MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSG_M

Total Repeats: 625

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020288	ACA	2	6	35945	35950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816528
502	NC_020288	AGG	2	6	35975	35980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816528
503	NC_020288	CCT	2	6	36059	36064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816528
504	NC_020288	ACG	2	6	36068	36073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816528
505	NC_020288	GT	3	6	36108	36113	0 %	50 %	50 %	0 %	451816528
506	NC_020288	TCA	2	6	36129	36134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816528
507	NC_020288	CAG	3	9	36183	36191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816528
508	NC_020288	GAAT	2	8	36272	36279	50 %	25 %	25 %	0 %	451816528
509	NC_020288	AGC	2	6	36315	36320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816528
510	NC_020288	TTC	2	6	36883	36888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816529
511	NC_020288	ACT	2	6	36896	36901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816529
512	NC_020288	CTT	2	6	36988	36993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816529
513	NC_020288	AATT	2	8	37015	37022	50 %	50 %	0 %	0 %	451816529
514	NC_020288	CTAC	2	8	37089	37096	25 %	25 %	0 %	50 %	451816529
515	NC_020288	TTC	2	6	37121	37126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816529
516	NC_020288	TGG	2	6	37341	37346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816530
517	NC_020288	CTT	2	6	37478	37483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816530
518	NC_020288	ATT	2	6	37596	37601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816530
519	NC_020288	GAT	2	6	37619	37624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816530
520	NC_020288	GATA	2	8	37709	37716	50 %	25 %	25 %	0 %	451816530
521	NC_020288	T	7	7	37720	37726	0 %	100 %	0 %	0 %	451816530
522	NC_020288	AGA	2	6	37768	37773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816530
523	NC_020288	TAAGTA	2	12	37803	37814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451816530
524	NC_020288	TAA	2	6	37874	37879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816530
525	NC_020288	GTT	2	6	37922	37927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816530
526	NC_020288	TCT	2	6	37928	37933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816530
527	NC_020288	GGA	2	6	37957	37962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816530
528	NC_020288	TGT	2	6	37999	38004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816530
529	NC_020288	GGAGT	2	10	38017	38026	20 %	20 %	60 %	0 %	451816530
530	NC_020288	GTT	2	6	38404	38409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816531
531	NC_020288	AAT	2	6	38443	38448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816531
532	NC_020288	CGGCAA	2	12	38458	38469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816531
533	NC_020288	ACC	2	6	38471	38476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816531
534	NC_020288	CGA	3	9	38530	38538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816531
535	NC_020288	TAG	2	6	38542	38547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816531
536	NC_020288	TCA	2	6	38596	38601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816531
537	NC_020288	A	7	7	38692	38698	100 %	0 %	0 %	0 %	451816532
538	NC_020288	CTT	2	6	38714	38719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816532
539	NC_020288	ATT	2	6	38767	38772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816532
540	NC_020288	GAGG	2	8	38790	38797	25 %	0 %	75 %	0 %	451816532
541	NC_020288	T	7	7	38877	38883	0 %	100 %	0 %	0 %	451816532
542	NC_020288	TCT	2	6	38889	38894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816532
543	NC_020288	CTA	2	6	38900	38905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816532
544	NC_020288	T	7	7	38949	38955	0 %	100 %	0 %	0 %	451816532
545	NC_020288	T	7	7	38958	38964	0 %	100 %	0 %	0 %	451816532
546	NC_020288	ACT	2	6	39030	39035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816532
547	NC_020288	TCC	2	6	39082	39087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816533
548	NC_020288	TTTC	2	8	39091	39098	0 %	75 %	0 %	25 %	451816533
549	NC_020288	T	9	9	39114	39122	0 %	100 %	0 %	0 %	451816533
550	NC_020288	ATTTTC	2	12	39129	39140	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451816533
551	NC_020288	TCT	2	6	39216	39221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816533
552	NC_020288	T	7	7	39227	39233	0 %	100 %	0 %	0 %	451816533
553	NC_020288	TCC	2	6	39359	39364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816533
554	NC_020288	TA	3	6	39371	39376	50 %	50 %	0 %	0 %	451816533
555	NC_020288	CTA	2	6	39379	39384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816533
556	NC_020288	TA	3	6	39486	39491	50 %	50 %	0 %	0 %	451816534
557	NC_020288	CCG	2	6	39504	39509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816534
558	NC_020288	AAG	2	6	39510	39515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816534
559	NC_020288	GAC	2	6	39637	39642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816534
560	NC_020288	AGC	2	6	39666	39671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816534
561	NC_020288	AGA	2	6	39715	39720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816534
562	NC_020288	GACA	2	8	39727	39734	50 %	0 %	25 %	25 %	451816534
563	NC_020288	AGG	2	6	39823	39828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816534
564	NC_020288	TA	3	6	39836	39841	50 %	50 %	0 %	0 %	451816534
565	NC_020288	CT	3	6	39892	39897	0 %	50 %	0 %	50 %	451816534
566	NC_020288	AC	3	6	39936	39941	50 %	0 %	0 %	50 %	451816534
567	NC_020288	GCG	2	6	39951	39956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816534
568	NC_020288	AAG	2	6	40092	40097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816534
569	NC_020288	GCA	2	6	40106	40111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816534
570	NC_020288	TAA	2	6	40225	40230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816534
571	NC_020288	GCT	2	6	40324	40329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816534
572	NC_020288	TAA	2	6	40404	40409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816534
573	NC_020288	AGA	2	6	40426	40431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816534
574	NC_020288	CCAAG	2	10	40450	40459	40 %	0 %	20 %	40 %	451816534
575	NC_020288	GCA	2	6	40480	40485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816534
576	NC_020288	TAC	2	6	40494	40499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816534
577	NC_020288	GCG	2	6	40542	40547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816534
578	NC_020288	ACA	2	6	40557	40562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816534
579	NC_020288	AAC	2	6	40572	40577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816534
580	NC_020288	AAG	2	6	40579	40584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816534
581	NC_020288	ACAAA	2	10	40687	40696	80 %	0 %	0 %	20 %	451816534
582	NC_020288	CTT	2	6	40726	40731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816534
583	NC_020288	TTC	2	6	40739	40744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816534
584	NC_020288	CGC	2	6	40795	40800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816534
585	NC_020288	AG	3	6	40818	40823	50 %	0 %	50 %	0 %	451816534
586	NC_020288	CAG	2	6	40825	40830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816534
587	NC_020288	TAG	2	6	40881	40886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816534
588	NC_020288	GTA	2	6	41086	41091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816535
589	NC_020288	TA	3	6	41095	41100	50 %	50 %	0 %	0 %	451816535
590	NC_020288	GGA	2	6	41107	41112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816535
591	NC_020288	A	7	7	41238	41244	100 %	0 %	0 %	0 %	451816535
592	NC_020288	AGA	2	6	41250	41255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816535
593	NC_020288	GAAAAT	2	12	41331	41342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816535
594	NC_020288	A	9	9	41349	41357	100 %	0 %	0 %	0 %	451816535
595	NC_020288	GAAA	2	8	41373	41380	75 %	0 %	25 %	0 %	451816535
596	NC_020288	GGA	2	6	41384	41389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816535
597	NC_020288	TAG	2	6	41435	41440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816536
598	NC_020288	A	7	7	41507	41513	100 %	0 %	0 %	0 %	451816536
599	NC_020288	A	7	7	41516	41522	100 %	0 %	0 %	0 %	451816536
600	NC_020288	TAG	2	6	41566	41571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816536
601	NC_020288	GAA	2	6	41578	41583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816536
602	NC_020288	A	7	7	41588	41594	100 %	0 %	0 %	0 %	451816536
603	NC_020288	CCCT	2	8	41673	41680	0 %	25 %	0 %	75 %	451816536
604	NC_020288	TAA	2	6	41698	41703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816536
605	NC_020288	AAG	2	6	41752	41757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816536
606	NC_020288	T	7	7	41773	41779	0 %	100 %	0 %	0 %	451816536
607	NC_020288	TGA	2	6	41870	41875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816536
608	NC_020288	CTA	2	6	42018	42023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816537
609	NC_020288	ATT	2	6	42108	42113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816537
610	NC_020288	TCT	2	6	42149	42154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816537
611	NC_020288	GAA	2	6	42159	42164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816537
612	NC_020288	CTAT	2	8	42261	42268	25 %	50 %	0 %	25 %	451816538
613	NC_020288	TAG	2	6	42302	42307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816538
614	NC_020288	ACG	2	6	42327	42332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816538
615	NC_020288	AGGC	2	8	42339	42346	25 %	0 %	50 %	25 %	451816538
616	NC_020288	T	6	6	42354	42359	0 %	100 %	0 %	0 %	451816538
617	NC_020288	TTG	2	6	42506	42511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816538
618	NC_020288	TGG	2	6	42534	42539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816538
619	NC_020288	G	6	6	42550	42555	0 %	0 %	100 %	0 %	451816538
620	NC_020288	TGG	2	6	42605	42610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816538
621	NC_020288	CCA	2	6	42622	42627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816538
622	NC_020288	GTT	2	6	42721	42726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816538
623	NC_020288	CAAG	2	8	42735	42742	50 %	0 %	25 %	25 %	451816538
624	NC_020288	GGA	2	6	42816	42821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816538
625	NC_020288	GTG	3	9	42891	42899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816538

< Previous 12Next >