MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC03

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019895	CAGC	2	8	114	121	25 %	0 %	25 %	50 %	430748168
2	NC_019895	TGCG	2	8	577	584	0 %	25 %	50 %	25 %	430748168
3	NC_019895	GCTT	2	8	1295	1302	0 %	50 %	25 %	25 %	430748168
4	NC_019895	TTCC	2	8	2476	2483	0 %	50 %	0 %	50 %	430748170
5	NC_019895	CTTG	2	8	2496	2503	0 %	50 %	25 %	25 %	430748170
6	NC_019895	CCTG	2	8	3694	3701	0 %	25 %	25 %	50 %	430748171
7	NC_019895	CCCG	2	8	4020	4027	0 %	0 %	25 %	75 %	430748171
8	NC_019895	CCGC	2	8	4891	4898	0 %	0 %	25 %	75 %	430748172
9	NC_019895	CGAT	2	8	4956	4963	25 %	25 %	25 %	25 %	430748172
10	NC_019895	CTGC	2	8	6054	6061	0 %	25 %	25 %	50 %	430748173
11	NC_019895	GGTT	2	8	6706	6713	0 %	50 %	50 %	0 %	430748174
12	NC_019895	CCGC	2	8	6826	6833	0 %	0 %	25 %	75 %	430748174
13	NC_019895	CGTG	2	8	7203	7210	0 %	25 %	50 %	25 %	430748174
14	NC_019895	CGAT	2	8	7502	7509	25 %	25 %	25 %	25 %	430748174
15	NC_019895	CGGG	2	8	8051	8058	0 %	0 %	75 %	25 %	430748175
16	NC_019895	GGCA	2	8	8443	8450	25 %	0 %	50 %	25 %	430748175
17	NC_019895	GCAA	2	8	8818	8825	50 %	0 %	25 %	25 %	430748175
18	NC_019895	GCGG	2	8	10030	10037	0 %	0 %	75 %	25 %	430748177
19	NC_019895	CCTG	2	8	10246	10253	0 %	25 %	25 %	50 %	430748177
20	NC_019895	TGGG	2	8	10292	10299	0 %	25 %	75 %	0 %	430748177
21	NC_019895	TGGC	2	8	10644	10651	0 %	25 %	50 %	25 %	430748177
22	NC_019895	CGGC	2	8	10846	10853	0 %	0 %	50 %	50 %	430748177
23	NC_019895	CGGG	2	8	10947	10954	0 %	0 %	75 %	25 %	430748177
24	NC_019895	GCCG	2	8	10972	10979	0 %	0 %	50 %	50 %	430748177
25	NC_019895	GAAG	2	8	11271	11278	50 %	0 %	50 %	0 %	430748178
26	NC_019895	GGCA	2	8	11299	11306	25 %	0 %	50 %	25 %	430748178
27	NC_019895	CCGC	3	12	11725	11736	0 %	0 %	25 %	75 %	430748179
28	NC_019895	TCCC	2	8	12042	12049	0 %	25 %	0 %	75 %	430748179
29	NC_019895	CCAA	2	8	12062	12069	50 %	0 %	0 %	50 %	430748179
30	NC_019895	GGCT	2	8	12467	12474	0 %	25 %	50 %	25 %	430748180
31	NC_019895	GGCG	2	8	12527	12534	0 %	0 %	75 %	25 %	430748180
32	NC_019895	CAAG	2	8	12801	12808	50 %	0 %	25 %	25 %	430748181
33	NC_019895	CGCC	2	8	12850	12857	0 %	0 %	25 %	75 %	430748181
34	NC_019895	CGGA	3	12	13706	13717	25 %	0 %	50 %	25 %	430748182
35	NC_019895	GGGC	2	8	14721	14728	0 %	0 %	75 %	25 %	430748183
36	NC_019895	TCTT	2	8	15002	15009	0 %	75 %	0 %	25 %	430748183
37	NC_019895	CGGT	2	8	15556	15563	0 %	25 %	50 %	25 %	430748183
38	NC_019895	GCGG	2	8	15654	15661	0 %	0 %	75 %	25 %	430748183
39	NC_019895	CATC	2	8	17162	17169	25 %	25 %	0 %	50 %	430748184
40	NC_019895	GGCA	2	8	17762	17769	25 %	0 %	50 %	25 %	430748185
41	NC_019895	AAGG	2	8	18138	18145	50 %	0 %	50 %	0 %	430748185
42	NC_019895	CCGG	2	8	21182	21189	0 %	0 %	50 %	50 %	430748189
43	NC_019895	GATC	2	8	25511	25518	25 %	25 %	25 %	25 %	430748191
44	NC_019895	TGGC	2	8	25567	25574	0 %	25 %	50 %	25 %	430748191
45	NC_019895	GCGG	2	8	25997	26004	0 %	0 %	75 %	25 %	430748192
46	NC_019895	GCCC	2	8	26047	26054	0 %	0 %	25 %	75 %	430748192
47	NC_019895	AGGC	2	8	26076	26083	25 %	0 %	50 %	25 %	430748192
48	NC_019895	CCAT	2	8	26487	26494	25 %	25 %	0 %	50 %	430748193
49	NC_019895	ATCG	2	8	26566	26573	25 %	25 %	25 %	25 %	430748193
50	NC_019895	GCGG	2	8	27700	27707	0 %	0 %	75 %	25 %	430748195
51	NC_019895	GAAG	2	8	28610	28617	50 %	0 %	50 %	0 %	430748195
52	NC_019895	CGAT	2	8	28695	28702	25 %	25 %	25 %	25 %	430748195
53	NC_019895	CGCC	2	8	28794	28801	0 %	0 %	25 %	75 %	430748195
54	NC_019895	GCGG	2	8	28810	28817	0 %	0 %	75 %	25 %	430748195
55	NC_019895	ACGC	2	8	29639	29646	25 %	0 %	25 %	50 %	430748195
56	NC_019895	CGGC	2	8	29652	29659	0 %	0 %	50 %	50 %	430748195
57	NC_019895	CCAG	2	8	30579	30586	25 %	0 %	25 %	50 %	430748196
58	NC_019895	GAAG	2	8	30965	30972	50 %	0 %	50 %	0 %	430748196
59	NC_019895	CGAC	2	8	31384	31391	25 %	0 %	25 %	50 %	430748197
60	NC_019895	GACG	2	8	32033	32040	25 %	0 %	50 %	25 %	430748198

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.