MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA_M

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020287	TCTT	2	8	1024	1031	0 %	75 %	0 %	25 %	451816676
2	NC_020287	CTTC	2	8	1211	1218	0 %	50 %	0 %	50 %	451816676
3	NC_020287	CAAA	2	8	1426	1433	75 %	0 %	0 %	25 %	451816677
4	NC_020287	ATCA	2	8	1798	1805	50 %	25 %	0 %	25 %	451816677
5	NC_020287	CCCG	2	8	1968	1975	0 %	0 %	25 %	75 %	451816678
6	NC_020287	TGAA	2	8	2396	2403	50 %	25 %	25 %	0 %	451816679
7	NC_020287	GGCA	2	8	2418	2425	25 %	0 %	50 %	25 %	451816679
8	NC_020287	TATC	2	8	4274	4281	25 %	50 %	0 %	25 %	451816682
9	NC_020287	GCAA	2	8	4439	4446	50 %	0 %	25 %	25 %	451816682
10	NC_020287	AGGA	2	8	4508	4515	50 %	0 %	50 %	0 %	451816682
11	NC_020287	ATTA	2	8	5508	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	451816683
12	NC_020287	TAAA	2	8	6006	6013	75 %	25 %	0 %	0 %	451816683
13	NC_020287	CTGC	2	8	6613	6620	0 %	25 %	25 %	50 %	451816684
14	NC_020287	CAAT	2	8	8312	8319	50 %	25 %	0 %	25 %	451816684
15	NC_020287	ATTT	2	8	8665	8672	25 %	75 %	0 %	0 %	451816685
16	NC_020287	TACT	2	8	9144	9151	25 %	50 %	0 %	25 %	451816685
17	NC_020287	ATTT	2	8	9377	9384	25 %	75 %	0 %	0 %	451816685
18	NC_020287	TTCC	2	8	10287	10294	0 %	50 %	0 %	50 %	451816685
19	NC_020287	TATC	2	8	10324	10331	25 %	50 %	0 %	25 %	451816685
20	NC_020287	AATT	2	8	11178	11185	50 %	50 %	0 %	0 %	451816685
21	NC_020287	AACT	2	8	11453	11460	50 %	25 %	0 %	25 %	451816685
22	NC_020287	AAAC	2	8	11722	11729	75 %	0 %	0 %	25 %	451816686
23	NC_020287	TTGG	2	8	12178	12185	0 %	50 %	50 %	0 %	451816686
24	NC_020287	TAAA	2	8	12320	12327	75 %	25 %	0 %	0 %	451816686
25	NC_020287	GTAG	2	8	13067	13074	25 %	25 %	50 %	0 %	451816687
26	NC_020287	TTTA	2	8	13300	13307	25 %	75 %	0 %	0 %	451816687
27	NC_020287	TAAT	2	8	13432	13439	50 %	50 %	0 %	0 %	451816687
28	NC_020287	GGGT	2	8	14092	14099	0 %	25 %	75 %	0 %	451816688
29	NC_020287	ACTT	2	8	14101	14108	25 %	50 %	0 %	25 %	451816688
30	NC_020287	CTTA	2	8	14244	14251	25 %	50 %	0 %	25 %	451816689
31	NC_020287	CAAT	2	8	15154	15161	50 %	25 %	0 %	25 %	451816690
32	NC_020287	GAGT	2	8	15655	15662	25 %	25 %	50 %	0 %	451816690
33	NC_020287	TACC	2	8	15691	15698	25 %	25 %	0 %	50 %	451816690
34	NC_020287	GTTT	2	8	15874	15881	0 %	75 %	25 %	0 %	451816691
35	NC_020287	GTCA	2	8	15938	15945	25 %	25 %	25 %	25 %	451816691
36	NC_020287	TCCC	2	8	17369	17376	0 %	25 %	0 %	75 %	451816692
37	NC_020287	GAAA	2	8	18433	18440	75 %	0 %	25 %	0 %	451816694
38	NC_020287	GTTT	2	8	18494	18501	0 %	75 %	25 %	0 %	451816694
39	NC_020287	AAAC	2	8	20135	20142	75 %	0 %	0 %	25 %	451816695
40	NC_020287	ATTT	2	8	20254	20261	25 %	75 %	0 %	0 %	451816695
41	NC_020287	ACAA	2	8	20437	20444	75 %	0 %	0 %	25 %	451816695
42	NC_020287	GGAG	2	8	20699	20706	25 %	0 %	75 %	0 %	451816695
43	NC_020287	CTTC	2	8	20874	20881	0 %	50 %	0 %	50 %	451816695
44	NC_020287	TTGG	2	8	20962	20969	0 %	50 %	50 %	0 %	451816695
45	NC_020287	AAAG	2	8	21524	21531	75 %	0 %	25 %	0 %	451816695
46	NC_020287	CTTT	2	8	22956	22963	0 %	75 %	0 %	25 %	451816698
47	NC_020287	CTCA	2	8	24277	24284	25 %	25 %	0 %	50 %	451816699
48	NC_020287	GGTA	2	8	25090	25097	25 %	25 %	50 %	0 %	451816699
49	NC_020287	CACT	2	8	25342	25349	25 %	25 %	0 %	50 %	451816700
50	NC_020287	GGAA	2	8	25673	25680	50 %	0 %	50 %	0 %	451816700
51	NC_020287	ACCC	2	8	25869	25876	25 %	0 %	0 %	75 %	451816700
52	NC_020287	AATT	2	8	26586	26593	50 %	50 %	0 %	0 %	451816701
53	NC_020287	TAAG	2	8	26742	26749	50 %	25 %	25 %	0 %	451816701
54	NC_020287	CAAA	2	8	28242	28249	75 %	0 %	0 %	25 %	451816703
55	NC_020287	ACAA	2	8	28408	28415	75 %	0 %	0 %	25 %	451816704
56	NC_020287	CATT	2	8	28430	28437	25 %	50 %	0 %	25 %	451816704
57	NC_020287	CCAC	2	8	28889	28896	25 %	0 %	0 %	75 %	451816705
58	NC_020287	ACCA	2	8	29999	30006	50 %	0 %	0 %	50 %	451816707
59	NC_020287	CACC	2	8	31300	31307	25 %	0 %	0 %	75 %	451816708
60	NC_020287	CTGT	2	8	32064	32071	0 %	50 %	25 %	25 %	451816708
61	NC_020287	CTCC	2	8	32206	32213	0 %	25 %	0 %	75 %	451816708
62	NC_020287	CAAA	2	8	32707	32714	75 %	0 %	0 %	25 %	451816708
63	NC_020287	TCAA	2	8	32886	32893	50 %	25 %	0 %	25 %	451816708
64	NC_020287	CCCA	2	8	34506	34513	25 %	0 %	0 %	75 %	451816712
65	NC_020287	GTTG	2	8	34640	34647	0 %	50 %	50 %	0 %	451816712
66	NC_020287	TCCT	2	8	34648	34655	0 %	50 %	0 %	50 %	451816712
67	NC_020287	GTAA	2	8	35494	35501	50 %	25 %	25 %	0 %	451816714
68	NC_020287	TTTC	2	8	35640	35647	0 %	75 %	0 %	25 %	451816714
69	NC_020287	TGGC	2	8	35989	35996	0 %	25 %	50 %	25 %	451816715
70	NC_020287	CATT	2	8	37843	37850	25 %	50 %	0 %	25 %	451816717
71	NC_020287	CCAA	2	8	37946	37953	50 %	0 %	0 %	50 %	451816717
72	NC_020287	AGGT	2	8	38096	38103	25 %	25 %	50 %	0 %	451816717
73	NC_020287	TGAT	2	8	38852	38859	25 %	50 %	25 %	0 %	451816718
74	NC_020287	TGAC	2	8	39023	39030	25 %	25 %	25 %	25 %	451816719
75	NC_020287	AGCA	2	8	39233	39240	50 %	0 %	25 %	25 %	451816719
76	NC_020287	GATA	2	8	41589	41596	50 %	25 %	25 %	0 %	451816722
77	NC_020287	TCCC	2	8	41841	41848	0 %	25 %	0 %	75 %	451816723
78	NC_020287	ACTA	2	8	41849	41856	50 %	25 %	0 %	25 %	451816723
79	NC_020287	TAGG	2	8	42582	42589	25 %	25 %	50 %	0 %	451816724
80	NC_020287	AGGG	2	8	43203	43210	25 %	0 %	75 %	0 %	451816725
81	NC_020287	AATT	2	8	43478	43485	50 %	50 %	0 %	0 %	451816726
82	NC_020287	ATGT	2	8	43608	43615	25 %	50 %	25 %	0 %	451816726
83	NC_020287	GGGA	2	8	44302	44309	25 %	0 %	75 %	0 %	451816727
84	NC_020287	CTCC	2	8	44374	44381	0 %	25 %	0 %	75 %	451816727
85	NC_020287	GGCG	2	8	44499	44506	0 %	0 %	75 %	25 %	451816727
86	NC_020287	ATTT	2	8	44546	44553	25 %	75 %	0 %	0 %	451816727
87	NC_020287	TCTT	2	8	46320	46327	0 %	75 %	0 %	25 %	451816729
88	NC_020287	AGTT	2	8	47046	47053	25 %	50 %	25 %	0 %	451816731
89	NC_020287	TGAT	2	8	47177	47184	25 %	50 %	25 %	0 %	451816731
90	NC_020287	GTTG	2	8	47897	47904	0 %	50 %	50 %	0 %	451816731
91	NC_020287	CCAA	2	8	47987	47994	50 %	0 %	0 %	50 %	451816731
92	NC_020287	ACTG	2	8	49441	49448	25 %	25 %	25 %	25 %	451816732
93	NC_020287	CCTA	2	8	49612	49619	25 %	25 %	0 %	50 %	451816732
94	NC_020287	AGAA	2	8	49734	49741	75 %	0 %	25 %	0 %	451816732
95	NC_020287	AGTG	2	8	50077	50084	25 %	25 %	50 %	0 %	451816732
96	NC_020287	CAAA	2	8	50351	50358	75 %	0 %	0 %	25 %	451816732
97	NC_020287	GTGG	2	8	50578	50585	0 %	25 %	75 %	0 %	451816733
98	NC_020287	CATT	2	8	50903	50910	25 %	50 %	0 %	25 %	451816733
99	NC_020287	ATTG	2	8	51147	51154	25 %	50 %	25 %	0 %	451816733
100	NC_020287	GATT	2	8	51516	51523	25 %	50 %	25 %	0 %	451816733
101	NC_020287	GTCT	2	8	51945	51952	0 %	50 %	25 %	25 %	451816734
102	NC_020287	TTGA	2	8	52521	52528	25 %	50 %	25 %	0 %	451816734
103	NC_020287	TAAT	2	8	52832	52839	50 %	50 %	0 %	0 %	451816734
104	NC_020287	TCGT	2	8	52908	52915	0 %	50 %	25 %	25 %	451816734
105	NC_020287	CATA	2	8	53192	53199	50 %	25 %	0 %	25 %	451816734
106	NC_020287	GAAG	2	8	53698	53705	50 %	0 %	50 %	0 %	451816734
107	NC_020287	TTAA	2	8	54011	54018	50 %	50 %	0 %	0 %	451816735
108	NC_020287	GCCA	2	8	54162	54169	25 %	0 %	25 %	50 %	451816735
109	NC_020287	AACT	2	8	54406	54413	50 %	25 %	0 %	25 %	451816735
110	NC_020287	TGAC	2	8	54724	54731	25 %	25 %	25 %	25 %	451816736
111	NC_020287	GATT	2	8	55226	55233	25 %	50 %	25 %	0 %	451816736
112	NC_020287	ATCG	2	8	55386	55393	25 %	25 %	25 %	25 %	451816736
113	NC_020287	GGTA	2	8	55475	55482	25 %	25 %	50 %	0 %	451816736
114	NC_020287	CGAT	2	8	55789	55796	25 %	25 %	25 %	25 %	451816736
115	NC_020287	CCCT	2	8	55804	55811	0 %	25 %	0 %	75 %	451816736
116	NC_020287	AGCT	2	8	55868	55875	25 %	25 %	25 %	25 %	451816736
117	NC_020287	CCAC	2	8	56041	56048	25 %	0 %	0 %	75 %	451816736
118	NC_020287	AATT	2	8	57369	57376	50 %	50 %	0 %	0 %	451816737
119	NC_020287	CAAA	3	12	57528	57539	75 %	0 %	0 %	25 %	451816737
120	NC_020287	ATTT	2	8	57810	57817	25 %	75 %	0 %	0 %	451816737
121	NC_020287	TCTT	2	8	58085	58092	0 %	75 %	0 %	25 %	451816737
122	NC_020287	TTCC	2	8	58751	58758	0 %	50 %	0 %	50 %	451816738
123	NC_020287	TAAC	2	8	58777	58784	50 %	25 %	0 %	25 %	451816738
124	NC_020287	TAAT	2	8	59045	59052	50 %	50 %	0 %	0 %	451816738
125	NC_020287	GCAG	2	8	59115	59122	25 %	0 %	50 %	25 %	451816738
126	NC_020287	TCTG	2	8	59179	59186	0 %	50 %	25 %	25 %	451816738
127	NC_020287	AAAG	2	8	59368	59375	75 %	0 %	25 %	0 %	451816738
128	NC_020287	GTTT	2	8	59403	59410	0 %	75 %	25 %	0 %	451816738
129	NC_020287	ACTG	2	8	59595	59602	25 %	25 %	25 %	25 %	451816738
130	NC_020287	AGGC	2	8	59648	59655	25 %	0 %	50 %	25 %	451816738
131	NC_020287	TAAT	2	8	59864	59871	50 %	50 %	0 %	0 %	451816738
132	NC_020287	AAAT	2	8	60753	60760	75 %	25 %	0 %	0 %	451816739
133	NC_020287	CAAA	2	8	60837	60844	75 %	0 %	0 %	25 %	451816739
134	NC_020287	GATC	2	8	61117	61124	25 %	25 %	25 %	25 %	451816739
135	NC_020287	TTGG	2	8	61129	61136	0 %	50 %	50 %	0 %	451816739
136	NC_020287	CAAA	2	8	62488	62495	75 %	0 %	0 %	25 %	451816742
137	NC_020287	CAGG	2	8	63065	63072	25 %	0 %	50 %	25 %	451816742
138	NC_020287	CTTT	2	8	63310	63317	0 %	75 %	0 %	25 %	451816742
139	NC_020287	TGCT	2	8	64296	64303	0 %	50 %	25 %	25 %	451816745
140	NC_020287	TCAA	2	8	70351	70358	50 %	25 %	0 %	25 %	451816748
141	NC_020287	GGTT	2	8	71081	71088	0 %	50 %	50 %	0 %	451816749
142	NC_020287	AACC	2	8	72394	72401	50 %	0 %	0 %	50 %	451816750
143	NC_020287	GTTA	2	8	72602	72609	25 %	50 %	25 %	0 %	451816751
144	NC_020287	GCCA	2	8	72695	72702	25 %	0 %	25 %	50 %	451816751
145	NC_020287	TTGA	2	8	72914	72921	25 %	50 %	25 %	0 %	451816751
146	NC_020287	AGCC	2	8	73267	73274	25 %	0 %	25 %	50 %	451816751
147	NC_020287	TTAC	2	8	74448	74455	25 %	50 %	0 %	25 %	451816752
148	NC_020287	CAAG	2	8	74924	74931	50 %	0 %	25 %	25 %	451816752
149	NC_020287	TTTA	2	8	75676	75683	25 %	75 %	0 %	0 %	451816753
150	NC_020287	GCTC	2	8	76280	76287	0 %	25 %	25 %	50 %	451816754
151	NC_020287	ACAG	2	8	76318	76325	50 %	0 %	25 %	25 %	451816754
152	NC_020287	GGGC	2	8	76368	76375	0 %	0 %	75 %	25 %	451816754
153	NC_020287	TAGC	2	8	76721	76728	25 %	25 %	25 %	25 %	451816754
154	NC_020287	TTAG	2	8	76957	76964	25 %	50 %	25 %	0 %	451816754
155	NC_020287	AATT	2	8	77384	77391	50 %	50 %	0 %	0 %	451816755
156	NC_020287	TCTT	2	8	77886	77893	0 %	75 %	0 %	25 %	451816756
157	NC_020287	AATT	2	8	78101	78108	50 %	50 %	0 %	0 %	451816756
158	NC_020287	AAAG	2	8	78188	78195	75 %	0 %	25 %	0 %	451816756
159	NC_020287	TAAA	2	8	78266	78273	75 %	25 %	0 %	0 %	451816756
160	NC_020287	CATT	2	8	78579	78586	25 %	50 %	0 %	25 %	451816756
161	NC_020287	TATT	2	8	78721	78728	25 %	75 %	0 %	0 %	451816756
162	NC_020287	TTCC	2	8	78889	78896	0 %	50 %	0 %	50 %	451816756
163	NC_020287	ATTA	2	8	79633	79640	50 %	50 %	0 %	0 %	451816757
164	NC_020287	CGCC	2	8	80161	80168	0 %	0 %	25 %	75 %	451816758
165	NC_020287	GATT	2	8	80373	80380	25 %	50 %	25 %	0 %	451816758
166	NC_020287	GAAT	2	8	80383	80390	50 %	25 %	25 %	0 %	451816758
167	NC_020287	TAAA	2	8	80450	80457	75 %	25 %	0 %	0 %	451816758
168	NC_020287	GGTT	2	8	81456	81463	0 %	50 %	50 %	0 %	451816760
169	NC_020287	CTGC	2	8	83350	83357	0 %	25 %	25 %	50 %	451816761
170	NC_020287	TTGG	2	8	83388	83395	0 %	50 %	50 %	0 %	451816761
171	NC_020287	ACCA	2	8	83698	83705	50 %	0 %	0 %	50 %	451816761
172	NC_020287	CCTG	2	8	84022	84029	0 %	25 %	25 %	50 %	451816761
173	NC_020287	TGGG	2	8	84388	84395	0 %	25 %	75 %	0 %	451816761
174	NC_020287	CTGG	2	8	84677	84684	0 %	25 %	50 %	25 %	451816761
175	NC_020287	GGCT	2	8	84869	84876	0 %	25 %	50 %	25 %	451816761
176	NC_020287	TTGC	2	8	85556	85563	0 %	50 %	25 %	25 %	451816761
177	NC_020287	TGGC	2	8	86347	86354	0 %	25 %	50 %	25 %	451816763
178	NC_020287	CGAT	2	8	86463	86470	25 %	25 %	25 %	25 %	451816763
179	NC_020287	TTGA	2	8	86690	86697	25 %	50 %	25 %	0 %	451816763
180	NC_020287	TATT	2	8	87013	87020	25 %	75 %	0 %	0 %	451816763
181	NC_020287	ATCA	2	8	87225	87232	50 %	25 %	0 %	25 %	451816764
182	NC_020287	GGTT	2	8	91010	91017	0 %	50 %	50 %	0 %	451816765
183	NC_020287	CCAG	2	8	91148	91155	25 %	0 %	25 %	50 %	451816766
184	NC_020287	ATTT	2	8	91236	91243	25 %	75 %	0 %	0 %	451816766
185	NC_020287	TTAC	2	8	93256	93263	25 %	50 %	0 %	25 %	451816769
186	NC_020287	TGCT	2	8	93666	93673	0 %	50 %	25 %	25 %	451816769
187	NC_020287	ATTG	2	8	93807	93814	25 %	50 %	25 %	0 %	451816770
188	NC_020287	CGGA	2	8	94311	94318	25 %	0 %	50 %	25 %	451816770
189	NC_020287	CGTT	2	8	95352	95359	0 %	50 %	25 %	25 %	451816771
190	NC_020287	CAAC	2	8	96437	96444	50 %	0 %	0 %	50 %	451816772
191	NC_020287	AGCA	2	8	97372	97379	50 %	0 %	25 %	25 %	451816773
192	NC_020287	TAAT	2	8	97555	97562	50 %	50 %	0 %	0 %	451816773
193	NC_020287	GAAA	2	8	98540	98547	75 %	0 %	25 %	0 %	451816775
194	NC_020287	CCCT	2	8	98840	98847	0 %	25 %	0 %	75 %	451816776

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.