MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4c

Total Repeats: 25374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019848	CCA	2	6	27112	27117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615572
502	NC_019848	CCTTGT	2	12	27140	27151	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	433615572
503	NC_019848	CGT	2	6	27162	27167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615572
504	NC_019848	CCA	2	6	27183	27188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615572
505	NC_019848	ATC	2	6	27193	27198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615572
506	NC_019848	CGC	2	6	27224	27229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615572
507	NC_019848	CAT	2	6	27261	27266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615572
508	NC_019848	GGT	2	6	27285	27290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615572
509	NC_019848	GCT	2	6	27316	27321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615572
510	NC_019848	GGC	2	6	27327	27332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615572
511	NC_019848	CGCC	2	8	27341	27348	0 %	0 %	25 %	75 %	433615572
512	NC_019848	CCG	2	6	27358	27363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615572
513	NC_019848	CGC	2	6	27390	27395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615572
514	NC_019848	GCG	4	12	27445	27456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615572
515	NC_019848	CCT	2	6	27461	27466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615572
516	NC_019848	ACG	2	6	27484	27489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615572
517	NC_019848	TGG	2	6	27499	27504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615572
518	NC_019848	GCC	2	6	27522	27527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615572
519	NC_019848	CTT	2	6	27555	27560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615572
520	NC_019848	CATC	2	8	27626	27633	25 %	25 %	0 %	50 %	433615572
521	NC_019848	CGA	2	6	27665	27670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615572
522	NC_019848	GGT	2	6	27732	27737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615572
523	NC_019848	TCG	2	6	27800	27805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615572
524	NC_019848	GT	3	6	27812	27817	0 %	50 %	50 %	0 %	433615572
525	NC_019848	TCA	2	6	27824	27829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615572
526	NC_019848	CTTCG	2	10	27838	27847	0 %	40 %	20 %	40 %	433615573
527	NC_019848	GC	3	6	27864	27869	0 %	0 %	50 %	50 %	433615573
528	NC_019848	CGGG	2	8	27907	27914	0 %	0 %	75 %	25 %	433615573
529	NC_019848	AAG	2	6	27922	27927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615573
530	NC_019848	GCC	2	6	27932	27937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615573
531	NC_019848	GCC	2	6	27971	27976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615573
532	NC_019848	ACG	2	6	28040	28045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615573
533	NC_019848	AGG	2	6	28074	28079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615573
534	NC_019848	GCC	2	6	28111	28116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615573
535	NC_019848	GAC	2	6	28132	28137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615573
536	NC_019848	CTCGC	2	10	28150	28159	0 %	20 %	20 %	60 %	433615573
537	NC_019848	GCG	2	6	28179	28184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615573
538	NC_019848	TGC	2	6	28221	28226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615573
539	NC_019848	CGT	2	6	28228	28233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615573
540	NC_019848	ACG	2	6	28256	28261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615573
541	NC_019848	GC	3	6	28271	28276	0 %	0 %	50 %	50 %	433615573
542	NC_019848	TGGC	2	8	28301	28308	0 %	25 %	50 %	25 %	433615573
543	NC_019848	ACC	2	6	28331	28336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615573
544	NC_019848	GGC	2	6	28344	28349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615573
545	NC_019848	TGGT	2	8	28403	28410	0 %	50 %	50 %	0 %	433615573
546	NC_019848	CGG	2	6	28452	28457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615573
547	NC_019848	TCG	2	6	28458	28463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615573
548	NC_019848	GC	3	6	28502	28507	0 %	0 %	50 %	50 %	433615573
549	NC_019848	AGA	2	6	28511	28516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615573
550	NC_019848	CGG	2	6	28526	28531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615573
551	NC_019848	CGA	2	6	28635	28640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615573
552	NC_019848	GCC	2	6	28690	28695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615573
553	NC_019848	GGC	2	6	28720	28725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615573
554	NC_019848	CGC	3	9	28735	28743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615573
555	NC_019848	TCGA	2	8	28745	28752	25 %	25 %	25 %	25 %	433615573
556	NC_019848	TCC	2	6	28787	28792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615574
557	NC_019848	CGA	2	6	28814	28819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615574
558	NC_019848	CGG	2	6	28874	28879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615574
559	NC_019848	CGGC	2	8	28889	28896	0 %	0 %	50 %	50 %	433615574
560	NC_019848	GGA	2	6	28959	28964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615574
561	NC_019848	CGT	2	6	29003	29008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615574
562	NC_019848	GGC	2	6	29019	29024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615574
563	NC_019848	GTG	2	6	29068	29073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615574
564	NC_019848	ATG	2	6	29092	29097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615574
565	NC_019848	CGG	2	6	29122	29127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615574
566	NC_019848	CTT	2	6	29175	29180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615574
567	NC_019848	CGT	2	6	29223	29228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615574
568	NC_019848	TCG	2	6	29257	29262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615574
569	NC_019848	CGAG	2	8	29324	29331	25 %	0 %	50 %	25 %	433615574
570	NC_019848	CAC	2	6	29340	29345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615574
571	NC_019848	GGC	2	6	29364	29369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615574
572	NC_019848	CGC	2	6	29380	29385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615574
573	NC_019848	CGG	3	9	29947	29955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615575
574	NC_019848	TC	3	6	29969	29974	0 %	50 %	0 %	50 %	433615575
575	NC_019848	CGA	2	6	29977	29982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615575
576	NC_019848	CGG	2	6	30018	30023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615575
577	NC_019848	GCA	2	6	30079	30084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615575
578	NC_019848	GCGCC	2	10	30096	30105	0 %	0 %	40 %	60 %	433615575
579	NC_019848	CTGC	2	8	30130	30137	0 %	25 %	25 %	50 %	433615575
580	NC_019848	TTG	2	6	30150	30155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615575
581	NC_019848	AC	3	6	30174	30179	50 %	0 %	0 %	50 %	433615575
582	NC_019848	TCG	2	6	30190	30195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615575
583	NC_019848	TCG	3	9	30219	30227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615575
584	NC_019848	CGCC	2	8	30274	30281	0 %	0 %	25 %	75 %	433615575
585	NC_019848	CGG	2	6	30292	30297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615575
586	NC_019848	TC	3	6	30355	30360	0 %	50 %	0 %	50 %	433615575
587	NC_019848	AGG	2	6	30366	30371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615575
588	NC_019848	GTGG	2	8	30442	30449	0 %	25 %	75 %	0 %	433615575
589	NC_019848	AAT	2	6	30583	30588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433615576
590	NC_019848	TCT	2	6	30696	30701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615576
591	NC_019848	GCG	2	6	30777	30782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615576
592	NC_019848	TCA	2	6	30784	30789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615576
593	NC_019848	TGC	2	6	30846	30851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615576
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595	NC_019848	GGC	2	6	30943	30948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615577
596	NC_019848	ACC	2	6	30974	30979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615577
597	NC_019848	TTC	2	6	30986	30991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615577
598	NC_019848	ATG	2	6	31093	31098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615577
599	NC_019848	CGA	2	6	31155	31160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615577
600	NC_019848	GAC	2	6	31216	31221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615577
601	NC_019848	GCC	2	6	31252	31257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615577
602	NC_019848	CG	3	6	31279	31284	0 %	0 %	50 %	50 %	433615577
603	NC_019848	TGC	2	6	31350	31355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615577
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605	NC_019848	CGC	2	6	31389	31394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615577
606	NC_019848	GGCGA	2	10	31396	31405	20 %	0 %	60 %	20 %	433615577
607	NC_019848	CGGT	2	8	31498	31505	0 %	25 %	50 %	25 %	433615578
608	NC_019848	GGT	2	6	31520	31525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615578
609	NC_019848	CGC	2	6	31613	31618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615578
610	NC_019848	GTGA	2	8	31631	31638	25 %	25 %	50 %	0 %	433615578
611	NC_019848	GCA	2	6	31644	31649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615578
612	NC_019848	CGA	2	6	31660	31665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615578
613	NC_019848	CG	3	6	31727	31732	0 %	0 %	50 %	50 %	433615578
614	NC_019848	CGAC	2	8	31774	31781	25 %	0 %	25 %	50 %	433615578
615	NC_019848	TGA	2	6	31804	31809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615578
616	NC_019848	GCG	2	6	31924	31929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615578
617	NC_019848	CGGT	2	8	32019	32026	0 %	25 %	50 %	25 %	433615578
618	NC_019848	CCT	2	6	32055	32060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615578
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620	NC_019848	CAA	2	6	32114	32119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615578
621	NC_019848	GCC	2	6	32168	32173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615578
622	NC_019848	TGT	2	6	32206	32211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615578
623	NC_019848	AGAT	2	8	32310	32317	50 %	25 %	25 %	0 %	433615579
624	NC_019848	GGA	3	9	32350	32358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615579
625	NC_019848	TGC	2	6	32368	32373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615579
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627	NC_019848	ACG	2	6	32444	32449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615579
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877	NC_019848	GAAA	2	8	45697	45704	75 %	0 %	25 %	0 %	433615588
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879	NC_019848	AACGA	2	10	45801	45810	60 %	0 %	20 %	20 %	433615588
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