MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I

Total Repeats: 39984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020247	AT	3	6	177121	177126	50 %	50 %	0 %	0 %	449068529
3502	NC_020247	CGTGAC	2	12	177132	177143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	449068529
3503	NC_020247	CTT	2	6	177207	177212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068529
3504	NC_020247	TGT	2	6	177238	177243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068529
3505	NC_020247	CTG	2	6	177261	177266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068529
3506	NC_020247	TC	3	6	177403	177408	0 %	50 %	0 %	50 %	449068529
3507	NC_020247	TTA	2	6	177414	177419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068529
3508	NC_020247	CAT	2	6	177438	177443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068529
3509	NC_020247	CATG	2	8	177474	177481	25 %	25 %	25 %	25 %	449068529
3510	NC_020247	ATCT	2	8	177498	177505	25 %	50 %	0 %	25 %	449068529
3511	NC_020247	GAC	2	6	177508	177513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449068529
3512	NC_020247	TCC	2	6	177565	177570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068529
3513	NC_020247	ATA	2	6	177695	177700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068530
3514	NC_020247	CAC	2	6	177730	177735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449068530
3515	NC_020247	ACC	2	6	177747	177752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449068530
3516	NC_020247	TCT	2	6	177769	177774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068530
3517	NC_020247	TCT	2	6	177780	177785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068530
3518	NC_020247	TAA	2	6	177801	177806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068530
3519	NC_020247	CCA	2	6	177838	177843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449068530
3520	NC_020247	TTG	2	6	177855	177860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068530
3521	NC_020247	TG	3	6	177859	177864	0 %	50 %	50 %	0 %	449068530
3522	NC_020247	TC	3	6	177911	177916	0 %	50 %	0 %	50 %	449068530
3523	NC_020247	TAA	2	6	177935	177940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068530
3524	NC_020247	TCA	2	6	178035	178040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068530
3525	NC_020247	CT	4	8	178090	178097	0 %	50 %	0 %	50 %	449068530
3526	NC_020247	T	6	6	178121	178126	0 %	100 %	0 %	0 %	449068530
3527	NC_020247	ATT	2	6	178305	178310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068531
3528	NC_020247	GTA	2	6	178323	178328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068531
3529	NC_020247	TAAT	2	8	178384	178391	50 %	50 %	0 %	0 %	449068531
3530	NC_020247	AGG	2	6	178436	178441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068531
3531	NC_020247	ATA	2	6	178494	178499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068531
3532	NC_020247	CCT	2	6	178501	178506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068531
3533	NC_020247	AGA	2	6	178546	178551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068531
3534	NC_020247	TTC	2	6	178618	178623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068531
3535	NC_020247	TTGA	2	8	178635	178642	25 %	50 %	25 %	0 %	449068531
3536	NC_020247	AGT	2	6	178656	178661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068531
3537	NC_020247	TCC	2	6	178681	178686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068531
3538	NC_020247	TAC	2	6	178692	178697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068531
3539	NC_020247	CTA	2	6	178852	178857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068531
3540	NC_020247	GAC	2	6	178881	178886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449068531
3541	NC_020247	AT	3	6	178888	178893	50 %	50 %	0 %	0 %	449068531
3542	NC_020247	TCAT	2	8	178908	178915	25 %	50 %	0 %	25 %	449068531
3543	NC_020247	TAT	2	6	178968	178973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068532
3544	NC_020247	AC	3	6	179022	179027	50 %	0 %	0 %	50 %	449068532
3545	NC_020247	TAA	2	6	179072	179077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068532
3546	NC_020247	CAT	2	6	179079	179084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068532
3547	NC_020247	TCGCTT	2	12	179098	179109	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	449068532
3548	NC_020247	CTCTG	2	10	179110	179119	0 %	40 %	20 %	40 %	449068532
3549	NC_020247	TAA	2	6	179123	179128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068532
3550	NC_020247	ATG	2	6	179159	179164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068532
3551	NC_020247	TTG	2	6	179181	179186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068532
3552	NC_020247	TTC	2	6	179238	179243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068532
3553	NC_020247	AT	3	6	179252	179257	50 %	50 %	0 %	0 %	449068532
3554	NC_020247	AT	3	6	179316	179321	50 %	50 %	0 %	0 %	449068532
3555	NC_020247	TTA	2	6	179371	179376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068532
3556	NC_020247	TACTA	2	10	179424	179433	40 %	40 %	0 %	20 %	449068532
3557	NC_020247	ATA	2	6	179447	179452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068532
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3559	NC_020247	TAA	2	6	179700	179705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068533
3560	NC_020247	TTAA	2	8	179743	179750	50 %	50 %	0 %	0 %	449068533
3561	NC_020247	AGTG	2	8	179751	179758	25 %	25 %	50 %	0 %	449068533
3562	NC_020247	AAC	2	6	179778	179783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068533
3563	NC_020247	TAA	2	6	179792	179797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068533
3564	NC_020247	CAA	2	6	179864	179869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068533
3565	NC_020247	GGA	2	6	179909	179914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068533
3566	NC_020247	TAT	2	6	179923	179928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068533
3567	NC_020247	GAG	2	6	180013	180018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068533
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3569	NC_020247	TCT	2	6	180111	180116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068534
3570	NC_020247	TC	3	6	180137	180142	0 %	50 %	0 %	50 %	449068534
3571	NC_020247	CAG	2	6	180162	180167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449068534
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3573	NC_020247	AT	3	6	180246	180251	50 %	50 %	0 %	0 %	449068534
3574	NC_020247	TA	3	6	180293	180298	50 %	50 %	0 %	0 %	449068534
3575	NC_020247	AAC	2	6	180304	180309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068534
3576	NC_020247	CTACT	2	10	180314	180323	20 %	40 %	0 %	40 %	449068534
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3578	NC_020247	ATATC	2	10	180592	180601	40 %	40 %	0 %	20 %	449068534
3579	NC_020247	ATT	2	6	180615	180620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068534
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3581	NC_020247	TAT	2	6	180735	180740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068534
3582	NC_020247	GAC	2	6	180807	180812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449068534
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3584	NC_020247	CCAA	2	8	180916	180923	50 %	0 %	0 %	50 %	449068534
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3587	NC_020247	CT	3	6	180992	180997	0 %	50 %	0 %	50 %	449068534
3588	NC_020247	AT	3	6	181011	181016	50 %	50 %	0 %	0 %	449068534
3589	NC_020247	ATG	2	6	181222	181227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068535
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3591	NC_020247	TAC	2	6	181261	181266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068535
3592	NC_020247	GAG	2	6	181275	181280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068535
3593	NC_020247	AAG	2	6	181344	181349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068535
3594	NC_020247	AGGA	2	8	181795	181802	50 %	0 %	50 %	0 %	449068535
3595	NC_020247	AG	4	8	181983	181990	50 %	0 %	50 %	0 %	449068536
3596	NC_020247	GTA	2	6	182051	182056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068536
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3598	NC_020247	ACA	2	6	182168	182173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068536
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3602	NC_020247	GTTT	2	8	182519	182526	0 %	75 %	25 %	0 %	449068537
3603	NC_020247	GCTT	2	8	182648	182655	0 %	50 %	25 %	25 %	449068537
3604	NC_020247	CT	3	6	182668	182673	0 %	50 %	0 %	50 %	449068537
3605	NC_020247	AG	3	6	182769	182774	50 %	0 %	50 %	0 %	449068537
3606	NC_020247	TAA	2	6	182835	182840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068537
3607	NC_020247	CTTA	2	8	182874	182881	25 %	50 %	0 %	25 %	449068537
3608	NC_020247	AT	3	6	183439	183444	50 %	50 %	0 %	0 %	449068538
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3610	NC_020247	CTTCG	2	10	183476	183485	0 %	40 %	20 %	40 %	449068538
3611	NC_020247	TACA	2	8	183548	183555	50 %	25 %	0 %	25 %	449068538
3612	NC_020247	GA	3	6	183562	183567	50 %	0 %	50 %	0 %	449068538
3613	NC_020247	CTT	2	6	183570	183575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068538
3614	NC_020247	GCA	2	6	183576	183581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449068538
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3618	NC_020247	TAG	2	6	183659	183664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068538
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3621	NC_020247	TAT	2	6	183969	183974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068539
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