TCA	2	6	294621	294626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119834
5516	NC_020307	GCC	2	6	294640	294645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119835
5517	NC_020307	CCG	2	6	294718	294723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119835
5518	NC_020307	CGC	2	6	294740	294745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119835
5519	NC_020307	GTC	2	6	294804	294809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119835
5520	NC_020307	TGC	2	6	294853	294858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119835
5521	NC_020307	GTT	2	6	294863	294868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119835
5522	NC_020307	CCG	2	6	294899	294904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119835
5523	NC_020307	CTG	2	6	295011	295016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119835
5524	NC_020307	CTG	2	6	295038	295043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119835
5525	NC_020307	GCT	2	6	295193	295198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119835
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5540	NC_020307	TGC	2	6	295746	295751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119836
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5550	NC_020307	CAG	2	6	296038	296043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119836
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5554	NC_020307	CGTC	2	8	296157	296164	0 %	25 %	25 %	50 %	452119836
5555	NC_020307	GTT	2	6	296166	296171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119836
5556	NC_020307	GCC	2	6	296252	296257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119836
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5560	NC_020307	TCA	2	6	296398	296403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119837
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5564	NC_020307	CCA	3	9	296581	296589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119837
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5585	NC_020307	ACTG	2	8	297619	297626	25 %	25 %	25 %	25 %	452119837
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5588	NC_020307	CAGACG	2	12	297695	297706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119837
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5595	NC_020307	GGTTG	2	10	297963	297972	0 %	40 %	60 %	0 %	452119837
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5603	NC_020307	CGTC	2	8	298443	298450	0 %	25 %	25 %	50 %	452119838
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5621	NC_020307	T	7	7	299432	299438	0 %	100 %	0 %	0 %	452119840
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5862	NC_020307	GGC	2	6	312219	312224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119853
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5987	NC_020307	CCA	2	6	319325	319330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119862
5988	NC_020307	GAC	2	6	319331	319336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119862
5989	NC_020307	ATT	2	6	319414	319419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119862
5990	NC_020307	CAA	2	6	319491	319496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119862
5991	NC_020307	ATT	2	6	319522	319527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119862
5992	NC_020307	A	8	8	319587	319594	100 %	0 %	0 %	0 %	452119862
5993	NC_020307	GCA	2	6	319596	319601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119862
5994	NC_020307	G	6	6	319654	319659	0 %	0 %	100 %	0 %	452119862
5995	NC_020307	GAC	2	6	319794	319799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119862
5996	NC_020307	GGCG	2	8	319823	319830	0 %	0 %	75 %	25 %	452119862
5997	NC_020307	CTGG	2	8	319945	319952	0 %	25 %	50 %	25 %	452119862
5998	NC_020307	TGCT	2	8	320008	320015	0 %	50 %	25 %	25 %	452119862
5999	NC_020307	TAT	2	6	320073	320078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119862
6000	NC_020307	CGGG	2	8	320121	320128	0 %	0 %	75 %	25 %	452119862

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