MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius N8

Total Repeats: 39327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020246	TAC	2	6	261266	261271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066347
5002	NC_020246	ATT	2	6	261288	261293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066347
5003	NC_020246	TAGA	2	8	261326	261333	50 %	25 %	25 %	0 %	449066347
5004	NC_020246	ATT	2	6	261354	261359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066347
5005	NC_020246	CCA	2	6	261377	261382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066347
5006	NC_020246	CT	3	6	261404	261409	0 %	50 %	0 %	50 %	449066347
5007	NC_020246	CTT	2	6	261497	261502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066347
5008	NC_020246	TTC	2	6	261509	261514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066347
5009	NC_020246	GTT	2	6	261639	261644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066347
5010	NC_020246	GTA	2	6	261816	261821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066347
5011	NC_020246	GTAT	2	8	261835	261842	25 %	50 %	25 %	0 %	449066347
5012	NC_020246	TCT	2	6	261849	261854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066347
5013	NC_020246	TCA	2	6	261909	261914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066347
5014	NC_020246	CTTC	2	8	261927	261934	0 %	50 %	0 %	50 %	449066347
5015	NC_020246	CAT	2	6	261935	261940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066347
5016	NC_020246	CTA	2	6	262030	262035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066347
5017	NC_020246	ACA	2	6	262068	262073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066347
5018	NC_020246	CAT	2	6	262087	262092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066347
5019	NC_020246	ACA	2	6	262146	262151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066347
5020	NC_020246	GCT	2	6	262164	262169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066347
5021	NC_020246	GGTA	2	8	262200	262207	25 %	25 %	50 %	0 %	449066347
5022	NC_020246	CTT	2	6	262226	262231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066347
5023	NC_020246	CTT	2	6	262273	262278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066347
5024	NC_020246	CTT	2	6	262309	262314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066347
5025	NC_020246	TTCT	2	8	262368	262375	0 %	75 %	0 %	25 %	449066347
5026	NC_020246	TCTA	2	8	262391	262398	25 %	50 %	0 %	25 %	449066347
5027	NC_020246	GGA	2	6	262449	262454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066347
5028	NC_020246	CTA	2	6	262576	262581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066347
5029	NC_020246	TAT	2	6	262604	262609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066347
5030	NC_020246	T	6	6	262609	262614	0 %	100 %	0 %	0 %	449066347
5031	NC_020246	TTA	2	6	262776	262781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066348
5032	NC_020246	AT	3	6	262790	262795	50 %	50 %	0 %	0 %	449066348
5033	NC_020246	AAG	2	6	262947	262952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066348
5034	NC_020246	GTA	2	6	263036	263041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066348
5035	NC_020246	CAG	2	6	263061	263066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066348
5036	NC_020246	TTA	2	6	263089	263094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066348
5037	NC_020246	TAT	2	6	263175	263180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066348
5038	NC_020246	CTC	2	6	263309	263314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066348
5039	NC_020246	AGG	3	9	263600	263608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066349
5040	NC_020246	AGT	2	6	263623	263628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066349
5041	NC_020246	AG	3	6	263642	263647	50 %	0 %	50 %	0 %	449066349
5042	NC_020246	CGA	2	6	263665	263670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066349
5043	NC_020246	AAGGG	2	10	263726	263735	40 %	0 %	60 %	0 %	449066349
5044	NC_020246	TAG	2	6	263793	263798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066349
5045	NC_020246	GTA	2	6	263826	263831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066350
5046	NC_020246	A	6	6	264002	264007	100 %	0 %	0 %	0 %	449066350
5047	NC_020246	CTA	2	6	264021	264026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066350
5048	NC_020246	GAG	2	6	264033	264038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066350
5049	NC_020246	TGT	2	6	264083	264088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066350
5050	NC_020246	GAT	2	6	264108	264113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066350
5051	NC_020246	GTT	2	6	264147	264152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066350
5052	NC_020246	CA	3	6	264265	264270	50 %	0 %	0 %	50 %	449066350
5053	NC_020246	AAG	2	6	264284	264289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066350
5054	NC_020246	GA	3	6	264305	264310	50 %	0 %	50 %	0 %	449066350
5055	NC_020246	CAT	2	6	264319	264324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066350
5056	NC_020246	A	6	6	264369	264374	100 %	0 %	0 %	0 %	449066350
5057	NC_020246	AGT	2	6	264413	264418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066350
5058	NC_020246	AAC	2	6	264493	264498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066350
5059	NC_020246	A	6	6	264544	264549	100 %	0 %	0 %	0 %	449066350
5060	NC_020246	AAT	3	9	264651	264659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066350
5061	NC_020246	AGA	2	6	264816	264821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066351
5062	NC_020246	AGG	2	6	264861	264866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066351
5063	NC_020246	TAT	2	6	264914	264919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066351
5064	NC_020246	ATA	2	6	265000	265005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066351
5065	NC_020246	AGG	2	6	265092	265097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066351
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5067	NC_020246	ACA	2	6	265146	265151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066351
5068	NC_020246	TTA	2	6	265196	265201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066351
5069	NC_020246	AAT	2	6	265281	265286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066351
5070	NC_020246	GAA	2	6	265354	265359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066351
5071	NC_020246	A	6	6	265387	265392	100 %	0 %	0 %	0 %	449066351
5072	NC_020246	GA	3	6	265596	265601	50 %	0 %	50 %	0 %	449066352
5073	NC_020246	GTA	2	6	265672	265677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066352
5074	NC_020246	TTATTG	2	12	265703	265714	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	449066352
5075	NC_020246	CTT	2	6	265740	265745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066352
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5077	NC_020246	TAA	2	6	265803	265808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066352
5078	NC_020246	TGAT	2	8	265813	265820	25 %	50 %	25 %	0 %	449066352
5079	NC_020246	AGA	2	6	265923	265928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066353
5080	NC_020246	GAT	2	6	265961	265966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066353
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5082	NC_020246	AG	3	6	266049	266054	50 %	0 %	50 %	0 %	449066353
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5085	NC_020246	GA	3	6	266483	266488	50 %	0 %	50 %	0 %	449066353
5086	NC_020246	GAG	2	6	266493	266498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066353
5087	NC_020246	A	7	7	266501	266507	100 %	0 %	0 %	0 %	449066353
5088	NC_020246	CA	3	6	266540	266545	50 %	0 %	0 %	50 %	449066353
5089	NC_020246	AGA	2	6	266582	266587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066353
5090	NC_020246	AGG	2	6	266601	266606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066353
5091	NC_020246	AG	4	8	266632	266639	50 %	0 %	50 %	0 %	449066353
5092	NC_020246	G	6	6	266644	266649	0 %	0 %	100 %	0 %	449066353
5093	NC_020246	TGA	2	6	266660	266665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066353
5094	NC_020246	CACAG	2	10	266750	266759	40 %	0 %	20 %	40 %	449066354
5095	NC_020246	CGT	2	6	266773	266778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066354
5096	NC_020246	TAC	2	6	266819	266824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066354
5097	NC_020246	ACC	2	6	266963	266968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066354
5098	NC_020246	TCC	2	6	266978	266983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066354
5099	NC_020246	GAG	2	6	267017	267022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066354
5100	NC_020246	TCT	2	6	267075	267080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066354
5101	NC_020246	TGA	2	6	267270	267275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066355
5102	NC_020246	AGA	2	6	267283	267288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066355
5103	NC_020246	AAAC	2	8	267295	267302	75 %	0 %	0 %	25 %	449066355
5104	NC_020246	GAA	2	6	267307	267312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066355
5105	NC_020246	TA	3	6	267381	267386	50 %	50 %	0 %	0 %	449066355
5106	NC_020246	CAA	2	6	267397	267402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066355
5107	NC_020246	TCT	2	6	267418	267423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066355
5108	NC_020246	TGA	2	6	267489	267494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066355
5109	NC_020246	AG	3	6	267496	267501	50 %	0 %	50 %	0 %	449066355
5110	NC_020246	ATA	2	6	267523	267528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066355
5111	NC_020246	GAG	2	6	267529	267534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066355
5112	NC_020246	TAG	2	6	267549	267554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066355
5113	NC_020246	TGA	2	6	267836	267841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066356
5114	NC_020246	TAA	2	6	267895	267900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066356
5115	NC_020246	CCA	2	6	267903	267908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066356
5116	NC_020246	AGG	2	6	267925	267930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066356
5117	NC_020246	TGA	2	6	268031	268036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066356
5118	NC_020246	TAA	2	6	268045	268050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066356
5119	NC_020246	AGG	2	6	268121	268126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066356
5120	NC_020246	AGA	2	6	268149	268154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066356
5121	NC_020246	AG	3	6	268230	268235	50 %	0 %	50 %	0 %	449066356
5122	NC_020246	AAG	2	6	268238	268243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066356
5123	NC_020246	ACA	2	6	268275	268280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066356
5124	NC_020246	GAG	2	6	268287	268292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066356
5125	NC_020246	CT	4	8	268368	268375	0 %	50 %	0 %	50 %	449066356
5126	NC_020246	CAA	2	6	268435	268440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066356
5127	NC_020246	CAC	2	6	268486	268491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066356
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5130	NC_020246	AGG	2	6	268582	268587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066356
5131	NC_020246	AGG	2	6	268716	268721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066356
5132	NC_020246	AGT	2	6	268754	268759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066356
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5134	NC_020246	AAG	2	6	268896	268901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066356
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5151	NC_020246	AT	3	6	269563	269568	50 %	50 %	0 %	0 %	449066356
5152	NC_020246	ATG	2	6	269586	269591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066356
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5154	NC_020246	AAG	2	6	269604	269609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066356
5155	NC_020246	GTTATA	2	12	269634	269645	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	449066357
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5164	NC_020246	AT	3	6	269878	269883	50 %	50 %	0 %	0 %	449066357
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5183	NC_020246	AG	3	6	270840	270845	50 %	0 %	50 %	0 %	449066358
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5203	NC_020246	CTC	2	6	271877	271882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066359
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5210	NC_020246	TCC	2	6	272280	272285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066360
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5213	NC_020246	CT	3	6	272328	272333	0 %	50 %	0 %	50 %	449066361
5214	NC_020246	TGTA	2	8	272353	272360	25 %	50 %	25 %	0 %	449066361
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5231	NC_020246	AGC	2	6	273403	273408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066361
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5233	NC_020246	AGCT	2	8	273596	273603	25 %	25 %	25 %	25 %	449066361
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5237	NC_020246	TCT	2	6	273865	273870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066361
5238	NC_020246	CTTTA	2	10	273878	273887	20 %	60 %	0 %	20 %	449066361
5239	NC_020246	CT	3	6	273906	273911	0 %	50 %	0 %	50 %	449066361
5240	NC_020246	GTG	2	6	273912	273917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066361
5241	NC_020246	CAA	2	6	273931	273936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066361
5242	NC_020246	TCC	2	6	273994	273999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066361
5243	NC_020246	ATT	2	6	274049	274054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066361
5244	NC_020246	CTT	2	6	274195	274200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066361
5245	NC_020246	TCCC	2	8	274226	274233	0 %	25 %	0 %	75 %	449066361
5246	NC_020246	CCCA	2	8	274276	274283	25 %	0 %	0 %	75 %	449066361
5247	NC_020246	TTC	2	6	274354	274359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066361
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5252	NC_020246	ATC	2	6	274790	274795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066361
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5257	NC_020246	AGTTT	2	10	275413	275422	20 %	60 %	20 %	0 %	449066362
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5274	NC_020246	CT	3	6	276311	276316	0 %	50 %	0 %	50 %	449066362
5275	NC_020246	CAAA	2	8	276332	276339	75 %	0 %	0 %	25 %	449066362
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5345	NC_020246	AC	3	6	280495	280500	50 %	0 %	0 %	50 %	449066368
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5360	NC_020246	ATA	3	9	281288	281296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066369
5361	NC_020246	AATC	2	8	281388	281395	50 %	25 %	0 %	25 %	449066369
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5366	NC_020246	CT	3	6	281548	281553	0 %	50 %	0 %	50 %	449066369
5367	NC_020246	TCT	2	6	281578	281583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066369
5368	NC_020246	AGA	2	6	281638	281643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066369
5369	NC_020246	CCG	2	6	281668	281673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449066369
5370	NC_020246	GCT	2	6	281731	281736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066369
5371	NC_020246	GA	3	6	281737	281742	50 %	0 %	50 %	0 %	449066369
5372	NC_020246	CAA	2	6	281759	281764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066369
5373	NC_020246	TTA	2	6	281838	281843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066370
5374	NC_020246	TTCCT	2	10	281934	281943	0 %	60 %	0 %	40 %	449066370
5375	NC_020246	TCA	2	6	281986	281991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066370
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5377	NC_020246	CA	3	6	282171	282176	50 %	0 %	0 %	50 %	449066370
5378	NC_020246	CTC	2	6	282213	282218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066370
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5381	NC_020246	CAC	2	6	282310	282315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066370
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5383	NC_020246	CTA	2	6	282326	282331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066370
5384	NC_020246	TCT	2	6	282375	282380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066370
5385	NC_020246	AT	3	6	282402	282407	50 %	50 %	0 %	0 %	449066370
5386	NC_020246	GT	3	6	282443	282448	0 %	50 %	50 %	0 %	449066370
5387	NC_020246	CAG	2	6	282452	282457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066370
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5389	NC_020246	AGT	2	6	282527	282532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066370
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5392	NC_020246	GTA	2	6	282611	282616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066370
5393	NC_020246	TGA	2	6	282784	282789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066370
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5395	NC_020246	ATG	2	6	282882	282887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066370
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5398	NC_020246	TA	3	6	283001	283006	50 %	50 %	0 %	0 %	449066370
5399	NC_020246	CTC	2	6	283008	283013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066370
5400	NC_020246	GTACT	2	10	283039	283048	20 %	40 %	20 %	20 %	449066370
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5402	NC_020246	CTT	2	6	283128	283133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066370
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5431	NC_020246	GGA	2	6	284910	284915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066372
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5433	NC_020246	TCC	2	6	284990	284995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066372
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5437	NC_020246	GCA	2	6	285130	285135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066373
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5450	NC_020246	GAT	2	6	285660	285665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066374
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5452	NC_020246	ATG	2	6	285880	285885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066374
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5459	NC_020246	GTCTC	2	10	286198	286207	0 %	40 %	20 %	40 %	449066374
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5470	NC_020246	TC	3	6	286991	286996	0 %	50 %	0 %	50 %	449066375
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5475	NC_020246	CT	3	6	287306	287311	0 %	50 %	0 %	50 %	449066375
5476	NC_020246	GTC	2	6	287362	287367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066375
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5482	NC_020246	A	6	6	287766	287771	100 %	0 %	0 %	0 %	449066377
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5487	NC_020246	CAT	2	6	287936	287941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066377
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5490	NC_020246	GAA	2	6	288035	288040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066377
5491	NC_020246	ACC	2	6	288056	288061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066377
5492	NC_020246	GCT	2	6	288066	288071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066377
5493	NC_020246	AGA	2	6	288074	288079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066377
5494	NC_020246	TAT	2	6	288125	288130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066377
5495	NC_020246	T	6	6	288137	288142	0 %	100 %	0 %	0 %	449066377
5496	NC_020246	CTT	2	6	288143	288148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066377
5497	NC_020246	TTC	2	6	288149	288154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066377
5498	NC_020246	T	6	6	288160	288165	0 %	100 %	0 %	0 %	449066377
5499	NC_020246	AGAAAA	2	12	288333	288344	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	449066378
5500	NC_020246	GTT	2	6	288353	288358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066378

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