MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I

Total Repeats: 39984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020247	GGA	2	6	208023	208028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068564
4002	NC_020247	CTC	2	6	208086	208091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068564
4003	NC_020247	GGA	2	6	208097	208102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068564
4004	NC_020247	ATG	2	6	208113	208118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068564
4005	NC_020247	ATT	2	6	208209	208214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068564
4006	NC_020247	CAA	2	6	208354	208359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068565
4007	NC_020247	AT	3	6	208375	208380	50 %	50 %	0 %	0 %	449068565
4008	NC_020247	AAG	2	6	208382	208387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068565
4009	NC_020247	GGGA	2	8	208435	208442	25 %	0 %	75 %	0 %	449068565
4010	NC_020247	AT	3	6	208454	208459	50 %	50 %	0 %	0 %	449068565
4011	NC_020247	ATC	2	6	208465	208470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068565
4012	NC_020247	TGA	2	6	208504	208509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068565
4013	NC_020247	ATT	2	6	208558	208563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068565
4014	NC_020247	AGA	2	6	208612	208617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068565
4015	NC_020247	ACCTGT	2	12	208669	208680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	449068565
4016	NC_020247	AT	3	6	208823	208828	50 %	50 %	0 %	0 %	449068566
4017	NC_020247	ACG	2	6	208829	208834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449068566
4018	NC_020247	TCA	2	6	208873	208878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068566
4019	NC_020247	GAG	2	6	208879	208884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068566
4020	NC_020247	TAT	2	6	208959	208964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068566
4021	NC_020247	T	6	6	209004	209009	0 %	100 %	0 %	0 %	449068566
4022	NC_020247	AGATA	2	10	209136	209145	60 %	20 %	20 %	0 %	449068566
4023	NC_020247	GAA	2	6	209146	209151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068566
4024	NC_020247	GAAA	2	8	209160	209167	75 %	0 %	25 %	0 %	449068566
4025	NC_020247	GAG	2	6	209227	209232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068566
4026	NC_020247	GTT	2	6	209269	209274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068566
4027	NC_020247	AGG	2	6	209300	209305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068566
4028	NC_020247	G	6	6	209321	209326	0 %	0 %	100 %	0 %	449068566
4029	NC_020247	ACC	2	6	209514	209519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449068566
4030	NC_020247	AC	3	6	209523	209528	50 %	0 %	0 %	50 %	449068566
4031	NC_020247	AGG	3	9	209564	209572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068566
4032	NC_020247	TAA	2	6	209615	209620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068566
4033	NC_020247	AG	3	6	209631	209636	50 %	0 %	50 %	0 %	449068566
4034	NC_020247	TAAGG	2	10	209706	209715	40 %	20 %	40 %	0 %	449068566
4035	NC_020247	GAG	2	6	209719	209724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068566
4036	NC_020247	ATGGG	2	10	209812	209821	20 %	20 %	60 %	0 %	449068566
4037	NC_020247	ACG	2	6	209831	209836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449068566
4038	NC_020247	GTG	2	6	209903	209908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449068566
4039	NC_020247	AAG	2	6	209974	209979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068567
4040	NC_020247	AGA	2	6	209980	209985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068567
4041	NC_020247	TGA	2	6	210021	210026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068567
4042	NC_020247	A	6	6	210116	210121	100 %	0 %	0 %	0 %	449068567
4043	NC_020247	GAA	2	6	210123	210128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068567
4044	NC_020247	ACA	2	6	210168	210173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068567
4045	NC_020247	GAG	2	6	210181	210186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068567
4046	NC_020247	CTTA	2	8	210305	210312	25 %	50 %	0 %	25 %	449068567
4047	NC_020247	TTC	2	6	210394	210399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068567
4048	NC_020247	AGA	2	6	210405	210410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068567
4049	NC_020247	TAG	2	6	210449	210454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068567
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4051	NC_020247	AGG	2	6	210938	210943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068568
4052	NC_020247	TTC	2	6	211095	211100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068569
4053	NC_020247	CCA	2	6	211116	211121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449068569
4054	NC_020247	TACTT	2	10	211169	211178	20 %	60 %	0 %	20 %	449068569
4055	NC_020247	TGAT	2	8	211230	211237	25 %	50 %	25 %	0 %	449068569
4056	NC_020247	TTA	2	6	211261	211266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068569
4057	NC_020247	TTA	2	6	211278	211283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068569
4058	NC_020247	GAA	2	6	211295	211300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068569
4059	NC_020247	TAT	2	6	211322	211327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068569
4060	NC_020247	GGA	2	6	211373	211378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068569
4061	NC_020247	AAT	3	9	211511	211519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068569
4062	NC_020247	TAT	2	6	211562	211567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068569
4063	NC_020247	GATA	2	8	211634	211641	50 %	25 %	25 %	0 %	449068570
4064	NC_020247	TTC	2	6	211665	211670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068570
4065	NC_020247	TTG	2	6	211689	211694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068570
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4070	NC_020247	CTTT	2	8	211866	211873	0 %	75 %	0 %	25 %	449068570
4071	NC_020247	TTC	2	6	211911	211916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068570
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4073	NC_020247	TAGA	2	8	212025	212032	50 %	25 %	25 %	0 %	449068570
4074	NC_020247	ATATT	2	10	212036	212045	40 %	60 %	0 %	0 %	449068570
4075	NC_020247	AACA	2	8	212137	212144	75 %	0 %	0 %	25 %	449068570
4076	NC_020247	CATT	2	8	212157	212164	25 %	50 %	0 %	25 %	449068570
4077	NC_020247	CTGG	2	8	212312	212319	0 %	25 %	50 %	25 %	449068570
4078	NC_020247	CTG	3	9	212382	212390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068570
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4080	NC_020247	CTA	2	6	212463	212468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068570
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4083	NC_020247	TAAC	2	8	212634	212641	50 %	25 %	0 %	25 %	449068570
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4085	NC_020247	GA	3	6	212757	212762	50 %	0 %	50 %	0 %	449068570
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4087	NC_020247	TCT	2	6	212904	212909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068571
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4090	NC_020247	ATATA	2	10	213015	213024	60 %	40 %	0 %	0 %	449068571
4091	NC_020247	CAA	2	6	213027	213032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068571
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4094	NC_020247	TAT	2	6	213160	213165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068571
4095	NC_020247	TA	3	6	213172	213177	50 %	50 %	0 %	0 %	449068571
4096	NC_020247	TA	3	6	213225	213230	50 %	50 %	0 %	0 %	449068571
4097	NC_020247	ATA	2	6	213288	213293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068571
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4104	NC_020247	ATA	2	6	213839	213844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068572
4105	NC_020247	TGG	2	6	213985	213990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449068572
4106	NC_020247	A	6	6	214044	214049	100 %	0 %	0 %	0 %	449068572
4107	NC_020247	GAA	2	6	214059	214064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068572
4108	NC_020247	CTG	2	6	214112	214117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068573
4109	NC_020247	CTC	2	6	214133	214138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068573
4110	NC_020247	CT	4	8	214142	214149	0 %	50 %	0 %	50 %	449068573
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4112	NC_020247	TTG	2	6	214214	214219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068573
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4122	NC_020247	AT	3	6	215114	215119	50 %	50 %	0 %	0 %	449068574
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4124	NC_020247	TA	3	6	215210	215215	50 %	50 %	0 %	0 %	449068574
4125	NC_020247	CAAAG	2	10	215335	215344	60 %	0 %	20 %	20 %	449068574
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4247	NC_020247	CT	3	6	221474	221479	0 %	50 %	0 %	50 %	449068580
4248	NC_020247	CCT	2	6	221535	221540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068580
4249	NC_020247	GTT	2	6	221613	221618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068580
4250	NC_020247	GTA	2	6	221619	221624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068580
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4252	NC_020247	GTCT	2	8	221675	221682	0 %	50 %	25 %	25 %	449068580
4253	NC_020247	AGA	2	6	221726	221731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068580
4254	NC_020247	TAC	2	6	221958	221963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068580
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4257	NC_020247	TGA	2	6	222082	222087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068580
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4259	NC_020247	TA	3	6	222113	222118	50 %	50 %	0 %	0 %	449068580
4260	NC_020247	CTT	2	6	222122	222127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068580
4261	NC_020247	TAC	2	6	222134	222139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068580
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4263	NC_020247	TTCT	2	8	222161	222168	0 %	75 %	0 %	25 %	449068580
4264	NC_020247	T	6	6	222183	222188	0 %	100 %	0 %	0 %	449068580
4265	NC_020247	ATC	2	6	222189	222194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068580
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4269	NC_020247	TCG	2	6	222341	222346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068580
4270	NC_020247	T	6	6	222375	222380	0 %	100 %	0 %	0 %	449068580
4271	NC_020247	CCTT	2	8	222400	222407	0 %	50 %	0 %	50 %	449068580
4272	NC_020247	GTTG	2	8	222426	222433	0 %	50 %	50 %	0 %	449068580
4273	NC_020247	CAT	2	6	222560	222565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068580
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4278	NC_020247	T	6	6	222915	222920	0 %	100 %	0 %	0 %	449068580
4279	NC_020247	CTT	2	6	222948	222953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068580
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4281	NC_020247	TCT	2	6	223003	223008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068580
4282	NC_020247	TTC	2	6	223017	223022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068580
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4286	NC_020247	CTT	2	6	223305	223310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068581
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4289	NC_020247	CTAT	2	8	223403	223410	25 %	50 %	0 %	25 %	449068582
4290	NC_020247	TAG	2	6	223446	223451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068582
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4313	NC_020247	GA	3	6	224634	224639	50 %	0 %	50 %	0 %	449068583
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4321	NC_020247	TCT	2	6	224937	224942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068583
4322	NC_020247	CT	3	6	224975	224980	0 %	50 %	0 %	50 %	449068583
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4332	NC_020247	AGG	2	6	225540	225545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068584
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4337	NC_020247	ACTA	2	8	225747	225754	50 %	25 %	0 %	25 %	449068584
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4350	NC_020247	TC	3	6	226311	226316	0 %	50 %	0 %	50 %	449068585
4351	NC_020247	AT	3	6	226322	226327	50 %	50 %	0 %	0 %	449068585
4352	NC_020247	TACA	2	8	226363	226370	50 %	25 %	0 %	25 %	449068585
4353	NC_020247	AGA	2	6	226557	226562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068585
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4355	NC_020247	TAT	2	6	226603	226608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068585
4356	NC_020247	GA	3	6	226709	226714	50 %	0 %	50 %	0 %	449068585
4357	NC_020247	TAA	2	6	226880	226885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068585
4358	NC_020247	TAC	2	6	226895	226900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068586
4359	NC_020247	ATG	2	6	226971	226976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068586
4360	NC_020247	GACA	2	8	226977	226984	50 %	0 %	25 %	25 %	449068586
4361	NC_020247	TA	3	6	227082	227087	50 %	50 %	0 %	0 %	449068586
4362	NC_020247	CT	3	6	227093	227098	0 %	50 %	0 %	50 %	449068586
4363	NC_020247	TTCT	2	8	227101	227108	0 %	75 %	0 %	25 %	449068586
4364	NC_020247	ACT	2	6	227168	227173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068586
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4370	NC_020247	TCT	2	6	227470	227475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068586
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4493	NC_020247	GAG	2	6	233713	233718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068594
4494	NC_020247	CAT	2	6	233733	233738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068594
4495	NC_020247	AAT	2	6	233739	233744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068594
4496	NC_020247	CAA	2	6	233948	233953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068594
4497	NC_020247	GA	3	6	233992	233997	50 %	0 %	50 %	0 %	449068594
4498	NC_020247	ACTAT	2	10	234040	234049	40 %	40 %	0 %	20 %	449068594
4499	NC_020247	ATA	2	6	234124	234129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068594
4500	NC_020247	CTA	2	6	234148	234153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068594

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