MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4d

Total Repeats: 1055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019849	GCATT	2	10	1936	1945	20 %	40 %	20 %	20 %	433610268
2	NC_019849	GCGTG	2	10	5981	5990	0 %	20 %	60 %	20 %	433610271
3	NC_019849	GGCTC	2	10	6087	6096	0 %	20 %	40 %	40 %	433610271
4	NC_019849	TGCCG	2	10	7688	7697	0 %	20 %	40 %	40 %	433610273
5	NC_019849	GCGCC	2	10	9097	9106	0 %	0 %	40 %	60 %	433610274
6	NC_019849	GGCGT	2	10	10677	10686	0 %	20 %	60 %	20 %	433610275
7	NC_019849	CAAGC	2	10	10826	10835	40 %	0 %	20 %	40 %	433610275
8	NC_019849	GCGCC	2	10	11188	11197	0 %	0 %	40 %	60 %	433610275
9	NC_019849	CCGAG	2	10	17519	17528	20 %	0 %	40 %	40 %	433610281
10	NC_019849	GGCTC	2	10	17986	17995	0 %	20 %	40 %	40 %	433610282
11	NC_019849	GGATG	2	10	19121	19130	20 %	20 %	60 %	0 %	433610284
12	NC_019849	CGCAG	2	10	19934	19943	20 %	0 %	40 %	40 %	433610285
13	NC_019849	GCCGA	2	10	20443	20452	20 %	0 %	40 %	40 %	433610285
14	NC_019849	GCCGG	2	10	22320	22329	0 %	0 %	60 %	40 %	433610287
15	NC_019849	TGACG	2	10	25442	25451	20 %	20 %	40 %	20 %	433610289
16	NC_019849	GCCAG	2	10	26048	26057	20 %	0 %	40 %	40 %	433610289
17	NC_019849	GCTCG	2	10	29886	29895	0 %	20 %	40 %	40 %	433610292
18	NC_019849	GCCCT	2	10	31285	31294	0 %	20 %	20 %	60 %	433610292
19	NC_019849	CGATC	2	10	33213	33222	20 %	20 %	20 %	40 %	433610294
20	NC_019849	TCGCC	2	10	40523	40532	0 %	20 %	20 %	60 %	433610300
21	NC_019849	CGGCC	2	10	42113	42122	0 %	0 %	40 %	60 %	433610300
22	NC_019849	GAAAA	2	10	42721	42730	80 %	0 %	20 %	0 %	433610301
23	NC_019849	TCCGG	2	10	43076	43085	0 %	20 %	40 %	40 %	433610301
24	NC_019849	CGGCG	2	10	44597	44606	0 %	0 %	60 %	40 %	433610302
25	NC_019849	TGTCA	2	10	44648	44657	20 %	40 %	20 %	20 %	433610302
26	NC_019849	CGCGG	2	10	44994	45003	0 %	0 %	60 %	40 %	433610303
27	NC_019849	TTCGC	2	10	45502	45511	0 %	40 %	20 %	40 %	433610303
28	NC_019849	ACGAA	2	10	48157	48166	60 %	0 %	20 %	20 %	433610305
29	NC_019849	CCGGT	2	10	48315	48324	0 %	20 %	40 %	40 %	433610305
30	NC_019849	CGGCA	2	10	49418	49427	20 %	0 %	40 %	40 %	433610306
31	NC_019849	GGCGA	2	10	54758	54767	20 %	0 %	60 %	20 %	433610311
32	NC_019849	GCAGG	2	10	57318	57327	20 %	0 %	60 %	20 %	433610313
33	NC_019849	GGATG	2	10	59788	59797	20 %	20 %	60 %	0 %	433610316
34	NC_019849	CGGGT	2	10	63159	63168	0 %	20 %	60 %	20 %	433610319
35	NC_019849	CTCGA	2	10	64479	64488	20 %	20 %	20 %	40 %	433610320
36	NC_019849	CTCGC	2	10	67755	67764	0 %	20 %	20 %	60 %	433610322
37	NC_019849	AACAC	2	10	68994	69003	60 %	0 %	0 %	40 %	433610323
38	NC_019849	CGGCG	2	10	73919	73928	0 %	0 %	60 %	40 %	433610327
39	NC_019849	CGGAG	2	10	75920	75929	20 %	0 %	60 %	20 %	433610330
40	NC_019849	GGCCG	2	10	78723	78732	0 %	0 %	60 %	40 %	433610332
41	NC_019849	GGCGG	2	10	81920	81929	0 %	0 %	80 %	20 %	433610335
42	NC_019849	GTGGC	2	10	83354	83363	0 %	20 %	60 %	20 %	433610337
43	NC_019849	TGCGC	2	10	85670	85679	0 %	20 %	40 %	40 %	433610338
44	NC_019849	TGCCG	2	10	88831	88840	0 %	20 %	40 %	40 %	433610341
45	NC_019849	CCGAC	2	10	91465	91474	20 %	0 %	20 %	60 %	433610343
46	NC_019849	GGGAC	2	10	91894	91903	20 %	0 %	60 %	20 %	433610343
47	NC_019849	GATCG	2	10	92715	92724	20 %	20 %	40 %	20 %	433610345
48	NC_019849	GAAAT	2	10	94121	94130	60 %	20 %	20 %	0 %	433610347
49	NC_019849	TGTCG	2	10	95258	95267	0 %	40 %	40 %	20 %	433610348
50	NC_019849	GATGC	2	10	96710	96719	20 %	20 %	40 %	20 %	433610350
51	NC_019849	CGGAG	2	10	97294	97303	20 %	0 %	60 %	20 %	433610350
52	NC_019849	AGGGC	2	10	97726	97735	20 %	0 %	60 %	20 %	433610350
53	NC_019849	TGCCG	2	10	100725	100734	0 %	20 %	40 %	40 %	433610353
54	NC_019849	GGCCC	2	10	105965	105974	0 %	0 %	40 %	60 %	433610359
55	NC_019849	TCGGC	2	10	106598	106607	0 %	20 %	40 %	40 %	433610359
56	NC_019849	GGCGA	2	10	108400	108409	20 %	0 %	60 %	20 %	433610360
57	NC_019849	TCGCC	2	10	108666	108675	0 %	20 %	20 %	60 %	433610360
58	NC_019849	AGATC	2	10	114685	114694	40 %	20 %	20 %	20 %	433610364
59	NC_019849	TCGTC	2	10	116857	116866	0 %	40 %	20 %	40 %	433610365
60	NC_019849	CGCGC	2	10	118655	118664	0 %	0 %	40 %	60 %	433610365
61	NC_019849	AGCGC	2	10	118891	118900	20 %	0 %	40 %	40 %	433610365
62	NC_019849	GCCTT	2	10	119160	119169	0 %	40 %	20 %	40 %	433610366
63	NC_019849	CCGAT	2	10	119780	119789	20 %	20 %	20 %	40 %	433610366
64	NC_019849	TCGCC	2	10	120033	120042	0 %	20 %	20 %	60 %	433610366
65	NC_019849	CCGAC	2	10	125455	125464	20 %	0 %	20 %	60 %	433610369
66	NC_019849	GGCGA	2	10	125496	125505	20 %	0 %	60 %	20 %	433610369
67	NC_019849	TCGGC	2	10	127573	127582	0 %	20 %	40 %	40 %	433610372
68	NC_019849	GGCGA	2	10	128455	128464	20 %	0 %	60 %	20 %	433610373
69	NC_019849	GCTCG	2	10	129099	129108	0 %	20 %	40 %	40 %	433610373
70	NC_019849	CCTTG	2	10	133995	134004	0 %	40 %	20 %	40 %	433610378
71	NC_019849	GAGCG	2	10	134392	134401	20 %	0 %	60 %	20 %	433610378
72	NC_019849	GCCGC	2	10	136894	136903	0 %	0 %	40 %	60 %	433610381
73	NC_019849	GCCGC	2	10	137742	137751	0 %	0 %	40 %	60 %	433610381
74	NC_019849	ACGCG	2	10	138289	138298	20 %	0 %	40 %	40 %	433610381
75	NC_019849	GAAAG	2	10	140591	140600	60 %	0 %	40 %	0 %	433610384
76	NC_019849	GCCGG	2	10	141763	141772	0 %	0 %	60 %	40 %	433610385
77	NC_019849	TCGCC	2	10	146400	146409	0 %	20 %	20 %	60 %	433610390
78	NC_019849	AAGCG	2	10	147055	147064	40 %	0 %	40 %	20 %	433610390
79	NC_019849	CATCG	2	10	149008	149017	20 %	20 %	20 %	40 %	433610392
80	NC_019849	TACGC	2	10	150031	150040	20 %	20 %	20 %	40 %	433610393
81	NC_019849	CGGCG	2	10	150085	150094	0 %	0 %	60 %	40 %	433610393
82	NC_019849	GCTCG	2	10	150310	150319	0 %	20 %	40 %	40 %	433610393
83	NC_019849	GGAAC	2	10	151361	151370	40 %	0 %	40 %	20 %	433610394
84	NC_019849	GCTCG	2	10	151999	152008	0 %	20 %	40 %	40 %	433610394
85	NC_019849	GCCCG	2	10	153455	153464	0 %	0 %	40 %	60 %	433610395
86	NC_019849	TCGCC	2	10	154335	154344	0 %	20 %	20 %	60 %	433610396
87	NC_019849	CGCGC	2	10	154939	154948	0 %	0 %	40 %	60 %	433610397
88	NC_019849	ACCGG	2	10	155482	155491	20 %	0 %	40 %	40 %	433610398
89	NC_019849	CCGCG	2	10	158169	158178	0 %	0 %	40 %	60 %	433610401
90	NC_019849	GCGTC	2	10	163229	163238	0 %	20 %	40 %	40 %	433610404
91	NC_019849	TCGGC	2	10	163860	163869	0 %	20 %	40 %	40 %	433610405
92	NC_019849	TCCGG	2	10	164728	164737	0 %	20 %	40 %	40 %	433610406
93	NC_019849	CGAGG	2	10	164949	164958	20 %	0 %	60 %	20 %	433610406
94	NC_019849	CGATG	2	10	165134	165143	20 %	20 %	40 %	20 %	433610406
95	NC_019849	ACGGC	2	10	168662	168671	20 %	0 %	40 %	40 %	433610409
96	NC_019849	GTGGG	2	10	168695	168704	0 %	20 %	80 %	0 %	433610409
97	NC_019849	CGCGT	2	10	168801	168810	0 %	20 %	40 %	40 %	433610410
98	NC_019849	CGGCG	2	10	171928	171937	0 %	0 %	60 %	40 %	433610412
99	NC_019849	TGTAT	2	10	174413	174422	20 %	60 %	20 %	0 %	433610413
100	NC_019849	GGGTC	2	10	174749	174758	0 %	20 %	60 %	20 %	433610413
101	NC_019849	TTGCG	2	10	174863	174872	0 %	40 %	40 %	20 %	433610413
102	NC_019849	GCCGG	2	10	176050	176059	0 %	0 %	60 %	40 %	433610414
103	NC_019849	GTGCG	2	10	177232	177241	0 %	20 %	60 %	20 %	433610415
104	NC_019849	TGATT	2	10	177281	177290	20 %	60 %	20 %	0 %	433610415
105	NC_019849	TCCTG	2	10	180432	180441	0 %	40 %	20 %	40 %	433610419
106	NC_019849	GCCCG	2	10	181273	181282	0 %	0 %	40 %	60 %	433610419
107	NC_019849	CGGCT	2	10	190483	190492	0 %	20 %	40 %	40 %	433610429
108	NC_019849	CCGGT	2	10	193893	193902	0 %	20 %	40 %	40 %	433610431
109	NC_019849	GGCGC	2	10	194337	194346	0 %	0 %	60 %	40 %	433610431
110	NC_019849	CGATC	2	10	198089	198098	20 %	20 %	20 %	40 %	433610433
111	NC_019849	GCCCA	2	10	198950	198959	20 %	0 %	20 %	60 %	433610434
112	NC_019849	AGGGC	2	10	200342	200351	20 %	0 %	60 %	20 %	433610435
113	NC_019849	GCCCG	2	10	201269	201278	0 %	0 %	40 %	60 %	433610436
114	NC_019849	GCGCG	2	10	202377	202386	0 %	0 %	60 %	40 %	433610438
115	NC_019849	GCGAC	2	10	203118	203127	20 %	0 %	40 %	40 %	433610438
116	NC_019849	ACCTC	2	10	214422	214431	20 %	20 %	0 %	60 %	433610450
117	NC_019849	CGGCG	2	10	215238	215247	0 %	0 %	60 %	40 %	433610451
118	NC_019849	GCGAT	2	10	215300	215309	20 %	20 %	40 %	20 %	433610451
119	NC_019849	ATCCG	2	10	215336	215345	20 %	20 %	20 %	40 %	433610451
120	NC_019849	CGGCG	2	10	215944	215953	0 %	0 %	60 %	40 %	433610451
121	NC_019849	TCTTG	2	10	217277	217286	0 %	60 %	20 %	20 %	433610452
122	NC_019849	GGGGC	2	10	221655	221664	0 %	0 %	80 %	20 %	433610456
123	NC_019849	CAGAA	2	10	222158	222167	60 %	0 %	20 %	20 %	433610456
124	NC_019849	TGCGC	2	10	222514	222523	0 %	20 %	40 %	40 %	433610457
125	NC_019849	AGCGC	2	10	224166	224175	20 %	0 %	40 %	40 %	433610459
126	NC_019849	GATCA	2	10	230663	230672	40 %	20 %	20 %	20 %	433610464
127	NC_019849	AGGGA	2	10	231145	231154	40 %	0 %	60 %	0 %	433610465
128	NC_019849	CGGCG	2	10	231590	231599	0 %	0 %	60 %	40 %	433610466
129	NC_019849	GATGT	2	10	232522	232531	20 %	40 %	40 %	0 %	433610466
130	NC_019849	CAGTG	2	10	233537	233546	20 %	20 %	40 %	20 %	433610467
131	NC_019849	GGCCG	2	10	234383	234392	0 %	0 %	60 %	40 %	433610468
132	NC_019849	AGCGC	2	10	235240	235249	20 %	0 %	40 %	40 %	433610469
133	NC_019849	TGCGA	2	10	236043	236052	20 %	20 %	40 %	20 %	433610469
134	NC_019849	GTCGC	2	10	236238	236247	0 %	20 %	40 %	40 %	433610469
135	NC_019849	GGCCG	2	10	242946	242955	0 %	0 %	60 %	40 %	433610475
136	NC_019849	GCGCC	2	10	246017	246026	0 %	0 %	40 %	60 %	433610478
137	NC_019849	CCGGC	2	10	246711	246720	0 %	0 %	40 %	60 %	433610480
138	NC_019849	GCGAC	2	10	249764	249773	20 %	0 %	40 %	40 %	433610484
139	NC_019849	GCCCG	2	10	250033	250042	0 %	0 %	40 %	60 %	433610484
140	NC_019849	GGAGA	2	10	250082	250091	40 %	0 %	60 %	0 %	433610485
141	NC_019849	TCGCC	2	10	252740	252749	0 %	20 %	20 %	60 %	433610487
142	NC_019849	CCTGC	2	10	253520	253529	0 %	20 %	20 %	60 %	433610487
143	NC_019849	CGGCA	2	10	253726	253735	20 %	0 %	40 %	40 %	433610487
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149	NC_019849	TGCGG	2	10	264517	264526	0 %	20 %	60 %	20 %	433610497
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157	NC_019849	GGCCA	2	10	273926	273935	20 %	0 %	40 %	40 %	433610505
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172	NC_019849	TGGAA	2	10	313930	313939	40 %	20 %	40 %	0 %	433610546
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249	NC_019849	GATCT	2	10	441165	441174	20 %	40 %	20 %	20 %	433610671
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251	NC_019849	GCTCG	2	10	443758	443767	0 %	20 %	40 %	40 %	433610672
252	NC_019849	GCGCC	2	10	448086	448095	0 %	0 %	40 %	60 %	433610676
253	NC_019849	GCCGC	2	10	451611	451620	0 %	0 %	40 %	60 %	433610679
254	NC_019849	GAAAA	2	10	454260	454269	80 %	0 %	20 %	0 %	433610684
255	NC_019849	GATCA	2	10	454385	454394	40 %	20 %	20 %	20 %	433610684
256	NC_019849	GTCCG	2	10	455353	455362	0 %	20 %	40 %	40 %	433610685
257	NC_019849	CGCGC	2	10	456264	456273	0 %	0 %	40 %	60 %	433610687
258	NC_019849	CCATT	2	10	456347	456356	20 %	40 %	0 %	40 %	433610687
259	NC_019849	GCGCA	2	10	457268	457277	20 %	0 %	40 %	40 %	433610687
260	NC_019849	GCCTT	2	10	457506	457515	0 %	40 %	20 %	40 %	433610687
261	NC_019849	CATTG	2	10	467061	467070	20 %	40 %	20 %	20 %	433610694
262	NC_019849	TCTTG	2	10	472727	472736	0 %	60 %	20 %	20 %	433610699
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264	NC_019849	GTCGC	2	10	477953	477962	0 %	20 %	40 %	40 %	433610703
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382	NC_019849	GTCGC	2	10	674620	674629	0 %	20 %	40 %	40 %	433610865
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384	NC_019849	CCGTC	2	10	675496	675505	0 %	20 %	20 %	60 %	433610865
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