MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX_M

Total Repeats: 1894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020297	GGT	2	6	28553	28558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816819
502	NC_020297	AAG	2	6	28650	28655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816819
503	NC_020297	CGGAT	2	10	28743	28752	20 %	20 %	40 %	20 %	451816819
504	NC_020297	TG	3	6	28753	28758	0 %	50 %	50 %	0 %	451816819
505	NC_020297	CGC	3	9	28781	28789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816819
506	NC_020297	AACC	2	8	28970	28977	50 %	0 %	0 %	50 %	451816819
507	NC_020297	TGG	2	6	28992	28997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816819
508	NC_020297	G	7	7	29187	29193	0 %	0 %	100 %	0 %	451816819
509	NC_020297	A	7	7	29239	29245	100 %	0 %	0 %	0 %	451816819
510	NC_020297	CCA	2	6	29534	29539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816819
511	NC_020297	ACT	2	6	29584	29589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816819
512	NC_020297	ATT	2	6	29646	29651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816819
513	NC_020297	GTG	2	6	29700	29705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816819
514	NC_020297	CGG	2	6	29719	29724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816819
515	NC_020297	CCA	2	6	29734	29739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816819
516	NC_020297	TCG	2	6	29789	29794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816819
517	NC_020297	ATC	2	6	29807	29812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816819
518	NC_020297	A	7	7	29818	29824	100 %	0 %	0 %	0 %	451816819
519	NC_020297	ACT	2	6	29933	29938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816819
520	NC_020297	AACGGG	2	12	29965	29976	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	451816819
521	NC_020297	CCG	2	6	30083	30088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816819
522	NC_020297	CGA	2	6	30115	30120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816819
523	NC_020297	GGA	2	6	30128	30133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816819
524	NC_020297	CTG	2	6	30228	30233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816819
525	NC_020297	ATCG	2	8	30240	30247	25 %	25 %	25 %	25 %	451816819
526	NC_020297	CCA	2	6	30301	30306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816819
527	NC_020297	GGGGT	2	10	30422	30431	0 %	20 %	80 %	0 %	451816819
528	NC_020297	ATT	2	6	30485	30490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816819
529	NC_020297	GTA	2	6	30580	30585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816819
530	NC_020297	ACC	2	6	30703	30708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816819
531	NC_020297	GTC	2	6	30742	30747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816819
532	NC_020297	CCAT	2	8	30817	30824	25 %	25 %	0 %	50 %	451816819
533	NC_020297	C	6	6	30886	30891	0 %	0 %	0 %	100 %	451816819
534	NC_020297	CAC	2	6	30953	30958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816819
535	NC_020297	GTC	2	6	30991	30996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816819
536	NC_020297	AACTG	2	10	31067	31076	40 %	20 %	20 %	20 %	451816819
537	NC_020297	GGA	2	6	31121	31126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816819
538	NC_020297	GCC	2	6	31130	31135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816819
539	NC_020297	GTG	2	6	31185	31190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816819
540	NC_020297	CTA	2	6	31264	31269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816819
541	NC_020297	ACAA	2	8	31452	31459	75 %	0 %	0 %	25 %	451816820
542	NC_020297	TTG	2	6	31466	31471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816820
543	NC_020297	TCC	2	6	31496	31501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816820
544	NC_020297	CAC	2	6	31504	31509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816820
545	NC_020297	CGC	2	6	31556	31561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816820
546	NC_020297	TAC	2	6	31649	31654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816821
547	NC_020297	AGAA	2	8	31745	31752	75 %	0 %	25 %	0 %	451816821
548	NC_020297	GGCAA	2	10	31784	31793	40 %	0 %	40 %	20 %	451816821
549	NC_020297	TTG	2	6	32140	32145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816822
550	NC_020297	T	6	6	32206	32211	0 %	100 %	0 %	0 %	451816822
551	NC_020297	GGC	2	6	32218	32223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816822
552	NC_020297	TTG	3	9	32247	32255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816822
553	NC_020297	CCT	2	6	32274	32279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816822
554	NC_020297	TGGTT	2	10	32305	32314	0 %	60 %	40 %	0 %	451816822
555	NC_020297	GTC	2	6	32403	32408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816822
556	NC_020297	TTG	2	6	32414	32419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816822
557	NC_020297	ATT	2	6	32479	32484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816822
558	NC_020297	TGG	2	6	32521	32526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816822
559	NC_020297	T	6	6	32716	32721	0 %	100 %	0 %	0 %	451816823
560	NC_020297	GTTT	2	8	32853	32860	0 %	75 %	25 %	0 %	451816823
561	NC_020297	CAA	2	6	32907	32912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816824
562	NC_020297	TCAC	2	8	32963	32970	25 %	25 %	0 %	50 %	451816824
563	NC_020297	ACA	3	9	32978	32986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816824
564	NC_020297	GTG	2	6	33056	33061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816824
565	NC_020297	AAT	2	6	33106	33111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816824
566	NC_020297	CATC	2	8	33224	33231	25 %	25 %	0 %	50 %	451816824
567	NC_020297	TCTTCA	2	12	33248	33259	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	451816824
568	NC_020297	GGC	2	6	33310	33315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816824
569	NC_020297	ACC	2	6	33329	33334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816824
570	NC_020297	CCCA	2	8	33360	33367	25 %	0 %	0 %	75 %	451816824
571	NC_020297	GA	3	6	33431	33436	50 %	0 %	50 %	0 %	451816824
572	NC_020297	CTG	2	6	33441	33446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816824
573	NC_020297	TAA	2	6	33486	33491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816824
574	NC_020297	TTGA	2	8	33943	33950	25 %	50 %	25 %	0 %	451816825
575	NC_020297	GCG	2	6	33952	33957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816825
576	NC_020297	GAAG	2	8	33987	33994	50 %	0 %	50 %	0 %	451816825
577	NC_020297	TTG	2	6	34012	34017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816825
578	NC_020297	GCG	3	9	34027	34035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816825
579	NC_020297	AAC	2	6	34062	34067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816825
580	NC_020297	CTGAA	2	10	34082	34091	40 %	20 %	20 %	20 %	451816825
581	NC_020297	AGA	2	6	34098	34103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816825
582	NC_020297	TGG	2	6	34136	34141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816825
583	NC_020297	GTC	2	6	34199	34204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816825
584	NC_020297	GGT	2	6	34212	34217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816825
585	NC_020297	TTG	2	6	34225	34230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816825
586	NC_020297	AGA	2	6	34260	34265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816825
587	NC_020297	ATA	2	6	34276	34281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816825
588	NC_020297	TGA	2	6	34373	34378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816826
589	NC_020297	GGGGA	2	10	34480	34489	20 %	0 %	80 %	0 %	451816826
590	NC_020297	AGG	2	6	34502	34507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816826
591	NC_020297	TCA	2	6	34533	34538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816826
592	NC_020297	TAA	2	6	34557	34562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816826
593	NC_020297	ACC	2	6	34610	34615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816826
594	NC_020297	AT	3	6	34802	34807	50 %	50 %	0 %	0 %	451816827
595	NC_020297	ACT	2	6	34819	34824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816827
596	NC_020297	CAAT	2	8	34864	34871	50 %	25 %	0 %	25 %	451816827
597	NC_020297	GAT	2	6	34882	34887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816827
598	NC_020297	CAA	2	6	34892	34897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816827
599	NC_020297	CATGCA	2	12	34900	34911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451816827
600	NC_020297	ATG	2	6	34937	34942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816827
601	NC_020297	CCA	2	6	34948	34953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816827
602	NC_020297	ATG	2	6	35123	35128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816827
603	NC_020297	ATG	2	6	35150	35155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816827
604	NC_020297	GAT	2	6	35215	35220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816827
605	NC_020297	CCA	2	6	35224	35229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816827
606	NC_020297	TGA	2	6	35241	35246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816827
607	NC_020297	GATG	2	8	35296	35303	25 %	25 %	50 %	0 %	451816827
608	NC_020297	TTG	2	6	35387	35392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816828
609	NC_020297	TGG	2	6	35394	35399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816828
610	NC_020297	GCTA	2	8	35524	35531	25 %	25 %	25 %	25 %	451816828
611	NC_020297	GAT	2	6	35672	35677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816828
612	NC_020297	TTAA	2	8	35681	35688	50 %	50 %	0 %	0 %	451816828
613	NC_020297	CAG	2	6	35759	35764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816828
614	NC_020297	GATTA	2	10	35784	35793	40 %	40 %	20 %	0 %	451816828
615	NC_020297	GTA	2	6	35807	35812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816828
616	NC_020297	CAA	2	6	35885	35890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816828
617	NC_020297	AGT	2	6	35897	35902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816828
618	NC_020297	CGG	2	6	35934	35939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816828
619	NC_020297	CCA	2	6	35943	35948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816828
620	NC_020297	TGT	2	6	35953	35958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816828
621	NC_020297	ATT	2	6	36080	36085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816829
622	NC_020297	TTA	2	6	36113	36118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816829
623	NC_020297	ATG	2	6	36235	36240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816829
624	NC_020297	ACA	2	6	36257	36262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816829
625	NC_020297	TAT	2	6	36381	36386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816829
626	NC_020297	ATT	2	6	36413	36418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816829
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628	NC_020297	ACC	2	6	36534	36539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816829
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