MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 chromosome

Total Repeats: 167701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019892	ATA	2	6	195864	195869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430741182
3502	NC_019892	TCA	2	6	195932	195937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741182
3503	NC_019892	AG	3	6	195948	195953	50 %	0 %	50 %	0 %	430741182
3504	NC_019892	TGA	2	6	195971	195976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741182
3505	NC_019892	CAG	2	6	195994	195999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741182
3506	NC_019892	AGG	2	6	196036	196041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741182
3507	NC_019892	GA	3	6	196043	196048	50 %	0 %	50 %	0 %	430741182
3508	NC_019892	CAC	2	6	196104	196109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741182
3509	NC_019892	CGC	2	6	197067	197072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741184
3510	NC_019892	CGG	2	6	197076	197081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741184
3511	NC_019892	CGT	2	6	197093	197098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741184
3512	NC_019892	GAG	2	6	197130	197135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741184
3513	NC_019892	GCT	2	6	197153	197158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741184
3514	NC_019892	CTC	2	6	197256	197261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741184
3515	NC_019892	GTG	2	6	197343	197348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741184
3516	NC_019892	GAA	2	6	197352	197357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430741184
3517	NC_019892	GTC	2	6	197364	197369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741184
3518	NC_019892	GCC	2	6	197394	197399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741184
3519	NC_019892	TGT	2	6	197417	197422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430741184
3520	NC_019892	GTC	2	6	197437	197442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741184
3521	NC_019892	AGGCCG	2	12	197614	197625	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430741184
3522	NC_019892	CCG	2	6	197636	197641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741184
3523	NC_019892	ATC	2	6	197736	197741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741184
3524	NC_019892	GCG	2	6	197776	197781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741184
3525	NC_019892	GGA	2	6	197814	197819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741184
3526	NC_019892	TGG	2	6	197956	197961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741184
3527	NC_019892	CTT	2	6	197994	197999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741184
3528	NC_019892	GTT	2	6	198286	198291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430741185
3529	NC_019892	AAG	2	6	198337	198342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430741185
3530	NC_019892	CTC	2	6	198445	198450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741185
3531	NC_019892	AGA	2	6	198543	198548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430741185
3532	NC_019892	AACC	2	8	198567	198574	50 %	0 %	0 %	50 %	430741185
3533	NC_019892	TCA	2	6	198636	198641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741185
3534	NC_019892	CAT	2	6	198673	198678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741185
3535	NC_019892	CGAG	2	8	198720	198727	25 %	0 %	50 %	25 %	430741185
3536	NC_019892	CCT	2	6	198753	198758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741185
3537	NC_019892	ACG	2	6	198791	198796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741185
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3539	NC_019892	CCGT	2	8	198887	198894	0 %	25 %	25 %	50 %	430741185
3540	NC_019892	CTT	2	6	198898	198903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741185
3541	NC_019892	GTT	2	6	198928	198933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430741185
3542	NC_019892	CG	3	6	198954	198959	0 %	0 %	50 %	50 %	430741185
3543	NC_019892	AGG	2	6	198974	198979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741185
3544	NC_019892	CTG	2	6	198987	198992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741185
3545	NC_019892	CGC	2	6	199015	199020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741185
3546	NC_019892	CGGG	2	8	199038	199045	0 %	0 %	75 %	25 %	430741185
3547	NC_019892	TGG	2	6	199088	199093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741185
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3550	NC_019892	GCCGC	2	10	199353	199362	0 %	0 %	40 %	60 %	430741185
3551	NC_019892	GA	3	6	199376	199381	50 %	0 %	50 %	0 %	430741185
3552	NC_019892	CTT	2	6	199398	199403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741185
3553	NC_019892	TGG	2	6	199908	199913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741186
3554	NC_019892	GCC	2	6	199973	199978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741186
3555	NC_019892	GAC	2	6	199985	199990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741186
3556	NC_019892	TTG	2	6	200022	200027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430741186
3557	NC_019892	GGCCAG	2	12	200030	200041	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430741186
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3559	NC_019892	AGGCCG	2	12	200118	200129	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430741186
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3561	NC_019892	GCGG	2	8	200189	200196	0 %	0 %	75 %	25 %	430741186
3562	NC_019892	CGA	2	6	200221	200226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741186
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3564	NC_019892	GAT	2	6	200345	200350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741186
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3570	NC_019892	CG	3	6	200799	200804	0 %	0 %	50 %	50 %	430741186
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3580	NC_019892	GGA	2	6	201400	201405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741186
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3585	NC_019892	GAA	2	6	201590	201595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430741186
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3588	NC_019892	GAC	2	6	201671	201676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741186
3589	NC_019892	GAGCCG	2	12	201713	201724	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430741186
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3591	NC_019892	CGT	2	6	201754	201759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741186
3592	NC_019892	ACC	2	6	201762	201767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741186
3593	NC_019892	GCCA	2	8	201788	201795	25 %	0 %	25 %	50 %	430741186
3594	NC_019892	TGG	2	6	202003	202008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741186
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3596	NC_019892	CGA	2	6	202105	202110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741186
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3602	NC_019892	GCGA	2	8	202261	202268	25 %	0 %	50 %	25 %	430741186
3603	NC_019892	CGA	2	6	202300	202305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741186
3604	NC_019892	C	6	6	202308	202313	0 %	0 %	0 %	100 %	430741186
3605	NC_019892	GAC	2	6	202346	202351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741186
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3607	NC_019892	TTG	2	6	202552	202557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430741186
3608	NC_019892	AG	3	6	202559	202564	50 %	0 %	50 %	0 %	430741186
3609	NC_019892	CGG	2	6	202565	202570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741186
3610	NC_019892	CGG	2	6	202580	202585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741186
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3612	NC_019892	ACC	2	6	202635	202640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741186
3613	NC_019892	CG	3	6	202644	202649	0 %	0 %	50 %	50 %	430741186
3614	NC_019892	GGTC	2	8	202657	202664	0 %	25 %	50 %	25 %	430741186
3615	NC_019892	CCT	2	6	202666	202671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741186
3616	NC_019892	ACC	2	6	202683	202688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741186
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3618	NC_019892	G	6	6	202829	202834	0 %	0 %	100 %	0 %	430741186
3619	NC_019892	CG	3	6	202869	202874	0 %	0 %	50 %	50 %	430741186
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3621	NC_019892	CGAC	2	8	202900	202907	25 %	0 %	25 %	50 %	430741186
3622	NC_019892	AGCACG	2	12	202914	202925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741186
3623	NC_019892	CGGAGC	2	12	202926	202937	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430741186
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3837	NC_019892	GCCT	2	8	216993	217000	0 %	25 %	25 %	50 %	430741194
3838	NC_019892	GGC	2	6	217007	217012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741194
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3865	NC_019892	CTGA	2	8	218971	218978	25 %	25 %	25 %	25 %	430741195
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3984	NC_019892	CCG	2	6	227074	227079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741200
3985	NC_019892	G	6	6	227079	227084	0 %	0 %	100 %	0 %	430741200
3986	NC_019892	GCCC	2	8	227096	227103	0 %	0 %	25 %	75 %	430741200
3987	NC_019892	TC	4	8	227114	227121	0 %	50 %	0 %	50 %	430741200
3988	NC_019892	CGC	2	6	227131	227136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741200
3989	NC_019892	GGGGC	2	10	227331	227340	0 %	0 %	80 %	20 %	430741201
3990	NC_019892	CGA	2	6	227342	227347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741201
3991	NC_019892	GCC	2	6	227402	227407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741201
3992	NC_019892	GGT	2	6	227472	227477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741201
3993	NC_019892	CATC	2	8	227726	227733	25 %	25 %	0 %	50 %	430741201
3994	NC_019892	CAC	2	6	227747	227752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741201
3995	NC_019892	GGC	2	6	227821	227826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741201
3996	NC_019892	CGC	2	6	227886	227891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741201
3997	NC_019892	GGC	3	9	227895	227903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741201
3998	NC_019892	GTC	2	6	227938	227943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741201
3999	NC_019892	GGT	2	6	228142	228147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741202
4000	NC_019892	GGC	2	6	228154	228159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741202

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