MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA_M

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020287	CCATC	2	10	761	770	20 %	20 %	0 %	60 %	451816676
2	NC_020287	TTTTA	2	10	937	946	20 %	80 %	0 %	0 %	451816676
3	NC_020287	AATTA	2	10	2018	2027	60 %	40 %	0 %	0 %	451816678
4	NC_020287	CCTGG	2	10	2545	2554	0 %	20 %	40 %	40 %	451816679
5	NC_020287	AATTT	2	10	9062	9071	40 %	60 %	0 %	0 %	451816685
6	NC_020287	GAAAT	2	10	9414	9423	60 %	20 %	20 %	0 %	451816685
7	NC_020287	CAAAA	2	10	10090	10099	80 %	0 %	0 %	20 %	451816685
8	NC_020287	GATCA	2	10	13184	13193	40 %	20 %	20 %	20 %	451816687
9	NC_020287	GCATC	2	10	18527	18536	20 %	20 %	20 %	40 %	451816694
10	NC_020287	TGATT	2	10	20054	20063	20 %	60 %	20 %	0 %	451816695
11	NC_020287	TGGAA	2	10	21382	21391	40 %	20 %	40 %	0 %	451816695
12	NC_020287	CAATC	2	10	29430	29439	40 %	20 %	0 %	40 %	451816706
13	NC_020287	GAATT	2	10	30825	30834	40 %	40 %	20 %	0 %	451816708
14	NC_020287	TTACC	2	10	31346	31355	20 %	40 %	0 %	40 %	451816708
15	NC_020287	CAAGC	2	10	31424	31433	40 %	0 %	20 %	40 %	451816708
16	NC_020287	ATTGA	2	10	33778	33787	40 %	40 %	20 %	0 %	451816709
17	NC_020287	ATTGG	2	10	33829	33838	20 %	40 %	40 %	0 %	451816710
18	NC_020287	ACCCC	2	10	33938	33947	20 %	0 %	0 %	80 %	451816710
19	NC_020287	CAAGC	2	10	40744	40753	40 %	0 %	20 %	40 %	451816721
20	NC_020287	GGGGC	2	10	43004	43013	0 %	0 %	80 %	20 %	451816725
21	NC_020287	GCATT	2	10	43588	43597	20 %	40 %	20 %	20 %	451816726
22	NC_020287	AGAGG	2	10	44335	44344	40 %	0 %	60 %	0 %	451816727
23	NC_020287	GAAGG	2	10	46140	46149	40 %	0 %	60 %	0 %	451816729
24	NC_020287	TAATT	2	10	47805	47814	40 %	60 %	0 %	0 %	451816731
25	NC_020287	TCTCC	2	10	48696	48705	0 %	40 %	0 %	60 %	451816731
26	NC_020287	TTGCC	2	10	49961	49970	0 %	40 %	20 %	40 %	451816732
27	NC_020287	AGCAA	2	10	50115	50124	60 %	0 %	20 %	20 %	451816732
28	NC_020287	TTGTT	2	10	54668	54677	0 %	80 %	20 %	0 %	451816736
29	NC_020287	TTTTC	2	10	56378	56387	0 %	80 %	0 %	20 %	451816737
30	NC_020287	AAAAT	2	10	58277	58286	80 %	20 %	0 %	0 %	451816737
31	NC_020287	AAAAT	2	10	60136	60145	80 %	20 %	0 %	0 %	451816738
32	NC_020287	TTTGG	2	10	61304	61313	0 %	60 %	40 %	0 %	451816739
33	NC_020287	GGGCT	2	10	61327	61336	0 %	20 %	60 %	20 %	451816739
34	NC_020287	TGGCG	2	10	65076	65085	0 %	20 %	60 %	20 %	451816746
35	NC_020287	TCGTA	2	10	65558	65567	20 %	40 %	20 %	20 %	451816746
36	NC_020287	GCCAT	2	10	73668	73677	20 %	20 %	20 %	40 %	451816752
37	NC_020287	ATGGA	2	10	73951	73960	40 %	20 %	40 %	0 %	451816752
38	NC_020287	TCAGC	2	10	74009	74018	20 %	20 %	20 %	40 %	451816752
39	NC_020287	CCCAA	2	10	80618	80627	40 %	0 %	0 %	60 %	451816758
40	NC_020287	TCTTG	2	10	85817	85826	0 %	60 %	20 %	20 %	451816762
41	NC_020287	CACCC	2	10	86438	86447	20 %	0 %	0 %	80 %	451816763
42	NC_020287	CGGAG	2	10	92383	92392	20 %	0 %	60 %	20 %	451816768

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.