MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992 plasmid pCFSAN001992_1

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020306	TTCG	2	8	102	109	0 %	50 %	25 %	25 %	452119510
2	NC_020306	TATG	2	8	1676	1683	25 %	50 %	25 %	0 %	452119511
3	NC_020306	CCGT	2	8	2643	2650	0 %	25 %	25 %	50 %	452119512
4	NC_020306	CGAC	2	8	2824	2831	25 %	0 %	25 %	50 %	452119512
5	NC_020306	ACCG	2	8	2915	2922	25 %	0 %	25 %	50 %	452119512
6	NC_020306	CATT	2	8	5208	5215	25 %	50 %	0 %	25 %	452119514
7	NC_020306	GCCA	2	8	5270	5277	25 %	0 %	25 %	50 %	452119514
8	NC_020306	CTGG	2	8	6039	6046	0 %	25 %	50 %	25 %	452119515
9	NC_020306	CTGG	2	8	6471	6478	0 %	25 %	50 %	25 %	452119515
10	NC_020306	CTGG	2	8	6670	6677	0 %	25 %	50 %	25 %	452119516
11	NC_020306	CAAC	2	8	6878	6885	50 %	0 %	0 %	50 %	452119517
12	NC_020306	GACG	2	8	7214	7221	25 %	0 %	50 %	25 %	452119518
13	NC_020306	GTAC	2	8	7822	7829	25 %	25 %	25 %	25 %	452119519
14	NC_020306	GAAA	2	8	8281	8288	75 %	0 %	25 %	0 %	452119520
15	NC_020306	TGGG	2	8	8939	8946	0 %	25 %	75 %	0 %	452119522
16	NC_020306	GCAT	2	8	9011	9018	25 %	25 %	25 %	25 %	452119522
17	NC_020306	CTGG	2	8	11227	11234	0 %	25 %	50 %	25 %	452119524
18	NC_020306	GCCG	2	8	11271	11278	0 %	0 %	50 %	50 %	452119524
19	NC_020306	GTCA	2	8	11499	11506	25 %	25 %	25 %	25 %	452119525
20	NC_020306	CCTG	2	8	11554	11561	0 %	25 %	25 %	50 %	452119525
21	NC_020306	GCTG	2	8	11672	11679	0 %	25 %	50 %	25 %	452119525
22	NC_020306	CAGT	2	8	11691	11698	25 %	25 %	25 %	25 %	452119525
23	NC_020306	ACAA	2	8	12827	12834	75 %	0 %	0 %	25 %	452119526
24	NC_020306	TGAA	2	8	13448	13455	50 %	25 %	25 %	0 %	452119526
25	NC_020306	GTTT	2	8	14237	14244	0 %	75 %	25 %	0 %	452119528
26	NC_020306	TTAT	2	8	14518	14525	25 %	75 %	0 %	0 %	452119528
27	NC_020306	AGCC	2	8	14563	14570	25 %	0 %	25 %	50 %	452119528
28	NC_020306	TGAT	2	8	14722	14729	25 %	50 %	25 %	0 %	452119528
29	NC_020306	CGTC	2	8	14819	14826	0 %	25 %	25 %	50 %	452119528
30	NC_020306	AGTC	2	8	14885	14892	25 %	25 %	25 %	25 %	452119528
31	NC_020306	TTCG	2	8	15021	15028	0 %	50 %	25 %	25 %	452119528
32	NC_020306	CTCA	2	8	15822	15829	25 %	25 %	0 %	50 %	452119528
33	NC_020306	ATGA	2	8	15852	15859	50 %	25 %	25 %	0 %	452119528
34	NC_020306	GTAA	2	8	16389	16396	50 %	25 %	25 %	0 %	452119528
35	NC_020306	TGAA	2	8	17550	17557	50 %	25 %	25 %	0 %	452119529
36	NC_020306	TGGG	2	8	18799	18806	0 %	25 %	75 %	0 %	452119531
37	NC_020306	TTAT	2	8	19158	19165	25 %	75 %	0 %	0 %	452119531
38	NC_020306	GAAA	2	8	19591	19598	75 %	0 %	25 %	0 %	452119532
39	NC_020306	ATTC	2	8	20095	20102	25 %	50 %	0 %	25 %	452119532
40	NC_020306	ATTT	2	8	21118	21125	25 %	75 %	0 %	0 %	452119533
41	NC_020306	CCTG	2	8	21644	21651	0 %	25 %	25 %	50 %	452119534
42	NC_020306	GAGC	2	8	21798	21805	25 %	0 %	50 %	25 %	452119534

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.