MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC01

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019893	GGCTC	2	10	2246	2255	0 %	20 %	40 %	40 %	430740945
2	NC_019893	AGTTC	2	10	3327	3336	20 %	40 %	20 %	20 %	430740946
3	NC_019893	AAGCG	2	10	5550	5559	40 %	0 %	40 %	20 %	430740948
4	NC_019893	TTGCA	2	10	6364	6373	20 %	40 %	20 %	20 %	430740948
5	NC_019893	GCGAT	2	10	12460	12469	20 %	20 %	40 %	20 %	430740953
6	NC_019893	TCAGG	2	10	16694	16703	20 %	20 %	40 %	20 %	430740956
7	NC_019893	TGTCA	2	10	18573	18582	20 %	40 %	20 %	20 %	430740957
8	NC_019893	CCTCG	2	10	21967	21976	0 %	20 %	20 %	60 %	430740960
9	NC_019893	AAGCC	2	10	22323	22332	40 %	0 %	20 %	40 %	430740960
10	NC_019893	ACGCG	2	10	25010	25019	20 %	0 %	40 %	40 %	430740962
11	NC_019893	CGTGG	2	10	27154	27163	0 %	20 %	60 %	20 %	430740963
12	NC_019893	GGCCG	2	10	28024	28033	0 %	0 %	60 %	40 %	430740963
13	NC_019893	GCATC	2	10	30318	30327	20 %	20 %	20 %	40 %	430740964
14	NC_019893	GTCGG	2	10	31111	31120	0 %	20 %	60 %	20 %	430740964
15	NC_019893	CGCTG	2	10	31392	31401	0 %	20 %	40 %	40 %	430740964
16	NC_019893	CGCAA	2	10	31510	31519	40 %	0 %	20 %	40 %	430740964
17	NC_019893	CGACC	2	10	32280	32289	20 %	0 %	20 %	60 %	430740965
18	NC_019893	CGGTG	2	10	33469	33478	0 %	20 %	60 %	20 %	430740966
19	NC_019893	CGGGC	2	10	34149	34158	0 %	0 %	60 %	40 %	430740966
20	NC_019893	CGTTC	2	10	38510	38519	0 %	40 %	20 %	40 %	430740968
21	NC_019893	GCTGG	2	10	38645	38654	0 %	20 %	60 %	20 %	430740968
22	NC_019893	AGTCT	2	10	39179	39188	20 %	40 %	20 %	20 %	430740968
23	NC_019893	CGAGG	2	10	42836	42845	20 %	0 %	60 %	20 %	430740972
24	NC_019893	CCGAT	2	10	43530	43539	20 %	20 %	20 %	40 %	430740973
25	NC_019893	GCCGA	2	10	44375	44384	20 %	0 %	40 %	40 %	430740974
26	NC_019893	TCCCG	2	10	45194	45203	0 %	20 %	20 %	60 %	430740974
27	NC_019893	TGGCC	2	10	46450	46459	0 %	20 %	40 %	40 %	430740974
28	NC_019893	GGGTC	2	10	47704	47713	0 %	20 %	60 %	20 %	430740974
29	NC_019893	TCGGG	2	10	47846	47855	0 %	20 %	60 %	20 %	430740974
30	NC_019893	GCGAG	2	10	48559	48568	20 %	0 %	60 %	20 %	430740974
31	NC_019893	GCTGG	2	10	48572	48581	0 %	20 %	60 %	20 %	430740974
32	NC_019893	ACGGC	2	10	49105	49114	20 %	0 %	40 %	40 %	430740974
33	NC_019893	CCCTG	2	10	49923	49932	0 %	20 %	20 %	60 %	430740974
34	NC_019893	ACCGT	2	10	51252	51261	20 %	20 %	20 %	40 %	430740974
35	NC_019893	CGGGC	2	10	51320	51329	0 %	0 %	60 %	40 %	430740974
36	NC_019893	CTGAG	2	10	54369	54378	20 %	20 %	40 %	20 %	430740974
37	NC_019893	CAACC	2	10	54659	54668	40 %	0 %	0 %	60 %	430740974

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.