MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA_M

Total Repeats: 1446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020287	CGA	2	6	32383	32388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816708
502	NC_020287	CGC	3	9	32458	32466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816708
503	NC_020287	C	6	6	32466	32471	0 %	0 %	0 %	100 %	451816708
504	NC_020287	GAT	2	6	32477	32482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816708
505	NC_020287	CAG	2	6	32500	32505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816708
506	NC_020287	A	6	6	32544	32549	100 %	0 %	0 %	0 %	451816708
507	NC_020287	CGA	2	6	32575	32580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816708
508	NC_020287	CTA	2	6	32641	32646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816708
509	NC_020287	CAAA	2	8	32707	32714	75 %	0 %	0 %	25 %	451816708
510	NC_020287	TGA	2	6	32866	32871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816708
511	NC_020287	TCAA	2	8	32886	32893	50 %	25 %	0 %	25 %	451816708
512	NC_020287	C	6	6	33026	33031	0 %	0 %	0 %	100 %	451816708
513	NC_020287	GAC	2	6	33032	33037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816708
514	NC_020287	CTT	2	6	33102	33107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816708
515	NC_020287	CTT	2	6	33686	33691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816709
516	NC_020287	GGC	2	6	33696	33701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816709
517	NC_020287	CGG	2	6	33743	33748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816709
518	NC_020287	ATTGA	2	10	33778	33787	40 %	40 %	20 %	0 %	451816709
519	NC_020287	ATTGG	2	10	33829	33838	20 %	40 %	40 %	0 %	451816710
520	NC_020287	CGC	2	6	33849	33854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816710
521	NC_020287	CAA	2	6	33859	33864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816710
522	NC_020287	AAT	2	6	33865	33870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816710
523	NC_020287	CTG	2	6	33883	33888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816710
524	NC_020287	ACCCC	2	10	33938	33947	20 %	0 %	0 %	80 %	451816710
525	NC_020287	CGAATA	2	12	33989	34000	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451816710
526	NC_020287	ATC	2	6	34076	34081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816710
527	NC_020287	TGA	2	6	34275	34280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816711
528	NC_020287	GGT	2	6	34287	34292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816711
529	NC_020287	TGG	2	6	34298	34303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816711
530	NC_020287	TGA	2	6	34319	34324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816711
531	NC_020287	G	6	6	34477	34482	0 %	0 %	100 %	0 %	451816712
532	NC_020287	CCCA	2	8	34506	34513	25 %	0 %	0 %	75 %	451816712
533	NC_020287	TAA	2	6	34571	34576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816712
534	NC_020287	GTTG	2	8	34640	34647	0 %	50 %	50 %	0 %	451816712
535	NC_020287	TCCT	2	8	34648	34655	0 %	50 %	0 %	50 %	451816712
536	NC_020287	TGG	2	6	34722	34727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816712
537	NC_020287	ATT	2	6	34791	34796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816712
538	NC_020287	GTA	2	6	34936	34941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816713
539	NC_020287	GAA	2	6	34981	34986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816713
540	NC_020287	TCC	2	6	34992	34997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816713
541	NC_020287	AAT	2	6	35051	35056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816713
542	NC_020287	CAA	2	6	35187	35192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816714
543	NC_020287	C	9	9	35217	35225	0 %	0 %	0 %	100 %	451816714
544	NC_020287	T	6	6	35290	35295	0 %	100 %	0 %	0 %	451816714
545	NC_020287	TTC	2	6	35308	35313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816714
546	NC_020287	AT	3	6	35420	35425	50 %	50 %	0 %	0 %	451816714
547	NC_020287	GTAA	2	8	35494	35501	50 %	25 %	25 %	0 %	451816714
548	NC_020287	TGT	2	6	35504	35509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816714
549	NC_020287	AAC	2	6	35519	35524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816714
550	NC_020287	AGC	2	6	35587	35592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816714
551	NC_020287	TCC	2	6	35603	35608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816714
552	NC_020287	TTTC	2	8	35640	35647	0 %	75 %	0 %	25 %	451816714
553	NC_020287	CTG	2	6	35686	35691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816714
554	NC_020287	GAC	2	6	35696	35701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816714
555	NC_020287	T	6	6	35728	35733	0 %	100 %	0 %	0 %	451816714
556	NC_020287	CAG	2	6	35806	35811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816715
557	NC_020287	ACC	2	6	35827	35832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816715
558	NC_020287	TTG	2	6	35950	35955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816715
559	NC_020287	GC	3	6	35972	35977	0 %	0 %	50 %	50 %	451816715
560	NC_020287	TGGC	2	8	35989	35996	0 %	25 %	50 %	25 %	451816715
561	NC_020287	CAA	2	6	36097	36102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816715
562	NC_020287	AAC	2	6	36196	36201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816715
563	NC_020287	GGC	2	6	36257	36262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816715
564	NC_020287	CTC	2	6	36280	36285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816715
565	NC_020287	C	6	6	37651	37656	0 %	0 %	0 %	100 %	451816716
566	NC_020287	CAT	2	6	37673	37678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816716
567	NC_020287	CTT	2	6	37768	37773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816716
568	NC_020287	CTT	2	6	37787	37792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816716
569	NC_020287	AG	3	6	37818	37823	50 %	0 %	50 %	0 %	451816716
570	NC_020287	AGC	2	6	37827	37832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816716
571	NC_020287	CATT	2	8	37843	37850	25 %	50 %	0 %	25 %	451816717
572	NC_020287	CAA	2	6	37872	37877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816717
573	NC_020287	CTC	2	6	37894	37899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816717
574	NC_020287	CCAA	2	8	37946	37953	50 %	0 %	0 %	50 %	451816717
575	NC_020287	CAA	2	6	38056	38061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816717
576	NC_020287	AGGT	2	8	38096	38103	25 %	25 %	50 %	0 %	451816717
577	NC_020287	CACAGA	2	12	38305	38316	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	451816718
578	NC_020287	GA	3	6	38315	38320	50 %	0 %	50 %	0 %	451816718
579	NC_020287	CAC	2	6	38337	38342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816718
580	NC_020287	CAA	2	6	38363	38368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816718
581	NC_020287	CAG	2	6	38610	38615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816718
582	NC_020287	CCG	2	6	38621	38626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816718
583	NC_020287	GTA	2	6	38628	38633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816718
584	NC_020287	CCG	2	6	38657	38662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816718
585	NC_020287	A	6	6	38676	38681	100 %	0 %	0 %	0 %	451816718
586	NC_020287	AGG	2	6	38719	38724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816718
587	NC_020287	CGG	2	6	38822	38827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816718
588	NC_020287	TGAT	2	8	38852	38859	25 %	50 %	25 %	0 %	451816718
589	NC_020287	TGAC	2	8	39023	39030	25 %	25 %	25 %	25 %	451816719
590	NC_020287	TAT	2	6	39065	39070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816719
591	NC_020287	AGA	2	6	39075	39080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816719
592	NC_020287	AAT	2	6	39131	39136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816719
593	NC_020287	CCG	2	6	39169	39174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816719
594	NC_020287	AGCA	2	8	39233	39240	50 %	0 %	25 %	25 %	451816719
595	NC_020287	CTA	2	6	39515	39520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816720
596	NC_020287	TAG	2	6	39630	39635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816720
597	NC_020287	TGA	2	6	39678	39683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816720
598	NC_020287	TCG	2	6	39684	39689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816720
599	NC_020287	TTC	2	6	39776	39781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816720
600	NC_020287	CGC	2	6	39790	39795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816720
601	NC_020287	GCGAGG	2	12	39854	39865	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	451816720
602	NC_020287	GAA	2	6	39931	39936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816720
603	NC_020287	AAG	2	6	40026	40031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816720
604	NC_020287	CTC	2	6	40675	40680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816721
605	NC_020287	TGGCAG	2	12	40730	40741	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451816721
606	NC_020287	CAAGC	2	10	40744	40753	40 %	0 %	20 %	40 %	451816721
607	NC_020287	CGA	2	6	40836	40841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816721
608	NC_020287	AAT	2	6	40939	40944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816721
609	NC_020287	GGA	2	6	40954	40959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816721
610	NC_020287	AGT	2	6	41004	41009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816721
611	NC_020287	CAG	3	9	41053	41061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816721
612	NC_020287	G	6	6	41065	41070	0 %	0 %	100 %	0 %	451816721
613	NC_020287	GGA	2	6	41097	41102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816721
614	NC_020287	TAG	2	6	41195	41200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816721
615	NC_020287	TAA	2	6	41238	41243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816721
616	NC_020287	T	6	6	41396	41401	0 %	100 %	0 %	0 %	451816722
617	NC_020287	TGA	2	6	41461	41466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816722
618	NC_020287	AGC	2	6	41506	41511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816722
619	NC_020287	CGC	2	6	41532	41537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816722
620	NC_020287	GGA	2	6	41555	41560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816722
621	NC_020287	G	8	8	41573	41580	0 %	0 %	100 %	0 %	451816722
622	NC_020287	GATA	2	8	41589	41596	50 %	25 %	25 %	0 %	451816722
623	NC_020287	CAG	2	6	41710	41715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816723
624	NC_020287	GTG	2	6	41791	41796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816723
625	NC_020287	TCCC	2	8	41841	41848	0 %	25 %	0 %	75 %	451816723
626	NC_020287	ACTA	2	8	41849	41856	50 %	25 %	0 %	25 %	451816723
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628	NC_020287	TAG	2	6	42393	42398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816724
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863	NC_020287	GAT	2	6	56304	56309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816737
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879	NC_020287	TGG	2	6	57318	57323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816737
880	NC_020287	CAT	2	6	57333	57338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816737
881	NC_020287	AATT	2	8	57369	57376	50 %	50 %	0 %	0 %	451816737
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