MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_020307	ACT	2	6	235728	235733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119772
4503	NC_020307	CGATT	2	10	235806	235815	20 %	40 %	20 %	20 %	452119772
4504	NC_020307	CTGGCG	2	12	235835	235846	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	452119772
4505	NC_020307	GCG	2	6	235856	235861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119772
4506	NC_020307	CAG	2	6	235911	235916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119773
4507	NC_020307	ATT	2	6	235947	235952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119773
4508	NC_020307	ATT	2	6	235959	235964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119773
4509	NC_020307	ACC	2	6	236034	236039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119773
4510	NC_020307	CTGG	2	8	236051	236058	0 %	25 %	50 %	25 %	452119773
4511	NC_020307	AGC	2	6	236089	236094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119773
4512	NC_020307	ATT	2	6	236121	236126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119773
4513	NC_020307	TAA	2	6	236159	236164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119773
4514	NC_020307	GGC	2	6	236184	236189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119773
4515	NC_020307	CG	3	6	236215	236220	0 %	0 %	50 %	50 %	452119773
4516	NC_020307	GC	3	6	236225	236230	0 %	0 %	50 %	50 %	452119773
4517	NC_020307	GCC	2	6	236262	236267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119773
4518	NC_020307	GAG	3	9	236286	236294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119773
4519	NC_020307	GCG	2	6	236368	236373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119773
4520	NC_020307	TGG	2	6	236374	236379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119773
4521	NC_020307	CGGCG	2	10	236399	236408	0 %	0 %	60 %	40 %	452119773
4522	NC_020307	GGC	2	6	236469	236474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119773
4523	NC_020307	GCT	2	6	236504	236509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119773
4524	NC_020307	TGA	2	6	236529	236534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119773
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4526	NC_020307	ACC	2	6	236594	236599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119774
4527	NC_020307	CGG	3	9	236613	236621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119774
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4529	NC_020307	TCA	2	6	236662	236667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119774
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4531	NC_020307	GGC	2	6	236765	236770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119774
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4533	NC_020307	CACG	2	8	236785	236792	25 %	0 %	25 %	50 %	452119774
4534	NC_020307	GGC	2	6	236849	236854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119774
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4536	NC_020307	CGC	2	6	236922	236927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119774
4537	NC_020307	A	6	6	237021	237026	100 %	0 %	0 %	0 %	452119774
4538	NC_020307	GGC	2	6	237053	237058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119774
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4542	NC_020307	AC	3	6	237225	237230	50 %	0 %	0 %	50 %	452119774
4543	NC_020307	GTC	2	6	237236	237241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119774
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4545	NC_020307	CGC	2	6	237340	237345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119774
4546	NC_020307	GC	3	6	237380	237385	0 %	0 %	50 %	50 %	452119774
4547	NC_020307	GC	3	6	237420	237425	0 %	0 %	50 %	50 %	452119774
4548	NC_020307	ATC	2	6	237516	237521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119774
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4550	NC_020307	TGC	2	6	237555	237560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119774
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4552	NC_020307	CGA	2	6	237640	237645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119774
4553	NC_020307	TGA	2	6	237704	237709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119775
4554	NC_020307	GCG	2	6	237715	237720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119775
4555	NC_020307	GGC	2	6	237790	237795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119775
4556	NC_020307	GTT	2	6	237828	237833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119775
4557	NC_020307	GCC	2	6	237844	237849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119775
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4559	NC_020307	TGG	2	6	237917	237922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119775
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4561	NC_020307	CG	3	6	238116	238121	0 %	0 %	50 %	50 %	452119775
4562	NC_020307	CG	3	6	238131	238136	0 %	0 %	50 %	50 %	452119775
4563	NC_020307	ATGAA	2	10	238232	238241	60 %	20 %	20 %	0 %	452119775
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4570	NC_020307	TGA	2	6	238471	238476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119776
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4572	NC_020307	TGA	2	6	238641	238646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119776
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4601	NC_020307	GTCA	2	8	240073	240080	25 %	25 %	25 %	25 %	452119778
4602	NC_020307	TGG	2	6	240097	240102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119778
4603	NC_020307	TGA	2	6	240159	240164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119778
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4605	NC_020307	CGC	2	6	240286	240291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119778
4606	NC_020307	GC	3	6	240325	240330	0 %	0 %	50 %	50 %	452119778
4607	NC_020307	A	6	6	240391	240396	100 %	0 %	0 %	0 %	452119778
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4624	NC_020307	GTG	2	6	241194	241199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119779
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4743	NC_020307	GC	3	6	245802	245807	0 %	0 %	50 %	50 %	452119786
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4989	NC_020307	CCA	2	6	262156	262161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119801
4990	NC_020307	TCCG	2	8	262210	262217	0 %	25 %	25 %	50 %	452119801
4991	NC_020307	CCG	3	9	262215	262223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119801
4992	NC_020307	GAG	2	6	262295	262300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119801
4993	NC_020307	CAC	2	6	262318	262323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119801
4994	NC_020307	GCC	2	6	262331	262336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119801
4995	NC_020307	TGA	2	6	262339	262344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119801
4996	NC_020307	TGC	2	6	262434	262439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119801
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4998	NC_020307	CGC	2	6	262540	262545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119801
4999	NC_020307	GAAG	2	8	262615	262622	50 %	0 %	50 %	0 %	452119801
5000	NC_020307	CGTA	2	8	262628	262635	25 %	25 %	25 %	25 %	452119801

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